BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323N19.T7 (MSMg01no323_n19.b1) | MSMg01-323N19.TJ (MSMg01no323_n19.g1) |
ACC | AG442166 | AG442167 |
length | 1,290 | 1,257 |
length of high quality (start - end) | 637 (136 - 772) | 640 (137 - 776) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_n19.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_n19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_n19.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_n19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | NCAAATTANNNNNNNATCAGTGGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTCAAACAAAAACAGTAACCATATAGTTTCTGTCTGCACC
CAGACCTGATCCTGTGCTCCCTAAAACCAAGTAGCAACAAGAGAGAGCTG
GTCTCCCAACAGTGCTGTCATACCCATGAGTACAGGGAAGACCACCAATT
CTGCTCAAATTCCTGGCCAAAGAGGGACCCAGCCAGAGCCATCCGGACAC
AGGAACGAAGGAACAGGAAGAAACAATCATTTTTCCTTAATATTTTTTGT
CATCAATGGACTTGATTCCCAATACAAAGACATAGACTAGCAGACTGGAT
ATGTAAACAGGACCCAGCACTTTGCTGCATGCAAAAAAAAAAAAAAAAGG
CACCTCAGTGTCTTATACAGGCACTACCTCAGAGTAAAAGGCTGAAAAGC
AATTTTTCCAAGCATATGATCCCAACAAACAAGATGGAGTAGCCATTCTA
ATATTGATTATAATCAACTTTCAACCAAAAGTTATTTTAAAGAGATAAGG
AAGGACACTTCATACTCATCAAAGGAAAAATCTACCAAGAAGAACTCTAA
ATTCTCTGCTCCAAATGCAAAGACACCCACATTCATAAAAGAAACTTTAC
TAAAGCTCAAAGCACACATTACGCCTCACACAATAATAGTGGGAGACTTC
AACAACCGACTCTCAACAATAGACAGATTGTGGAAACAGAAACTAAACAG
AGACAAGGTGAAACTAACAGAAGTTATGGACCANATGGATTTAACATATA
TCTATAGAACATTTCATCCTAAAACAAAAGAATATACTTTCTTCTCAGCA
CTTCAACCTACCTTCTCCAAACCTGACCACAAAAATGGTCACAAAACAGG
CCTCAACAGATTCAAGAACATTGAAATAATGCTTTTTTGTGACTCATCAG
GTAGGCTATGTTTACTATCCACTTGTACACCCATTAAGGGGGATATAGGA
AATTAATAATGCTAGCAACGGTAAGAAACCCCACTAATTTTCCCCTTCCA
AGTTGTGGGGCCTGGGAACTACAGTTCACTCTTTCTTTTAATTCATAACC
CCCCTTTCTCTTGTTCCCGCCAAATCCCGGTTCCACAGGCAAATTCAAAT
TCCAAAAATGGGTTTAAACGTCCCCTAACCCCTTATAAAAAAAAAAACCA
CCTCTAATAATTTCCTCGCCCCACAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTCTCTC
TACACAAAGGGTTTATAATAAAATCTCTTCCAAACACCAA
| NCCCGTTTTTNNNNNAACATGCGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAACTCCTGTTGNTGNTT
TAAGATTTAAAATTAAAACCTTTATATGTGTGCCCGCCTGCGTGTATGCA
TGTACACCATGTATGTAATGGTACCGTGTCCAAGAAGGCCAGAAAGGGGT
GGGAGTGGAGGCTCATGTGGCTTCTGAAGTGGGGTCCTGTGCTTGTACAA
CTTACCAAGCCACCTCTGCAGACCTGTTCTTTTTTTTAAATGTATATTTA
TTTACTTGTGTATATGTATGTATCACAACATGTATGTAGAGGCCAGAGGA
CAAATGAGGGCGTCAGGTCTCTCCTTCCACTACTGGAGTCTGAAGAACTC
GGGTTATTATTATTGGTGGCAAGTCCCTTTACCCACTGAGCTGTCTCACC
AGGTCTTTGGGTCTGTTGGTGAGGCTGCTGTTACTGTGTCCTGCTAACCT
TGGCACAACACCCCTTTTGCTACTTAGAAGCTGCACCATGTTATCTGGGT
GCAGACTTTCCAAAGTCACGTAGGTTACTAAGTTTACGGACATCCCTCAG
ATTGAACCTTGTTCTACAAGTGAGTTAATCAGAATGTATTCAAAAGAACT
GTGGTATGCAGTGTTCTATATAATGCTTGATATGGTTTCAAAAGCCAGTT
CCCCACAAATTAAGTGTGTGAGGAGGTACATCGAGAGGAACGGTGGGGCC
AGCAGCCTTGTTGTGAACCATGAGAAAGAAAAGTATTAACAGGAAACAGG
AAGGGAAAGAAAAACCCATCCTGAGCCTGGCAATCAATACCTTAGATGGT
CTGAAACCCTGGTAAAGGACAAGGCCAGGCTCAGTGGGCAAACACAGACA
CCAAGCCTAATGACCGGAATTCATTGCCCTTAACTCTCGTGGAAGATGAA
AAAATTTTTCTTGTAAAAGGCAACATTCCACCCCCCCCATAAGTAAAATT
TCCAATAAAAATTTAAAGAAGTTGCCTCTTCTCCGTAAGGGCCTTTGCCT
TTCCAAGAGTTCTACTTTTCTTAAAAACCATGAACCCTTCCCCTGGTTAA
GGGTTAACCCCCCAAAATTTTAAAAATTTTTGTAATTTTTTTCCTAAAAA
CCCCTCAAAAACCCAATCTTTTTTCTTAAAAAATTCCTAATAGCTTTTTT
TAACAACACAAAATATTCCTAAAATAAAATCTCCTCCGTGCTTTTTTTTT
TATTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 7 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 10 15 9 8 8 10 8 8 8 21 19 28 28 28 30 36 37 47
50 50 50 50 43 43 50 47 42 50 53 53 50 50 57 57 53 53 50 50 50 50 28 25 19 19 9 9 9 9 6 6 6 7 6 7 12 10 16 18 22 15 24 21 30 36 36 53 59 59
53 53 53 53 50 50 53 42 38 36 36 35 31 31 28 28 19 19 11 13 13 10 9 8 8 8 8 11 10 11 10 10 10 10 12 19 19 34 34 46 50 59 59 59 59 53 57 57 57 53
53 53 53 50 50 50 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 51 51 43 43 43 47 43 50 50 50 50 50 50 50 51 51 51 68 68 68 68 68 51 51 57 57 48 48 48 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 59 59 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 48 43 41 39 43 43 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 48 48 48 59 47 59 30 27 19 16 10 10 10 10 10 10 12 19 23 34 41 59 59 59 59 48 43 43 37 37 28 37 37 59 40 48 48 48 48 48 48 57 48 57 54 57 54 57
57 68 68 68 57 59 59 57 47 43 43 47 57 57 59 59 59 57 57 48 39 39 30 44 44 27 27 27 32 41 42 57 57 54 57 54 57 57 68 68 68 59 44 44 37 44 48 50 50 48
57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 44 44 35 35 35 44 44 57 45 45 45
57 57 57 59 59 59 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 59 57 57 59 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 68 68 57 57 50 50 52 52 52 59 59
59 35 43 43 57 57 57 59 57 57 59 54 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 43 43 43 43 44 44 57 57 43 43 47 59 59 68 68 68 59 59 48 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 50 50 50 48 48 57 57 57 57 57 48 48 43 43 43 48 42 39 30 30 28 40 43 59 59 59 59 59 48 48 57 44 43 40 37 37 39 37 32 32
16 16 16 27 25 22 32 38 34 34 25 28 24 25 19 32 40 59 59 59 59 59 37 37 37 37 32 31 31 39 43 41 43 36 37 37 38 39 38 36 32 35 41 39 31 28 36 36 36 36
39 30 30 24 22 25 34 34 44 59 44 41 41 44 44 39 36 21 21 11 11 12 12 12 12 12 11 11 11 12 12 9 3 0 3 18 12 19 22 22 32 43 35 34 36 37 31 37 30 32
30 32 32 30 28 23 23 23 34 23 20 11 11 11 11 11 23 25 29 39 17 16 19 15 19 19 34 27 18 15 14 13 16 14 16 16 15 13 13 24 24 24 24 16 15 12 13 17 10 10
13 13 17 10 8 6 6 8 8 17 14 13 17 14 16 13 12 13 15 18 15 16 14 19 19 14 10 10 17 17 20 28 25 18 18 14 9 8 10 8 8 12 14 19 28 19 19 19 17 17
12 11 17 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 19 14 12 12 16 16 15 14 12 12 12 10 10 10 10 9 12 20 24 21 19 14 12 12 11 11 11 11 10 9 9 9 8
6 8 8 8 8 11 8 8 8 12 19 10 11 16 13 11 12 13 12 11 10 10 10 8 6 6 6 6 8 6 9 11 13 16 16 20 20 20 26 26 19 17 11 11 11 12 12 14 12 15
14 13 15 8 8 9 8 8 8 8 8 10 12 9 13 10 9 8 8 8 8 13 8 6 6 6 7 6 6 6 7 11 9 9 8 10 11 9 9 10 14 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 9 8 12 14 14 14 11 10 8 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 11 11 11 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 10 10 8 9 8 8 8
8 9 9 16 13 13 10 8 8 8 8 8 8 9 10 12 10 6 6 6 7 10 11 8 8 8 8 10 18 17 15 15 8 6 6 6 10 8 11 10 18 10 7 8 6 7 6 8 10 11
11 17 14 20 15 22 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 16 16 10 8 6 6 7 7 8 12 11 10 9 9 9 10 10 15 17 18 26 23 17 15 8 8 8 6
6 8 8 8 8 8 8 7 10 12 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 9 13 11 16 21 26 38 39 41 37 22 19 19 19 19 17 8 8 8 6 9 9 9 9 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 10 14 18 15 10 10 10 9 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 8 17 9 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 10 11 9 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 13 8 7 9 9 16 10 19 19 20 22 21 24 30 31 29 24
16 16 25 29 36 36 37 37 37 37 35 35 35 35 36 36 36 44 44 50 50 47 47 27 27 9 9 11 12 8 9 8 8 8 9 12 9 9 11 11 11 12 18 3 0 3 3 0 3 21
21 33 33 33 59 39 44 44 53 41 41 37 37 37 37 37 17 13 8 8 10 8 7 7 8 10 15 23 25 18 13 10 9 9 9 10 13 25 26 33 33 33 31 31 36 36 38 53 57 57
53 53 53 53 50 57 50 50 50 50 50 50 50 47 47 51 47 43 43 43 47 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 54 54 54 54 57 57 59 59 44 42 35 35 42 44 59 57 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 48 48
59 59 59 59 59 34 36 28 18 12 9 11 12 18 11 11 15 28 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 48 44 42 36 36 43 59 57 57 57 57 57 68 68
68 57 57 54 48 44 44 44 32 28 32 41 47 47 59 59 59 59 59 47 47 46 44 47 47 47 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 43 43 43 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 57
57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 68 59 59 54 54 57 59 59 59 54 59 59 59 59 68 57 57 53 53 50 50 50 57 59 59 59 43 43 43 43 44 44 50 53 48 48 41 40 46 59 43 44 39 37 37 39 44
39 43 46 40 40 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 57 50 47 47 41 41 33 33 33 30 30 30 39 37 37 44 44 44 47 59 59 59 59 59
47 39 39 33 33 30 30 30 41 59 43 39 31 41 41 59 59 59 34 32 22 22 22 36 31 39 37 43 37 32 28 22 22 30 34 32 31 29 29 29 32 37 37 37 31 36 34 34 23 32
28 32 32 22 15 11 22 18 27 30 24 30 34 41 39 31 31 31 25 30 21 19 11 16 14 16 13 16 11 12 12 9 13 10 14 9 8 9 8 10 10 24 22 22 20 20 22 25 22 28
22 24 22 22 27 27 24 19 20 18 26 19 23 19 15 15 17 33 32 27 31 28 30 14 12 11 12 18 14 12 15 10 11 12 12 11 12 19 21 22 22 12 13 11 11 10 17 11 17 11
11 21 30 20 22 22 18 18 20 21 11 9 9 9 11 11 19 18 16 16 16 10 9 9 9 8 8 10 9 9 9 10 9 9 9 9 16 11 9 9 9 9 9 8 10 9 9 9 10 10
10 10 10 11 16 9 10 10 16 16 24 25 24 20 22 15 10 9 9 12 15 23 12 9 9 12 10 12 15 10 10 11 10 8 8 12 13 11 12 10 8 8 8 8 7 9 11 11 11 11
11 10 10 11 9 11 13 11 10 11 9 9 10 13 8 8 8 9 9 10 16 16 11 11 10 10 11 13 10 10 11 18 17 29 21 9 9 9 10 8 7 8 12 10 11 11 16 21 17 12
12 10 10 10 13 10 11 12 23 16 15 15 13 11 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 6 6 6 8 6 8 8 10 8 8 8 8 9 11 11 13 12 11 11 10 10 8 7 7 8 10
11 16 16 18 15 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 9 10 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10
8 8 8 8 11 12 10 10 10 8 8 8 8 9 10 10 15 9 8 8 8 11 13 10 10 10 10 14 13 9 8 8 8 8 10 10 13 12 13 10 10 12 10 9 9 10 9 11 11 15
15 11 11 8 8 8 8 9 21 18 11 11 11 9 8 8 8 8 8 15 19 19 18 10 10 10 13 14 13 14 8 8 9 9 8 8 8 6 8 8 7 8 8 8 8 12 19 14 16 12
12 11 10 10 10 8 10 9 9 10 8 8 13 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12 12 12 18 12 9 9 9 9 9 10 11 11 11 16 12 25 24 30 24 9 14
9 9 9 15 30 25 19 |