BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392P13.T7 (MSMg01no392_p13.b1) | MSMg01-392P13.TJ (MSMg01no392_p13.g1) |
ACC | AG494381 | AG494382 |
length | 798 | 786 |
length of high quality (start - end) | 90 (81 - 170) | 245 (72 - 316) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_p13.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_p13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_p13.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_p13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNAATCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCGCACCCCACCG
CGGAATTCTGGGCTACCCCCCCCGCACGGCAAAATAGAAAAGACCTAAGA
ATAGGCACATACAGTATTTTAGTTCACTTCATTTGTTTTGGATTGTTTTG
GTGTGATGTTGAGTTTTGTGGTTAGGGGAGGCCTCTCGGAGAGTGTGGGC
CTGTGCACCCCACCCCTCCCCCGCACACCCCCGCTCCGGTCCGCCGCGAT
TTTTTTTTCCCAGGGACGCACGCCGCCACAGCGCGGACACCCCCTCCCTC
TCCCCCCGACGGGACCACTCTCCCTCCATTCCCCGCCNCCCCCGAAACCC
CCGCCCCCCGCCTTCTCCCCCCCCCCCTCCCCACGGGCCCGCCACCCCCC
TTCGTTATTTTGTGTCCCCACACCCCCCCCCAATGATGGAATGATAATAA
TTACCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCACATCCCCCCCCCCCCCTCACCT
CCCCCCCCCCCCCTTCCCCCCCCCCCCTCTTCTCACCCCCCCCCCACCCC
CCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCTTATTCACTACCCCCCCTCCCACTC
CCCCCCCCCCCCCTCTCCCCCCCCTCCTACTTCCTCCCCCCCCCCTCCCC
CGTCCTCCCCTCCCACCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCGCCCACTCCCCCC
CCCCTCCCCCCCCTTACCCCCCCCCCCACCCCACCCCTTCCCCCCCCCCC
CCCCCCCTCCTTTCACCCCCTTCCCGCTCTATCTCCCCCCCNCTCCCC
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGTTACTGTTTTCCTGTTGGTCCATTGT
GTCCTTTGGATAGTGGCACCTGCTTTATCAGTGTTGTACATTTTAGGTTG
TCAGCACCAGATAGGAAAAGAATGCCATCCATCATTAAGTAAGAGGCATG
GTGGTTCACACCTTCAATCCCAGCACTTGGGAGGCAAAAGCAGGGAGATT
TCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGGGTTCCAGAATGGCCAG
GGCTCCCCCCAAAAACCTTTTATGGTGGCTTTCTTTGGTGGATGAGTGTG
CGATTTGAATGTGTTCCCCAAATGCCTGCGCTGTCCCCCAAGCCCGCCTG
CATCCCCTTACTCCCAGCTTGCGCGAATTTGTTTATAATTCCCCTTCATC
CCCTCGTCCGTCTCCACTTCCTTCTTTTCCCTCTTCCACCCTTTCCCCTG
TAACCCCAGCAAAACCCTCCTTTCCCTCCTCCCCCTCTTCCCTCTTTCCC
TCTTTTCCCTCCTCTTCCTCCCCCCCCCCCCTTTCCCCCGCTTTTCTTCT
TTTTCCTCCCTCCCCTTTCTTTTTTCTCTTCTTCTCGCCTTTTCTCCCCC
CCCTTTTCCTTTTCCCCCTATGACTCTTGTTCCCTCCCTTTTCCCCCTCC
CACTTCCTTCTTTTCTTCCCCTCTTCCTTCCTCCCCCCTTTTCTTTCCCC
TCCCCTCTCCCGCTTCCCTTTCCTTTTTTTCCCTCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 7 6 7 8 8 8 8 9 11 23 39 39 39 23 20 11 17 18 19 8 8 3 0 3 8 8 9 8 10 10 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 13 8 8 12 19 25 23
33 36 27 33 33 23 23 11 11 11 11 9 9 9 12 12 16 14 18 19 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 15 18 34 34 41 41 37 50 47 59 41 37 25 25 14 15 12 27 21 33
33 33 33 33 37 21 21 15 16 15 23 11 11 11 21 25 59 59 59 39 32 18 13 10 10 10 10 11 11 11 11 11 23 23 34 41 39 39 39 37 37 37 37 37 30 37 37 44 44 50
47 39 43 34 34 34 34 33 33 43 48 43 43 40 37 37 37 33 22 21 11 9 9 11 11 11 11 17 17 10 13 17 13 16 17 23 22 28 27 27 10 10 12 12 12 11 21 15 16 13
16 15 12 12 13 13 19 17 10 8 12 12 12 11 10 8 8 9 10 16 16 18 27 19 15 8 8 8 14 22 11 10 10 7 7 10 19 18 9 9 9 10 11 10 10 17 15 11 10 10
11 12 12 16 12 12 9 12 11 9 8 8 8 9 17 10 10 10 10 13 10 8 8 6 6 8 8 12 13 16 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 13 17 11 8 8 8 13 8 8 10
7 7 10 15 13 8 6 6 8 13 10 13 15 10 12 8 8 8 7 7 9 7 7 8 8 6 6 6 6 6 9 10 10 15 18 19 3 0 3 16 17 19 13 9 11 10 9 10 10 6
7 6 7 8 9 9 9 9 14 17 10 12 9 9 10 10 10 8 8 8 8 19 15 15 8 8 8 10 9 17 13 11 11 11 8 8 8 8 8 8 10 12 10 19 19 24 30 17 19 8
8 8 8 8 10 6 7 8 10 10 7 7 6 8 8 8 8 8 3 3 3 7 9 16 13 19 17 13 10 8 6 6 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6
8 8 8 8 17 15 31 30 19 19 9 9 9 13 15 17 11 8 8 9 9 18 22 37 22 23 12 10 10 10 10 10 10 10 12 10 14 25 21 21 13 9 11 8 8 8 8 8 7 7
12 13 10 12 17 30 37 37 32 25 8 12 8 8 8 10 15 32 33 33 33 33 30 19 15 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 12 22 18 31 19 17 13 9 9 9 9 9 10 14 21
10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 17 19 25 31 29 33 33 23 23 8 8 6 6 8 10 9 10 8 8 6 7 17 22 11 10 10 8 8 8 9 8 8 9 9 9
16 15 15 15 25 14 21 14 15 15 24 21 11 8 8 8 8 17 21 23 18 10 9 8 8 12 10 10 11 11 13 11 10 8 8 8 10 10 24 27 37 33 30 22 11 14 10 12 8 8
8 8 9 9 9 9 9 13 12 10 9 9 15 10 8 7 15 14 16 15 13 10 10 8 8 8 10 12 18 18 20 24 24 23 25 22 12 9 8 10 8 8 8 9 9 16 19 25 24 26
28 28 23 11 10 10 22 22 28 37 29 29 16 10 8 8 8 8 9 9 10 9 16 17 17 13 8 8 8 9 13 8 8 11 13 21 12 9 10 10 15 11 15 12 12 18 18 12 12 12
12 19 20 23 21 20 13 11 11 16 10 11 10 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 9 9 9 9 10 10 11 16 31 41 19 15 3 0 3 6 8 7 7 7 | Open.Hide. 9 13 11 8 8 8 16 17 15 10 10 10 15 19 31 27 27 15 14 13 20 14 14 28 24 18 25 11 9 9 6 6 6 6 6 6 10 10 13 18 16 22 33 37 33 36 36 36 33 33
39 39 39 26 26 14 13 9 9 9 9 10 10 11 12 10 10 15 19 19 16 18 22 29 34 43 48 48 57 57 57 59 59 37 47 37 37 28 41 41 59 59 42 42 33 33 33 42 39 48
48 59 59 59 59 59 59 42 34 34 42 42 42 48 44 44 32 35 37 42 57 47 47 47 47 57 57 48 39 35 35 39 42 57 57 48 48 48 48 48 48 57 44 57 46 46 48 48 50 44
44 32 35 32 43 43 43 43 35 35 43 43 37 37 43 37 35 35 42 37 37 50 50 38 38 52 52 52 57 52 52 52 52 57 57 59 52 52 52 43 57 43 43 43 52 52 57 57 57 57
54 52 57 59 57 57 50 50 52 52 52 57 50 57 52 43 43 43 43 52 57 57 57 50 50 43 43 50 59 50 50 50 44 37 43 44 46 47 48 46 57 43 43 37 44 30 21 21 27 27
28 33 27 34 32 54 54 54 57 59 57 57 48 48 48 48 48 48 43 59 37 35 30 30 33 36 25 33 33 39 43 47 37 35 41 39 59 59 48 48 48 59 59 59 48 48 39 47 39 35
28 33 25 25 34 34 48 59 59 47 34 34 19 21 12 11 9 9 9 9 9 9 9 12 12 14 24 23 35 35 43 59 48 47 37 30 24 18 21 24 15 15 20 24 28 32 31 23 15 11
11 11 16 16 25 19 19 18 15 15 18 18 17 14 14 14 15 17 10 13 13 13 22 12 12 10 8 8 12 19 17 17 10 10 10 15 15 23 11 11 11 12 10 10 11 13 15 13 12 8
8 8 8 8 8 9 11 11 11 9 9 10 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 6 6 8 9 9 10 21 15 10 9 8 8 8 8 17
17 14 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 9 8 8 10 9 9 9 9 8 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
6 6 6 6 8 10 9 9 9 9 9 14 12 9 9 11 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 16 14 9 8 8 8 11 17 16 11 10 11 11 17 20 15 12 8 10 10
10 12 12 18 18 10 8 11 12 14 12 11 9 9 9 13 13 22 22 36 37 37 33 18 20 10 10 9 11 10 10 11 15 10 10 10 8 8 6 6 6 8 18 17 16 12 12 10 10 8
8 8 8 9 11 11 9 10 10 10 10 13 14 15 15 10 12 7 7 8 8 8 8 12 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 8 8 8 7 8 17 15 11
10 10 10 16 10 11 10 10 13 10 10 10 8 12 9 10 12 12 12 11 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 13 13 18 18 18 31 28 14 9 10 10 10 15 11 9 9 12 9 8 11
8 6 6 7 8 10 16 10 8 8 8 10 10 13 23 11 12 19 14 14 17 18 19 27 12 10 10 11 19 15 15 14 14 25 22 19 13 8 6 6 6 8 8 10 18 19 19 10 10 10
14 11 10 10 9 10 10 10 12 13 10 11 9 17 15 21 15 15 17 28 16 13 12 9 9 14 11 9 11 8 8 8 10 10 10 10 |