BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-009M16
Chromosome10 (Build37)
Map Location 96,145,734 - 96,249,167
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC628256
Upstream geneEea1, EG432491, LOC667380, Btg1
Downstream gene4930556N09Rik, EG667407, Dcn, Lum, Kera, Epyc, 4921510H08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-009M16.bB6Ng01-009M16.g
ACCDH845639DH845640
length1,006776
definitionDH845639|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009M16, 5' end.DH845640|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-009M16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,248,152 - 96,249,167)(96,145,734 - 96,146,509)
sequence
gaattctaccagtttgatgaagaagttcaaggatgttaagcaacttgaac
aagcctacattcgatttcagcctaacacaaaatgtgtttaagctggaggt
ttcgtgttggccatgaaaacaacaagccatcacaaagcccgtgaataact
gagtgtgtattatataattagtggccagattttgccatgcttttcatgtt
cactttctcagaattgagacacaaggactatgaacatagagaaaccaagt
gaaatctttatttcagaactgttttcctctctctgaactgtaatcacatc
taattttatgttgattctatatgttattattgggataagcttgtggcttt
tctactgtctgatagatcatgttattaaacacattcatttatttcctggc
tcaggtggtataatgtgtactctgcagatgaaatctgtgtgtgttattgg
gaaggggctttccaggtgacatttgtgccttgcaagtttcatgttcaaat
caattttcttcaaatatagataagcagggtgttttagtataacaccattg
tgggatttggcctatttttatgcaaattgtaagtctgtatctcaggtata
cagagtttcacggttaaaaaatgtatattccctttcaataatctgtctat
agtatgaaattatcaaggatggatttattagacccaaagaaaatagtaat
tccaatttgaggctttttacataagttaaaaggaatgatattgtggttcc
tgccattgttatattgtttaaagtagagatggataatggggtttaaaggt
atatggtaaagaagaaatacaacacaataaataatacatgagaagggaga
aatactgtcgatgaaagcatatgaaaagacagcatggggagatagtctgg
gggttggggagaatcaaaatgaatctaaattgttaagtatgtctgaaagg
caacaagaaatctgttatcttgtgatcaatttaaatttaataattgaaca
gattca
gaattcaataggaaacaggattaaccctgccccttcccaagtatgtataa
agcagtaaacagtgattccactcaccgatggggttgcctgtaggaaagct
ctagaaatgtcgctcttgtgagttgtcaaccatgttgaggtggctttagg
atcactcagctgcctgcgagtcttcaagcatcaggtccctgattccactg
ctggttggatttgagtggtctcattcatttgtgtggttgtacttttattg
ggggtgaacagagatgtccttagacagttcatgcatctttggaaaaatta
cacagaaatgcatctctgaatgtctgtcctccatccttgtaggtaattga
tagctccaatctcatttcaggtacttccaggcacctaaaccattcactct
tctccaagaggaagtcacagaggtaaaacaaagccattaaactgggctaa
gccagctgtttaaagactgtgctggggtgtggtaacctgcaaaatgcctg
ctcaagactgggctccactccatcatatgtggggaaggggctcacgaggc
tctgtccctttcaaaggaaatattggcaattcttggttggtggggttgga
agataggtatcattatcttcagtcgtatagacaactggaaagtttcccaa
agacccgtaaatagccttgcatccatgtttgtccaaacaaccctaattaa
actccttgggccacacaaaacctaacccccaaaagcatggtaactgtgtg
acagggaggagggggagaggaaggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_96248152_96249167
seq2: B6Ng01-009M16.b_48_1053 (reverse)

seq1  TGAATCTGTTCAATTTAATTAAAAATTTTAAATTAGATCACAGAGTAACA  50
      |||||||||||||||  ||||||   |||||||| |||||||   |||||
seq2  TGAATCTGTTCAATT--ATTAAA---TTTAAATT-GATCACAAGATAACA  44

seq1  GATTTCTTTGTGGCATTTTCAGGCATACTTTATCAATTTAGATTCATTTT  100
      ||||||||  || |  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTGTTGCC--TTTCAGACATAC-TTAACAATTTAGATTCATTTT  91

seq1  GATTTCTCCCCAACCCCCAGACTATCTCCCCATTGCTGTCTTTTCATATG  150
      || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GA-TTCTCCCCAACCCCCAGACTATCTCCCCA-TGCTGTCTTTTCATATG  139

seq1  CTTTCATCGACAGTA-TTCTCCCTTCTCATGTATTATTTATTGTGTTGTA  199
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATCGACAGTATTTCTCCCTTCTCATGTATTATTTATTGTGTTGTA  189

seq1  TTTCTTCTTTACCATATACCTTTAAACCCCATTATCCATCTCTACTTTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTTTACCATATACCTTTAAACCCCATTATCCATCTCTACTTTAA  239

seq1  ACAATATAACAATGGCAGGAACCACAATATCATTCCTTTTAACTTATGTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATAACAATGGCAGGAACCACAATATCATTCCTTTTAACTTATGTA  289

seq1  AAAAGCCTCAAATTGGAATTACTATTTTCTTTGGGTCTAATAAATCCATC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCCTCAAATTGGAATTACTATTTTCTTTGGGTCTAATAAATCCATC  339

seq1  CTTGATAATTTCATACTATAGACAGATTATTGAAAGGGAATATACATTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATAATTTCATACTATAGACAGATTATTGAAAGGGAATATACATTTT  389

seq1  TTAACCGTGAAACTCTGTATACCTGAGATACAGACTTACAATTTGCATAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCGTGAAACTCTGTATACCTGAGATACAGACTTACAATTTGCATAA  439

seq1  AAATAGGCCAAATCCCACAATGGTGTTATACTAAAACACCCTGCTTATCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGGCCAAATCCCACAATGGTGTTATACTAAAACACCCTGCTTATCT  489

seq1  ATATTTGAAGAAAATTGATTTGAACATGAAACTTGCAAGGCACAAATGTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTGAAGAAAATTGATTTGAACATGAAACTTGCAAGGCACAAATGTC  539

seq1  ACCTGGAAAGCCCCTTCCCAATAACACACACAGATTTCATCTGCAGAGTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGAAAGCCCCTTCCCAATAACACACACAGATTTCATCTGCAGAGTA  589

seq1  CACATTATACCACCTGAGCCAGGAAATAAATGAATGTGTTTAATAACATG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTATACCACCTGAGCCAGGAAATAAATGAATGTGTTTAATAACATG  639

seq1  ATCTATCAGACAGTAGAAAAGCCACAAGCTTATCCCAATAATAACATATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCAGACAGTAGAAAAGCCACAAGCTTATCCCAATAATAACATATA  689

seq1  GAATCAACATAAAATTAGATGTGATTACAGTTCAGAGAGAGGAAAACAGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCAACATAAAATTAGATGTGATTACAGTTCAGAGAGAGGAAAACAGT  739

seq1  TCTGAAATAAAGATTTCACTTGGTTTCTCTATGTTCATAGTCCTTGTGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAAATAAAGATTTCACTTGGTTTCTCTATGTTCATAGTCCTTGTGTC  789

seq1  TCAATTCTGAGAAAGTGAACATGAAAAGCATGGCAAAATCTGGCCACTAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTCTGAGAAAGTGAACATGAAAAGCATGGCAAAATCTGGCCACTAA  839

seq1  TTATATAATACACACTCAGTTATTCACGGGCTTTGTGATGGCTTGTTGTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATAATACACACTCAGTTATTCACGGGCTTTGTGATGGCTTGTTGTT  889

seq1  TTCATGGCCAACACGAAACCTCCAGCTTAAACACATTTTGTGTTAGGCTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGGCCAACACGAAACCTCCAGCTTAAACACATTTTGTGTTAGGCTG  939

seq1  AAATCGAATGTAGGCTTGTTCAAGTTGCTTAACATCCTTGAACTTCTTCA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCGAATGTAGGCTTGTTCAAGTTGCTTAACATCCTTGAACTTCTTCA  989

seq1  TCAAACTGGTAGAATTC  1016
      |||||||||||||||||
seq2  TCAAACTGGTAGAATTC  1006

seq1: chr10_96145734_96146509
seq2: B6Ng01-009M16.g_71_846

seq1  GAATTCAATAGGAAACAGGATTAACCCTGCCCCTTCCCAAGTATGTATAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATAGGAAACAGGATTAACCCTGCCCCTTCCCAAGTATGTATAA  50

seq1  AGCAGTAAACAGTGATTCCACTCACCGATGGGGTTGCCTGTAGGAAAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTAAACAGTGATTCCACTCACCGATGGGGTTGCCTGTAGGAAAGCT  100

seq1  CTAGAAATGTCGCTCTTGTGAGTTGTCAACCATGTTGAGGTGGCTTTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAATGTCGCTCTTGTGAGTTGTCAACCATGTTGAGGTGGCTTTAGG  150

seq1  ATCACTCAGCTGCCTGCGAGTCTTCAAGCATCAGGTCCCTGATTCCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTCAGCTGCCTGCGAGTCTTCAAGCATCAGGTCCCTGATTCCACTG  200

seq1  CTGGTTGGATTTGAGTGGTCTCATTCATTTGTGTGGTTGTACTTTTATTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTGGATTTGAGTGGTCTCATTCATTTGTGTGGTTGTACTTTTATTG  250

seq1  GGGGTGAACAGAGATGTCCTTAGACAGTTCATGCATCTTTGGAAAAATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGAACAGAGATGTCCTTAGACAGTTCATGCATCTTTGGAAAAATTA  300

seq1  CACAGAAATGCATCTCTGAATGTCTGTCCTCCATCCTTGTAGGTAATTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAATGCATCTCTGAATGTCTGTCCTCCATCCTTGTAGGTAATTGA  350

seq1  TAGCTCCAATCTCATTTCAGGTACTTCCAGGCACCTAAACCATTCACTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTCCAATCTCATTTCAGGTACTTCCAGGCACCTAAACCATTCACTCT  400

seq1  TCTCCAAGAGGAAGTCACAGAGGTAAAACAAAGCCATTAAACTGGGCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAAGAGGAAGTCACAGAGGTAAAACAAAGCCATTAAACTGGGCTAA  450

seq1  GCCAGCTGTTTAAAGACTGTGCTGGGGTGTGGTAACCTGCAAAATGCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCTGTTTAAAGACTGTGCTGGGGTGTGGTAACCTGCAAAATGCCTG  500

seq1  CTCAAGACTGGGCTCCACTCCATCATATGTGGGGAAGGGGCTCACGAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGACTGGGCTCCACTCCATCATATGTGGGGAAGGGGCTCACGAGGC  550

seq1  TCTGTCCCTTTCAAAGGAAATATTGGCAATTCTTGGTTGGTGGGGTTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCCCTTTCAAAGGAAATATTGGCAATTCTTGGTTGGTGGGGTTGGA  600

seq1  AGATAGGTATCATTATCTTCAGTCGTATAGACAACTGGAAAGTTTCCCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGGTATCATTATCTTCAGTCGTATAGACAACTGGAAAGTTTCCCAA  650

seq1  AGACCCGTAAATAGCCTTGCATCCATGTTTGTCCAAACAACCCTAATTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCGTAAATAGCCTTGCATCCATGTTTGTCCAAACAACCCTAATTAA  700

seq1  ACTCCTTGGGCCACACAAAACCTAACCCCCAAAAGCATGGTAACTGTGTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTTGGGCCACACAAAACCTAACCCCCAAAAGCATGGTAACTGTGTG  750

seq1  ACAGGGAGGAGGGGGAGAGGAAGGTG  776
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGGAGGAGGGGGAGAGGAAGGTG  776