BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-005I03
Chromosome10 (Build37)
Map Location 123,855,579 - 123,993,537
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930503E24Rik
Upstream geneAI851790
Downstream geneLOC671416, Slc16a7, LOC100042987, EG668313, LOC100042992, LOC668317, LOC100042994
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-005I03.bB6Ng01-005I03.g
ACCDH842625DH842626
length1,0311,016
definitionDH842625|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-005I03, 5' end.DH842626|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-005I03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,992,503 - 123,993,537)(123,855,579 - 123,856,599)
sequence
gaattctaaaaactgagataatgcagattgctgcggaatcaatgtttgaa
gttcctctcagcaacagggtttacactgttgaattgtacatctgtgaatt
ttattgcaggacaaaatttgttgaatatacaaaaaataagacagatcata
atgaaatgcctttcagggtctcaggaatgagagttttcaagcctgttcat
catacaacaagcaactgaaaaatgtgaataatttacctattctgttactc
ttttacttgtcatcctgctcatatgatctatattcctctaagacagaatt
cactaagcttactgcattctttgacgccttgtgcacattaccgttagtct
tgaggtgatagctaatgtgataagcagtaattattttcatattccaacac
ttatgcacagtacatgctacatatcatgaggaacagaaactcattgatga
taaatcttctaccttccatgaaacataaatcactagatctgctgctaaag
ctgatcagacacattctacattccattttatccacagatatattcatttt
tcttcatgagcatttggagtctgcagaataaatcttaaatggctagcaat
tttgtcgtggtatattgttttaaatggattttcattgggttgttttgtga
tgcttagagtatacttacttttatatctcctcatcaagatagaaacaccc
acacacacatacacccctccacacacacacacaaatttcttgtgtagttc
agaagagggacgtagaagaactgagcatccaataactaaatgagatgctc
taaagctttatctattctggataccattaaagttcagtgtaattatattc
aacccactacatatttgtatagcaactatagtaggtttcacgccttccct
catcagctcatatctatcaaacagaaatttcaaagtaagtgagatacatt
ttcatagcgaagtttccaacaaaaatgtacttttcagagtcatcggttta
agagattggaactcctcatgaggatattgat
gaattctttatgttgtatacacttcaatatatttgcaattggctaccaaa
gtatggtaatcactaatagcttgttgttactttcatgttggatagacctt
aaatttctttatagaaatttacacatgtgatatgcccttcatactaagtt
gttccttttgagatgtatctttgggcattacattcttaggcaactctgag
tttttttacatctcagtgtaatcatcttcctgtggttgttattagtgagt
ttggacacaatggattctatagtagagttgaagaaattcaccctctgtgt
ggatcttgcgagagtatggtcctcttagaaatttatgggtgtgtgatgca
cacactaaagtgtgtgtactgtactgtgcatggttattcccacaacataa
tgctgatccttgatgagaactttctcagcccacgttaacattagttgcta
cttgaatgcctctctattactagctattccaatactagtgaaagcctgaa
gtacttattgagttagaaagtggcagaggaaaagacacttcacaagagaa
taggaattgcaggcactctgtgatacccataacaaatcctgtcaacactg
tgtgaaatgtgtgtgacccaggtccttcctctccagctgtggctgcataa
agatggggtaatggttaaggttttactcaaccaggtatttttaagtttta
ttatcatcaaggcacaaacaaaaaattgtcaatttcactgagggtctctt
ggagccatctagagaatgggcatgtccggatttttgttgtctagcaacat
ttctgtctgactcctcggaagttgtatgatcacggagaggcaatagccaa
tgatgctattcttttcatttacattgagcatcatgggtcagactgagtgc
actgtagcttgagcaagcgaaagatctatcggacgtgatctgaaagttat
caaagacattcactctcaatgagactcttttacaatgctcaatgtaacta
gaactacgtatgaact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_123992503_123993537
seq2: B6Ng01-005I03.b_44_1074 (reverse)

seq1  ATCAATAT-CTCAT-AGGAGTTACAAAATTCT-TAAAACAGATGACATCT  47
      |||||||| ||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||| |||
seq2  ATCAATATCCTCATGAGGAGTTCCAA---TCTCTTAAACCGATGAC-TCT  46

seq1  GAAAAGTACATTTTTGTTGGAAACCTTTGCTATGAAAATGTATCTTATTT  97
      ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||
seq2  GAAAAGTACATTTTTGTTGGAAA-CTTCGCTATGAAAATGTATCTCACTT  95

seq1  ACTTTTGAAATTTCTGTTTGATAGATATTGAGCTGATG-GGGGAGGGGTG  146
      || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||
seq2  AC-TTTGAAATTTCTGTTTGATAGATA-TGAGCTGATGAGGGAAGGCGTG  143

seq1  AAACCTACTATAGTTGCTATACAAATATGTAGTGGGTTGAATATAATTAA  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AAACCTACTATAGTTGCTATACAAATATGTAGTGGGTTGAATATAATTAC  193

seq1  ACTGAACTTTAATTGTATCCAGAATAGATAAAGCTATAGAGCATCTCATT  246
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ACTGAACTTTAATGGTATCCAGAATAGATAAAGCTTTAGAGCATCTCATT  243

seq1  TAGTTATTGGATGCTCAGTTCTTCTACGTCCCTTCTTCTGAACTACACAA  296
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TAGTTATTGGATGCTCAGTTCTTCTACGTCCC-TCTTCTGAACTACACAA  292

seq1  GAAAATTGTGTGTGTGTGTGGAGGGGTGTATGTGTGTGTGGGTGTTTCTA  346
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATTTGTGTGTGTGTGTGGAGGGGTGTATGTGTGTGTGGGTGTTTCTA  342

seq1  TCTTGATGAGGAGATATAAAAGTAAGTATACTCTAAGCATCACAAAACAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATGAGGAGATATAAAAGTAAGTATACTCTAAGCATCACAAAACAA  392

seq1  CCCAATGAAAATCCATTTAAAACAATATACCACGACAAAATTGCTAGCCA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATGAAAATCCATTTAAAACAATATACCACGACAAAATTGCTAGCCA  442

seq1  TTTAAGATTTATTCTGCAGACTCCAAATGCTCATGAAGAAAAATGAATAT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGATTTATTCTGCAGACTCCAAATGCTCATGAAGAAAAATGAATAT  492

seq1  ATCTGTGGATAAAATGGAATGTAGAATGTGTCTGATCAGCTTTAGCAGCA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGGATAAAATGGAATGTAGAATGTGTCTGATCAGCTTTAGCAGCA  542

seq1  GATCTAGTGATTTATGTTTCATGGAAGGTAGAAGATTTATCATCAATGAG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGTGATTTATGTTTCATGGAAGGTAGAAGATTTATCATCAATGAG  592

seq1  TTTCTGTTCCTCATGATATGTAGCATGTACTGTGCATAAGTGTTGGAATA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTCCTCATGATATGTAGCATGTACTGTGCATAAGTGTTGGAATA  642

seq1  TGAAAATAATTACTGCTTATCACATTAGCTATCACCTCAAGACTAACGGT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAATAATTACTGCTTATCACATTAGCTATCACCTCAAGACTAACGGT  692

seq1  AATGTGCACAAGGCGTCAAAGAATGCAGTAAGCTTAGTGAATTCTGTCTT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGCACAAGGCGTCAAAGAATGCAGTAAGCTTAGTGAATTCTGTCTT  742

seq1  AGAGGAATATAGATCATATGAGCAGGATGACAAGTAAAAGAGTAACAGAA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAATATAGATCATATGAGCAGGATGACAAGTAAAAGAGTAACAGAA  792

seq1  TAGGTAAATTATTCACATTTTTCAGTTGCTTGTTCTATGATGAACAGGCT  846
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TAGGTAAATTATTCACATTTTTCAGTTGCTTGTTGTATGATGAACAGGCT  842

seq1  TGAAAACTCTCATTCCTGAGACCCTGAAAGGCATTTCATTCTGATCTGTC  896
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TGAAAACTCTCATTCCTGAGACCCTGAAAGGCATTTCATTATGATCTGTC  892

seq1  TTATTTTTTGTATATTCAACAAATTTTGTACTGCAATAAAATTCACAGAT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTTGTATATTCAACAAATTTTGTCCTGCAATAAAATTCACAGAT  942

seq1  GTACAATTCAACAGTGTAAACCCTGTTGCTGAGAGGAACTTCAAACATTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAATTCAACAGTGTAAACCCTGTTGCTGAGAGGAACTTCAAACATTG  992

seq1  ATTCTGCAGCAATCTGCATTATCTCAGTTTTTAGAATTC  1035
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCGCAGCAATCTGCATTATCTCAGTTTTTAGAATTC  1031

seq1: chr10_123855579_123856599
seq2: B6Ng01-005I03.g_67_1082

seq1  GAATTCTTTATGTTGTATACACTTCAATATATTTGCAATTGGCTACCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTATGTTGTATACACTTCAATATATTTGCAATTGGCTACCAAA  50

seq1  GTATGGTAATCACTAATAGCTTGTTGTTACTTTCATGTTGGATAGACCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGGTAATCACTAATAGCTTGTTGTTACTTTCATGTTGGATAGACCTT  100

seq1  AAATTTCTTTATAGAAATTTACACATGTGATATGCCCTTCATACTAAGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTCTTTATAGAAATTTACACATGTGATATGCCCTTCATACTAAGTT  150

seq1  GTTCCTTTTGAGATGTATCTTTGGGCATTACATTCTTAGGCAACTCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCTTTTGAGATGTATCTTTGGGCATTACATTCTTAGGCAACTCTGAG  200

seq1  TTTTTTTACATCTCAGTGTAATCATCTTCCTGTGGTTGTTATTAGTGAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTACATCTCAGTGTAATCATCTTCCTGTGGTTGTTATTAGTGAGT  250

seq1  TTGGACACAATGGATTCTATAGTAGAGTTGAAGAAATTCACCCTCTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACACAATGGATTCTATAGTAGAGTTGAAGAAATTCACCCTCTGTGT  300

seq1  GGATCTTGCGAGAGTATGGTCCTCTTAGAAATTTATGGGTGTGTGATGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCTTGCGAGAGTATGGTCCTCTTAGAAATTTATGGGTGTGTGATGCA  350

seq1  CACACTAAAGTGTGTGTACTGTACTGTGCATGGTTATTCCCACAACATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACTAAAGTGTGTGTACTGTACTGTGCATGGTTATTCCCACAACATAA  400

seq1  TGCTGATCCTTGATGAGAACTTTCTCAGCCCACGTTAACATTAGTTGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGATCCTTGATGAGAACTTTCTCAGCCCACGTTAACATTAGTTGCTA  450

seq1  CTTGAATGCCTCTCTATTACTAGCTATTCCAATAGTAGTGAAAGCCTGAA  500
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTTGAATGCCTCTCTATTACTAGCTATTCCAATACTAGTGAAAGCCTGAA  500

seq1  GTACTTATTGAGTTAGAAAGTGGCAGAGGAAAAGACACTTCACAAGAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTTATTGAGTTAGAAAGTGGCAGAGGAAAAGACACTTCACAAGAGAA  550

seq1  TAGGAATTGCAGGCACTCTGTGATACCCATAACAAATCCTGTCAACACTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAATTGCAGGCACTCTGTGATACCCATAACAAATCCTGTCAACACTG  600

seq1  TGTGAAATGTGTGTGACCCAGGTCCTTCCTCTCCAGCTGTGGCTGCATAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAATGTGTGTGACCCAGGTCCTTCCTCTCCAGCTGTGGCTGCATAA  650

seq1  AGATGGGGTAATGGTTAAGGTTTTACTCAACCAGGTATTTTTAAGTTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGGTAATGGTTAAGGTTTTACTCAACCAGGTATTTTTAAGTTTTA  700

seq1  TTATCATCAAGGCACAAACAAAAAATTGTCAATTTCACTGAGGGTCTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCATCAAGGCACAAACAAAAAATTGTCAATTTCACTGAGGGTCTCTT  750

seq1  GGAGCCATCTAGAGAATGGGCATGTCCGGATTTTTGTTGTCTAGCAACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCATCTAGAGAATGGGCATGTCCGGATTTTTGTTGTCTAGCAACAT  800

seq1  TTCTGTCTGACTCCTCTGAAGTTGTATGATCACGGTGAGGCAATAGCCAA  850
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCTGTCTGACTCCTCGGAAGTTGTATGATCACGGAGAGGCAATAGCCAA  850

seq1  GGATGCTATTCTTTTCATTTACAGTGAGCATCATGGGTCAGACTGAGTGC  900
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCTATTCTTTTCATTTACATTGAGCATCATGGGTCAGACTGAGTGC  900

seq1  ACTGTAGCTTGAGCAAAGCGAAAGATCTATCGGAGGTGATCTGAAAGTAA  950
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  
seq2  ACTGTAGCTTGAGC-AAGCGAAAGATCTATCGGACGTGATCTGAAAGT-T  948

seq1  ATCAAAAGACATAACACTTCTAAATAAGATTCTTTAAATGTGTGCAAATG  1000
      ||| ||||||||  ||| ||| ||| ||| ||||| |   ||  | ||||
seq2  ATC-AAAGACAT-TCAC-TCTCAATGAGACTCTTTTACAATGCTC-AATG  994

seq1  TAACTAG-ACCACGTATGAACT  1021
      ||||||| || |||||||||||
seq2  TAACTAGAACTACGTATGAACT  1016