| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-400O03.T7 (MSMg01no400_o03.b1) | MSMg01-400O03.TJ (MSMg01no400_o03.g1) |
|---|
| ACC | AG500399 | AG500400 |
|---|
| length | 794 | 781 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 253 (74 - 326) | 218 (333 - 550) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no400_o03.b1 PHD_FILE: MSMg01no400_o03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no400_o03.g1 PHD_FILE: MSMg01no400_o03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:14:20 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCATCCGCGGAA
TTCATTGTTAACATTCCGGATCAAAAAGAGATCCACCTAAGGTCCACTCA
ATCTTAGAAGCCAGGGTCAAGGGCTTCGTGCCCTTGCCATAGTTCCTATT
TTAGTCTATTGTATAGTCCACCTTCCCCCTAGGCCATTGTAAATACGTGT
GTATGGGTATAACTCAGCTATCTATAGTTCTAAGTATCTATTCTGGTTCC
TCCTTATTTCTCAAACTTCCTTCTTCCTAGATGATGGTGAATTCCTGTGT
AGGGCAGTGACTTAGCTTTTATTCTATGCGTATAGTGTAATACCAGAGGC
AATTCTGAATGTCACTGAATAGGCAACATTCTTACTGAATTCCAAGTCCA
TGGTCTGCTCAAGGACTTTCTAGGACAATGGATCACTGGTGAAGGCTTAT
CTATGTCAGAATTCAATCTTAAAAGGCACTTGTAATAAGATAATACTAAA
AGAGAGAACGTGTATCCATACACCAGACTATCGTGGTAATAGGGTATTAG
TATATGTGTTAAAGAGTAACGCCATACCTCACTACTTGTGTTTTCCGTGC
TTTTCTCTGCCTCTTGTTTGTTCCCTTCGTCTCTTTCTTCTCTGCCAAGT
TGTCTCTTACTGTAGTCTCGTTTTTTTTTTTTTTCTATCTTGCCTTTTTC
TCTCTCTTTTTTCCCCTTTCCCTTCCCTTTTTTTTCCCTTCTTTTATCTT
TCTTTTCTTTCCTCCCTTCTTTTCTTTTTCCTCTTTATTCTTAT
| TGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTCATGTGATTCTGGAGGCTGAGAATTC
CCAAGATTTGCACTTGGGTTGCTAGAAACCCAGGAAAGTTGATGTCTGTT
TCCAGCCTGAGTCTGAAGGTCTGAGAACCAGGAAATATAATATAACTTTC
AGCCCAAAAGCTGATGTTTTAGTCCAAATCCAGGTACCAGAAAAGATCAG
TGTTGTATTCATGTTCAGGTAGGAGGAAGTCCCTCATGACCAGCCACTGA
GTTCTTCTACTCGGGCCATCACTTGATGCTCTCACACACCGGATCTCTTT
GCCAAGCCCACTGTTTTAAACGTTATCATCTCAGAGATATACCCAGAGCA
GTGCCAGGCTCATGGCTCAAACAAGCTGACACATAAAGCTAGGTGTGAGT
GCCCTTGCCACCAGAGAGTTCAGAGAGAAGAACAACACAGTAAGAAGTGC
AGTTATGGCTAGAGAGATGAGAACTTGAAGATTAAGGTACGGCATAGCTG
ATTCAAGGCTCCAGAATATGACTATGAAGAAAAACCATGTAGCTGTGTCG
ATTGTCATGGAGTGTTCACTGGAAAGTCCATATGGTGGAAGCAGGGCTTC
TTATGAGCGCAAGCCGAATAGTCTTCTTTGAGAGTGTGGAAGCCTGAGTA
CTGGTCCTCGCGGGAAAGGTTGTAGTATGACAAACGATAGTCAAGCTACC
CAATTGTTTCCGTGTTTCGCATATATTCTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 10 11 24 24 12 12 11 11 11 11 11 11 8 17 17 24 26 31 43 29 24 30 30 30 29 35 34 17 9 8 7 7 7 9 9 9 10 11 13 14 12 20 25 20 31 31
31 33 33 33 33 33 47 27 27 11 9 7 6 6 8 8 6 7 9 10 13 13 13 13 19 28 32 39 30 35 35 35 35 35 50 57 57 59 59 59 59 59 50 50 50 50 48 48 42 42
42 48 57 57 57 57 57 57 44 44 47 47 47 48 48 48 32 28 20 18 18 14 18 13 19 26 20 41 41 57 57 57 59 59 59 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 52 57 57 54 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 44 32 22 17 17 17 32 25 41 41 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 54 54 54 46 46 46 59 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 48
48 48 59 59 59 59 57 50 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 41 44 27 27 11 10 7 7 7 6 6 7 7 8 8 14 12 25 25 41 41 50 39 44 43 39 39 43 39 39 39 35
35 35 40 40 57 59 43 40 40 39 37 32 28 21 23 18 26 14 15 28 23 19 19 12 12 12 21 25 35 41 43 47 50 50 50 59 59 59 57 57 39 39 35 35 37 43 59 59 48 48
48 57 57 57 57 57 59 59 59 41 35 35 39 44 44 54 54 44 44 23 19 19 27 22 25 25 36 36 44 18 16 12 15 12 15 12 34 18 12 11 11 12 23 21 30 28 28 29 18 15
15 15 23 23 28 15 15 14 18 21 25 26 23 13 11 10 13 15 8 6 6 6 6 8 13 11 11 11 11 24 26 21 17 24 21 21 20 20 19 19 20 20 24 33 36 30 19 13 12 15
15 28 23 28 23 23 19 19 12 10 8 8 10 12 13 13 12 12 16 23 25 19 21 18 15 15 14 16 15 10 10 10 19 13 10 10 9 10 10 12 13 14 22 22 20 21 21 13 8 8
8 10 10 10 10 9 11 11 11 17 17 12 11 10 9 10 13 10 10 9 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 9 9 8 10 10 9 8
8 8 8 11 10 13 13 13 13 18 8 8 8 8 8 9 9 12 11 10 10 8 9 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 15 15 23 18 19 13 14 11 11 10 15 11 8 8 6 6
8 8 10 10 10 10 10 9 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 12 10 14 16 17 28 28 27 12 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 15 13 16 16 8
7 6 7 8 8 8 15 15 17 13 12 11 10 21 11 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 11 12 16 25 16 18 15 13 9 9 12 11 11 8 9 9 9 8 8 6 6 6 8 11 22
25 22 22 13 13 10 10 9 13 8 8 8 10 12 10 11 15 9 9 10 9 11 12 11 11 11 19 19 20 19 10 9 8 7 7 9 9 8 8 8 8 6 6 6 | Open.Hide. 8 8 7 7 9 15 12 23 30 30 32 27 27 32 25 24 23 29 23 39 41 37 37 34 34 39 30 25 10 9 9 9 11 11 8 8 8 9 10 10 11 11 16 16 21 16 12 11 26 26
50 50 50 50 47 47 37 21 21 9 9 9 6 6 6 6 6 8 10 12 13 23 21 33 30 26 27 37 37 53 50 50 50 53 59 44 43 43 43 43 43 43 59 59 37 37 37 37 37 37
43 50 50 50 50 53 53 53 41 41 37 37 37 37 30 17 11 9 9 10 10 16 11 18 15 21 21 34 34 48 48 47 39 42 57 42 43 50 50 43 42 34 34 37 42 43 48 48 42 42
48 48 48 54 57 54 57 48 48 47 47 47 48 48 50 50 48 37 36 25 23 32 32 35 30 42 37 43 42 37 37 35 35 37 42 47 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 48 57 57 46
46 48 57 41 41 20 20 20 28 41 44 44 44 39 39 44 44 68 59 59 59 68 68 68 59 59 43 43 43 59 59 59 59 57 57 43 43 39 36 37 43 43 57 57 47 53 41 41 39 47
59 31 27 13 13 10 10 10 17 15 15 28 41 39 42 48 48 48 48 48 48 48 57 48 57 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 57 57 57 48
48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 30 32 16 16 9 9 9 9 9 9 9 9 11 9 11 18 27 37 47 50 50 50 50 53 50 57 57 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 48 40 43 43 48 43 48 48 42 41 43 43 43 43 43 46 47 47 48 57 48 57 54 54 57 57 44 47 47 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 59 59 35 33 43 43 43 43 57 44 44 43 43 43 44 36 27 27 20 20 20 32 32 38 41 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 48 43
43 43 42 42 44 42 28 28 32 32 35 42 33 33 33 35 35 42 43 44 44 36 28 28 30 41 41 41 27 36 40 44 40 37 37 37 37 36 30 24 17 17 20 30 36 39 39 35 35 37
39 43 43 43 47 47 43 43 43 43 43 43 39 40 39 43 39 30 29 18 18 26 27 31 33 33 28 23 30 30 37 37 32 25 25 32 37 37 37 37 37 39 37 30 30 15 15 12 16 22
22 27 22 14 14 14 12 13 11 11 11 22 24 32 17 15 11 11 19 23 29 37 37 37 43 30 32 20 15 15 21 21 25 22 22 22 25 28 28 14 8 8 8 8 11 17 14 12 12 12
12 15 16 17 19 14 15 15 20 18 24 22 20 9 9 9 9 9 8 16 10 11 11 15 22 17 15 14 18 23 14 15 13 8 8 9 8 8 9 11 12 12 12 13 11 10 10 10 11 10
8 9 9 11 11 11 13 15 13 19 12 12 8 8 6 6 10 8 8 8 9 9 10 16 19 19 19 19 21 21 11 11 11 12 12 22 17 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 10 11
10 8 8 8 8 10 8 11 11 11 10 8 8 8 8 10 13 14 10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 9 8 8 7 6 6 8 8 8 8 11 11 11 11 12 10
10 10 9 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 13 10 12 10 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 10 9 9 9 |
|---|
