BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-436I02.T7 (MSMg01no436_i02.b1) | MSMg01-436I02.TJ (MSMg01no436_i02.g1) |
ACC | AG527555 | AG527556 |
length | 749 | 736 |
length of high quality (start - end) | 458 (54 - 511) | 502 (85 - 586) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no436_i02.b1 PHD_FILE: MSMg01no436_i02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:01:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no436_i02.g1 PHD_FILE: MSMg01no436_i02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:01:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCTTTCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCACTTGCATTTACTTTCAAGTTGGGCTGGATGGTGGTG
GTACATGAGACAGAGGAAGAGGCAGGCTATTCTATGTGAATTGGAGGCCA
GACTGGTCTACAGAGCAAGTTCTAGGATAGCCAGGGCTACAACACAGAGA
AACCCTGTCTCATAAGACCATTTAAAAAAAAAGGTAAATTCAAGTTCGGT
TTCTATTAATGCAGATTCTAAACTTCCCACTCTATTCAGATATAACCAGC
TTTCCAGTCTTTCTATTTAGCTATCAAAGCAAGTGAAAAGAATAGGACTT
CTCTCCATTTTGTAGTTACATAATGCTAAATTATGATGAAGCTGTCCAGG
GACACTGCTGGTAAGAAAGGTGGTATTTTCTGGGCAGTGATGGCACACAC
CTTTAATCTCAGCACTTGGGAGGTAGAGGCAGTCGGATTTCTGAGTTCGA
GGCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGTGCTACACAGA
GTAAGTCCTACACCATGTCAGTTAGGAGTATACAGTCTGGTCCTCTGTTT
CACTATGTTTCTATTGCGCTTATTAGAGGGCCTCCTTACAAAGGTTAACA
ACAGTTTGTTTTATTGGAAGGTTCTTATCTATTGTTACTAATTCCTGGTT
CTTTCTCTACCCTTTTGCCGCGCCGTTTACTTCCCTTTCTTTTTTCTTT
| TGTGTGGTTCGATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACC
GAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGG
GAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAAT
GGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCATGGATGTGGAG
AAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCA
CTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCATAATATTGGACATAGTACTACC
GGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAA
CTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATCTTCATAGCAGCCTTATTTATA
ATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGAT
ACAGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTATTCAGCTATTAAAA
AGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATC
ATCCTGAGTGAGGTAACACTTCCCTAAGGAACTCACACCATATGTACTCC
TTGAAAAATGGATAATAGTCCCCAATCTAGGATTCTCTAAATATTATATA
CAATTTGCTATATTATTGTAACTTCAGAATAATGAN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 10 10 10 12 9 9 9 9 9 11 10 10 10 13 16 27 29 33 32 27 25 25 37 19 23 14 17 18 28 37 48 30 28 30 30 30 21 21 11 11 11 12 11 11 11 21 19 22
17 20 20 28 31 44 57 35 35 28 28 36 36 47 41 41 37 34 28 19 17 18 13 11 11 13 21 23 30 33 33 33 46 48 48 48 57 59 57 42 42 43 43 43 50 59 59 59 57 57
43 43 36 39 34 36 42 43 42 41 46 46 54 47 54 47 47 47 48 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 47 54 54 59 59 48 48 48
57 54 57 57 48 48 48 50 57 57 57 57 57 50 43 43 43 59 59 59 52 59 59 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 57
57 57 37 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 62 54 62
62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 34 19 26 20 26 38 43 62 62 52 62 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68
68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 43 35 35 42 43 43 35
37 43 43 35 35 43 44 59 57 52 52 52 43 43 29 31 42 43 43 43 42 37 35 35 43 44 44 57 48 44 42 42 42 43 43 57 57 57 57 57 48 39 37 37 42 42 41 42 30 30
41 42 44 57 57 57 43 43 37 42 37 37 37 37 44 47 47 39 36 32 28 33 28 33 32 37 37 47 39 33 32 23 23 23 24 28 30 43 43 39 39 28 28 23 32 32 23 20 20 23
23 20 20 24 24 32 37 32 32 17 17 18 22 21 19 12 12 12 21 22 30 30 30 34 43 47 37 28 28 21 19 12 12 12 12 22 12 12 12 10 10 19 17 26 20 23 17 19 14 15
19 22 28 28 14 14 14 26 26 17 13 10 10 10 10 19 18 16 12 12 15 19 19 12 14 15 19 15 10 10 10 12 12 18 23 14 14 21 15 10 9 9 9 12 15 14 8 8 8 8
8 8 11 13 9 17 10 10 10 10 10 10 9 10 15 8 8 10 15 15 8 10 10 11 10 13 10 9 9 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 10 19 10 10 11 12 12 14 14 12
15 12 8 8 8 7 10 6 6 6 8 8 10 10 10 10 8 9 9 9 9 10 10 8 8 10 10 8 9 9 9 9 8 8 11 14 9 9 8 8 8 8 8 10 11 11 8 6 8 6
6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 14 13 12 9 9 9 9 12 10 10 13 10 10 9 9 9 9 11 13 10 10 10 10 10 11 19 13 12 9 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 6 6 8 8 10 10 10 9 9 9 11 12 12 12 10 10 9 9 11 10 15 22 10 12 10 12 17 34 34 37 37 37 39 31 32 41 41 30 27 16 10 7 7 8 8 7 12 9 10 10
24 19 37 37 40 44 36 36 38 36 42 47 47 59 57 57 44 23 23 9 9 10 12 19 11 15 15 25 21 36 36 36 43 48 54 54 50 48 50 50 51 51 51 48 50 50 43 48 50 57
57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 57 57 57 54 54 57 57 48 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 50 50
57 48 48 46 50 50 50 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 54 57 57 68 57 57 57 57 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52 52 57 52 52 57 57 48 48 48 57 41 41 41 50 50 50 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 57 57 54 54 46 57 46 54 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 48 47 43 43 43 47 59 59 57 54 54 48 57 48 48 48
59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 59 37 37 30 28 30 30 26 17 10 8 8 8 8 15 22 34 47 50 50 50 50 50 59 59 48 57 57 57 57 57
48 48 48 50 48 48 48 48 43 43 44 57 68 68 59 59 54 54 48 59 43 43 39 44 40 43 43 43 43 48 48 59 59 57 47 47 43 59 59 43 43 43 42 42 43 43 44 46 44 48
48 59 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 39 57 57 59 68 68 68 68 68 68
48 48 39 37 30 30 31 44 40 46 46 39 42 32 36 36 43 43 43 42 33 30 30 33 28 28 24 32 20 23 23 32 32 32 28 25 25 25 23 34 34 46 30 30 30 30 23 21 37 37
37 30 30 37 37 39 40 43 43 43 43 40 37 37 32 33 33 33 32 24 24 24 19 22 23 34 34 37 24 13 12 9 9 15 19 43 37 29 26 19 19 19 24 28 22 17 11 11 17 19
37 43 39 47 39 48 48 48 48 48 47 47 47 47 33 31 32 22 23 23 22 24 19 11 11 11 11 11 25 30 31 31 35 32 18 14 17 16 14 14 15 17 22 8 9 9 12 12 15 22
31 25 25 25 26 30 28 39 32 35 22 16 9 9 9 9 10 10 10 8 9 7 7 7 7 12 12 18 20 23 21 10 10 9 9 9 10 9 9 10 10 16 15 10 10 10 9 8 9 9
9 9 11 9 9 8 8 8 10 8 10 9 15 14 10 10 10 9 9 9 10 10 19 11 11 11 11 10 10 10 11 10 13 13 10 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 10 8 8 8 8 10 10 11 16 16 12 3 0 |