BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023P23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 123,468,389 - 123,561,039
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMon2, Usp15, LOC100042958, AI851790
Downstream gene4930503E24Rik, LOC671416
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023P23.bB6Ng01-023P23.g
ACCDH855764DH855765
length8311,060
definitionDH855764|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P23, 5' end.DH855765|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,468,389 - 123,469,219)(123,559,981 - 123,561,039)
sequence
gaattcttccatatcacttcatatttttaattttctttaataaagattat
atctctttggaaattcatcatctagaatattgaaatatttaaatttacat
gtatttaactgctaaaaaatttatcatcataattaccatgtttggaattc
tgtaataatctcaaaactttaaagaatgaaaataacattactttcctgaa
ggtatatttagggatgggtatgctttgtagttttaatcccataaagtgaa
tgctgtaaaaggctcattcggtttatgtttgagttgtgtggtggttgatc
ttgacttttgaaagatatccagtcaattagcaaaacatatgtttggtttg
aatgtgaggcctttccagagttgattaatgatgaggatgttgacctaacc
aacattaatctatggttggcttcaaaatttgaatttactactgagaagta
atgggaacagacatttatagggaagaaagataattggcgcttgaccataa
aggcatgtcttaccctggtccctttcctactatactctgttttttgttta
tcatggattgaacaaatctgcttgctcacctatgctctcccagacatgag
gggcaaaatcctccaatactgtgaactaaatgtatctttttccatgaact
tttcccctggtattgtgtaacagtcacaagaaggcccaactaagccaggt
ggtggtggcacatgcctttaatcccaacacttgggggtcagaggcagaca
gatttctgagtttgaggccagtctggtctacaaagtgagttccaggacag
ccagggctacacagagaatctctgtctcaaa
gaattctttgtcaggaaatacctcataaatccacatttctaaagtgagac
aattgttgaaattatttcttgcggaacctgagtctaaaactctgatattt
tctaatactatgaacgaagataaattattcttgtcgaaagtaaggtatat
taatgaaatacatgcaatttttgtctgtatattgtttctaagatgatagc
tcttctttctaaagctaagttaccttctaatttcacatttcaaaatatat
tattcattctgtatttgctttacttgaatagactgagcagctgtaataaa
tatcacttccacaaatattttcttaaagttacattattgagtaaaaattt
tcttagacttgttgtatacttcagaaaatattgaaggtttagtacatgca
aagccaatgtcagaattcctatctccacggggcaggtggagaggagtcac
tggtaaatgttgcctctcaagagctcctcaagtactcagagaatactatg
tgcagagcaccctgataaaacacagtttgatttacttggaactcatttac
atgtcaataagcctaagtaggttatttggaggtttttctcaagtataata
cacagacaagccacagacgatatatcaccgagtttagtttgtgacaacag
gtttcaatattttacaattttaagcttctaactatctaacaattatcatc
tatcatttatttatcatttattacttatctatcatttattccctattctc
tattaccattttatatactgtgcatcatctatctcatctgtgcatctaat
atctacctgcactatctaactacttatctactatctactaccctatctag
tgtatactgctcaattgcacaatgcattgtgtgtatgatatgcattttct
ctttgaaaattatctcttacagtatcaaggcatctgtgacacacacacac
acacacacacacacacacacacacagcgcacatatatacgtatacattta
tattttatagtattggactggctcatttcatgacattgactagttttaca
cgatgttctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_123468389_123469219
seq2: B6Ng01-023P23.b_42_872

seq1  GAATTCTTCCATATCACTTCATATTTTTAATTTTCTTTAATAAAGATTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCATATCACTTCATATTTTTAATTTTCTTTAATAAAGATTAT  50

seq1  ATCTCTTTGGAAATTCATCATCTAGAATATTGAAATATTTAAATTTACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTTTGGAAATTCATCATCTAGAATATTGAAATATTTAAATTTACAT  100

seq1  GTATTTAACTGCTAAAAAATTTATCATCATAATTACCATGTTTGGAATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAACTGCTAAAAAATTTATCATCATAATTACCATGTTTGGAATTC  150

seq1  TGTAATAATCTCAAAACTTTAAAGAATGAAAATAACATTACTTTCCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAATAATCTCAAAACTTTAAAGAATGAAAATAACATTACTTTCCTGAA  200

seq1  GGTATATTTAGGGATGGGTATGCTTTGTAGTTTTAATCCCATAAAGTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATATTTAGGGATGGGTATGCTTTGTAGTTTTAATCCCATAAAGTGAA  250

seq1  TGCTGTAAAAGGCTCATTCGGTTTATGTTTGAGTTGTGTGGTGGTTGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTAAAAGGCTCATTCGGTTTATGTTTGAGTTGTGTGGTGGTTGATC  300

seq1  TTGACTTTTGAAAGATATCCAGTCAATTAGCAAAACATATGTTTGGTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTTTGAAAGATATCCAGTCAATTAGCAAAACATATGTTTGGTTTG  350

seq1  AATGTGAGGCCTTTCCAGAGTTGATTAATGATGAGGATGTTGACCTAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAGGCCTTTCCAGAGTTGATTAATGATGAGGATGTTGACCTAACC  400

seq1  AACATTAATCTATGGTTGGCTTCAAAATTTGAATTTACTACTGAGAAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATTAATCTATGGTTGGCTTCAAAATTTGAATTTACTACTGAGAAGTA  450

seq1  ATGGGAACAGACATTTATAGGGAAGAAAGATAATTGGCGCTTGACCATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAACAGACATTTATAGGGAAGAAAGATAATTGGCGCTTGACCATAA  500

seq1  AGGCATGTCTTACCCTGGTCCCTTTCCTACTATACTCTGTTTTTTGTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATGTCTTACCCTGGTCCCTTTCCTACTATACTCTGTTTTTTGTTTA  550

seq1  TCATGGATTGAACAAATCTGCTTGCTCACCTATGCTCTCCCAGACATGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGATTGAACAAATCTGCTTGCTCACCTATGCTCTCCCAGACATGAG  600

seq1  GGGCAAAATCCTCCAATACTGTGAACTAAATGTATCTTTTTCCATGAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAAAATCCTCCAATACTGTGAACTAAATGTATCTTTTTCCATGAACT  650

seq1  TTTCCCCTGGTATTGTGTAACAGTCACAAGAAGGCCCAACTAAGCCAGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCCTGGTATTGTGTAACAGTCACAAGAAGGCCCAACTAAGCCAGGT  700

seq1  GGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAACACTTGGGGGTCAGAGGCAGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAACACTTGGGGGTCAGAGGCAGACA  750

seq1  GATTTCTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAG  800

seq1  CCAGGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCAAA  831
      |||||||||||||||||| | ||||||||||
seq2  CCAGGGCTACACAGAGAATCTCTGTCTCAAA  831

seq1: chr10_123559981_123561039
seq2: B6Ng01-023P23.g_70_1129 (reverse)

seq1  CAGAACATCTGTGT-AAACTAGTCAATGTCATGAAATGAG-CAGTCATAT  48
      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||
seq2  CAGAACATC-GTGTAAAACTAGTCAATGTCATGAAATGAGCCAGTCCAAT  49

seq1  ACTAT-ATATATATATGTATATGTATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  97
      ||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||
seq2  ACTATAAAATATAAATGTATACGTATATATGTGCG-CTGTGTGTGTGTGT  98

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCACAGATGCCTTGATACTGTAAGAGA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCACAGATGCCTTGATACTGTAAGAGA  148

seq1  TAATTTTCAAAGAGAAAATGCATATCATACACACAATGCATTGTGCAATT  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTCAAAGAGAAAATGCATATCATACACACAATGCATTGTGCAATT  198

seq1  GAGCAGTATACACTAGATAGGGTAGTAGATAGTAGATAAGTAGTTAGATA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTATACACTAGATAGGGTAGTAGATAGTAGATAAGTAGTTAGATA  248

seq1  GTGCAGGTAGATATTAGATGCACAGATGAGATAGATGATGCACAGTATAT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGGTAGATATTAGATGCACAGATGAGATAGATGATGCACAGTATAT  298

seq1  AAAATGGTAATAGAGAATAGGGAATAAATGATAGATAAGTAATAAATGAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGGTAATAGAGAATAGGGAATAAATGATAGATAAGTAATAAATGAT  348

seq1  AAATAAATGATAGATGATAATTGTTAGATAGTTAGAAGCTTAAAATTGTA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATGATAGATGATAATTGTTAGATAGTTAGAAGCTTAAAATTGTA  398

seq1  AAATATTGAAACCTGTTGTCACAAACTAAACTCGGTGATATATCGTCTGT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATTGAAACCTGTTGTCACAAACTAAACTCGGTGATATATCGTCTGT  448

seq1  GGCTTGTCTGTGTATTATACTTGAGAAAAACCTCCAAATAACCTACTTAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTCTGTGTATTATACTTGAGAAAAACCTCCAAATAACCTACTTAG  498

seq1  GCTTATTGACATGTAAATGAGTTCCAAGTAAATCAAACTGTGTTTTATCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATTGACATGTAAATGAGTTCCAAGTAAATCAAACTGTGTTTTATCA  548

seq1  GGGTGCTCTGCACATAGTATTCTCTGAGTACTTGAGGAGCTCTTGAGAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTGCTCTGCACATAGTATTCTCTGAGTACTTGAGGAGCTCTTGAGAGG  598

seq1  CAACATTTACCAGTGACTCCTCTCCACCTGCCCCGTGGAGATAGGAATTC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATTTACCAGTGACTCCTCTCCACCTGCCCCGTGGAGATAGGAATTC  648

seq1  TGACATTGGCTTTGCATGTACTAAACCTTCAATATTTTCTGAAGTATACA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATTGGCTTTGCATGTACTAAACCTTCAATATTTTCTGAAGTATACA  698

seq1  ACAAGTCTAAGAAAATTTTTACTCAATAATGTAACTTTAAGAAAATATTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTCTAAGAAAATTTTTACTCAATAATGTAACTTTAAGAAAATATTT  748

seq1  GTGGAAGTGATATTTATTACAGCTGCTCAGTCTATTCAAGTAAAGCAAAT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAGTGATATTTATTACAGCTGCTCAGTCTATTCAAGTAAAGCAAAT  798

seq1  ACAGAATGAATAATATATTTTGAAATGTGAAATTAGAAGGTAACTTAGCT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATGAATAATATATTTTGAAATGTGAAATTAGAAGGTAACTTAGCT  848

seq1  TTAGAAAGAAGAGCTATCATCTTAGAAACAATATACAGACAAAAATTGCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAAAGAAGAGCTATCATCTTAGAAACAATATACAGACAAAAATTGCA  898

seq1  TGTATTTCATTAATATACCTTACTTTCGACAAGAATAATTTATCTTCGTT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTTCATTAATATACCTTACTTTCGACAAGAATAATTTATCTTCGTT  948

seq1  CATAGTATTAGAAAATATCAGAGTTTTAGACTCAGGTTCCGCAAGAAATA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTATTAGAAAATATCAGAGTTTTAGACTCAGGTTCCGCAAGAAATA  998

seq1  ATTTCAACAATTGTCTCACTTTAGAAATGTGGATTTATGAGGTATTTCCT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAACAATTGTCTCACTTTAGAAATGTGGATTTATGAGGTATTTCCT  1048

seq1  GACAAAGAATTC  1059
      ||||||||||||
seq2  GACAAAGAATTC  1060