BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-368N21.T7 (MSMg01no368_n21.b1) | MSMg01-368N21.TJ (MSMg01no368_n21.g1) |
ACC | AG475991 | AG475992 |
length | 761 | 764 |
length of high quality (start - end) | 501 (47 - 547) | 451 (69 - 519) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no368_n21.b1 PHD_FILE: MSMg01no368_n21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:06:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no368_n21.g1 PHD_FILE: MSMg01no368_n21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:06:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCCTAATTTTTCCAGACTTTTATCATAAATGGGTGTTGGATTTTGT
CAAACGCTTTCTCCGCATCTAACAAGATGATCATGTGGTTTATGTCTTTG
AGTTTGTTTATATAGTGGATTACGTTGATGGATCTCCACATATTAAACCA
ACCCTGCATCCCTGGAATGAAGCCTACTTGATCATAATCGATCATCATTT
TGATGTTCTTGGATTCGGTTAGTGAAAATTTTATTGAGTATTTTTGCATC
GATATTCATAAGGGAAATTGGTCTGAAGTTCTTTTTCTGTGTTGGGTCTG
TATGTGGTTTAACTATCAGAGTAATTGTTGCTTCATAGAATGAATTGGGT
AAAGTACCTTCTGTTTCTATTTTGTAGAATAGTTTGAGGAGAATTGGAAT
TATGTCTTCTTTGAAGGTCTGAGATAACTCTGCACTAAACCCATGTGGCC
CTGGGCTTTTTTTGGTTGGGAGACTATTAATGATTACTTCTGTTTCTTTA
GGAGATATGGGACTGTTTAGATAATTAACCTGATCCTGATTTAATTTTTG
GACCTGGNATCTGTCTAGGAATTTATCACTTCTTCCCGTTTTTCCAGGTT
TGTGAGGATAGCCCTTGTAATAAGAACTAAGATGGTTTGGATTCCCCCGG
GTCTTTTTCGATGTCCCCCCTTTTAATTCGGAATTTGTAAGGCCCCCCAA
TTTTCTTTTTG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCTCCACAAAGGCTTCCCCTCCTAAAGAAT
GCATAACTTCTCCAGTGTCGCCAATTGAAAACCAAGCAATCAAGTACACG
AACACATAGGAGCTTTATTATTCAAACCACAACAGTATGAGACTGACATG
ATCCATAACTTGTCTGCCTGAATGAAGAGAGATTAATTTACACCAGGGAA
GTTCGGTAGCAAACGTGTGGAGCTTTAAAACGACATAAAATTCACAATAA
TGCAATATTGTTTTAAAGTGTACCAACTATGAGATCAGAGCCCATAAGGC
TGAGTCTTACCTTGACAGCTGATCTGAAGGTGAGCTGAGGCAAAACAATG
CCGACAAAGGCTCCAACAGTTACCCTGCTGCTGGAGGCAGCTCAGGATGA
GAGCCATACAAATACCACGTTACTAAGAATAATACTAATTCTACATTAAA
CCCTTCAGACTGTACTTTAAATCTGAAATCATAAAAACAAGTATAAGAAA
AAGTCAAAAGAAAATGTTCATTTATATAATAAACCCAAATTTCATTTTCA
ACTTACAAAATACATCATGGCATATTTAACCAATCAATCATGTCTTGGTA
AATGTTTAAAATTTACTGTTAGCCCCAGAAATAAAGCTTCATTGCCACTA
AAAAATCTAAACGGAAAATTCCGTAACTTTTTGTTAGCCAACCGAGGAAA
TATAGCCTTTGGAG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 8 7 7 7 10 25 32 27 25 12 11 11 19 27 28 32 31 32 37 37 47 41 22 19 14 14 16 19 21 9 9 9 12 10 9 9 11 9 9 10 17 19 24 37 41 59
36 36 36 36 50 50 57 57 57 57 57 35 34 30 26 23 11 11 10 19 28 39 48 48 54 42 47 42 47 47 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51
50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 41 38 34 28 17 17 18 41 41 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 50 68 68 68 68 53 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 50 50 53 50 50
50 50 59 59 59 50 50 50 47 47 59 59 43 41 37 41 43 59 47 59 59 47 47 40 37 37 47 41 41 39 59 47 47 47 59 41 37 37 43 41 41 43 59 47 41 32 29 29 29 23
30 34 32 32 43 43 47 59 59 59 59 59 39 36 32 32 32 35 32 34 33 37 33 39 39 41 39 41 34 37 39 39 35 31 31 39 39 34 34 36 37 30 22 22 19 23 22 19 19 14
12 13 11 11 11 12 12 21 15 18 20 19 20 20 22 15 12 12 10 11 11 16 11 19 18 12 12 12 12 12 28 28 30 28 24 24 28 17 17 11 9 8 8 11 10 11 19 8 8 8
8 11 14 15 14 14 3 0 3 15 14 15 10 10 10 10 10 9 9 10 11 22 21 12 9 9 8 8 8 9 9 9 12 11 14 13 9 9 9 11 19 20 13 13 10 11 10 10 10 10
10 13 11 10 10 8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 10 10 10 8 9 7 7 8 10 8 8 8 8 8 10 8 6 6 7 8 10 17 19 14 14 11 17 10 10 10 9 14 7 6 6
6 9 10 10 8 17 9 8 7 7 9 9 9 9 9 13 12 19 11 16 18 19 22 26 14 10 9 10 9 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 16 16 14 8 10 8
9 9 7 8 6 6 15 19 13 10 10 | Open.Hide. 8 8 9 10 11 9 10 10 26 26 37 39 39 39 39 37 37 37 32 31 37 37 32 27 27 10 9 9 8 8 6 6 6 8 15 19 30 37 37 37 41 33 36 36 36 36 42 44 48 48
48 44 41 30 24 32 29 39 36 37 37 43 36 42 36 36 41 42 54 68 68 68 50 50 41 41 41 41 48 51 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 50 50 47 47 44 44 44 39 37 39 39 39 41
37 37 37 37 37 37 39 44 44 37 37 44 44 39 41 42 42 42 48 48 50 50 37 37 37 37 37 32 37 41 44 44 59 59 50 50 50 50 50 50 50 47 59 47 41 41 43 37 37 44
37 37 39 41 39 39 25 25 17 28 28 20 20 23 34 22 18 9 9 9 9 19 19 16 9 9 9 9 17 15 25 25 29 29 39 30 34 28 24 24 32 30 30 33 30 10 9 9 9 9
9 16 19 10 6 6 6 7 8 9 11 11 11 12 22 22 20 20 25 25 19 28 20 20 20 15 12 12 12 12 11 21 19 19 21 14 16 16 24 19 18 18 16 16 16 30 25 15 14 12
10 13 13 17 12 12 10 16 16 11 11 11 12 12 19 13 18 14 19 12 12 11 11 13 16 26 25 15 10 14 8 8 9 15 9 9 9 10 9 9 9 9 9 9 8 8 10 10 10 9
15 11 11 9 9 9 11 11 13 9 10 10 17 16 18 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 9 9 9 12 11 10 11 10 8 10 8 8 8 8 12 6 6 6 6 6
6 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 12 12 12 9 8 8 10 8 8 8 10 9 9 7 8 7 7 7 8 10
8 8 8 7 7 8 8 8 7 6 6 6 8 6 |