| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-440B18.T7 (MSMg01no440_b18.b1) | MSMg01-440B18.TJ (MSMg01no440_b18.g1) |
|---|
| ACC | AG530303 | AG530304 |
|---|
| length | 771 | 1,413 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 127 (54 - 180) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_b18.b1 PHD_FILE: MSMg01no440_b18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no440_b18.g1 PHD_FILE: MSMg01no440_b18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:06:25 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NNNNTTATTCCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCTCACACACTGCCAGTAAGGAGCTAACAGAACCTTAAT
GATTCATCTTACCAGCACTGACATGTTTGAATATATAAAATCAATGCACA
AAAAAATGAAGGAAGAGCAAGCTGTCTACATCATTTCTGTAGTANGCAGA
GAAGATGAACTTAACCCTTCCTCTCNNNTACTCTNNCGAAACCATAATGG
CTNNNGGGTGGGTGGGTTGTTTGGGGGTATGAGGGGGAGGGGGTGGGAGG
NNTCNCCAAAAAAAAGCAAAACTCGGNCCCCCCAGCCCCTATTTCCCNNN
NTTTGGNGGGACACACCCCGGGAACACCCTATAACCCCCCCCTTATTTAA
AAAAAACCCCCCCCCCAAAAAGGGGGCCCCTCTCCCAAATTTTTGGCGGG
GCCCCCCCCCCCCNNAATAAAAAAATAANCCCCCCTATTTTCCNCCNAAA
AAAAACAANNNNCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCACACAAAAAAAA
AAAAAAAAACATAATCACCTATTTCCNTCACTACCCCCTCCCCCCCCCTC
NNCCCCCCCCCACCCCCTCCCCTCACCACCCTTCCCTTCACCTTATCCNT
CTCTACTCCACTACCCNNNCCCCCCCCCTTNNNCTCTCCCCTTTCAACAA
TATCCCACATTTCTTCCTCCTTCTTTTACCTTTATTTTTTTTTCCTTTCC
ATTTTTGGTTTGTGGGTGTTG
| TTTTTCTTCTATCTTTGTATGAGGGTGTGTGAACAGACAGGCGAGGTAGA
GAGCGAGCTAGTCCTCCGACAAGTCATACACAAGACATCATATCATTAAT
GGCATCGCTCGCGTGTAGCTCTCTGTCTTGACTATACNCTCACTCGCCAT
CTAACAATCTTTGACACTCCGCGCACAAGAGTAGCTGTGACATAGATACC
GGCGTTATCTTATTATCACCGACGTGCACTGTCGTCTCTGGCGCTGATGG
CTCTTGCGTTACTATCACTAGATATCTACACTCTTACTTTATATCAACCT
ATGACATAACGACGAAGTAGCACTACATATAGTGAGCGTCTAGTTCACTC
ACGTCACCCGCCTCATCTGCGACTCTCTATTCTACGACCTCTCACCGTCT
CCTCCATACGCTCTATTCTGTATTGCATCTTTCTTCATGTCTTGGAGGTA
CTCCGCCCTCATGGCGCGTACACTACTGTCAGTACCGTATATGCTATCGA
TTAATATGCTATTTATAGTAGCTCATCACGCATAGCGCTGCTACATGCTC
CTTNTCTCCCGCTACCGCGACCCTAGCGTCTCCACCCGCCGACCACACTC
ACACACCGCACATAGCGATATGCGACACATCGCCTCGTGGCTATCTAATT
TCTATCGACACTCACGCATCTCTTGGTATCTAATTATTCCTTCTTCTCGG
TCACTCTCTGTATGTAGCTGATCCTCTATTTCGCACACGATCTACTAACT
CNTTATATCATACACCTTCTCTACTGCTTATAGTATGCTCGTTCTTCTCC
TCTGCTTCGCTATCTCGCATATACGTCATCCTGCAGTATCCATCCGACGA
TACTCTCGCTTACTCGCTATCCTTCTGCATGACCGAGACGCTGTGTTTTG
CGTCTCTCTACGATATCTCCGACTCTCTCCTCACCTTCTACTCATACCAC
GCTCGATATCATTATTCATCATATGCTATCAGACAGTAGTCATAGTAGGA
TTACTAAATGTAACCATATATCTTCTACTGTAGACTCAATGTACTACACT
CAACTTCTAGCCATCCTATCTCACGCATTACTGCACGCTCGATCCATAGC
GACATTATGCTATATCGTCGTAATTATGTATAGTCATGTANTGCTAGTCG
GTACATTACGTTTCACATTAGACTGTCTGTCTTCTGACTAGCGAAAGCGT
CATATCGTCTCTACACGCGTGTACATACTCTTGCAGATCGCTATGCGCCT
ACCTACTAACCGTCTCGATGATACGCGGCAGATTCGCACTCCGCCGCGAT
CAGCTCATCTACTCACGTATCTGCATACTGTCTAGTCGCTCTAATATCAC
GATACATACTATCTCTCGATGTACTCAGATTATTACGCGTGGATGCGNCT
ACTGTTGTATGGN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 7 7 6 6 8 9 15 12 12 18 27 3 0 0 3 15 17 23 24 20 20 22 35 35 44 22 21 12 12 12 21 21 10 10 9 10 11 9 10 10 10 10
10 14 14 28 29 41 41 19 19 14 19 23 25 37 37 37 37 37 32 23 18 24 19 19 12 10 12 23 34 57 57 57 53 53 50 50 50 50 42 41 39 39 39 39 39 39 37 32 32 37
37 37 30 33 28 28 28 33 43 53 36 26 19 12 12 26 35 38 36 36 33 33 33 50 42 41 59 59 22 19 19 22 23 29 41 39 39 37 28 24 29 28 28 28 34 34 30 30 24 28
28 30 39 26 22 22 25 23 23 34 41 26 26 14 17 14 14 14 28 28 44 43 47 43 43 28 30 26 18 17 22 21 19 18 23 20 19 26 15 23 11 11 11 3 0 3 12 9 9 9
7 7 8 8 8 10 10 11 24 19 19 21 9 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 6 3 0 0 0 3 11 7 7 7 3 0 0 3 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
9 3 0 0 0 3 8 6 7 7 10 10 8 8 8 8 11 11 11 11 11 11 12 14 13 14 10 9 6 6 6 6 6 6 13 12 9 8 8 8 8 8 9 9 6 7 6 6 6 3
0 0 3 3 0 3 11 12 10 15 15 15 10 10 9 10 9 9 8 7 7 6 6 6 6 3 0 3 10 12 19 21 9 9 9 10 10 10 11 11 11 11 13 13 12 10 3 0 0 0
0 3 11 11 9 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 8 9 10 9 6 7 7 9 7 8 11 10 11 11 10 11 9 9 9 9 9 10 17 20 17 14 8 8 6 6 6 8 8 8 14
17 26 14 11 11 11 11 11 21 27 34 31 20 16 9 8 8 8 11 9 12 12 16 9 9 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 12 9 8 8 8 8 8 8 9
9 10 16 26 37 37 37 24 25 19 9 9 3 0 0 3 9 9 9 12 12 18 8 8 6 6 8 3 0 3 12 19 9 9 19 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 3 0 3 17 8
12 19 24 30 22 17 21 3 0 0 0 0 3 11 10 21 10 10 10 23 19 8 13 8 8 8 8 19 15 17 11 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 10 8 7 8 10 15 13 13 11
11 8 16 8 8 8 8 9 9 10 13 11 6 7 11 8 8 10 11 15 17 17 14 7 7 3 0 3 11 9 8 8 10 10 9 7 7 7 8 10 19 19 30 30 28 19 17 8 8 3
0 0 3 10 15 8 8 8 13 13 9 9 15 18 9 8 13 12 8 8 8 15 11 15 8 8 8 6 6 8 8 10 15 10 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 3 0 3
8 8 8 8 8 8 9 11 13 8 11 6 6 8 8 3 0 0 0 3 15 10 8 8 9 14 10 10 18 3 0 0 0 3 8 8 9 9 9 18 15 12 8 8 6 6 8 6 9 9
12 12 15 16 21 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 9 9 9 9 21 10 11 11 11 13 15 11 8 8 8 8 8 8 6 9 9 7 8 17 8 8 8 10 10 8
6 7 9 7 10 8 8 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 | Open.Hide.12 12 12 12 12 9 8 15 8 7 7 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 13 8 8 8 9 8 8
10 10 10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 10 8 11 12 8 8 6 6 6 6 10 8 7 6 7 8 10 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 8 10 8 6 6 7 7
6 6 9 8 10 6 6 6 6 10 10 6 6 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 10 10 10 8 8 9 10 10 12 10 10
9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 6 8 6
6 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 11 12 12 10 11 11 11
11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 8 7 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8
6 6 6 9 10 9 6 8 6 8 8 8 11 11 13 8 10 9 6 7 7 8 8 13 10 10 8 8 8 7 9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10
10 10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 11 13 12 12 11 11 11 9 12 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10
8 10 8 8 8 8 8 8 11 10 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 9 9 8
10 8 7 7 6 6 6 6 8 9 10 10 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 11 10 12 11 10 10 6 8 6 6 8 6 6 6 6 8
8 8 3 0 3 8 12 10 8 6 6 6 6 12 12 12 12 8 8 6 6 8 6 8 8 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 11 16 11 8 8 8 6 8 8 8 8 6
6 6 6 6 6 6 8 8 11 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 10 8 8 6 6 7 7 10 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 10 12 11 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 7 7 6 8 8 8 8 8 9 9 10 8 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 13 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 10 10 16 11 11 11 11 11 11 11 11 11 10 8 7 8 9 9 9 10 12 13 17 12 14 14 15 12 13 11 8 7 8 8 8 6 8 8 6 8 7 7 6 6 8 8 8
3 0 3 10 8 8 8 6 6 8 8 12 12 9 10 10 10 12 15 13 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 9 6 6 8 6 8 8 8 8 9 9 9 10 11 14 13 13 11 9 8
8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 12 10 16 10 10 12 12 10 6 6 6 6 6 7 10 11 10 9 7 7 6 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8
10 13 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 10 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 7 10 12 12 16 13
15 12 14 15 15 15 8 8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 6 7 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 12 19 10 7 7 7 8 6 6 9 9 9 9 11 11 12 8 8 10 10 8
8 8 9 13 24 19 15 10 13 10 8 8 7 6 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 9 10 13 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 6 6 7
6 10 8 9 9 6 10 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 8 8 13 15 14 10 10 8 8 6 8 8 7 8 6 6 8 6 10 8 8 8 7 7 6 6 6 8
8 6 6 6 10 10 11 13 13 10 10 9 9 9 12 12 12 12 11 11 11 10 9 9 9 8 15 8 6 6 8 8 8 6 6 7 8 10 12 9 8 7 8 8 8 8 10 9 8 8
10 10 10 8 9 8 8 9 7 10 6 6 6 6 9 9 11 11 10 10 9 8 8 8 6 6 8 7 6 6 6 8 8 8 8 10 9 8 10 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 9 9 10 7 7 9 9 9 8 8 10 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10
10 11 6 6 6 6 8 8 13 10 9 9 8 8 8 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 9 9 8 7 7 8 8 8 11 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8
8 6 6 6 6 8 6 11 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 7 6 9 8 8 10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 16 13 13 9 9 6 8 8 8 8 10 6 7 8 8 8 7 7 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 8 11 9 10 9 9
8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 9 13 10 9 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 9 7 7 6 6 8 8 11 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 8
8 10 8 8 8 11 8 7 7 8 8 3 0 |
|---|
