| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-539P11.T7 (MSMg01no539_p11.b1) | MSMg01-539P11.TJ (MSMg01no539_p11.g1) |
|---|
| ACC | AG606331 | AG606332 |
|---|
| length | 767 | 757 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 620 (69 - 688) | 349 (326 - 674) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no539_p11.b1 PHD_FILE: MSMg01no539_p11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:19:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no539_p11.g1 PHD_FILE: MSMg01no539_p11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:19:06 2005 |
|---|
| singlet/doublet | doublet | doublet |
|---|
| BLAST hit | unique | unique |
|---|
| Map location. | (133,178,083 - 133,178,508) | (133,004,638 - 133,004,986) |
|---|
| sequence | NCCCCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCAGCTTCTCGCATACCGAGCAGAACTACTGAGTTACACCCCAG
CTGCCGGATTTTTTTTTTTTTTTTGAAACAGGCTCTAGCTCTGATGCCCT
GTTCAGTGTTGCAAGATATTTGATCACACAATGAACCCCAAGTCTGTTAT
TTACTGGGGAAAAACAAACTGTTTCTAGTTGTGGTGTGGCACAGCACTTA
GCACTCACCTTTAATCCCTCTAGCTGGAATACAGACACGCCCTTAGTACC
TTTCACCCCAAACAATGAAGGTAACGTTAGTTTATAGAAGGGAGCACCCA
CATTTGAAAGTGATATCACACACATACACTTACACATTCATACACATGCA
CCCATACACAGACACACATATACACACATAAACTCAAACAACACATGCAG
AGTCACACATGTATACATTTACACACACACATACACTCATAGACACATAT
ATACTTTACACACAGAAATCTCACACACACAAACTTGCCTCTGGTTCTTG
TGCTGCCTTTGGATTACCGCTATTTCTATGATTCCTTGGACCTGGGAAAA
TGCGGCAATGTCTGTTATGAACATCCTCTTCCCTCCAGGCTTCTAAGCCA
CACACACACACACACACACACACACACACACACCTCACACATACACACAC
CTCTCTCACACACACACACCACACACACATACATCTTTAATAACACACAC
CTTTATAAAAAAATACC
| TTCCTATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCCTCATGTGAGAGCAAGAAT
GGAGAGCAGCAACCCAGGGTGGGAGGTGACCGTGTGAGCGGGGGAGAAAG
GTAAGAAGGCAGACTCTGAAAGAGAAGTACAGAGGACATCAGGCTGGCTG
TTCATTTATATCTGAAGATCCTGTTGCTTTAGGCCCTCTAATTCAGGCCA
GGAAAAACTGGGGGTGGGGTTGGAGCGAGGGGAGGGGGACCAGGTCCCTC
CCTTGGGCCCTCCCGAGGTATGTCAGGAGTACACAGAGGTGTTTCTTCAC
TTCCCCATGTGATCACAGCCGCCTGGACCAGTGTGCCCGCTCACATCACT
GCTCAGGAATCTGGCTCTTGTTTACTTAACACAACAGCACTGCTCCTCCT
GCTTTCCAGAGAGCTTGTGGAGGAGCCTGGGGCCTGGGAAGGGGAACCTG
CACAGGAGAGCTGCTGAATAGGAGCAGTGAACTCCTGAGCTCCAGCCCAG
TCAAGGCCTCCCTCACCGACATGGAGAGTCTGGAGAGATCTTGGGTTTCC
CTGGCCTTCCCGAGACCAAGATACCTGAAGCCCAAATCCTCACATGAGGA
TTTGGGGGAGAAATTGGATGACACACCACCTATTGTGTGTTCTGTTTTCT
GCCAAGAAATGACTGGGTGTAGCACAACACATGTCCGTGGTGGAGTAATC
TGGTAGA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 10 10 10 10 10 10 10 11 15 15 15 13 13 12 23 11 9 9 9 9 22 23 41 30 19 21 9 9 9 9 9 9 10 9 11 11 11 11 17 17 19 12 14 19 32
39 37 31 28 28 28 28 21 19 9 9 6 6 6 6 8 8 10 16 22 36 39 43 47 37 37 39 39 50 50 57 57 57 57 50 53 53 50 50 50 57 57 57 57 54 54 54 43 42 43
43 57 57 59 57 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59
54 54 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 51 57 68 57 57 57 52 52 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 26
26 38 44 44 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 26 26 12 13 26 39 44 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 43 44
35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 50 50 50 52 52 52 52 52 52 57 52 59 54 54 52 59 52 52 52 57 52 52 52 52 52 57 59 59 54 54 54 59 57
59 57 59 57 57 57 42 42 35 42 42 46 46 47 47 59 59 59 59 57 57 54 54 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 54 54 48 57 48 47 47 41 39 43 47 47 47 43
43 43 43 43 43 43 43 46 46 57 43 43 43 43 43 43 43 40 43 43 48 48 48 48 57 48 48 48 43 43 40 40 40 41 41 41 41 31 31 37 31 31 39 31 34 43 43 34 36 36
28 28 23 23 34 34 31 31 36 37 41 39 40 40 40 43 43 43 43 43 39 39 39 39 39 41 41 37 32 31 31 26 37 24 24 17 24 20 30 37 32 24 32 24 28 24 34 24 25 33
37 37 39 41 41 41 35 35 32 33 30 30 30 36 39 32 32 23 19 22 24 24 18 18 16 24 27 30 30 30 37 27 24 27 22 19 12 28 15 15 12 12 10 13 11 14 14 19 18 16
16 12 12 11 11 11 12 11 12 12 18 15 23 23 34 31 39 32 30 25 24 24 19 19 20 25 18 12 8 8 8 10 10 11 11 14 8 10 10 6 6 6 8 8 8 8 11 14 9 13
13 11 10 12 10 8 8 9 11 12 10 7 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 7 7 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 15 8 9 10 13 13 41 37 37 33 33 33 32 32 28 32 44 18 18 9 6 6 8 6 8 8 8 8 8 9 15 25 22 19 12 21 30
37 32 33 33 33 33 33 33 21 17 9 9 9 9 10 9 9 9 15 20 28 25 15 15 16 24 27 29 41 47 50 33 33 33 36 36 36 57 57 57 53 53 57 57 57 57 50 50 50 50
50 50 59 59 57 54 54 54 54 54 48 47 43 47 43 43 46 46 57 57 57 48 48 48 50 57 57 57 57 57 57 54 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 48 50 57 50 50 50 57 57 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 57 54 54 57 57 57 57 57
57 57 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 57 57 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 30 19 19 11 11 12 12 11 12 12 18 23 31 39 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 68 59 57 48 48 48 57 48 48 48 46 46 40 40 46 46 48 48 48 54 54 54 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 52 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 50 57 57
54 54 57 44 44 43 35 35 43 50 57 57 57 59 59 59 57 57 59 43 43 43 44 57 44 57 43 44 44 37 37 48 57 57 68 57 57 54 48 48 47 57 43 47 39 39 37 39 39 43
43 54 54 54 57 48 48 46 48 46 57 57 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 30 30 17 17 24 30 34 43 43 40 39 39 41 41 41 43 39 41 44 37 37 37 37 37
37 39 41 41 36 32 37 34 37 39 32 32 37 26 22 12 12 12 24 28 35 39 39 46 46 43 43 33 33 33 33 33 34 39 37 39 35 37 37 33 28 28 34 34 37 37 30 25 25 32
21 27 28 31 28 34 30 39 37 36 15 19 10 9 9 10 19 32 37 34 37 24 22 13 9 9 9 9 9 16 20 20 13 14 10 13 12 14 17 20 14 21 24 14 10 8 8 8 8 13
8 11 12 12 12 19 19 29 29 37 37 35 35 32 31 29 33 24 19 10 8 8 8 7 7 9 13 10 10 8 6 6 6 8 8 10 10 10 11 12 13 12 11 8 9 8 8 8 8 8
10 9 10 16 10 10 10 |
|---|
