BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-435B01.T7 (MSMg01no435_b01.b1) | MSMg01-435B01.TJ (MSMg01no435_b01.g1) |
ACC | AG526456 | AG526457 |
length | 764 | 754 |
length of high quality (start - end) | 462 (36 - 497) | 390 (75 - 464) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no435_b01.b1 PHD_FILE: MSMg01no435_b01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:59:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no435_b01.g1 PHD_FILE: MSMg01no435_b01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:59:40 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCCATATTTGCGGCGCTATACGACTCCTATATTCAGAGGATCCGCGGAAT
TCAAACTCAGTTCCCTCTACTTTTACAGCAAGCGCTTTACCCACAGAGCC
ATCCCTTTAACTGTACATGGTTTATTTTATGTGTAAAGTCAAGCCAGAGA
AAATGATATAAAAAGATGGAAGAAGAAGAAATTGGGGAAAGGATGAGAGG
CAATGAGGGGTGGATATGATCAAATTACATCATATGCATGTATTAAAATA
TAACAATGAAACATAATTAGTGTATGCTAATAAACTTCAAATATTAGAAT
TTTATAATTTCAAAATTGTAACAAAATATTTATCTAGGATGAGCATAAAG
GAATAATGTGAACAGGCCATAAAATTTAAAGAGAATCTACAAAGTTGATT
GTAGCATTTCTGTAGTATTTATGATTTAAAAATTATCTATTATGAAAATA
AAGTTCTCATGTATGCATATTTATTTTAACTAATTTAGAAATTATTCAGC
ACATGTACAGAGATTGCTCAAAGGTTAGGAGCATGGACTTCCTCTTGCAG
AGGATCCCTATTCATCTCCCAGGTAACTCACAAGTCCCTGTCATTTCACT
CCTGGAACATCCACCACCCTTTGTTTTCGCCATAGTTCTTGTACTATAAT
GCTGTTTTCTCTCCCCCCTGCTGCCTCTTCTTCTCCTTTCCCTCCTCTAT
CTTTACCCCACCTTATACTCCGCTCGTCTTCCTTCTCCCCTTTTCGCTTC
GGATTTATATTATT
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACAGTAGAAGAAATTAACTTCAGATAG
GCTTGTTGAAGAGATTTTGCAAGCCTGGAAGCTGGGTCCAGGGTGTGCAG
CTGGCATTGGGTTCTGACAGGAGCAAGTCTACTCTCTGTGTTTATATGTA
ATCATTGGGATCCACAGAGGCATGCCTGGAGCCTGAGTTCATAAAGGCTG
ATCTGACATTAATGTGATCTTGCCATCTGGGTTGATAGGGGCCATCTGGC
ATTAGACTCTCCTGGGGCAGGCCTGGAGTTTGAATCTACAAGGAGGCACC
TGGAGCCTAGTTCTATAGGAGCTAGCCGGTTAGTAGGCAGAGCTACCATG
CGGTCATCTTGGCTCTGAAGCCTGGATCTATGTGTGTTTTTATTTTTCTA
TCANAAATAATAAGAAAATTCTCTTATGATTAAGACTTGTTGGCCCTAGA
GAGACGTTCCCATTTTTAATTATTTATACTGATCTTCCGCACATAACTAT
TTGTGTGTTCCACCCCCCCCCCTTATTTTCATTTCTTTTTGTCTCGCCGC
AATCCTCGGCCTTCTTTTATCCCTCGCCTCTTCTGTCCCACTGGGGTCCC
CTCCCCCTCTTTCTCCCCTTATTCATGCCCGTGGGGGCGCGAAGCTCCAT
AACATGGAAGTCATCCTTCCCTTACCTCCTTCTTATTCTTTCTCTCCCTC
CCCC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 9 9 12 15 18 23 23 24 37 26 24 16 16 16 24 34 25 23 13 12 12 17 24 10 10 8 8 8 8 23 23 28 29 28 28 28 29 32 41 41 35 35 28 28
31 31 33 37 33 30 21 21 11 10 10 11 17 28 31 34 39 46 46 48 48 48 48 36 32 31 31 34 37 43 47 40 47 39 46 46 57 48 43 34 33 28 28 28 28 42 32 31 25 28
28 37 42 41 48 48 44 44 54 54 54 57 44 57 37 37 37 43 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 32 29 29 44 36 33 35 32 44 44 57 57
50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 68 59 59 50 50 50 50 50 50 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 57 59 52
52 52 57 57 57 57 59 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 57 59 62 62 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 43 35 31 44 44 62 62 44 44 31 31 31 44 44
68 68 68 62 62 62 62 62 62 43 35 35 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 52 62 62 62 62 62 62 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 44 43 31 31 41 44 43 52 52 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 47 43 35 35 42 43 44 52 52 52 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 52 52 43 43 33 33 43 44 52 52 52 57 57 57 52
52 52 57 57 57 57 43 50 43 43 43 32 32 43 43 35 37 43 43 47 48 48 48 57 57 57 57 43 43 43 43 43 44 57 57 44 48 48 48 57 57 48 43 43 43 43 39 43 43 44
46 47 48 48 46 44 36 30 24 24 19 21 37 39 42 43 36 36 43 43 43 47 39 37 30 32 32 23 34 23 28 28 29 37 28 28 13 13 13 24 28 43 48 34 30 23 11 9 8 8
8 7 7 14 17 24 22 19 23 32 22 30 22 25 26 15 19 12 12 11 16 20 25 18 23 28 20 20 23 28 28 24 26 21 15 13 15 17 19 16 16 16 19 22 24 14 13 10 11 11
11 15 15 24 21 10 10 10 15 10 12 12 11 11 11 15 11 12 12 12 11 11 11 10 9 9 9 10 9 11 11 9 9 9 12 11 13 11 11 11 13 10 10 10 11 13 11 11 11 11
13 15 16 11 11 16 11 10 11 21 13 10 9 8 8 10 8 8 9 9 10 10 8 8 8 6 10 8 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 10 8 10 6 6 8 8 8 8
8 8 8 9 13 8 6 6 6 8 8 10 10 10 16 15 11 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 11 10 12 10 9 9 10 10 9 9 10 10 9 10 10
10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 10 8 9 10 10 10 10 8 6 6 10 8 11
11 11 11 6 8 6 6 10 8 10 10 13 18 14 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 8 9 17 10 8 8 8 15 15 29 25 30 39 39 37 37 37 25 20 30 19 25 24 23 12 9 9 12 15 11 13 11 11 11 21 27 43 48 27 23 11 11 11 18
21 43 43 50 50 44 44 24 26 19 19 20 20 21 26 19 23 28 21 21 10 10 8 15 14 24 27 32 57 68 68 68 68 51 57 57 50 48 48 43 42 30 30 24 22 33 38 68 57 57
54 54 54 59 57 68 68 68 68 57 59 50 50 50 50 50 50 57 47 43 43 44 43 33 28 43 44 44 50 50 37 43 43 44 44 44 22 28 43 43 43 43 68 68 57 59 52 52 52 52
52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 44 44 32 43 43 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 44 59 35 35 43 43 43 43 52 52 43 43 44 44 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 43
44 39 35 35 43 38 44 62 43 43 43 43 45 43 43 43 62 62 62 52 52 52 43 43 35 35 43 44 44 44 43 31 35 43 44 44 44 44 35 43 43 44 44 68 62 62 52 52 52 44
44 52 52 43 57 39 39 39 57 59 68 68 68 68 68 59 59 43 52 43 44 43 31 31 35 42 43 38 41 41 68 68 68 68 68 68 68 68 59 41 38 18 20 38 43 43 38 41 36 52
52 50 50 44 44 21 38 28 43 43 52 43 41 41 41 44 33 33 38 41 32 23 20 38 41 41 68 68 68 68 68 68 50 50 37 37 32 32 20 27 44 44 57 57 57 42 42 33 33 33
36 44 44 34 32 18 15 24 24 24 32 15 24 41 41 41 59 57 47 47 37 43 41 34 30 17 14 14 34 34 59 59 57 57 48 48 43 43 43 59 43 43 43 43 48 43 48 46 47 42
40 32 32 17 17 28 28 39 32 41 41 41 41 28 37 37 34 34 34 34 25 32 34 32 32 31 37 37 47 47 47 41 59 47 48 48 48 48 47 47 50 47 47 37 43 41 32 28 28 28
18 16 3 0 3 16 20 28 30 34 26 30 28 20 19 16 19 13 9 8 8 8 15 19 33 39 32 28 28 28 24 25 13 12 12 13 13 13 10 10 16 19 18 12 8 8 8 8 8 8
11 11 10 8 7 6 8 8 10 10 11 11 11 9 11 15 8 8 8 10 7 7 8 8 6 6 8 8 8 10 9 9 9 8 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 10 13 15 17 12 14 10 10 7 6 8 8 9 10 10 10 10 10 10 11 12 10 12 13 11 11 11 9 9 9 9 9 9 9 8
8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 10 13 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 7 7 10 12 6 6 8 8 10 10 11 11 11 10 10 10
10 10 10 15 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 12 8 8 8 8 8 9 8 8 8
8 8 8 10 9 10 12 12 12 8 8 8 6 6 8 8 13 15 8 8 6 6 8 8 8 10 8 11 10 10 9 8 12 10 7 7 13 10 19 15 13 10 12 9 8 8 8 8 11 10
10 10 10 10 |