BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-024F04
Chromosome10 (Build37)
Map Location 124,796,218 - 124,935,029
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100042987, EG668313, LOC100042992
Upstream gene4930503E24Rik, LOC671416, Slc16a7
Downstream geneLOC668317, LOC100042994, Lrig3, LOC100043547
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-024F04.bB6Ng01-024F04.g
ACCDH855993DH855994
length1,121737
definitionDH855993|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024F04, 5' end.DH855994|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-024F04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,933,894 - 124,935,029)(124,796,218 - 124,796,953)
sequence
gaattcatctcccctgagcttagtaattatcgtatttgtttatttttatg
tgtaggtatgttccctcacatagatgtgtgtgcactgcatgagtatattt
caatactatgcacgcatcaacaaaccagcagagagtatcaggtcttgtga
tccttgagtgcagcagcttgtgagctgccatgtggatgctgggaatggaa
ctaggctcttgagcaagagcagcaagtgctcttaacctatgagccacctc
tccagcccttttctctagatttcactaacaatggataggattctgtagac
ttgtttatttatttttcccttttttaaaagatgtaggctgaattaaatgg
gaatactctgtatataagcagccaagctaggaccaaatctgtactgttaa
gtaagattaaatgactgtttcaatctttacctatgtttgtttgtttgttt
gttttttgtaaataatgtgtaattattttgcagttatatcaagtgttcca
tgagtctaaatggtattttcagaaagctgttcttagcatgatgccacacc
aaacactttagccactcaaactacggattctatgtcaccaccttttcaaa
gccctgccttaatgcactgccttcatctaacaagtttaactctttgttta
gtgaatactccacaccaagtgaatctcaggcagtgaaggggcacaaatat
caatctatttgctttaacataaaaaaattaagtctttaagttataaatac
cttcatattttattttttaaaaaatcacattgggataatgcacatacatg
tttctataaatttatactcatgcatatttcatgatttgtgcttctcatgt
acatgcatatgaaatgagacaatgtagatgcagggtggatcacagcacct
ggttgtatttttaagtacctacttattatattgcttgaaagaaacatggg
atagtgttcaagatttattatataactctcatgatatactatacagtccc
atctatttctgttttggaagcattttgataatgtgcttcaagaacctcct
tgtagcctccgttccataggaacccagactctagcagctacattgatgat
tcctttcctctagcattctgt
gaattccagatatttactcatccaccaagtaggaactataagacccccga
tgctgggcctccgcttaagtcccgggatgagctggccaacaccccaacat
ctcaagagaaaaccacacctgatgcaaactgcaagaggttttattatcag
ctagctgagggcaaagtccctctactgtgcagggcaggggagtttgactc
tgagctgtgacagtagggggcttttaacagctagctgaggagttgggagg
agttgcgaagagttcttctcttcctggtgtccttggtgaaatttacaagg
caggagtggggagtgagttctttttgaatttttatctccatgtcctcagc
acaggaaggcaggcatctccggttgtacagtatagaaacaaaaaggcttt
ttgctggctatagagaacaaagagcttctttttagctgtatttttaaaga
tcagggaaaacaagcttggggaacatctaggggctttaccttccagggag
aaacgctctaagtcggggtctcacagaacgaagcacaatattccatacct
gggctttgttgatctcagtataagctttcttctcctatcaagtatctctc
atctatttcacttttgagaatctgtcacttgagacatacactgtcaggta
cctcactggaccttttccttcaaacaaatgtaaaatagagagtctgtttt
cctccataagtccaaaaagtagcattagaaggcctcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_124933894_124935029
seq2: B6Ng01-024F04.b_44_1164 (reverse)

seq1  ACAGGATGCTAGAGGAAAGTGATCACATTTAAATGGTAGCTGCTAGAGCT  50
      |||| ||||||||||||||  ||||    | ||| ||||||||||||| |
seq2  ACAGAATGCTAGAGGAAAGGAATCA----TCAAT-GTAGCTGCTAGAG-T  44

seq1  CTGGGTGTTCCTAATGGGGAACGGAGAGCACAGAGAGTACCTTGAAGCCA  100
      ||||  |||||||    |||||||||   |||  |||   ||||||| ||
seq2  CTGG--GTTCCTA---TGGAACGGAGGCTACAAGGAGGTTCTTGAAG-CA  88

seq1  CATATTACAAAATGGCCTCCATAACAGAAATAGATGGGACTGTATAGTAT  150
      ||| |  |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAT-TATCAAAAT-GCTTCCAAAACAGAAATAGATGGGACTGTATAGTA-  135

seq1  TATCATTGAGAG-TATATAATTAATCTTTGAACACTATCCCATGTTTCTT  199
      ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TATCA-TGAGAGTTATATAATAAATC-TTGAACACTATCCCATGTTTCTT  183

seq1  TCAAGCAATTATAATAAGTAGGTACTTAAAAATACAACCAGGTGCTGTGA  249
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGCAA-TATAATAAGTAGGTACTTAAAAATACAACCAGGTGCTGTGA  232

seq1  TCCACCCTGCATCTACATTGTCTCATTTCATATGCATGTACATGAGAAGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCCTGCATCTACATTGTCTCATTTCATATGCATGTACATGAGAAGC  282

seq1  AC-AATCATGAAATATGCATGAGTATAAATTTATAGAAACATGTATGTGC  348
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCATGAAATATGCATGAGTATAAATTTATAGAAACATGTATGTGC  332

seq1  ATTATCCCAATGTGATTTTTTAAAAAATAAAATATGAAGGTATTTATAAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCCCAATGTGATTTTTTAAAAAATAAAATATGAAGGTATTTATAAC  382

seq1  TTAAAGACTTAATTTTTTTATGTTAAAGCAAATAGATTGATATTTGTGCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGACTTAATTTTTTTATGTTAAAGCAAATAGATTGATATTTGTGCC  432

seq1  CCTTCACTGCCTGAGATTCACTTGGTGTGGAGTATTCACTAAACAAAGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACTGCCTGAGATTCACTTGGTGTGGAGTATTCACTAAACAAAGAG  482

seq1  TTAAACTTGTTAGATGAAGGCAGTGCATTAAGGCAGGGCTTTGAAAAGGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTTGTTAGATGAAGGCAGTGCATTAAGGCAGGGCTTTGAAAAGGT  532

seq1  GGTGACATAGAATCCGTAGTTTGAGTGGCTAAAGTGTTTGGTGTGGCATC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGACATAGAATCCGTAGTTTGAGTGGCTAAAGTGTTTGGTGTGGCATC  582

seq1  ATGCTAAGAACAGCTTTCTGAAAATACCATTTAGACTCATGGAACACTTG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAGAACAGCTTTCTGAAAATACCATTTAGACTCATGGAACACTTG  632

seq1  ATATAACTGCAAAATAATTACACATTATTTACAAAAAACAAACAAACAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAACTGCAAAATAATTACACATTATTTACAAAAAACAAACAAACAAA  682

seq1  CAAACATAGGTAAAGATTGAAACAGTCATTTAATCTTACTTAACAGTACA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATAGGTAAAGATTGAAACAGTCATTTAATCTTACTTAACAGTACA  732

seq1  GATTTGGTCCTAGCTTGGCTGCTTATATACAGAGTATTCCCATTTAATTC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTGGTCCTAGCTTGGCTGCTTATATACAGAGTATTCCCATTTAATTC  782

seq1  AGCCTACATCTTTTAAAAAAGGGAAAAATAAATAAACAAGTCTACAGAAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTACATCTTTTAAAAAAGGGAAAAATAAATAAACAAGTCTACAGAAT  832

seq1  CCTATCCATTGTTAGTGAAATCTAGAGAAAAGGGCTGGAGAGGTGGCTCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATCCATTGTTAGTGAAATCTAGAGAAAAGGGCTGGAGAGGTGGCTCA  882

seq1  TAGGTTAAGAGCACTTGCTGCTCTTGCTCAAGAGCCTAGTTCCATTCCCA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTAAGAGCACTTGCTGCTCTTGCTCAAGAGCCTAGTTCCATTCCCA  932

seq1  GCATCCACATGGCAGCTCACAAGCTGCTGCACTCAAGGATCACAAGACCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCACATGGCAGCTCACAAGCTGCTGCACTCAAGGATCACAAGACCT  982

seq1  GATACTCTCTGCTGGTTTGTTGATGCGTGCATAGTATTGAAATATACTCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTCTCTGCTGGTTTGTTGATGCGTGCATAGTATTGAAATATACTCA  1032

seq1  TGCAGTGCACACACATCTATGTGAGGGAACATACCTACACATAAAAATAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGCACACACATCTATGTGAGGGAACATACCTACACATAAAAATAA  1082

seq1  ACAAATAC-ATAATTACTAAGCTCAGGGGAGATGAATTC  1136
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATACGATAATTACTAAGCTCAGGGGAGATGAATTC  1121

seq1: chr10_124796218_124796953
seq2: B6Ng01-024F04.g_70_806

seq1  GAATTCCAGATATTTACTCATCCACCAAGTAGGAACTATAAGACCCCCGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGATATTTACTCATCCACCAAGTAGGAACTATAAGACCCCCGA  50

seq1  TGCTGGGCCTCCGCTTAAGTCCCGGGATGAGCTGGCCAACACCCCAACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGCCTCCGCTTAAGTCCCGGGATGAGCTGGCCAACACCCCAACAT  100

seq1  CTCAAGAGAAAACCACACCTGATGCAAACTGCAAGAGGTTTTATTATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAGAAAACCACACCTGATGCAAACTGCAAGAGGTTTTATTATCAG  150

seq1  CTAGCTGAGGGCAAAGTCCCTCTACTGTGCAGGGCAGGGGAGTTTGACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTGAGGGCAAAGTCCCTCTACTGTGCAGGGCAGGGGAGTTTGACTC  200

seq1  TGAGCTGTGACAGTAGGGGGCTTTTAACAGCTAGCTGAGGAGTTGGGAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTGTGACAGTAGGGGGCTTTTAACAGCTAGCTGAGGAGTTGGGAGG  250

seq1  AGTTGCGAAGAGTTCTTCTCTTCCTGGTGTCCTTGGTGAAATTTACAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCGAAGAGTTCTTCTCTTCCTGGTGTCCTTGGTGAAATTTACAAGG  300

seq1  CAGGAGTGGGGAGTGAGTTCTTTTTGAATTTTTATCTCCATGTCCTCAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGTGGGGAGTGAGTTCTTTTTGAATTTTTATCTCCATGTCCTCAGC  350

seq1  ACAGGAAGGCAGGCATCTCCGGTTGTACAGTATAGAAACAAAAAGGCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGAAGGCAGGCATCTCCGGTTGTACAGTATAGAAACAAAAAGGCTTT  400

seq1  TTGCTGGCTATAGAGAACAAAGAGCTTCTTTTTAGCTGTATTTTTAAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGGCTATAGAGAACAAAGAGCTTCTTTTTAGCTGTATTTTTAAAGA  450

seq1  TCAGGGAAAACAAGCTTGGGGAACATCTAGGGGCTTTACCTTCCAGGGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGAAAACAAGCTTGGGGAACATCTAGGGGCTTTACCTTCCAGGGAG  500

seq1  AAACGCTCTAAGTCGGGGTCTCACAGAACGAAGCACAATATTCCATACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACGCTCTAAGTCGGGGTCTCACAGAACGAAGCACAATATTCCATACCT  550

seq1  GGGCTTTGTTGATCTCAGTATAAGCTTTCTTCTCCTATCAAGTATCTCTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTTGTTGATCTCAGTATAAGCTTTCTTCTCCTATCAAGTATCTCTC  600

seq1  ATCTATTTCACTTTTGAGAATCTGTCACTTGAGACATACACTGTCAGGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATTTCACTTTTGAGAATCTGTCACTTGAGACATACACTGTCAGGTA  650

seq1  CCTCACTGGACCTTTTCCTTCAAACAAATGTAAAATAGAGAGTCTGTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACTGGACCTTTTCCTTCAAACAAATGTAAAATAGAGAGTCTGTTTT  700

seq1  CCTCCATAAGTCC-AAAAGTAGCATTAGAAGGCCTCG  736
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCATAAGTCCAAAAAGTAGCATTAGAAGGCCTCG  737