BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021F09
Chromosome10 (Build37)
Map Location 72,084,936 - 72,250,270
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZwint
Upstream geneEG216082, LOC622812, EG327767, 1700049L16Rik, LOC100040505
Downstream geneLOC432471, LOC544705, LOC100039981, LOC623191
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021F09.bB6Ng01-021F09.g
ACCDH853869DH853870
length532946
definitionDH853869|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021F09, 5' end.DH853870|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021F09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(72,084,936 - 72,085,473)(72,249,321 - 72,250,270)
sequence
cttttaaggggggtgggctttaactgaagcctgagtgaaaagaaagtggg
gacacttttggggacaaatgacaacagattttattgatcccatttcaaac
ctgttattaccaaaactctgcttgtttgctgcttgtggaacatggctgtc
ctttatctgttatgcacaaaagaggtcacaaatgcatatcctgggtacat
ggtgatgccatcctgtgccagagacaaactggtcacagttatctttgtcc
tcaatgggaaaattctgtcctcgttctaacacacattatcagacccttga
ccaagcagaaaacttgatatgagacagagaagacagcccaaatgaccttc
agtcaacagttgcctgctcctcttttcttggtttccccaccaattaaaac
ttcggtctatgagagttctttctctacatgtcaggtatctgtaatcccta
ggataaatgttctatcatgcttgatgtgttcataaaaagataaagagaga
gggggtatgttctggtggatgtgtggtgaggt
gaattccaggatgagtaaagacagccaggcttagaacccacatctgcaag
gaacaaagcataacagcagatatctctttagccatgaaagaactgtggaa
ccctgcaaggacatcttgttgtaggcagccaggtgcctaaaagatggtgc
cggcctccggtaccccatctctgtaaatgacaacactgtgcaggcgctag
cccgaatctggcgccaacccctcccgagcgggtgcatacaaatcaaagtg
ccggcagactgaccaatcccaggaggacgcatagctctccccagtgctgg
cgtgtatataagcagtcttccctgggtttccggggttcccatagcatcta
ggcgtcccaggaataaagctgttgagaagaacctgaccgtgttgcgtttt
tccttgccggacgaggtgggcgcaacatcttgtaagaactttggagaaga
gccttcaaagagaaagcgtctgttatccctcaagtgaagaatatacattc
ctctcttttgtttcacttactacctattactttctaagaaaacttgacaa
ctctctcatttttcatgccccatatgtgctgcctcaggcagccccaagtg
tggtataagcattacatttgactactggccatgtggcattggaagtcaca
caggcatctgctcctggccccacattggcattggtaggcttccattcatg
tctgccaggcctaagttctcagaggagaagcattcgattcactgggtctt
cagtgtgaatccttagttccattgttctaacctaagcccagttctctcct
taagaatgagcaccgaccccgcttgagtgccaacttcagagttgctcttc
aggttgggtgtgtattatggctgaatagctgagtgtccctgaatgtgtga
tatatgtgagccatgtttgagcagtatgagttctgacatgggtcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_72084936_72085473
seq2: B6Ng01-021F09.b_43_580

seq1  GAATTCCTTTTAAGGGGGGTGGGCTTTAACTGAAGCCTGAGTGAAAAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTTTAAGGGGGGTGGGCTTTAACTGAAGCCTGAGTGAAAAGAA  50

seq1  AGTGGGGACACTTTTGGGGACAAATGACAACAGATTTTATTGATCCCATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGGACACTTTTGGGGACAAATGACAACAGATTTTATTGATCCCATT  100

seq1  TCAAACCTGTTATTACCAAAACTCTGCTTGTTTGCTGCTTGTGGAACATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACCTGTTATTACCAAAACTCTGCTTGTTTGCTGCTTGTGGAACATG  150

seq1  GCTGTCCTTTATCTGTTATGCACAAAAGAGGTCACAAATGCATATCCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCCTTTATCTGTTATGCACAAAAGAGGTCACAAATGCATATCCTGG  200

seq1  GTACATGGTGATGCCATCCTGTGCCAGAGACAAACTGGTCACAGTTATCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATGGTGATGCCATCCTGTGCCAGAGACAAACTGGTCACAGTTATCT  250

seq1  TTGTCCTCAATGGGAAAATTCTGTCCTCGTTCTAACACACATTATCAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTCAATGGGAAAATTCTGTCCTCGTTCTAACACACATTATCAGAC  300

seq1  CCTTGACCAAGCAGAAAACTTGATATGAGACAGAGAAGACAGCCCAAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGACCAAGCAGAAAACTTGATATGAGACAGAGAAGACAGCCCAAATG  350

seq1  ACCTTCAGTCAACAGTTGCCTGCTCCTCTTTTCTTGGTTTCCCCACCAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTCAGTCAACAGTTGCCTGCTCCTCTTTTCTTGGTTTCCCCACCAAT  400

seq1  TAAAACTTCGGTCTATGAGAGTTCTTTCTCTACATGTCAGGTATCTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACTTCGGTCTATGAGAGTTCTTTCTCTACATGTCAGGTATCTGTAA  450

seq1  TCCCTAGGATAAATGTTCTATCATGCTTGATGTGTTCATAAAAAGATAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAGGATAAATGTTCTATCATGCTTGATGTGTTCATAAAAAGATAAA  500

seq1  GAGAGAGGGGGTATGTTCTGGTGGATGTGTGGTGAGGT  538
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGGGGGTATGTTCTGGTGGATGTGTGGTGAGGT  538

seq1: chr10_72249321_72250270
seq2: B6Ng01-021F09.g_72_1016 (reverse)

seq1  GGACCCCTGTCAGAACTCATACTGCTCAAACATGGCTCACATAT-TCCCA  49
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||
seq2  GGACCCATGTCAGAACTCATACTGCTCAAACATGGCTCACATATATCACA  50

seq1  CATCTGGGGACACTCAGCTATTCAGCCATAATAACACACCCAACCTGGAA  99
      |||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||
seq2  CATTCAGGGACACTCAGCTATTCAGCCATAAT-ACACACCCAACCT-GAA  98

seq1  GAGCAACTCTTGAGGTTGGCACTCAAGCGGGGTCGGTGCTCATTCTTATA  149
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAGCAACTC-TGAAGTTGGCACTCAAGCGGGGTCGGTGCTCATTCTTA-A  146

seq1  GGAAGAGAACTGGGCTTTAGGTTAGAACAATGGAACTAAGGATTCACACT  199
      || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GG-AGAGAACTGGGC-TTAGGTTAGAACAATGGAACTAAGGATTCACACT  194

seq1  GAAGACCCAGTGAATCGAATGCTTCTCCTCTGAGAACTTAGGCCTGGCAG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACCCAGTGAATCGAATGCTTCTCCTCTGAGAACTTAGGCCTGGCAG  244

seq1  ACATGAATGGAAGCCTACCAATGCCAATGTGGGGCCAGGAGCAGATGCCT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGAATGGAAGCCTACCAATGCCAATGTGGGGCCAGGAGCAGATGCCT  294

seq1  GTGTGACTTCCAATGCCACATGGCCAGTAGTCAAATGTAATGCTTATACC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGACTTCCAATGCCACATGGCCAGTAGTCAAATGTAATGCTTATACC  344

seq1  ACACTTGGGGCTGCCTGAGGCAGCACATATGGGGCATGAAAAATGAGAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTGGGGCTGCCTGAGGCAGCACATATGGGGCATGAAAAATGAGAGA  394

seq1  GTTGTCAAGTTTTCTTAGAAAGTAATAGGTAGTAAGTGAAACAAAAGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCAAGTTTTCTTAGAAAGTAATAGGTAGTAAGTGAAACAAAAGAGA  444

seq1  GGAATGTATATTCTTCACTTGAGGGATAACAGACGCTTTCTCTTTGAAGG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATGTATATTCTTCACTTGAGGGATAACAGACGCTTTCTCTTTGAAGG  494

seq1  CTCTTCTCCAAAGTTCTTACAAGATGTTGCGCCCACCTCGTCCGGCAAGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTCCAAAGTTCTTACAAGATGTTGCGCCCACCTCGTCCGGCAAGG  544

seq1  AAAAACGCAACACGGTCAGGTTCTTCTCAACAGCTTTATTCCTGGGACGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACGCAACACGGTCAGGTTCTTCTCAACAGCTTTATTCCTGGGACGC  594

seq1  CTAGATGCTATGGGAACCCCGGAAACCCAGGGAAGACTGCTTATATACAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATGCTATGGGAACCCCGGAAACCCAGGGAAGACTGCTTATATACAC  644

seq1  GCCAGCACTGGGGAGAGCTATGCGTCCTCCTGGGATTGGTCAGTCTGCCG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCACTGGGGAGAGCTATGCGTCCTCCTGGGATTGGTCAGTCTGCCG  694

seq1  GCACTTTGATTTGTATGCACCCGCTCGGGAGGGGTTGGCGCCAGATTCGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTTGATTTGTATGCACCCGCTCGGGAGGGGTTGGCGCCAGATTCGG  744

seq1  GCTAGCGCCTGCACAGTGTTGTCATTTACAGAGATGGGGTACCGGAGGCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGCGCCTGCACAGTGTTGTCATTTACAGAGATGGGGTACCGGAGGCC  794

seq1  GGCACCATCTTTTAGGCACCTGGCTGCCTACAACAAGATGTCCTTGCAGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCATCTTTTAGGCACCTGGCTGCCTACAACAAGATGTCCTTGCAGG  844

seq1  GTTCCACAGTTCTTTCATGGCTAAAGAGATATCTGCTGTTATGCTTTGTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCACAGTTCTTTCATGGCTAAAGAGATATCTGCTGTTATGCTTTGTT  894

seq1  CCTTGCAGATGTGGGTTCTAAGCCTGGCTGTCTTTACTCATCCTGGAATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCAGATGTGGGTTCTAAGCCTGGCTGTCTTTACTCATCCTGGAATT  944

seq1  C  950
      |
seq2  C  945