BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323G04.T7 (MSMg01no323_g04.b1) | MSMg01-323G04.TJ (MSMg01no323_g04.g1) |
ACC | AG441822 | AG441823 |
length | 1,117 | 1,238 |
length of high quality (start - end) | 671 (135 - 805) | 371 (417 - 787) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_g04.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_g04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_g04.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_g04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:06:52 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCTATCCNNNNNNNNAGTCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCAGTGACAAGGTTACCTACTCTAAAACCCTCAAATTT
ACTTCTAGTAGAGATTAATTCTTGAAACTAATTAGGCATTACAAAGAACA
GAGCCGGAATAGCTCATGGCTATTCTGCAGAGTGTTTACTTGGGACAATA
GCCAATCGTACCCAGACAAGGGAATTCACAATGGCTTAGTGAATAGGTGG
GTTTACCATGAAAGAGTTAGGGAATCCCCCTGAGAAAGGTTTCTTCACTA
GGCTCAAAGAAACAGCATAAATCAGGCATTTACTAAGAACCCCTGGTGGT
GGGCTTAACAATAGACTAGCATTACACCTGGCTCCCTTCTTAGTGGCAGC
AGCCTGGTCTCTGCCTTCTTTTGATGCATACATTCCTTATGTTTTGTGTC
ACTGTAACTCAGAGGATGTATTTCACCTGTTTCTTGTTGCTCTTCTGTAT
AAAAAGTTAGATGCTCAACTTGAAAAATTACATTCAGATTCTACACAATC
TCCTGTGTTGCATATATTTGTCATTCATTCGCCGACTCCTTGTCCATCTG
CAACCAGAGACCCGTTCTATGCAGACAGGGAACAAAAGGGTCTGCAGCAC
CCAGAAACTTAGAATACCCAAAATACAATTTGCAAAACACAAGAAAATCA
AGAAGAAGGAAGACCAGCGTGTGGATACTTCATTTCTCCTTAGAATAGGG
AACAAAATACCCATGGAAGAACTTACAGAAATAAAGTTTGGAGCAAAGAT
GAAAGGATGGACCACCCAGAGACTACCCCATCTGGGGATCCCTCCCATAA
TCAGCCACCAAACACAGACACTATTGCATATGCCAGCAAGATTTTGCTGA
AAGGACCCTGATATAGCTGTCTCATGTGAAGCTTTGCCCGTGCCTGGCAA
ATACCGAAGTGGATGCTCCATCTTGGAATGGAACCACAGGGCCCCCCATT
GGAAGGACCTAGAAAAAATGGCCCCAAGGAACCCGAAAGGGTTCTGCCAA
CCCCTATTGTGGGGGGCCCACAAATGTTGGAACTAACCCGGTAACCCCTC
CAAAGCTTTGGGTCTTN
| NCCCACCTTNNNNNTTTCATGCTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCATAAAGAGCCAGAGCTCTGGC
CNANCACNAGGNNNCCTCCTTTAAAACCTCTCCGCTCCTTACTTGCTGAT
TGGCTTAATAAAAATCTGGTGGCCAAAGGCTAGGTAGGAATGGGAAGGCA
GAACTTCCATGCCCAGAGATGTCTCTACTAGAAGAAGAGAAGTGGAGATA
TGCCATCTGGGCATGGAGGTGGTTGCTCATGAATAGGAGCAAAGAGGTAA
AGAACTAGCTATGTGGCAGAACTTAGGGTTAAAAGAGCTAGAAGAGCTAG
ATAGATAGAGCTAGCTGAGGGTCTGCCCCACAATATTTGACATCCAACTT
GGTGGCATTTTTTTTAGTTTAAGACACTACATTTAAGCAGTAGAACCCAG
GCACAGAATCAGCAGTCAGCCATGTCTTGCTCTATGAGCAATGTGTGGCA
AAAAAACAAAGAGAAGCTGATAAGTGGCCCACAGGGTGGAAGGCAGAGAA
AGTAGAGCCCTGGCTGTAGTCTGTGAGAACACAGGAGGTAAAACAAGCAC
TTCCCAGAGCTAGGCTACAGCTTATCAAAGCAGATTTAAATGAGCTGAGC
ATTGAGAAGTAGAATGCTAGGATACAACAGTACAACAAGGATGTTCCTTT
AAATCGGCATAAATACTCTGCAGAGGAATCCAATCTAGAACCTACAGTGC
CACCTCATGATGAGATTGCAAAATGCCATTTCAGGCCCATTAGAAAGCCC
AGGATTATTTTTTCAGTTGCGATAAGAGATTAGACTCCACAAGGGCTTGA
GAAAATTGGGTGAAAGCCCCTAGAGACACTAGACTTAAAGAGATTTGAAG
GGACCATAATGTTTTTATGCCATGATTTTAATGTATGGCAAGCAGATACT
TTATTAAGTAGCCCCCCAAAATCCTATAATTCCAAGAATGGAGATATTTG
ATGCCGCCCTTCTTAAACATGGCCCCTCCCTTAAAGGTGTAAAAGGAGGC
TTCCATTTTGGGACCATGGAATAGGGCCAAAGGGTATTAATTTTGCCCGG
AAACGGTTGCTAGGGTAAAGGCCAGAATTCTTAATTAAAAAAACGCGACC
CGTGTTTAAGGAAACCTCCCTTAAAACAGGGGCCTAAAAAGCATTTTTTG
CCCCCTTTGTGCCAGTTGGAAGTATCAAAAATAGTTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 9 7 7 7 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 12 15 17 8 8 8 15 19 23 28 28 42 33 32 33 33 37
37 42 50 50 50 50 50 53 53 53 50 42 57 35 35 35 35 35 35 31 31 31 33 31 30 29 21 21 9 7 7 7 7 7 7 11 11 12 12 15 12 12 12 9 18 18 37 33 36 36
36 36 38 50 50 38 36 36 36 36 33 44 50 33 37 37 23 19 10 11 11 11 11 12 12 19 17 22 21 15 14 15 16 11 11 11 30 27 48 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 59 59
36 34 21 21 19 11 11 11 23 25 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 48 48 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 47 47 47 59 44 39 39 41 40 39 36 36
36 39 32 36 41 37 37 39 39 37 37 39 41 37 37 41 41 39 39 39 39 39 37 37 41 41 41 41 59 41 37 37 41 39 44 48 46 46 46 34 34 25 25 22 30 30 32 29 29 34
39 41 41 46 46 41 32 20 23 24 32 32 41 39 34 36 36 34 30 29 29 37 37 37 47 37 39 39 31 33 32 32 32 30 30 37 32 32 32 29 29 32 36 32 29 29 32 37 36 37
18 19 15 15 15 12 14 19 21 27 28 25 11 10 10 16 15 20 19 13 15 16 28 18 19 22 20 26 22 33 37 37 33 31 30 30 25 30 18 13 8 8 8 8 8 13 22 31 22 18
21 19 12 12 9 10 10 12 14 17 25 19 17 17 16 16 13 10 8 8 8 10 11 16 25 23 18 12 11 15 16 9 9 9 9 11 10 10 9 10 10 16 17 22 24 16 16 16 17 16
20 18 12 10 13 10 10 10 9 9 12 14 9 10 10 11 11 16 11 11 11 13 11 12 11 6 6 6 9 7 12 10 10 12 10 17 10 8 8 8 8 8 11 10 12 11 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 8 6 6 8 8 10 12 9 8 9 9 9 9 9 15 13 8 8 8 8 8 8 9 13 13 11 11 17 16 22 13 10 9 9
9 9 9 10 9 9 9 10 11 11 11 11 10 10 10 10 15 8 9 9 9 16 11 11 10 9 9 10 13 12 13 11 16 11 11 11 11 12 12 17 13 10 9 8 10 8 8 8 10 16
12 13 11 15 13 10 8 13 8 8 8 9 11 14 11 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 10 11 11 10 9 8 8 8 8 8 10 13 16 18 9 15 7 6 6
6 9 8 8 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 9 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 13 9 8 9 9 12 10 18 19 15 17 8 11 11 15 15 10 12
19 24 28 35 35 37 29 33 26 24 29 36 38 53 36 53 41 41 37 37 47 41 27 27 10 9 7 7 8 7 8 8 8 6 6 6 6 7 9 9 9 9 15 23 27 37 37 37 23 25
3 0 3 0 3 21 3 0 3 21 3 0 0 0 3 6 6 6 12 12 11 12 12 19 19 26 14 11 11 8 8 8 8 8 21 22 33 31 31 31 31 33 36 50 57 57 57 57 57 57
57 57 57 47 47 47 47 50 50 53 53 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 54 54 54 53 53 68 68 68 57 57 59 48 44 44 57 57 57 68 68 59 59 59
59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59 59 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 42 42 35 43 42 39 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 59 59 59 54 48 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 27 20 11 9 9 10 11 9 8 8 8 8 8 15 34 41 59 47 48 48 53 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 59 59
68 68 68 68 68 54 54 48 46 43 43 43 43 36 36 28 30 30 37 42 36 36 25 25 25 30 42 42 44 44 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 59 59 59 59 59 44 44 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 52 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 57 59 59 68 68 59 59 57 57 43 46 46 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 47 47 48 48 48 48 48
57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 39 43 43 50 50 59 57 50 50 50 50 50 48 50 48 48 48 46 46 40 39 47 37 37 31 35 37 37 37 37 37 32 32 23 24 28 28 28
37 37 41 41 41 41 41 43 41 37 37 32 31 32 37 43 47 47 47 37 39 29 29 19 22 22 18 18 19 20 21 27 31 35 34 34 34 34 37 37 36 41 39 43 36 39 36 37 23 23
11 11 11 25 27 37 37 36 41 37 33 33 16 16 14 18 18 23 27 30 27 25 28 24 24 19 26 32 34 34 34 23 23 22 30 24 24 19 22 10 12 10 10 10 12 22 32 31 30 37
32 27 27 30 37 37 25 24 19 14 8 8 9 9 8 8 10 11 15 12 12 12 16 16 20 21 26 22 16 16 16 9 11 9 17 17 16 10 11 11 16 19 22 21 20 23 28 20 15 10
9 9 19 12 12 12 10 8 8 8 9 9 9 10 12 19 11 11 10 10 11 8 10 10 10 10 9 9 9 11 8 8 8 11 11 16 15 14 9 9 9 9 8 8 10 15 15 15 17 12
8 8 11 8 8 10 8 9 9 9 9 11 10 18 21 13 9 8 8 8 8 8 9 15 10 10 10 15 15 19 12 9 9 11 10 10 8 9 9 9 12 10 10 9 10 8 8 10 13 15
10 12 9 9 9 10 8 8 8 10 10 12 13 14 14 13 11 11 13 11 8 10 8 9 8 9 10 17 22 22 12 11 10 11 10 8 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 13 12 13
10 8 8 8 8 10 15 18 8 12 10 10 8 8 9 14 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 11 11 15 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 7 7 9 13 10 10 10 11 11 13 13
13 11 14 10 12 12 13 16 15 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 12 11 15 10 9 8 8 8 8 9 9 9 12 16 17 11 11 10 8 8 8 10 10 13 11 10 8 9 8 11 8
9 10 11 11 12 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 16 10 10 12 10 8 10 8 8 8 8 8 6 10 7 7 8 6 10 8 10 10 16 11 14 10 9 10 10 9 9 10 8 10 8
6 6 6 6 8 7 9 10 10 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 16 16 16 14 14 8 8 10 10 8 10 12 19 23 13 12 8 6 6 6 6 8 10 13 12 9 9
9 8 9 9 9 6 15 8 8 6 6 7 10 6 6 6 6 8 8 6 6 7 9 9 11 8 8 8 8 8 10 11 12 11 11 11 10 10 |