BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-372B15.T7 (MSMg01no372_b15.b1) | MSMg01-372B15.TJ (MSMg01no372_b15.g1) |
ACC | AG478444 | AG478445 |
length | 740 | 745 |
length of high quality (start - end) | 550 (42 - 591) | 498 (70 - 567) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no372_b15.b1 PHD_FILE: MSMg01no372_b15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:10:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no372_b15.g1 PHD_FILE: MSMg01no372_b15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:10:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CCTGCTTTCACTACTTTTGATGAACGATTGAAATGTGTCATATTACAGTG
TGAATGAAATAATCTTTTTCCTTCCCAAGTTGTTTTAGCTTATGGTGCTG
TTTATGACAAATAGTAACTGTAATTAAGACAAACTGGAACCAGGAGTAAG
ATAGTATTGTGTCACACTTAACAATGTTGTTCTTTGGAGTATGGTGAAAG
CCCTGGAAAATACACTGAGTGTTAAAGACCCAGTGACCTGGTCTGCATGA
ACTTGGACAGCATTATTGTTGAGAGCAGTAAAGAAACTGAAGGACTGGCT
TGCTTGTGATGTTTCAGAGGGATGCTCAGATGTTACTGAATCATTTATTT
AAAGAATTGTGGTGTCTTGAGAAGGAACTAAAAAAAATCACATGAAATTA
ACAAGAGACAATAACCCACTGCAATATAACATTTTTTTTATTTTTATTTT
TGGCTGGGACAAGGAATGCTGGTCAACTAGAGTTGAAGAATGAGCTGTCA
TTAAGACCAGCATCATCAAATTGAAATATTTTGGGAAGTACACAGAAGAG
TCAGTGCACAGAAGTTGTGTTCCAGAGGCAGCTGATATTATAATTTTTGC
TGGCACATGAACTTGGTAATATAAAAGTCACCCAGGTTGTAATGATTTGT
AAGTATGACGGGATCTGCTGAAGCTTCCCCTGTATACCAA
| GXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGGCCTGTATCCCATTTTTCATAG
TGTTATTTCTAATATCTGTTGGGATAGGGGTTCTCTATAACTTAATGCAT
TAACTTTCTGTCTCTTACTTTCTTGCATTTAAGATTAAGGCCTAAATTTC
TTTATTCCCCCATTCATGTTTAAAAGCATTTAAAGCAATTACCATTTTTT
TCCTTCTATGCTTGAACAGATAGCATTTTCTTGACTTGTATTTTTCCCTG
CTAAGGAAATTAATATCTCTTAATTATTATTTGTTGAGATAGTATTTCTC
CCTATTTCCATGACTTTGTTTCCTCCATTTGAGATAAATTCCCTAATCTC
CCCTAAAACGGCCATACAACTCCAGTAAGTTATATGTTTTCTTGACCACA
TAGAAAATGGCAATGTCAGAAAACATTACATTGCTTTAACCAATACACAC
AGCAAGACACTGAACCATTCCTACAGTCCCAACAAGTGGCACAAGTGATA
GAGGAAACTAATACAGTCTCAAACAATAACCAAAAAAAAAAAACCCCCAA
AACAAAAACTAAAACAAACAATTAGCATATCCCTTAACAGTAAAAGTAAA
AAAAAAATTAAAATATTTGAGCTGACAAACCATCATAAAATTCCCACTTG
AACCATAATTGAAAGAAAGGGAATTGGGAACATCCCACAAAAAAA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 25 25 23 23 29 27 31 21 25 11 11 12 16 16 26 33 59 30 30 27 19 18 9 9 9 17 12 11 11 11 13 13 16 16 23 25 29 30 39 39 39 23 17 17 21 29
25 27 27 10 10 10 12 15 10 11 16 30 39 39 39 46 46 37 41 41 47 47 53 57 57 57 57 57 57 57 50 40 40 47 47 47 53 53 50 68 68 68 68 51 47 42 42 42 47 59
68 68 68 68 54 54 54 54 57 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 51 50 47 57 48 50 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 41 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 48 39 30 23 15 12 11 10 10 10 10 10 25 30 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 43 46 46 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59
59 59 59 59 59 54 54 54 54 57 54 59 54 50 50 48 57 57 59 57 68 57 57 57 57 47 47 39 43 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 59 59 59
57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 57 52 52 52 59 59 59 52 47 42 43 43 52 57 59 59 59 59 57 57 52 52 43 50 43 57 57 59 57 48
48 50 50 54 57 57 57 57 54 54 54 59 57 59 48 57 48 54 59 57 57 54 54 54 57 59 68 57 57 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 59 57 43 43 39 43 43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 47 47 37 36 25 30 30 30 30 20 19 30 30 33 33 28 34 28 28 22 29 34 37 47 47 41 41 41 46 41 43
43 39 31 24 32 20 26 24 28 28 30 33 33 30 23 23 14 14 14 28 30 39 41 32 32 41 39 41 41 44 41 41 34 32 39 30 19 12 12 12 19 19 24 15 12 12 14 18 14 16
18 19 19 16 24 24 16 15 15 18 18 34 28 25 22 22 24 30 30 33 30 26 18 14 14 15 18 19 18 13 8 8 8 15 10 16 15 25 24 28 28 22 24 24 18 21 21 19 18 25
17 12 9 9 9 13 13 15 19 13 12 12 12 18 13 10 11 13 11 16 25 34 29 34 18 17 11 11 10 8 10 10 10 10 11 11 11 10 10 11 19 15 8 8 10 15 13 13 15 15
13 15 12 12 12 12 11 11 13 12 14 11 14 12 12 12 20 27 27 27 17 20 14 12 12 17 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 8 6 7 6 6 8 12 15 11 11 20 25 25 39 39 39 36 37 44 21 27 20 15 12 11 10 10 18 18 11 11 11 19 21 32 41 39 37 39 31 33 31 37 33 33 41 41
25 25 11 12 11 12 19 20 25 30 30 46 46 29 28 30 30 36 36 59 59 59 59 57 57 57 57 50 48 48 48 50 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 42 41 41 41 36 42 44
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 47 48 48 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 57 57 57 57 68 68 59 59
57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 59 57 57 57 68 57 57 54 54 46 46 43 47 43 43 43 48 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 46 48 48 48 48 43 47 47 47 39 39 39 43 39 39 43 43 46
46 46 59 59 59 59 46 41 41 41 41 28 24 24 24 24 29 59 41 41 46 37 37 32 37 35 47 43 43 43 37 37 37 37 37 32 26 20 17 23 23 37 37 37 36 36 36 39 39 40
39 41 41 41 41 37 41 41 41 32 37 30 30 19 19 15 15 13 17 10 10 10 10 14 16 30 32 25 22 23 18 20 22 30 25 22 11 11 11 19 22 20 16 13 12 9 8 8 8 9
13 22 18 16 12 13 11 15 13 16 17 28 28 39 28 28 19 19 15 12 9 9 7 7 8 7 8 8 18 20 13 10 10 9 8 8 8 8 8 10 14 12 13 17 16 12 17 12 9 11
12 16 16 20 16 16 13 9 10 8 9 9 11 10 9 9 13 13 19 14 11 18 11 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 14 11 11 11 23 18 16 9 10 12 8 8 8
10 10 10 11 11 11 11 15 10 10 6 6 6 6 13 11 16 19 17 15 8 8 8 8 8 8 9 10 10 15 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 |