BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-439D17.T7 (MSMg01no439_d17.b1) | MSMg01-439D17.TJ (MSMg01no439_d17.g1) |
ACC | AG529636 | AG529637 |
length | 888 | 724 |
length of high quality (start - end) | --- | 197 (318 - 514) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no439_d17.b1 PHD_FILE: MSMg01no439_d17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:05:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no439_d17.g1 PHD_FILE: MSMg01no439_d17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:05:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GTAGAATTGTAGAGTACCGTTTAATGGGTTTCCCACTATATTCGTACACA
TTCAGCGCATTTATCCCAATTATCAGAGAAAAAAGCAATACCACATAGAT
CCTGAAAATAGGCAAGACTGGCGCGTTACAAAAATTCAGAACGCAGCAGG
TGTCAAAGACCGTATAATGCCGTACTATATATACCACCTCCGCCAGCGCG
CGGCTAGTCATAATTATTTACGTTTCGCTTCGCGTAACACTCTTCCATCC
CTGCGTGTTGATCGTAACGCTACGGTTTTATATGCTACGTTGATCTATGC
GCTATGCGTGAGTAATATCCCGCTTCCCCCCCAAGATTTTTTGCCACATT
CTCCCCCTAATCTACTTTCTTGTTTAGTCGCGTATGTTCCTTAGTTTAAT
ATCCAGCCAATTTCCTATTTTTATTATCCTATGCTGCCTCCGCTGTATGG
TTAGTTCCTCCCTTCTTCTTCCGTATATAGCGCTCGATAAGTTGGCCCCC
GCTAAACGGATAGAGTGTTTACAGTAGCGTCGCAGAGCACCCTAAAGTTA
ACCGTATTGAAGGAGTGGAGACGTTCCGCGTCATATCGGTGTGTTCGACT
GTACGTGTCGTATATAGTGGACATGTTTTCCCTCCGTCCTTTTTTAACCC
GCTATCCCCGACCACATTAATACTCCCATAATATCTATTCCGTCTATTTT
CGGCAAAATTAATATAATATTCCGTGTGTAATACCGCCCCATGTTATATC
CCATATATCTTCGCCCATAGTGTCTTCGTCGGCTTAATAATTTATAACAC
CCTACTGCCGTGTACGTTTACGGGCGATTCGCAATGACGTCCCCGCGGTA
ATTACCGCCCCACTTTAACCCTAGATTTATCCTATTGC
| TGTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXTTCAGGAATCCATTCCCCCAGGTTTGACACAGTTTGGTGACTCCA
TACATTAACTAATGACAATAAGTATACCCCAGGACAATTGTGTTTTCCTT
TCTGTTTAAAATAGTANACTCTAGGAAATGTTCATCAATCAAACCCATCC
CCTGTAAATGCTATTGTTTTGGTAATGAAAACTCAGATGAACTCTTGATG
GCACAAATTAAGCAGAAGGAAACTAAATCCCAACCATTACAGTAAGTGCT
CACTCATGATATTATTGATCTAGAAAACAGATTTATATTTCTTCATATGC
AGATATTCCAGAGGCTGACTACAACAAGTAGACAGAGTGTCAATTATCTA
TGTTTGCAAAGAGACATTATTTTAGGCAATATCACATTGCCTGAAAATAT
TATCACATGGATTTGATCAATTTTTAGTCAAAGCAGTAATTTTGAAAAAT
AACCCTGCTGAGTACATAGTCATCAATAAAGGATTGAGTAACTCATCTGA
CAGTCTAGCCTTAATGACTAAAGCGTCTCCTTAACAAATTCAATTTGAAC
ATTTATAAGGTAATCAACTATTTTTGTTATTGACCTGTATTATCCATATC
AAGAAATCCCAAGACTCTTCCGAATATAATTCCAACACACCTTAATTAAC
TCTGCCTCTAATTCACATTTCTCC
|
quality values | Open.Hide.11 13 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 9 9 9 11 11 9 9 9 13 10 8 8 6 6 6 6 8 10 7 6 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 7 8 8 8 10 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10
8 7 8 7 6 10 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 15 17 15 15 12 8 8 8 8 10 8 11 11 11 13 13 13 11 11 11 11 10 10 10 9
9 9 9 11 12 12 9 9 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 6 6 8 10 10 6 6 8 8 9 9 12 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 7 9 10
9 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 7 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 15 10 10 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 8 8 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 10 10 9 9 11 11 12 12 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 8
11 10 10 18 12 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 9 13 11 10 8 10 8 8 8 8 10 10 12 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 12 12 11
11 11 10 10 10 10 9 9 10 10 8 6 6 6 8 6 6 8 10 12 12 11 11 6 8 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 6 6 6 6 9 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 8 8
8 7 7 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 12 10 10 15
10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 9 9 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 7 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 9 8 10 10 10 10 14 17 17 11 10 9 8 10 8
8 10 8 6 6 8 13 10 8 8 8 10 8 10 11 11 11 10 10 10 10 10 10 10 10 6 7 9 7 10 8 10 10 10 10 10 10 11 10 10 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 11 14 9 9 9 10 9 9 9 9 9 8 8 6 7 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 10 9 9 9 10 10 10 10 12 11 11 10 10 10 10 10 11 12 8 8 6 6 8
8 13 11 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6 6 6 9
9 9 8 13 9 9 9 8 10 10 10 10 10 11 13 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 15 9 9 9 9 11 12 19 24 22 20 21 22 21 32 30 30 32 31 29 21 16 9 9 6 6 6 6 6 6 9 9 9 10 12 12 15 21 13 9 9 10 26 21 39 39 43 23
19 7 7 7 6 8 7 6 6 6 6 6 11 10 10 12 25 28 30 30 32 44 44 44 47 47 59 39 39 39 31 32 33 37 37 37 41 39 39 32 28 28 32 32 37 37 19 17 15 19
18 29 28 31 31 31 33 33 37 31 30 29 22 14 9 9 9 13 17 19 23 27 31 39 39 50 37 33 33 29 28 23 17 22 18 22 23 28 37 37 41 37 37 37 30 19 14 14 19 23
23 25 24 20 18 18 19 9 9 9 9 15 17 21 23 3 0 3 27 27 44 44 44 13 12 12 12 11 18 19 30 37 37 42 41 37 37 37 37 37 37 39 39 32 32 37 37 37 37 47
50 59 59 39 32 32 28 28 32 37 37 41 42 37 33 33 33 36 36 36 31 31 31 31 33 37 37 37 44 41 41 44 59 59 41 41 41 32 23 27 13 12 12 12 18 23 31 31 32 35
48 57 57 59 57 53 53 53 48 54 54 54 47 47 43 43 43 59 59 48 48 57 57 57 54 54 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
50 50 47 47 30 27 12 12 12 7 7 7 7 7 7 10 10 11 19 27 27 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 24 24
12 12 12 30 30 48 57 44 43 37 39 37 43 43 59 48 68 68 68 57 57 48 48 44 57 44 43 36 44 32 37 37 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 54 54 54 50 59 37 37 37 50 50 50 57 57 57 57 50 44 44 29 28 36 43 50 44 44 46 57 57 48 48 48 57 48 54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 48 39 39 39 39 47 43 43 48 48 43 47 47 54 54 54 50 54 42 42 30 24 28 24 21 25 25 24 25 20 20 20 28 26 32 28 31 23 19 19 20 20 25 34 34
43 37 32 31 31 31 34 34 30 29 12 12 12 25 21 26 26 21 21 11 12 12 19 18 18 23 24 23 23 34 30 33 30 25 23 30 28 24 18 15 16 19 20 21 28 39 39 30 26 16
16 19 25 11 16 18 13 17 22 29 28 30 31 31 32 32 35 30 15 12 8 8 10 11 13 19 16 20 23 34 34 41 34 34 22 15 15 18 13 10 11 11 14 19 32 43 39 39 35 39
37 33 33 33 28 21 21 12 12 9 9 9 9 12 10 10 11 15 12 22 16 20 20 25 23 18 18 18 17 14 14 22 13 20 18 14 13 11 8 6 6 6 6 10 8 8 11 12 17 21
22 17 15 10 14 9 9 8 8 8 6 6 6 9 12 16 16 13 10 10 8 8 8 9 10 13 13 15 13 12 9 11 9 9 9 13 10 8 8 8 8 10 11 9 8 13 8 8 8 8
8 10 10 11 8 9 8 8 8 8 10 10 15 12 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 |