BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-499A08.T7 (MSMg01no499_a08.b1) | MSMg01-499A08.TJ (MSMg01no499_a08.g1) |
ACC | AG575204 | AG575205 |
length | 756 | 753 |
length of high quality (start - end) | 249 (68 - 316) | 380 (321 - 700) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_a08.b1 PHD_FILE: MSMg01no499_a08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no499_a08.g1 PHD_FILE: MSMg01no499_a08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:25:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCTACAT
CTTTACTACAGACTGCAAAGGGACTGTCAACACTGGGCTTAGTTTGATCT
AAAATACCTCTTCCATAGTAACTCACTTTGTCCAACAAGGCCACATGTAT
TTCCCAGAAGTCCATACCTCCTAAAATTGCTGCTTCTTGTGAACCAATCA
TTCAAATACATGAATCTTCAGGGCCCATACTTATTCAAAACAGCATATTG
TGGCATGTATTTTAATTGATAGAGATGTTTCCCCTATTCCCGTCATCTGT
ACAAATCGAATGATTTCTGCTGTCCTTTGCCTATAGCGGGGGAAGGATCT
TCTCTTTAACCTAGAAGACTGGGTTAAAGATTCCCATACTTTGTAACTTC
CAAAGCAGCTCAGTGTGTAAAGTGAGATGTTTGAATACCCACATTTTTCT
ATGGATTCAATTCTTTCAGTAATCAGTATGACTCTGATTGGTTTTAAAGC
CAAATAGTTTATATTTTTGACGCTAGGAGTGTGAAATAAAGTATCACAAC
TGCTCTTCTCAATGCTCTAAAGGATAGTCTTTCCTTCAGTGTTTTGTGAC
AGCATGATCTAAAGCCAATGACTCCACTTTTCGTGAGTTACATTCCTGTG
GTATTCCTCCAACTTCTCCTTGTAAGTTTCCTGTAAATGGATTTTTAAAG
TGATGGATTGTAATTAATGGTAATATGACAATAGGGCCCAATTGTTTACT
AAATAT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTT
TGCAATATACAACGGAGGATCCAGAGAAAGATGTCAGCTACTATACAGCT
GGAGTAAGCCTCCCCACGTGGGTATTGAGAATGGAACTTCTATCCTCTGG
AAGAGCTATAACAGTTCTTAACATCTGATAGTCTCCCAGATCTGCTTTGC
ACATTTCACTGAAGAACAATGCCTGAAAATGCCATACGCCTTTTATCTAT
TCACTCCTAAATGGAAAGTTTGACATTTTGATTCTTTACAATACTGGTTA
TGCTTATGCTTCTTATTTTGGTAGAACTCTCCAACAAGGACATGAATGAA
ACTGGGATTTCTTCTGTCAGAGAAATTATTGATTACTCAAATATTGGTCC
CTTTAATCTTTGCTCTTCACATTTACTAGAAATTCTTTGTTAAGAAATAA
GTCCTCAAATCTCATCATGTATCCCGCATTGACGTTCAGATAAACCCCAA
GTCTGATGTCCTAGGATGCAGACTTCTTAAGATTTTTGGGAAACAAAATT
ATCTTCTTAACTACTCTGCTTCTGGTACTTTCACTAATTTTAATGGACTT
TTTGTTTTGGAATACATGGAATGTAGCCTGTGCTTGTACATGTGCATGTG
CATGTGTGTGTGTCGTTGTGTGTGTGTGATGGTGATGGTGATGGTGATGG
TGAATGGTGGTGNACCCCCCCTCCCTTCCCCCGTCTTTACTTTTTCCCCT
TGT
|
quality values | Open.Hide.22 30 34 30 22 18 24 18 14 10 10 10 21 21 41 28 30 28 28 23 29 29 27 9 9 7 7 7 8 7 7 10 10 12 12 16 12 12 11 21 21 29 30 33 33 39 39 33 33 33
33 27 27 9 9 9 9 9 9 9 9 12 16 16 17 17 17 17 18 23 33 34 50 50 50 50 53 53 53 53 57 57 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54
57 57 68 57 57 57 39 39 35 36 36 26 28 28 22 32 32 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 37 37 39 44 57 57 57 57 57 57 43 43 50 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 43 43 35 43 44 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 50 43 41 41 59 44 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 59 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 50 50 50 35 43 43 59 57 57 57 57 57 57 43 47 47 57 57 57 57 48 57 57 57 48 44 44 32 24
22 34 34 57 57 57 48 48 48 59 59 57 57 59 57 57 57 57 47 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 59 47 57 57 59 47 47 33
33 30 33 37 39 43 33 33 30 37 37 37 37 25 25 12 12 11 11 11 9 15 11 19 19 34 34 43 44 26 28 28 31 31 42 48 48 48 48 57 59 48 48 48 48 43 43 43 48 43
43 43 43 43 39 43 30 30 30 43 27 32 32 20 20 31 32 43 46 44 46 43 43 43 47 57 57 54 54 44 44 41 41 41 35 32 31 29 29 31 36 28 28 32 30 30 30 37 28 23
23 23 23 25 30 26 19 19 19 21 21 8 8 8 14 19 19 18 18 26 26 30 28 18 16 11 11 11 13 15 23 14 18 18 34 28 32 30 30 24 24 25 17 24 31 34 42 30 42 43
34 34 34 39 46 34 42 33 37 37 42 59 59 48 47 30 30 16 11 10 15 15 15 13 10 15 15 26 32 43 34 30 15 14 14 18 18 18 10 9 8 8 8 12 30 33 35 32 32 24
24 20 19 16 18 11 15 15 21 24 24 24 22 24 28 37 37 18 13 9 9 9 13 15 11 11 11 11 15 18 34 37 43 47 39 29 23 20 16 17 13 12 8 8 8 8 8 10 10 10
10 10 11 11 11 18 23 34 43 39 37 28 22 21 21 19 21 17 27 23 17 10 10 11 8 8 8 9 10 10 17 26 30 37 26 23 14 11 11 11 15 11 11 11 10 10 8 10 13 8
10 10 8 8 8 8 9 10 10 13 15 15 13 10 9 9 9 10 10 10 14 12 14 10 13 14 14 14 26 26 17 10 10 10 11 11 9 9 9 9 8 8 10 8 8 9 17 11 10 10
11 17 18 13 15 10 10 10 10 13 12 15 15 15 21 19 14 12 11 11 8 8 8 8 8 14 19 15 18 12 12 12 12 13 10 13 13 10 10 10 10 11 11 12 11 11 15 10 8 8
8 8 8 12 8 8 8 9 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 11 11 11 11 11 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 9 9 8 8 8 10 10 9 10 12 10 10 10 6 6 6
8 11 10 12 19 13 | Open.Hide.11 11 25 25 39 41 41 42 50 50 50 50 47 33 27 18 9 9 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 15 17 15 10 11 25 25 41 50 50 50 50 47 37 23 21 10 9 8 8
6 6 6 6 8 8 8 10 8 10 15 15 24 18 28 21 22 32 32 36 36 36 36 38 38 57 59 59 50 47 47 47 47 40 40 40 50 48 57 57 57 57 59 54 50 48 48 50 50 68
68 68 68 68 48 44 36 30 27 30 41 42 42 46 44 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 57
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59
57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 54 54 59 59 59 59 57 59 59 59 57 40 42 30 30 30 42 32
44 42 48 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 41 34 23 15 14 10 10 10 13 16 15 15 12 19 33 33 59 59 59 59 59 57 57 48 48 57 57 57 50 53 53 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68
59 59 43 47 43 43 43 46 46 54 54 54 54 48 48 48 47 47 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 59 48 48 48 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 68 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 57
59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 43 43 39 47 43 57 57 48 48 57 48 44 47
57 57 57 59 59 57 54 54 54 54 59 59 54 50 48 48 46 44 42 35 35 37 47 47 54 54 54 43 48 43 43 43 43 43 57 59 59 59 59 59 57 47 47 47 47 47 47 37 37 37
37 46 41 41 43 38 34 34 39 39 44 47 47 47 47 48 47 47 46 41 41 39 32 29 29 32 37 41 41 41 41 37 37 37 37 37 37 39 41 32 32 35 31 30 25 36 39 39 37 32
30 30 27 30 20 20 29 29 28 26 29 28 35 32 32 32 35 31 32 43 41 41 39 37 36 37 31 26 34 23 23 23 34 32 33 33 29 24 31 34 39 35 35 35 39 32 47 35 35 30
34 33 32 33 33 42 42 43 43 47 47 47 43 39 36 33 36 34 47 39 39 39 48 43 47 35 37 37 30 28 22 31 21 21 17 17 17 22 27 30 30 30 27 27 28 24 19 18 18 12
12 13 11 9 8 8 8 8 7 8 11 3 0 3 7 8 8 9 9 9 11 10 10 9 8 8 10 10 8 8 9 10 10 10 12 10 10 9 11 11 15 8 8 8 15 10 10 10 10 12
10 10 10 |