BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-012N13
Chromosome10 (Build37)
Map Location 119,581,451 - 119,699,908
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIrak3, Tmbim4, 1190005P17Rik
Upstream geneCand1, Grip1, Helb
Downstream geneHmga2, LOC100042902, Msrb3, LOC100043488, Lemd3, Wif1, LOC100042911
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-012N13.bB6Ng01-012N13.g
ACCDH847819DH847820
length1,157836
definitionDH847819|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012N13, 5' end.DH847820|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-012N13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,581,451 - 119,582,631)(119,699,076 - 119,699,908)
sequence
gaattctgactgccatcatgcctgcctactggactgaaatatcatgtcta
ttgatctgatttcgttgtattgcaagcttgagaatggtcaccatatcttg
accgccatgtgtagcaggatttcccctgtccaattaatttaattatttat
acaacaagaagtctgtgattggacagagaaaaagggaggcagctcgaaga
gctgcagagatggggacagagaagacaggtagggacaaggaagcaagata
gagggagatgaacagggtgatacagaatccaagtaattttaatagcccca
ggtagatgtgttatcatatagggttaaaacaattggggcaacttgtctaa
tctaggtgggcagcttgtaccattatcaattggtcctgaattgattgtgc
acgcatcctgtgaattgaaaatttactgagatataaatctgactgattaa
ttataagcttctagagttttgtttctaccaggttgctaggtgttgtggtg
gctgacctcagtgtgggcagttgttgcgcgggactggcatggccacgacc
tgccaagggaacttagtgagtctggtacatttcaggacatttcaggagct
ccaggtcaaagagatcaccgagttcagagcaccccactggagccatgtgt
cccaccagtccctggtgtagcatgagctattgatagttgttttaatattt
cccacaacagctatgtatccctggtaccccaaatataatatttgcttata
aatgaacagatcacatctatgacaaatacattttaaaacaatgaaaacaa
atatgtaccctttaaggggtcagactgttaaataaaatgcccctttcaaa
ctacttttcattagattaaaaaaaaattatcaatggaggtgggagtgttc
tggggagctcaccgggaggtgacaggatacttattgtttgcaagcattct
ggggggtcaaactcaagtcagcagcttgctgtaaacatgcctttacttac
taagcacttactggcccatatttgaatattttataacactctgttttact
agtatggcttctacacacagcagagtgtaggtttgttgtttaagctagaa
ggttatctattagcctagatttctgtggggacctgaattgtcactaatgg
aaattca
gaattcactgtgcccagctaacacatggtaccattcccagtttctggtag
attagattgaaaattcaattatccctcaatggtatacttagcaatttttt
ggtttcatttggaaaccctgtctcaagggaataagctggatatagacaga
ggaagtgacaaaggaagacacatgatgtcctcccctggtctcccccagtg
tacatggttagcataccagcacactcaaatgcatatagaccacacatttg
cttataccatatacacagacacagacacagagagagagagacagagagag
acagagagagacagagaggactgccccagtaacctactttctttaagttg
ctttccattttccatcacctctctacaacgccatcagtttatgaacacag
gattcagtcgtttgccggtgttgaatgaagccctctgaacactgctgcca
ttgccttcttgatcaggccagctgtgactacctgggtgattgcgacattg
atggttccttgtggaacacttggtatggaaggggctcaaaccttcacaca
acatcccagccactccttcctactgcagaggcaggtagctgaatgtgatt
ccatcctgactgaatgggaggtgatagactatatagcatgtgtatggtta
actggaacaggaactccgtctttatagctatagagaagttgtcatccaca
ctggggtgagacttttggtggtgcaaacgctatggggccactccagctca
tgaaaacaagccatactatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatataaataaatatatatatatatatatatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_119581451_119582631
seq2: B6Ng01-012N13.b_48_1204

seq1  GAATTCTGACTGCCATCATGCCTGCCTACTGGACTGAAATATCATGTCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGACTGCCATCATGCCTGCCTACTGGACTGAAATATCATGTCTA  50

seq1  TTGATCTGATTTCGTTGTATTGCAAGCTTGAGAATGGTCACCATATCTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTGATTTCGTTGTATTGCAAGCTTGAGAATGGTCACCATATCTTG  100

seq1  ACCGCCATGTGTAGCAGGATTTCCCCTGTCCAATTAATTTAATTATTTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCCATGTGTAGCAGGATTTCCCCTGTCCAATTAATTTAATTATTTAT  150

seq1  ACAACAAGAAGTCTGTGATTGGACAGAGAAAAAGGGAGGCAGCTCGAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAAGAAGTCTGTGATTGGACAGAGAAAAAGGGAGGCAGCTCGAAGA  200

seq1  GCTGCAGAGATGGGGACAGAGAAGACAGGTAGGGACAAGGAAGCAAGATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGAGATGGGGACAGAGAAGACAGGTAGGGACAAGGAAGCAAGATA  250

seq1  GAGGGAGATGAACAGGGTGATACAGAATCCAAGTAATTTTAATAGCCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAGATGAACAGGGTGATACAGAATCCAAGTAATTTTAATAGCCCCA  300

seq1  GGTAGATGTGTTATCATATAGGGTTAAAACAATTGGGGCAACTTGTCTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATGTGTTATCATATAGGGTTAAAACAATTGGGGCAACTTGTCTAA  350

seq1  TCTAGGTGGGCAGCTTGTACCATTATCAATTGGTCCTGAATTGATTGTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTGGGCAGCTTGTACCATTATCAATTGGTCCTGAATTGATTGTGC  400

seq1  ACGCATCCTGTGAATTGAAAATTTACTGAGATATAAATCTGACTGATTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCATCCTGTGAATTGAAAATTTACTGAGATATAAATCTGACTGATTAA  450

seq1  TTATAAGCTTCTAGAGTTTTGTTTCTACCAGGTTGCTAGGTGTTGTGGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGCTTCTAGAGTTTTGTTTCTACCAGGTTGCTAGGTGTTGTGGTG  500

seq1  GCTGACCTCAGTGTGGGCAGTTGTTGCGCGGGACTGGCATGGCCACGACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACCTCAGTGTGGGCAGTTGTTGCGCGGGACTGGCATGGCCACGACC  550

seq1  TGCCAAGGGAACTTAGTGAGTCTGGTACATTTCAGGACATTTCAGGAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGGGAACTTAGTGAGTCTGGTACATTTCAGGACATTTCAGGAGCT  600

seq1  CCAGGTCAAAGAGATCACCGAGTTCAGAGCACCCCACTGGAGCCATGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCAAAGAGATCACCGAGTTCAGAGCACCCCACTGGAGCCATGTGT  650

seq1  CCCACCAGTCCCTGGTGTAGCATGAGCTATTGATAGTTGTTTTAATATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCAGTCCCTGGTGTAGCATGAGCTATTGATAGTTGTTTTAATATTT  700

seq1  CCCACAACAGCTATGTATCCCTGGTACCCCAAATATAATATTTGCTTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAACAGCTATGTATCCCTGGTACCCCAAATATAATATTTGCTTATA  750

seq1  AATGAACAGATCACATCTATGACAAATACATTTTAAAACAATGAAAACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAACAGATCACATCTATGACAAATACATTTTAAAACAATGAAAACAA  800

seq1  ATATGTACCCTTTAAGGGGTCAGACTGTTAAATAAAATGCCCCTTTCAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTACCCTTTAAGGGGTCAGACTGTTAAATAAAATGCCCCTTTCAAA  850

seq1  CTACTTTTCATTAGATTAAAAAAAAATTATCAATGGAGGTGGGAGTGTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTTTCATTAGATTAAAAAAAAATTATCAATGGAGGTGGGAGTGTTC  900

seq1  TGGGGAGCTCACCGGGAGGTGACAGGATAACTTATTGTTTGCAAGCATTC  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGCTCACCGGGAGGTGACAGGAT-ACTTATTGTTTGCAAGCATTC  949

seq1  TGGGGGGTCAAACTCAAGTCAGCAGGCTTGCCTGGTAAACATGCCTTTAC  1000
      |||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||
seq2  TGGGGGGTCAAACTCAAGTCAGCA-GCTTGC--TGTAAACATGCCTTTAC  996

seq1  TTACTAAGCCACTTTACTGGCCCCATATTTG-ATATTTTATAACACTCTG  1049
      |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| 
seq2  TTACTAAG-CAC-TTACTGG-CCCATATTTGAATATTTTATAACACTCT-  1042

seq1  GTTTTACCTAGTAATGGCTTCTACAACCACAGCAGGAGTGTGAGGTGTTT  1099
      |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||| ||  ||||
seq2  GTTTTA-CTAGT-ATGGCTTCTACA--CACAGCA-GAGTGT-AG--GTTT  1084

seq1  GTTTGTTTTAAGCTAGAAAGGTTATCTATTAGTCTAGAATTCTCTGTGGG  1149
      |||   |||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||
seq2  GTT--GTTTAAGCTAG-AAGGTTATCTATTAGCCTAGA--TTTCTGTGGG  1129

seq1  AAGCTGAATTTGTCACACTAATGAAGAATTCA  1181
       | ||||| ||||  |||||||| | ||||||
seq2  GACCTGAA-TTGT--CACTAATGGA-AATTCA  1157

seq1: chr10_119699076_119699908
seq2: B6Ng01-012N13.g_68_903 (reverse)

seq1  ----TATATAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT  46
          |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATA-TATATATATATATTTATTTATATATATATATATATATAT  49

seq1  ATATATATATATATATATATAGTATGGCTTGTTTTCATGAGCTGGAGTGG  96
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATATATATATATATATAGTATGGCTTGTTTTCATGAGCTGGAGTGG  99

seq1  CCCCATAGCGTTTGCACCACCAAAAGTCTCACCCCAGTGTGGATGACAAC  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATAGCGTTTGCACCACCAAAAGTCTCACCCCAGTGTGGATGACAAC  149

seq1  TTCTCTATAGCTATAAAGACGGAGTTCCTGTTCCAGTTAACCATACACAT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTATAGCTATAAAGACGGAGTTCCTGTTCCAGTTAACCATACACAT  199

seq1  GCTATATAGTCTATCACCTCCCATTCAGTCAGGATGGAATCACATTCAGC  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATATAGTCTATCACCTCCCATTCAGTCAGGATGGAATCACATTCAGC  249

seq1  TACCTGCCTCTGCAGTAGGAAGGAGTGGCTGGGATGTTGTGTGAAGGTTT  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTGCCTCTGCAGTAGGAAGGAGTGGCTGGGATGTTGTGTGAAGGTTT  299

seq1  GAGCCCCTTCCATACCAAGTGTTCCACAAGGAACCATCAATGTCGCAATC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCCCTTCCATACCAAGTGTTCCACAAGGAACCATCAATGTCGCAATC  349

seq1  ACCCAGGTAGTCACAGCTGGCCTGATCAAGAAGGCAATGGCAGCAGTGTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAGGTAGTCACAGCTGGCCTGATCAAGAAGGCAATGGCAGCAGTGTT  399

seq1  CAGAGGGCTTCATTCAACACCGGCAAACGACTGAATCCTGTGTTCATAAA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGGCTTCATTCAACACCGGCAAACGACTGAATCCTGTGTTCATAAA  449

seq1  CTGATGGCGTTGTAGAGAGGTGATGGAAAATGGAAAGCAACTTAAAGAAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGCGTTGTAGAGAGGTGATGGAAAATGGAAAGCAACTTAAAGAAA  499

seq1  GTAGGTTACTGGGGCAGTCCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTTACTGGGGCAGTCCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTC  549

seq1  TCTCTCTCTGTGTCTGTGTCTGTGTATATGGTATAAGCAAATGTGTGGTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTGTGTCTGTGTCTGTGTATATGGTATAAGCAAATGTGTGGTC  599

seq1  TATATGCATTTGAGTGTGCTGGTATGCTAACCATGTACACTGGGGGAGAC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCATTTGAGTGTGCTGGTATGCTAACCATGTACACTGGGGGAGAC  649

seq1  CAGGGGAGGACATCATGTGTCTTCCTTTGTCACTTCCTCTGTCTATATCC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGAGGACATCATGTGTCTTCCTTTGTCACTTCCTCTGTCTATATCC  699

seq1  AGCTTATTCCCTTGAGACAGGGTTTCCAAATGAAACCAAAAAATTGCTAA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTATTCCCTTGAGACAGGGTTTCCAAATGAAACCAAAAAATTGCTAA  749

seq1  GTATACCATTGAGGGATAATTGAATTTTCAATCTAATCTACCAGAAACTG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATACCATTGAGGGATAATTGAATTTTCAATCTAATCTACCAGAAACTG  799

seq1  GGAATGGTACCATGTGTTAGCTGGGCACAGTGAATTC  833
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGGTACCATGTGTTAGCTGGGCACAGTGAATTC  836