BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-473A15.T7 (MSMg01no473_a15.b1) | MSMg01-473A15.TJ (MSMg01no473_a15.g1) |
ACC | AG555432 | AG555433 |
length | 1,523 | 801 |
length of high quality (start - end) | --- | 335 (76 - 410) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no473_a15.b1 PHD_FILE: MSMg01no473_a15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no473_a15.g1 PHD_FILE: MSMg01no473_a15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:50:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TGTGTGCTGTTTTAGTGCGCGTGTGTGAGGTGTAGTCTGATGTGATCTTC
TTGGTGAGTGGTGCGATAGTAAGTGGCTATGTGTGTGTTATCTACTCCGT
CGCAGGTACTGACGTGGACGACACGAGGAGCAGTCGGGCAGTGTGGTGGC
GTGGCGAGCGGTAGGCCACCGGTGTGCTGTGTGATGTGTGTTTAGTCGTA
CGCTCACTGTGTGTGTGTTCATCGCTATGCCTTAGCGTACGTGTCTCGCT
TGTGTGTCGCTGCGATCAGCGCGCCGCGGTCGCGCCGCTGTTGGCCGTCT
CCTGCTATGNACTACGCTCTTCGCTACGATCGCTTGCTCGTGTGTTCCGT
TCGGCATTCATCGTCATAGCCTATATCGTCACAGCATAACACGTGCGCGT
CTCTTGCTATCAGTACTCGTTCGTCGGAGCTGAGCTGCTGTCGCGACTGG
CACGCTGGCACTCTATCACTGCGTCTAGCTNTNCGCCATCGGCGCATGAG
TATCGAGTCGTGATNTGTCGGCGTGGTGTGCGCGCGCGTCGACGTTCGTG
CATGGATACTTGTCGACGCGACTATCGTGATTGCCGTGCTGTACGCACGC
GTCACTCTGCGCACGACGGCAGTGATAGTCCAGATTGCAGCATGATCGGT
GCGATGTGACTAGATGAGATGTGATGTGTCTCGTTGGTATGTGATGTTCT
GCGACTGATGTTGATGAGCGAGTGTGAAGATGCATGCGCGCGACGCGACT
GTATGATACGCTCGCTCGATAGTGCGTCACANCTNTACTCTCGATATCCT
ATCGCATGATAAGTGCGGCACGCCGCGTGTGCGCCTCGCTGTGGCGCAGT
CGAGCGTGCGAATACCCGCGTCCTGCTCTCGTATTCATCGTCTCCTCGCG
TANCCCGTGTAGCGACTCTCTTGCTGAGGACGCGTACTCTCGTGCTATAC
TATNCNTTATACACTCGTGGTCTGCTGTCTGTGGCGCGCCGGTGGTTCGT
CGACGCGTTTGTGTCGCGGTCCAGGCGACATAGCGTCACATAAGGTGTAT
GCGACACAGACTGGCGTGGTCGCAGCTTCGTTCTGATTCANACCCACGAC
GATATGCTGTGTCTGCGTCGCGACGGAGCGGTAGCGCGATCGCTGTGATA
TCATATATGCGCGTGCGTATTGGTGCGCTTCGTTATAGTACCCGTGTCCG
GACGCCTCTCACGTGTGAGTGCCCTGACAGCTGTCGTGCATGCCCGCATC
TATNGACATCAGCGCGATCGCTGCCGCTGGAACGTTTGACCGCGTNGACC
GTCAGGCACGGAGAGCGCACAGTGTNCTCGTGTACNGCACTCGCATGACT
CTACGACNTACGCGGACGCGCGCGTGTCGACTCGTATNTGTAATGATCCA
CACGCGCTCGACTATCGCTCGCTCNAGACTCGGATGTCTTAGACCTTGCT
GTTCCGTGGATCTATACGCGAACATCACATTTGCGTGACTGACGCTGTGC
GCGTTGTGCGTCGAGGCGCGTCN
| ACTATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTTCTGGGCTACTTGAGCGACATG
GGTAGTGTGGCCACGTGTTCTGGGCCAGGAATCTGGCAGGGATCAGGGAG
ACATCTACCCTCTCAGGTGGGTGCCTGGGTGCCAGGGTCTCAGACCCACT
CGATTCAAGTTTCTTGGCATGGTTCTTTGTTGTACATCTTGTTAATCTCA
GATGGTGAGTGTTGCAGCTCTTATGAGATGAAGGCTGTGGTTTTCTTGCT
CACTTCTCTCGTCCATGAACAAAGATATTTTTGAGAGGTAACTATTTTCA
GCTGAAAGCAAACAGCCTTTTAAAAAGTGTCTCTGTTTCCTTAGGTGCAG
ACATTTTGGAAATGCCAAATCGAAAATGCATATGCTCCCGTGGAAGAAGC
AAAGGGGGTTGATTTGCTAAGTGTGCATCTCTTTGTTGTGGCTCAAAAAT
CTGAGCGTGATTTCTTGGGAAACCGTCCTAGTGTAATTGAAAGAATTCTG
TGGTTCTAATTTGTGAGCCCCCACTGGGGCTGTCTATTTCTATTTATATT
TTTGTCCTTTTTATGGGTTACTCCGTTAACCTATTTCTTTGTTTTGCCAT
CTGCGTTACTTCTGGTTGATTATTCGTCCTTTCCGTTTCTCTACATTCGC
ATACTCTTTCTATAAACATAAGTTCTTTATAGCTGTTATTCTCCCCTTTA
TGACTTGTCTTTTTTATTTATGCTGTCTAGTTTAGATTTATACGCTCATC
T
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 6 6 6 8 6 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 11 6
8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 10 11 11 10 10 10 10 12 8
8 8 8 8 6 8 10 10 9 8 11 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 8 6 6 6 8 7 6 6 6 10 9 9 7 7 8 8 7 10
9 9 10 10 10 7 7 8 7 6 8 6 6 6 6 7 10 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 9 6 10 7 7 8 8
10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 11 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8
10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 7 8 10 10 9 9 9 10 9 8 8 6 7 8 6 7 6 8 8 8 8 8 11 9 6 6 6 8 6 8 7 8
7 8 8 8 9 11 11 11 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 10 6 9 6 6 6 6 7 9 11 10 12 9 9 9 11 9 9 9 8 11
7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 12 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 3 0 3 0 3 11 11 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6
6 6 8 10 8 6 6 8 8 10 11 13 11 3 0 3 7 8 8 8 6 9 10 9 9 11 10 11 10 11 11 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 9 9 12 12 12 6
6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 7 8 8 8 8 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 9
10 10 10 10 15 15 15 11 11 11 11 11 11 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 7 8 8 8 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 7 7 7 9 11 11 11 11 14 15 18 13 11 11 11 11 9 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 7 7 7 10 10 8 6 6
6 10 11 8 8 8 8 10 11 11 6 6 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 13 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6
8 7 8 9 12 12 11 17 9 8 8 6 6 6 8 8 8 9 9 10 11 11 11 8 6 6 6 6 6 10 3 0 3 3 0 3 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 6 8 8 6
6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 6 6 6 8 7 7 7 8 8 8 8 10 10 8 8 10 13 9 9 9 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 6 6 6 8 6 8 8 8 9 7 7 8 7 7 9 12 11 22 10 10 9 8 8 8 8 8 10
10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 10 9 9 9 9 9 7 7 12 10 10 9 11 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9
9 9 3 0 3 0 3 11 7 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 7 8 8 9 11 12 12 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 8
6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 10 8 8 13 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 19 14 18 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 10 8 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 7 12 9 9 10 7 8 8 9 11 11 11 3 0 3 8 8 7 7 7 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 14 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 12 9 11 11 11 11 9 9 8 7 9 7 7 6 6 8
8 8 8 9 11 11 6 8 6 6 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 6 10 11 9 10 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 13
12 12 11 11 11 9 9 9 10 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 10 10 15 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 9 9 9 15 8 8 6 6 8 6 7 9 7 10 7 7 9 7
7 7 3 0 3 10 10 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 7 6 6 3 0 3 6 6 6
6 6 6 6 8 7 7 8 6 6 6 8 9 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 8 8 8 8 11 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8
8 8 6 8 6 6 3 0 3 11 11 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 7 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 3 0 3 8 8 8 11 6 6 6 6 8 6 6
8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 3 0 3 6 8 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10
10 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 11 10 8 6 6 6 6 6 6 9 9 8 9 8 8 8 8 10 9 8 7 6 6 6
6 6 6 6 8 10 10 11 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 8 8 10 8 7 8 8 19 16 19 10 10 11 19 33 32 37 39 39 41 42 50 50 50 47 47 39 25 23 9 9 9 12 11 11 18 17 20 20 30 30 39 37 37 47 47 53 50
50 47 36 33 50 50 50 42 34 27 18 11 12 11 15 15 16 23 30 29 31 31 31 28 35 36 38 38 42 42 53 53 50 57 57 57 57 57 53 53 57 57 57 68 50 50 50 50 47 51
68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 54 54 54 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 50 50 46 50 50 50 57 57 57 57 57
50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 52 57 57 57 57 57 57
57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 52 52 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 54 52
57 52 54 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 52 52 47 47 43 43 35 37 43 50 50 57 57 59 50 50 43 47 47 57 43 43 43 44 44 48 57 48 48 43 42 37 35
30 30 32 44 37 43 43 43 43 37 27 26 18 18 12 13 13 26 32 32 36 23 23 36 36 43 43 43 43 43 43 43 47 47 43 43 43 47 43 48 43 43 43 43 30 33 29 43 36 28
25 28 28 37 39 37 28 19 16 14 16 22 24 17 17 20 21 25 14 18 14 28 28 33 21 21 19 14 14 17 22 31 34 37 30 30 23 15 10 15 10 11 10 12 22 22 22 18 27 28
30 33 33 37 32 28 28 37 28 21 21 10 10 10 19 11 14 12 18 10 10 10 10 19 14 18 15 12 21 21 28 24 17 10 8 8 13 15 17 16 17 10 10 12 9 11 9 10 11 10
12 19 19 16 16 10 8 8 8 8 8 10 10 15 22 10 10 15 19 15 10 8 8 8 8 9 8 9 9 9 9 9 11 10 8 10 8 9 9 10 10 10 10 11 13 14 15 13 10 10
11 9 9 14 12 14 16 18 13 8 8 8 8 10 15 9 9 10 12 14 19 14 10 9 9 10 10 8 8 8 8 13 10 10 10 8 10 9 8 8 6 6 8 11 11 22 14 14 14 17
16 20 20 14 16 10 10 9 10 10 10 11 12 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 11 8 8 6 7 8 8 10 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8
8 8 9 9 10 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 7 10 8 10 10 11 13 11 9 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 8 8
10 10 10 10 11 11 11 15 8 10 8 12 8 8 8 8 9 10 10 11 11 12 16 12 18 12 17 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 13 8 8 10 10 9 9 10 10 10 10 8 8
6 6 8 6 6 8 6 7 10 8 10 10 12 13 12 12 12 10 10 8 10 8 8 8 11 11 12 12 11 11 11 9 9 8 8 8 7 8 8 10 11 18 8 8 8 8 8 8 9 9
9 |