BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-460G12.T7 (MSMg01no460_g12.b1) | MSMg01-460G12.TJ (MSMg01no460_g12.g1) |
ACC | AG545771 | AG545772 |
length | 2,020 | 713 |
length of high quality (start - end) | --- | 484 (67 - 550) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no460_g12.b1 PHD_FILE: MSMg01no460_g12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:33:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no460_g12.g1 PHD_FILE: MSMg01no460_g12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:33:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTCCAAAACTCTATCATCGCTANNTNACACGACAGAGTATGTNNNNCGC
GTCTGTCTTTCTCTACTCGTGTAANCACGTGTNTCGCCAGTCGTGAGAGT
ATACTAGTGATCGCTGATGCACTACGCTGCGTTCACTATCACCAGACAAG
AGACATCACATCCACACTACTCAGCCNCCTCATATGNNATCACACCGCCC
AGCGCTACAGNACNACACTGCGTCGTACTTCGCTGTNCGATTACAAGACG
CATGCTGATATGATGTGGATATGATATATATTACGATCAGATAGCGAGAC
ATGTGATGCTGCTTAATATACGACGCGTGTGCTGTTCGTGTGGTGCGNCG
GCGTGTCGCGCNGGCGAGNCGTCGCTACGGCCATTGTATGTTGTTTCTCG
GNCGTGTAATCACATGTCATACACGGCATACACGCGACTAGAGTACAAGT
ATGACGAGATGATGCAGGNCAATAATAAGCGCGCGTAAGATCATCCTCAG
ACACGAGCGACAATCTTCGTATGTTACTGCTTNACGTGAAGTGATTATGT
ACNTNCATCTCCCTGCCGATCCATGCTGATAGATGCGCATGTAGATCGTA
CGATGCTGNTAGTGCATANATGAGTGATATCTGCTGACACGCAATATGAG
ACTCATACATTCAGCTGCATACGTGATACTACATAATGACATACATTAAT
GATNAAGCAACTCTCACTGTTACTTCTANTACTGTTCGCTTAGCGTGTGC
TACTGCCGTTATGCTGCGCGTGCTATGTGCATCGCGATGCTAGTGTTCGG
TCTCATGTGGTGAGCAGACGTGNACGACAGTAGGTATGNGCATGACCTGG
TCGTATGCTCGACGAGCGCTGATGTCACATAGTAGTGNTCACGTAGCGCG
ANTATGGATGTTGTAGTTTGATCTCGTCCTGNCGTATGAAGTGCATGNAC
TAGAGCTCTGATGACACTGCATANTATCGTAATGCTACCTCAACGTGTGA
NCTGNCGTAATACATCTNATAGTACATCTACTCTATGATATGACTTCACC
GCGAGCGGCCCNGCAGCAGACTGACGGTAGTACACTNGANTGAGTATGAC
TGATGGCTCCCCGCTGTNATGTATACGAGCTCCGAGNCTGTCGTCGCAGC
GTACGCAGACGCGCGCCGATGATTGTATAATCATAGTATTTNTANTTGCG
CCGCATNTCATGTACATACNTNNCTGCTGTCTGNTGCATCGACTATGATC
CGACGCTCGANCGCATCATTGANTCTGCGTGCNTNNCCCGCTATNACGAC
GCACGCATCTGACTGACGTACATNTCACATCTTGTACATANCNTTTGTAC
TAGNCCCCCACCAGATCATATACGAGTAGTAACTANTATGANCTANTACT
ATTNNACTATCTACAGCTGATGAGGTACTATGACTACTANAGGCNTNCTN
ATNTCANNTGCGCGTGATGNCTCCTGACGATATGTAGAGNCTCGACGAAG
TATAATCGCGGCGTGNTGTGCTGCACTGTANTNTGNCGTGNTAGNACGCA
CGCGGTAGTCGTACGGTGCTGAATGATGTGNTGTACAGTCGATGAGTTAC
TCAGTAGTATCGNCGTGTGGTGTCGCTGACATCGTGCTGCNTTGTANTGA
TAGTATTCTCTGATATAATAGTACTAGNTGATCGACTGTAGCTACACGCT
CTTACTNTTTAAGCACAGCCTGTCGCACCGACTCANCGACGTCTCATATG
CTGTGTGACTNANCGACGAACNGTCAACGATAGCATTACTANCATTCTNA
CTAGTAATACGAATGCATGATATGNANCGTATAGTCACAGTGTCACGCTG
TNAGTAGTCTTCCGATGATCATCATGNTACAGATGTACGTAGCGATCGAT
AGGNTAGATCGTGCGTATAGTGATCACATTTCNATCGCATCGCGATGCTG
ACGANTATATACTGCTGTTCAGCACGCGCGCGATCGATCGCTGTACTGAG
CAATCCGCTGCAGTACGTGN
| GTGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTGATGGGTTTTGGCTGGACGACACTGATAGTAT
GTTTTAAGGGCCATAATCGAGAAACCCAGTCAGAATTTCAGACAGCTCCC
TTTTCAGCCCTTCATCCCACACACGCTGTTAACTACTATTACCCAAACTG
CAGTACACACAAACCACGGGTTCTTGACCCACAAACTCTGAACTAAAATA
ACCCCTTCCTTCCTTCCTTCAGTTGCCTTTAGTCTGGTAGTTTGCTTCAC
AGTATTGAAAAAGGTAACTAATCCAGCGGGAAAATTCTTACTTAGAAAGT
ACAAAATTCTGAGTGTTGGGTAGCAGTTTTCTCTGAGGTTAAAAGTGTTC
ATCCGAGAGGGAAGCTCAGTAAGGCTCACAGGGTGCTCACAGGGTGGTAG
AACAGGGTGTTCGAAGAGAAGGTGAAACATTGCTGCCTCGGGGAAGGTTC
TGGTGCTCCGAAAGTGAACAACTCAAAATAGCTTGAGGAAGTTCCTGAAA
CTGACCGTATAGTCTAGGCCCCTCCCTAAGCATGTAGAAGCAGTAAAAAA
ATGACTGAGAGACTGACAGATATGCTGAGCTTCCAGCTGTGTGGGAGGAG
CCCAGACCGATTTGGCTGCCTGGAAAAAATAAAGATCCGTCCAGGCGGCT
AGCTTGGCAAGTG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 0 3 0 3 10 6 6 6 8 10 10 14 10 10 10 9 9 9 3 0 0 0 0 3 8 8
8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 10 10 11 11 3 0 3 9 11 11 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 9 11 10 13 11 10 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 10 10 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 3 0 0 3 10 10 10 8 8 8 9 9 9 7 6
6 8 8 10 16 21 10 7 6 3 0 3 3 0 3 7 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8 6 6 7 6 8 8 9 9 9 10 8
8 8 8 9 9 13 11 11 13 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 13 12 6 6 6 6 8 6 6 6
6 6 8 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 7 6 8 10 9 9 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 3 0 3 6
8 6 11 6 8 6 6 8 8 13 3 0 3 8 10 8 9 3 0 3 8 8 8 6 6 6 8 6 8 7 6 6 6 6 6 6 10 11 17 13 16 10 9 8 8 8 6 6 6 7
3 0 3 11 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 6 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 12 11 11 15 15 13 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6
6 6 8 8 12 9 9 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 8 8 8 6 6 8 8 12 12 3 0 3 6 8 10 9 8 8 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8
8 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 7 7 9 10 15 15 10 11 11 9 10 10 18 17 12 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 8 8 8 6 7 8 6 6 8 8 8 6
6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 8 10 9 9 9 11 3 0 3 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 11 11 11 11 11 11 10 6 6 6 6 6 7 8 8 8 9 9
9 9 6 10 6 6 6 6 8 8 7 9 9 9 11 11 12 8 8 6 6 6 6 8 7 11 10 10 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 6
6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 3 0 3 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 6 6 6 8 8 8 10 10
11 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 9 12 13 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 10 12 10 8 6 6 6 6 6 7 13 10 18 15 17 16
12 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 10 10 15 10 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 7 6 6 6 6 6 8 10 9 12 12
3 0 3 6 6 6 6 6 6 10 12 10 7 6 6 6 6 6 9 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 3 0 3 9 8 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 9 3 0 3 6
6 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 6 6 8 8 10 10 11 6 6 6 6 3 0 3 7 7 7 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3
0 3 10 3 0 3 8 6 8 8 8 8 8 8 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6
8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 10 9 8 3 0 3 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 6 6
6 6 6 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 8 10 10 3 0 3 11 9 10 8 13 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 3 0 3 6 6 6 6 8 10 11 8 6 6 6 8
6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 6 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 8 3 0 3 3 0 3 8 8 8 10
8 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 10 8 15 11 6 6 6 3 0 3 0 0 3 8 8 8 8 8 11 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 10 8 8 8 3 0 3 9 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 6 8 6 6 8 8 12 3 0 3 0 0 3 12 11 9 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6
6 9 10 10 11 10 10 10 10 8 7 7 9 12 8 6 8 6 6 6 7 11 3 0 3 6 6 8 6 6 8 6 7 7 8 9 11 9 9 3 0 3 0 3 8 6 6 6 6 6
8 11 3 0 3 8 8 8 9 6 6 6 6 8 7 10 6 6 6 7 15 11 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 3 0 3 10 12 11 3 0 3 6 3 0 3 9 9 10
6 7 3 0 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 8 9 10 10 10 8 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 0 3 3 0
3 3 0 3 7 3 0 0 3 12 8 6 6 6 6 6 8 9 3 0 3 6 7 7 8 10 9 11 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 3 0 3 11 11 9 9 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 3 0 3 10 10 9 9 9 11 9 8 8 6 8 6 3 0 3 0 3 3 0 3 9 9 3 0 3 8 3 0 3 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 13 7 10 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 3 0 3 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 8 6 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 13 3 0 3 6 6 6 8 8 7 7 9 9 9 11 11 10 8 8 8 10 7 9 10 8 8 8 8 8 3 0 3 10 9 13 3 0 3 6 6
6 11 8 8 8 8 6 6 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 3 0 3 9 9 8 8 8 9 10 8 8 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 3 0 3 8 8 11 13 13 8 8 8 8 8 8 6 6
6 8 6 8 7 7 8 8 8 3 0 3 0 3 11 11 11 10 8 8 3 0 3 6 6 8 10 10 9 11 12 8 10 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 3 0 3
7 7 8 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 13 11 12 11 12 11 11 3 0 3 0 3 8 6 6 8 6 6 6 6 9 9 8 8 7 7 7 8 11 7 7 7 6 8
3 0 3 9 9 13 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 10 9 9 9 10 10 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8
8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 3 0 3 8 8 7 7 7 7 7 8 6 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 3 0 3 10 10 10 10 9 9 9 10 10 10 12 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 9 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 7 8 8 6 6 8 8 8 6
6 7 7 8 7 6 6 6 6 6 9 11 11 11 16 15 15 18 3 0 | Open.Hide. 6 8 6 6 6 8 6 12 27 24 37 29 29 32 37 39 35 37 44 23 16 6 6 6 6 6 7 6 6 6 8 14 10 10 11 11 13 25 32 37 37 37 37 37 37 23 23 8 8 6
6 7 7 9 7 8 23 18 22 17 15 23 29 31 36 36 48 50 53 47 50 50 53 53 57 53 53 57 57 57 57 57 50 68 68 68 68 68 68 68 47 47 50 50 50 51 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59
59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 48 47 47 47 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 30 21
18 15 11 11 11 16 19 23 32 32 59 47 50 50 50 50 57 59 59 59 59 57 53 50 50 53 53 57 57 57 57 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43 43 46 47 54 57
57 57 59 59 59 57 57 54 57 57 59 59 57 57 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 47 59 42 43
43 57 47 43 43 47 47 57 57 57 57 46 46 39 43 39 42 30 44 43 48 48 54 59 48 43 43 43 48 47 42 47 59 59 59 59 47 48 48 48 59 59 59 57 57 59 48 48 48 48
40 41 41 41 40 39 37 35 27 30 22 31 28 34 32 41 47 47 48 48 47 39 35 30 39 39 48 48 43 43 43 37 37 28 28 28 37 32 34 29 40 40 42 32 30 22 28 30 30 37
37 40 40 43 37 39 39 42 37 35 32 30 32 32 32 35 36 42 32 32 32 33 37 37 37 43 43 59 57 57 48 36 36 31 22 17 24 22 24 30 30 30 37 37 37 37 41 27 18 19
18 20 19 21 22 20 23 23 21 22 20 20 18 17 24 12 14 14 28 28 37 37 36 33 37 34 24 19 15 19 19 21 27 15 15 10 15 15 23 28 28 28 28 34 28 30 30 28 32 21
22 22 28 30 36 24 25 12 12 10 11 8 11 11 13 15 9 9 9 12 15 15 12 15 15 22 24 19 18 16 20 15 12 12 16 16 26 24 13 13 13 12 16 18 18 10 13 13 17 19
16 15 12 10 10 10 15 15 19 14 16 21 23 21 16 20 11 13 13 17 10 11 13 21 21 24 17 14 12 19 14 10 8 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 9 9 11 10 11 10 8
10 8 8 10 13 10 12 10 10 10 10 10 10 |