BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-389K01.T7 (MSMg01no389_k01.b1) | MSMg01-389K01.TJ (MSMg01no389_k01.g1) |
ACC | AG491837 | AG491838 |
length | 867 | 754 |
length of high quality (start - end) | 77 (82 - 158) | 415 (82 - 496) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no389_k01.b1 PHD_FILE: MSMg01no389_k01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:33:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no389_k01.g1 PHD_FILE: MSMg01no389_k01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:33:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCAATTATAACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATTCCCAGAGGATCC
GCGGAATTCCTGTCCTTCCCCAGGCCAGTCACCTAACTTCCCTAGTTCCC
TCCAGTGTGTGGAGAGGATTAATGGTGTAAGAGCTGTAAGGTGCTTATGA
CCCAAACACAAGAAAATCATCACAACAGCATTCTGGTTTAGTTATGGCAT
GCAAAGCATGAGATGAAATAAAAGGCCCACTTAGCCCTGTATCTGTGGCT
TGGGGTCTTTGCTGAAGTTATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGCGCG
TGTGTGCCCGCCTCCCCCCCCCTCTTTTTCCCNCCCCNCCNCCCCCCCCC
CCCCTCCCCGNCCTTCTTTCTTCCTCCCTCCCCTCCTCCCGCGGCCCGCC
CTCCCTCCCTTCCTCCCCCCTCCCCCCCTTCCTCCCTCCTCCCCCCCCCT
CCCTCCCCCCTTTCCCCCCTCCCTCCCCTTCCCCCCTCCTTCCCTCCTCC
CCTCCTCCTCCCCCCTCCTTCCCCCTCCTTCCCTTCCCCCCCTCCTTCCT
TATCGTCCCCCGCTCCCCCCCCCTCCCTTNTCCCCCCCACTCTCCCTTTC
CACTTTCCTTCCCCCTCCCCCCCCCTTCTCTTCTCCTCCCTCCCCCCTTT
TTCCCCTTTTGCCCCCTTCCCTCCCCTCCTTCCTCCTCTTTCCCCTCCGC
CCTTTCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTTTCCCCTCCCTTTCCCT
CCCCCTTCCTTTCCTCCCCATTCCCCTTACCTTCCCCCTTCCCTCATCCC
TTCCTCCTCTCCCCTCCTCCCCTTTTCTCTTCCCTTCCTCCCCCCTCTCC
CTCCTCCCCCCCTTTTT
| NNCCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAGATTGCCTAGACAATAG
TGTAAGATTCTGTCTCACAACAACCTGGAATTATAGATGGCTGTGAGCTG
CAGGGTAGGGGTTGGGAGTCCTCTACAAGAGCGGCCAGTGCTCATAAGCA
TGAAGCTACCTCGTGGGCATCACCACCCTTCTGGTCTAAAATGGCAGTAC
TTACCAGTTCCCAGAGAGGAGTGGAAGAAAGCAGACATTTTGACAGATTC
AGAAGTGGAGTTTTGCCAGGCATGTGGAAAGAATGACCAGTGGGACAGGG
GTGTGCAAGAATCTGACAAGAGAAGTTAACGTGATGACACTGGCAACTAG
ACTGGGTCTAGCCTCAGGTCACTGTGTGAAGATGAGCAAGGTGCTAAGGG
GATCGTGGACTGCTTGAGGGATTAGAGATTCATTAAACAGAAGAACGCTC
AGAGAATAACAGATTTTGGGGCTTGAGTAACTCACACAGCAGACCCGGGA
ATGTCCAGAAGGATAAAGACCCAGAAGCTATAGTTCCTACCCTTACAGCA
AAATGAGATGAGAAGACCTCCTAACCCTAACGAAAGGCTAGTAAGCGAAC
GCGTGGAAAGCTCAACGGGCTATTAGTACTGGCCTGCTCTTACTGAGGAA
CCTGGGTTCGCCTCCCCTCCACCCACCCTTGCCCCTGACACCCCCCCCGT
TACG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 8 11 11 8 8 9 11 11 21 15 11 11 10 9 9 9 9 21 16 33 30 28 18 17 9 9 9 14 12 12 7 6 9 8 8 8 10 11 11 13 13 18 21 17 13
11 11 12 15 27 23 26 11 11 12 21 27 12 9 9 9 11 11 8 8 8 8 8 9 13 13 16 10 23 12 12 12 26 28 36 36 28 28 33 27 28 24 24 13 30 28 44 37 37 44
32 29 22 28 24 34 36 35 35 35 39 39 32 39 39 20 20 17 20 20 28 31 34 22 21 22 23 23 32 32 43 36 30 30 30 30 30 32 28 28 28 23 23 15 15 28 32 29 37 37
32 27 27 30 24 25 16 16 14 14 12 24 18 18 15 21 21 29 29 29 16 13 9 9 9 10 10 9 10 13 16 24 30 29 24 20 20 18 28 22 22 21 21 26 26 13 10 10 10 19
19 19 20 20 24 28 20 23 18 25 23 11 11 22 24 33 26 22 12 11 11 12 27 18 20 22 27 15 11 11 11 18 12 12 8 6 6 8 8 9 11 18 18 24 15 30 25 24 11 11
15 17 12 13 12 19 15 21 24 30 32 37 34 28 24 18 14 14 15 24 23 28 30 41 41 41 41 32 37 21 23 13 18 18 18 13 12 12 13 25 25 18 18 10 8 8 12 12 13 9
11 12 13 8 8 6 6 8 8 15 14 13 11 11 18 22 19 22 10 10 10 8 9 10 10 10 13 13 11 12 11 3 0 3 12 12 3 0 3 3 0 3 18 18 25 19 19 18 20 18
19 13 22 8 10 12 15 10 8 3 0 3 15 9 9 10 10 8 6 6 6 8 15 10 14 11 13 21 10 8 8 8 7 8 7 8 9 9 10 8 8 8 8 8 10 12 11 9 8 9
8 12 13 22 20 22 21 23 28 20 15 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 13 23 23 14 14 11 27 15 10 9 9 9 9 13 10 16 13 20 12 14 18 21 32 31 31 24 16 17 11
9 9 9 11 12 13 8 10 11 11 15 14 17 10 9 9 8 9 8 10 10 15 11 11 14 12 16 10 10 10 13 12 12 11 10 9 8 10 15 18 18 10 9 9 9 12 12 30 22 20
19 24 12 12 11 9 12 10 8 8 8 8 7 10 9 9 11 13 30 34 34 30 25 15 14 18 21 17 12 10 10 16 13 27 22 19 19 19 22 23 17 12 13 11 10 10 10 10 10 10
10 10 11 9 9 9 16 21 15 15 10 8 8 7 6 9 9 18 18 9 9 9 9 8 10 9 6 8 3 0 3 8 8 17 22 15 18 11 12 9 6 6 6 6 9 7 13 19 12 12
9 9 9 10 10 12 17 9 13 9 9 7 8 8 8 6 8 9 9 9 16 30 27 21 17 10 10 10 16 11 12 19 10 8 8 8 8 8 17 8 15 13 12 20 18 10 13 10 10 9
10 10 10 17 18 10 15 7 9 9 9 6 9 9 9 10 8 8 10 11 8 10 10 17 17 12 9 9 9 9 8 17 10 10 10 10 15 31 35 32 14 11 11 9 9 6 6 6 6 9
17 10 19 19 16 13 17 16 12 15 9 9 9 13 14 28 15 12 11 11 11 10 10 10 10 14 18 11 11 11 10 10 11 20 14 18 16 16 12 11 9 16 10 10 19 10 10 13 11 24
24 31 20 24 15 15 15 13 16 16 12 15 22 18 18 16 8 8 6 6 8 7 9 9 8 8 8 8 6 6 7 6 8 7 10 10 10 9 9 12 12 12 7 7 6 7 8 8 8 12
9 8 10 9 9 14 10 10 9 9 9 15 11 9 10 10 15 26 13 14 14 11 11 14 16 17 11 11 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 8 8 9 10 8 12 8 10 10 10 9 13
9 8 9 9 10 9 10 11 11 10 17 13 11 10 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 7 6 6 7 10 12 11 10 10 10 16 17 31 39 37 37 32 29 21 25 18 19 18 3 0 3 3 0 3 27 27 25 23 18 9 9 9 10 11 9 9 10 12 12 19 18 18
18 18 30 27 36 36 36 36 36 33 59 40 37 37 37 27 23 8 8 6 8 8 8 12 12 11 18 23 23 33 24 28 19 32 32 47 53 50 59 59 57 48 42 42 22 22 28 42 43 59
59 59 68 68 68 68 68 46 46 47 48 41 48 31 42 28 28 28 37 37 47 47 47 47 57 57 48 48 50 50 50 50 50 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57
48 48 47 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 52 52 57 57 50 57 52 43 43 43 43 52 43 43 44 43 52 52 57 59 57 59 52 54 54 59 59 59 57 57 57
57 68 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 45 57 59 59 68 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 43 43 43 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 59 68 57 57 54 54 54 57 44 44 32
28 28 44 44 59 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 43 43 43 57 50 54 57 54 57 44 32 19 18 15 15 16 16 24 32 30 42 32 40 42 48 59 57 57 54 57 57 57 57 57
57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 48 48 48 57 44 46 39 39 32 37 32 35 35 37 39 46 57 57 59 59 54 48 48 47 47 47 59 43 43 36 43 43 39 39 40 43 39 59 39 39
39 47 47 37 59 59 34 34 34 39 35 31 31 39 41 37 39 37 37 37 37 37 47 46 57 48 48 48 59 48 48 48 43 43 43 43 43 47 43 48 48 57 48 48 48 48 48 48 59 41
41 40 39 37 32 30 25 24 34 37 37 41 46 46 39 43 43 43 37 37 30 24 24 21 22 28 32 28 26 22 14 14 12 25 25 37 37 30 30 24 24 20 32 21 25 18 26 24 20 15
12 12 21 23 18 9 9 9 13 16 30 30 37 37 35 33 33 32 32 37 43 59 35 37 32 32 28 20 18 19 24 32 13 21 11 12 11 15 15 24 21 11 11 16 16 20 24 18 15 25
23 23 14 12 14 14 12 15 15 15 17 17 21 15 14 14 9 16 13 9 9 10 8 10 22 12 12 15 30 30 43 37 33 25 25 25 30 30 17 18 9 8 8 11 13 8 19 21 22 18
16 19 17 19 17 17 20 24 28 24 13 13 16 12 9 8 8 8 8 10 16 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 11 13 9 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8
9 10 9 9 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 11 16 12 12 11 11 11 11 12 11 8 8 8 10 8 8 9 10 10 9 10 11 12 11 9 10 8 8 8 8 6
8 8 8 6 7 8 8 8 8 10 15 15 19 14 11 10 9 8 8 8 8 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 9 10 18 12 14 12 10 10 8 8 8 13 16 16 8 8 6 6 6
8 8 6 6 |