BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-391E09.T7 (MSMg01no391_e09.b1) | MSMg01-391E09.TJ (MSMg01no391_e09.g1) |
ACC | AG493086 | AG493087 |
length | 769 | 853 |
length of high quality (start - end) | 334 (70 - 403) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_e09.b1 PHD_FILE: MSMg01no391_e09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_e09.g1 PHD_FILE: MSMg01no391_e09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:26 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCACCAAATCCCCGGAATTCTACT
ACATTTTGCGTTAATTTTCAATATAATGCCAGCCTTCAGGATTGGAGAAA
GATCTACCAATATTTGAAAGAAAATTCTACTGTCAGAAAAAATAATAAAC
AATTACAATAACAAGTGCTGGACACATTTAAAAATAATTTCATCTGACAG
TACGTCTGGTGTTTCTCAAATATTAGCTGATAAATTGTCAGGCATGGATC
CTAAAACTTGACTACAGAGTGTAACTTACTGCAGTTGGAGAAGCCACTCT
TGCTTTACTTATTTTTATTCTTCTAATTGGCATTGTTGGACTAGCTAAAT
ATCAATGTTGCTTTCATAAGCACAATTTGAAAGTGTGGTCCTTGTAGGAA
AATCTTCTACAAACTAAATTAAAACAATATAAAAGGAAGAAACTTTAGAG
AAATGGCATGAGGTAACTGTGCCCAGCCTGCCTACTGTGAGGTGACTTAA
GAATATATGTAAATCCCACGACACTGGACCACTGAGAAAACATATACTTT
CCCCCCCCACAAGCCTGATGTTCCTGCCCAGCAAGTTGCGCGCCCGAAAA
AAGACCTCCCTGGCCCTTTCCTCGTGAGAAACCACCTTGGTTTCTCTCAC
CACATCCCCCTCTAAAAAATTTGATTGCCCAAAACGCCTTACTCCCCACC
GAAGTTTTTCCCCCCCCCCCCTCCTTCCCCACAAACAAAAATACCCTCTC
AAATCATACCCCTTGGCAC
| TCCGAAGATAGGGGTAGCCTGGCGGCGCCTGTTCACAACTTTAGGTGAAC
TATAGATTTACCAAAACATTCTTTGGNGNGNGTGTGTGTGTGTGCGCGTG
CCTCAACACAACTAAACCAACTTACCCACTACATAACAAAAACCCAAAAC
CTCACTTTTTCCTCGCGGGGGGGCTTATTATACCCTACTTACTCCCCCCA
AACCCCTCCCCCCCCCCTCCACATCTCCTCCCCTCCCCTCTCTCCATTTT
CTTCTCTTCAAACAAAAATCAAACCACTAAAACACTACTTACTCTCATCC
CCAACACCCCACAACAACCCCCTTCTTAATACTTTCAACAAAAAAAACCC
AGCCACCAAAAAACCACATTCTCTCTTTCTCCTTTCCTTTACCTCCTACC
AAATTAACCATACACCACCCCCAATCCCACACTTCACACCAACAATAATA
CAATAAACTAACAAACAAAAACCAACCCATTTTTAATTCCACAGAAATTC
ACCCCGTACCCCCTTACCCCTCTCCCCCAAATATTATTACCCTCATAACA
CCCTATAACATTTCCAAAATTACTATAAAATAAAACCATATATTCCCATC
TCCCCATTTATCACACTACCACTATCCCATATAATATCATTACCTACCCA
TTCCACCACCTTCTCCCACCCTCCATCTCCCTTCCTTTCACCCTCTCCCC
TACCCTTACAATCCACTCATNCCATTTAACCACCTCAAAAAATAACCCAA
ACAATCATCAAATCCCCCCACCCCCAACCTACTTATCCCACCTCCATTTA
CATATACTCTTCCCCCCCCACAACACACTTCTCTAAATCTAACCAAACAA
ATT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 15 16 11 15 15 17 11 11 10 21 21 21 21 10 13 15 8 10 14 15 11 10 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 11 12 12 11 11 12 17 25 37 30 31 35 22 17
10 10 10 11 14 12 11 11 12 12 11 11 12 12 15 17 19 18 12 12 12 28 34 59 41 39 39 28 26 16 19 15 25 18 22 22 19 11 11 22 26 36 38 53 59 59 59 59 59 57
53 43 43 36 36 36 39 39 48 48 43 59 43 48 43 43 42 43 48 48 48 47 47 41 27 27 21 25 25 32 32 36 25 16 11 11 24 34 42 47 47 48 50 48 48 57 57 48 44 37
37 35 48 30 30 14 14 14 32 30 46 43 43 43 43 43 43 42 42 35 43 43 43 43 43 43 43 50 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 28 28 28 43 43 52 44 36 32 27
44 44 52 52 52 52 50 52 59 59 59 57 50 59 44 44 43 29 29 43 44 57 44 57 44 44 23 43 44 57 57 57 57 57 57 57 42 44 32 28 28 36 27 24 24 15 15 22 32 42
57 57 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 32 32 18 17 17 30 30 48 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 57 54 54 54 57 57 59 59 57 57 47 40 40 39 48 57 48 48
48 59 59 48 48 48 48 34 34 30 20 18 10 8 6 7 7 9 18 37 37 39 47 47 47 48 43 48 39 39 35 39 39 39 59 59 59 57 57 57 43 48 25 25 12 24 24 31 31 42
43 37 30 30 31 33 39 43 43 47 57 57 42 43 30 30 21 25 21 30 18 21 16 19 17 27 32 59 59 59 43 43 35 35 32 37 30 30 24 24 30 30 32 24 28 20 25 25 28 28
34 25 23 12 12 12 11 11 11 11 11 11 13 15 21 14 20 22 28 34 39 27 23 11 12 12 28 30 48 59 59 48 48 48 48 37 30 18 12 12 22 22 30 33 20 27 15 15 11 16
16 32 28 24 9 9 10 13 15 23 30 21 21 13 12 17 18 23 14 21 21 17 19 11 11 11 13 12 16 12 14 9 12 15 15 22 16 23 23 21 16 10 10 10 17 16 24 15 16 11
11 11 16 21 35 28 22 25 19 18 15 19 22 30 21 19 11 9 9 8 8 8 8 8 10 9 11 12 12 10 10 11 13 15 9 9 9 16 10 9 9 9 9 11 9 9 10 14 11 11
11 9 9 9 10 12 12 10 10 9 10 9 9 9 10 9 10 10 12 12 23 11 11 11 11 13 13 13 11 11 10 8 7 7 8 7 8 8 8 8 8 8 7 8 8 9 11 20 20 18
14 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 19 17 24 17 15 13 10 11 11 12 12 11 11 8 8 8 10 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 9 6 8 6 6 8 15 15 8 8 8 8 8 8 10 10 9 10 9 9 9 9 9 8 8 10 10 11 8 8 8 8 16 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 12 8 8 7 7 7
6 8 8 11 10 12 10 12 13 16 18 25 25 33 30 28 28 20 12 13 10 9 9 9 11 11 11 10 15 8 8 8 8 10 11 11 11 16 11 14 11 11 10 9 13 8 8 8 8 9
11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 16 17 22 10 10 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 8 6 6 6 8 8 8 7 7 7 7 9 8 8 8 14 13 25 37 37 39 25 25 23 23 19 12 10 11 11 9 10 7 9 9 9 8 7 6 8 9 11 12 24 25 25 21 13 16
28 25 25 21 9 9 8 8 8 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 14 30 30 28 25 27 3 0 3 0 3 0 3 22 22 36 35 37 28 28 20 20 14 12 10 8 8 8 10 11 11
9 8 8 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 7 8 8 8 8 8 10 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 10 8 8 6 6
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 7 11 9 9 9 13 11 9 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 13 14 7 8 7 9
10 10 8 12 8 8 10 17 9 9 10 10 11 16 16 9 13 12 12 15 15 10 6 6 6 6 8 8 8 8 9 14 24 24 17 13 16 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9
7 6 8 8 9 8 8 8 8 10 12 14 6 6 8 8 7 7 7 7 12 9 10 8 9 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 12 7 11
10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 12 16 11 11 9 9 8 8 8 8 9 9 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 13 9 9 9 10 10 8 8
9 9 6 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 12 13 13 11 11 10 10 10 10 10 8 10 8 9 6 6 6 6 8 8
16 18 10 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 7 10 8 8 6 6 6 7 10 13 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 11 10 13 13 10 8 8 6
6 8 8 8 8 10 9 11 11 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 12 12 12 10 8 8 8 7 8 8 10 12 15 12 9 8 8 8 8 7 7 6 10 8 8 8 8
8 8 8 13 9 9 9 9 10 9 11 11 16 10 12 12 11 10 8 10 8 8 8 9 9 9 10 10 8 11 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 7 8 7 6 10 8 8 8 17
8 8 8 8 8 10 10 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 8 8 6 6 8 6 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 10 10 10
10 10 8 10 8 7 7 8 11 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 10 10 10 8 8 8 11 9 8 10 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 9 11 11 10 12 9 9
12 9 8 10 10 10 8 7 6 7 12 8 8 8 10 10 9 7 7 10 8 9 8 8 8 8 8 8 13 13 13 13 12 12 10 9 9 9 9 9 10 8 8 13 8 8 6 7 6 6
6 8 6 9 8 8 8 8 8 12 8 8 8 9 9 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 12 8 8 8 8 10 6 6 7 7 10 13 23 19 14 12 15 15 8 8 8 12 16 14 8
8 8 8 8 8 10 10 15 10 8 8 6 6 8 8 9 11 8 12 8 8 8 10 11 6 6 8 8 10 11 17 10 9 9 9 8 8 10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 15 11 11
11 18 16 10 10 10 9 9 8 10 10 10 11 8 13 10 9 12 8 8 8 8 7 6 8 8 10 12 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 12 12 10 12 10 10 8 8
9 9 9 |