| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-323P20.T7 (MSMg01no323_p20.b1) | MSMg01-323P20.TJ (MSMg01no323_p20.g1) |
|---|
| ACC | AG442257 | AG442258 |
|---|
| length | 1,283 | 1,293 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 753 (96 - 848) | 722 (92 - 813) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:08:11 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | plural | no hit data |
|---|
| sequence | NNNCCGATTTTNNNNNNNATCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGA
GGATCCGCGGAATTCTCTAATGTTGCAGCCCCGATATAAACAGTTTAGAA
ATCTATCTCACTCCTCATAAAGCCTGTATAACTCATGACTCCATTTCTTT
CCTCCTTCTCACAAATGCTGTTTCTCTTCAGATGCAGCCTTTTCTCCACT
TTAGTCCACAAATAAAAAGACATTTACTAAGTGAAGTACTCTCATGACAC
TTTTATATTTGGAAAATGCAGATCTCCAGAAAACATTTTTCTATCTAGAG
ATTGTGTAGGTTTCTGTAAAGTACCCAGTAGTTGACAAGAAATAGTATGT
TCTTCTTTAAACCCATGATAATTAACCATGACACTTGAGTCGAAGGAGCT
TAGAATACCCTGAAAACAATTTCTATGCATGTCTGTGAGAGGGTTTTTAG
GTCTGTTTAACGAAGATGGGAAAACCTATTCTAACTGAGGGAAGCATCAT
CTCAGGGGCTGGAGTCCCAGACAGAATAAAAGAAAAAAAAATAGAAAAAA
AAGCCTTCATCATGTTCTGCTTCTTAAATGTGGATGGCATGTGACCAACT
CCCTTGTCTCCTTGCCTTTGTGTCTCCCCCCCTAGTATATGATCCCTAAA
ACTGTGAGCCAAAATAAACCCTCCCTTCCTTAAACTTTCTTTTTCAGATA
TTGCATCACAGCAAGGAGCTAAGCAGCTAATGCAAAACCCTAGAACTGAA
ATCAAAATAGTATCCTTCAATAGTAAGATAGGGGTTAAACAAATGTGTCA
ACAGGACTGCATCCCATGCCATCCAGATTATAATCTATGGTATCAGTTCT
GGAAGCCCAGCCCATACTCCAGGAGCTTTTGTGGGACATAAAACCATGCC
AGGAAGTTTGGTAAGCCAGACCATGTTGAGACTCAGAGACTTATTTGGTC
CACCCCTGAGGCTTAAATGTCTCCAGGGTTCCCTCCCAAATCCTGAATTG
AAAAATGGGCCTGCTTCTCACATCAAAAAAATGGTAAATTTTCTTTGTCC
AAAAAAATTTCCCTATTTATGAAAAACCTACCAACCTTAAACAAAAAACA
TTTTTTTTCTTCCAAAATCCTCCCCCCCAAAGGGGTTAATTTCCCTTTCT
CCTGTAAAAGGGGGAAAAAATAAAACTCCTTTTTTCTTTTTATAAAAAAT
GTTAGAGAAAAAAAAGGGCTCTTTATTAATATGCCGGGAAAAGGCTTTTT
CCAAAAAAAAAACACACAAACTGTTCCCCTAAA
| NNNCCAATTCCTTNNNNNAGGATGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAACTGACGAATACCGAA
AGGCAGAGAAGCACCTGACAAATTGCTCAACATCCTTAACCATCAGGGAA
ATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGC
TAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGCCGTGGATGTGGAGAAA
GAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTC
TGGAAATCAGTCTGGTGGTTCCTCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGA
GGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTG
GTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATA
GCCAGAAGCTGGAAGGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACA
GAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGA
ATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATC
CTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACT
GATAAGTGGATATTAGCCCAAAACCTAAGATACCCAAGATATAAGATACA
ATTTCCTAAACATATGAAACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGAACA
CTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACA
GAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATAAAAGGATGGACCATGTAGACACTACC
ATATCCGGGGATCCATCCCATAATCAGCTTCCAAATGCTGACACCATTGC
ATACACTAGCAAGATTATGCTGAAAGGACCCTGATATAGCTGTCTCTTGG
CAAAAAAAGCCTGGGGCCTACCAAAAATTAAATGGGATGCTCCCCCCCCG
CTTATTGAAGGATCCCATGGCCCCCCCGGAAGGAAGGAGAGAAATTACCC
AAAAACTCAAGGGGATCGGCCCCCCTGCAGGGGGGAAAACATTTTTAAAT
TATCCGTACCCCGGACCTCCTGACCCTTCTGTGGTTGGGNCAAAAAAAGG
CCAAACCCCCTCCCCTGGCAAAGAAAGCCCCTTGGCACCCCCAATTATAT
TTCCCTCTCTCAGGAAAGCCCGGCCCTAAAAAAAAAGGGGGGTATGGAAA
AAACCNCTTNCNCCNTCCNCTNCCCTCCTTCTACTTACCTCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 9 10 10 10 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 7 7 7 7 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 8 8 10 12 16 17 17 30 32 29 29 28
28 28 36 43 50 50 43 40 47 47 47 42 42 53 42 36 36 36 36 35 35 31 31 31 33 42 41 44 21 17 8 6 8 8 8 8 8 8 9 13 13 13 11 9 10 19 18 27 36 53
53 53 53 53 50 50 50 50 50 50 50 36 36 33 33 31 31 33 33 33 19 23 11 8 8 8 8 11 15 17 29 29 33 33 33 33 36 33 33 33 33 34 34 42 43 43 53 53 53 53
53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68
57 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 43 35 31 31 31 35 43 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 47 47 47 48 48 48 59 59 59 57 53 53 50 50 50 57 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 33 30 30 37 41 47 48 47 47 47 47 59 59 44 41 41 44
59 59 59 47 41 41 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 59 59 47 47 47 59 43 41 41 44 59 59 59 59 47 47 59 59 59 59 47 32 32 23 32 32
43 43 57 59 59 43 43 43 43 43 48 50 50 57 43 43 28 28 28 30 30 30 37 37 43 43 48 41 41 41 41 41 39 41 37 39 39 34 37 34 34 28 28 25 32 39 19 11 11 11
11 12 19 22 29 34 39 39 37 39 37 37 37 32 37 40 37 35 28 26 34 34 41 41 36 27 30 14 21 15 24 22 40 43 36 34 35 37 37 39 37 37 39 39 37 39 37 43 39 37
37 39 37 37 37 37 40 40 41 39 39 30 31 31 40 37 35 30 25 31 39 41 32 30 23 23 14 20 20 35 32 28 36 32 32 23 18 18 18 18 28 23 34 32 21 28 13 13 21 19
14 14 19 18 22 19 22 22 14 14 11 12 16 24 37 35 37 18 15 15 16 11 10 12 12 11 11 19 16 12 11 10 10 11 17 9 9 9 15 11 14 16 13 13 12 20 20 28 18 13
12 11 12 12 10 10 10 12 12 11 12 11 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 13 15 15 12 12 9 9 9 8 8 8 6 6 6 7 9 10 9 10 9 9 9 6 6 6 6 8
6 8 8 9 8 9 11 9 8 8 8 8 8 8 10 14 14 12 12 9 9 9 12 11 11 11 9 9 9 9 8 6 6 8 6 7 8 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
10 9 9 9 8 8 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 8 6 6 6 6 6 8 10 10 11 19 16 17 12 10 8 8 6 6 6 6 6 6 11 11 10 10 10 10 11 10 9 9 9
9 11 17 30 22 16 12 12 11 12 12 11 8 6 6 6 8 8 11 11 12 12 16 12 15 17 13 8 8 8 8 8 11 12 12 15 15 10 13 13 10 11 11 19 17 9 9 9 9 9
9 12 12 24 15 15 9 8 10 10 11 11 9 9 12 11 10 9 10 10 10 10 11 11 10 9 9 9 11 12 20 23 18 17 11 11 8 10 8 6 7 6 6 6 8 9 8 8 12 12
11 10 9 9 9 9 8 6 6 6 13 9 8 8 8 8 13 13 8 8 8 10 8 7 6 8 6 6 6 6 9 11 7 7 7 7 7 12 15 11 10 9 9 9 10 18 22 17 8 8
6 6 6 8 8 8 8 6 9 9 9 17 17 9 8 8 8 8 7 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 11 11 15 12 12 12 20 11 9 9 9 8 8 8 8 8
8 9 12 14 24 26 10 10 7 6 6 6 6 6 8 10 10 13 13 12 8 8 8 8 6 11 11 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 8 8 10 8 8 6 6 6 3 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 8 10 11 8 8 9 8 8 8 15 15 19 8 9 9 22 19
28 17 23 15 19 8 8 8 23 23 37 35 35 36 36 50 36 53 44 44 39 50 47 26 23 12 9 11 11 10 11 11 10 9 9 9 12 12 9 9 15 13 26 28 37 33 33 44 50 53
53 59 59 57 50 50 50 53 53 44 50 59 37 33 33 21 21 10 10 9 10 8 8 8 15 18 30 33 33 37 40 40 25 26 19 15 11 11 11 11 11 23 23 41 39 50 50 50 50 53
50 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 53 53 50 50 50 47 42 42 42 47 40 42 54 68 48 57 57 48 48 50 50 50 50 57 57 57 50 54 68 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57
57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 31 31 31 43 43 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 57 68 68 68 57 57 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 59 57 57 57 57 59 68 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59
59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 57 57 48 48 48 48
41 42 41 41 59 41 41 32 36 32 37 37 36 34 41 41 31 34 39 41 41 41 59 47 43 39 32 31 39 30 39 39 41 59 47 48 48 48 48 48 48 43 44 39 39 35 39 39 37 37
36 43 43 41 44 43 41 36 37 44 44 59 47 44 44 44 41 37 41 43 47 39 36 36 39 36 39 39 44 39 39 39 37 32 39 35 39 39 37 30 30 32 37 36 36 36 59 59 41 41
41 47 47 44 44 41 37 41 41 41 41 41 27 27 11 11 11 16 22 32 31 32 30 30 30 34 32 37 31 30 17 17 17 28 30 34 34 24 28 31 31 41 41 41 41 34 34 41 41 28
24 14 14 14 22 18 31 31 39 29 11 9 9 9 9 13 14 23 23 11 11 11 17 11 19 17 17 17 24 27 27 23 24 25 24 27 33 37 22 23 12 12 11 15 15 17 28 23 19 19
23 26 15 18 16 21 18 20 21 18 12 19 13 25 32 27 26 26 23 27 28 24 25 26 28 25 25 25 30 30 12 9 8 8 8 11 20 30 28 27 21 15 12 14 13 13 14 17 17 15
15 11 20 11 11 9 21 11 10 10 11 11 10 10 10 8 10 12 21 19 20 13 13 12 11 12 11 12 14 21 10 10 10 10 10 9 11 9 9 9 11 15 12 11 11 11 11 11 9 9
8 8 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 7 6 6 6 6 8 6 8 6 6 10 10 10 8 6 6 6 6 6 7 8 8 14 11 10 10 10 10 10 17 11 11 11 15 12 9 10
8 8 8 8 6 7 12 11 12 10 11 10 10 10 9 9 10 10 9 11 13 20 23 23 27 13 11 11 10 10 10 13 10 9 9 9 10 6 6 6 6 6 7 9 10 9 10 10 12 13
22 28 12 11 8 8 6 6 8 12 16 20 12 10 10 10 11 11 13 16 15 16 15 11 10 10 9 9 9 10 11 12 22 20 19 14 13 9 9 10 10 10 8 13 14 14 14 12 15 12
12 9 9 8 8 8 8 13 10 15 21 11 11 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 8 10 10 10 9 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 3 0 3 6 6 15 12 16 12 12 18 14
18 13 11 10 9 12 14 15 13 7 9 9 9 9 12 11 9 9 9 6 13 6 6 6 6 8 9 9 10 9 9 8 8 8 6 6 6 7 13 9 9 8 8 11 11 9 9 9 11 11
12 15 14 14 6 6 6 6 6 6 8 8 7 7 6 7 6 8 11 10 6 6 6 6 6 6 10 11 12 15 20 19 19 13 11 10 9 9 9 7 7 10 8 8 8 12 12 7 8 8
8 8 6 8 3 0 3 8 3 0 3 0 3 3 0 3 8 3 0 3 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 11 15 12 |
|---|
