BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-026B08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 60,311,136 - 60,443,905
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCbara1, LOC664936, Dnajb12, Ddit4, D10Ertd641e, Ascc1, Spock2, Chst3, LOC100039080, Psap, Cdh23, 4632428N05Rik, Slc29a3, Unc5b
Downstream genePcbd1, Sgpl1, 1700021K02Rik, Adamts14, Prf1, EG237361, X99384, Nodal, Eif4ebp2, D830039M14Rik, Lrrc20, Npffr1, Ppa1, Sar1a, Tysnd1, Aifm2, H2afy2, LOC100039284, Col13a1, EG436164
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-026B08.bB6Ng01-026B08.g
ACCDH857228DH857229
length1,0861,099
definitionDH857228|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026B08, 5' end.DH857229|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-026B08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,442,804 - 60,443,905)(60,311,136 - 60,312,244)
sequence
gaattcaatggcccactgatgtcaggatgtcacacactcaaggctgggct
agagacccatgtaccccaccccagttcagtgctaagactctgactaggaa
gcaggggatgtgtccgtggctccttttctttcctgcttggctctatatga
actaaaggggcagctgtggactgattggtatttagtacctctaggagcca
ggctctgcccctctctgggaagctaggaagaggctctgggcatcagccct
ctgctggctctgtcaatccagggtcacagtagaagaaggctcatggaccc
tgtctggatgcctggtggatacactggtgtgtcaatgggtagaagatgcc
cccatcattcaccaggaaccagatacaaacatcgtccactacagatgcct
cctttggagcctatggaattctcaaggtagacaccagaagccgttccaat
gagggccttagcatcctctcagtcattcaatggaattctcccttgagcac
atgctcatagaaatcctgccctatcagaaatcaactccagcaaggacata
ctcctgctctaaagccttctatggctccccactgccccctacaaaaggat
tagtgggatcctggtcacacagggaagagaagtcatgttgagaaggtggg
ggtccgatgacttcataaaggatctttaatttttatttatttatttttta
acaagagatgaaactgaggctcagggttggataagccacccatggctaca
ctgctaggtcatgtctgagacaggagtcacaccaggtatttgtgtcagag
cccaagctctttaactctccagaaggaagaggtgtgggggatggtgtagc
attaaccaggtggctcccggggctgcagttgcagcagagaatggagttat
cagaggtggatcctagccttgcccaaaggaccatgagctgccaggaagga
gacgcagtctcactacagaagcaacagcagatctcaacagccgcctgtgg
acatcagtaggtgctcacgaagccagcggggggtttgtgggtgccttccc
tgaaaggacacagttggctcctacctcctattagta
gaattcctcgccttggactaacatgttatttgaagacaggtctgtgcaga
tgtattcatgtttagatgaggtcacagaatggctccaatccaacaggact
gtgtccctacagacagggcaaacctggacacagctgcatgctgggaaggc
ggtgtgaaggcagtgggggaaggtagacagtcaggatgctccagtaaagg
ccatgaaaccaccatcaccggtgatgctggctgctagaagtggctgggaa
agaggccagcatggtctgcagacttgtagggagcatagcccgttccctga
gcttagactttttgcctcctcaactgtgagatactgtggctgtctaagcc
actgggtgtgcttgcttttttgaggcccgagtcctcacacttgcatggga
agcagcgccgtactgactgaatcatcagccctgtttctggaaatgtgact
tctttatttattagtttattttattgatcagttgaattttataaatataa
tgctgttttgtgggagagcgtgcgagcacttgtgccactgtgcacatatg
gaggtcagaggacaacttccaagagtcagttttctcctattgtgtaggtg
ctggggattgaactcaagccatcagacttggcaacaagtgcctttacctg
cttagccctcttgccagtcctggaaaagttactcatattggcactgatat
gttaccacatattcctattgtccttctgccctactgccctttctgccctt
ctgcccttctgccctactgccctactgccctactgccctactgccctact
gccttctctgggactcctcatctaagagccccaaccctgggttgccccag
tctctttcagaaaagcagctcccatgatctctctcttcctctttggctcc
attctccaaccctgtcttctcacactctgattgatcacctcctcagaagc
atctgtacccacagggaagcatccaactgagtttcttccgcggaacctag
ctggtggactgttctatggattttcataatccccctgcgctgtttgaata
aaatgaccttaatgccataagggagtgcccaatagagatgtggccttgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_60442804_60443905
seq2: B6Ng01-026B08.b_47_1132 (reverse)

seq1  TACTAATGATGAGTGTAGGAGCCAAACTGTGTCCCTTTCCAGGGAAGGCC  50
      ||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||| |
seq2  TACTAAT-AGGAG-GTAGGAGCC-AACTGTGTCC--TTTCAGGGAAGG-C  44

seq1  ACCCAACAGACCCCCACGCTGGCTTCAGTGAGCACCTACTGATGTCCACA  100
      |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACCC-ACAAACCCCC-CGCTGGCTTC-GTGAGCACCTACTGATGTCCACA  91

seq1  GGCGGCTGTTGAGAATCTGCCTGTTTGCCTTCTGTAGTGGAGACTGCCTT  150
      ||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||| ||||||| | |
seq2  GGCGGCTGTTGAG-ATCTG-CTGTT--GCTTCTGTAGT-GAGACTG-CGT  135

seq1  CTCCTTCCTGGCAGCTCATGGTCCTTTGGGCAAGGCTAGGATCCACCTCC  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CTCCTTCCTGGCAGCTCATGGTCCTTTGGGCAAGGCTAGGATCCACCT-C  184

seq1  TGATAACTCCATTCTCTGCTGCAACTGCAGCCCCGGGAGCCACCTGGTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAACTCCATTCTCTGCTGCAACTGCAGCCCCGGGAGCCACCTGGTTA  234

seq1  ATGCTACACCATCCCCCACACCTCTTCCTTCTGGAGAGTTAAAGAGCTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTACACCATCCCCCACACCTCTTCCTTCTGGAGAGTTAAAGAGCTTG  284

seq1  GGCTCTGACACAAATACCTGGTGTGACTCCTGTCTCAGACATGACCTAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTGACACAAATACCTGGTGTGACTCCTGTCTCAGACATGACCTAGC  334

seq1  AGTGTAGCCATGGGTGGCTTATCCAACCCTGAGCCTCAGTTTCATCTCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTAGCCATGGGTGGCTTATCCAACCCTGAGCCTCAGTTTCATCTCTT  384

seq1  GTTAAAAAATAAATAAATAAAAATTAAAGATCCTTTATGAAGTCATCGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAAAATAAATAAATAAAAATTAAAGATCCTTTATGAAGTCATCGGA  434

seq1  CCCCCACCTTCTCAACATGACTTCTCTTCCCTGTGTGACCAGGATCCCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCACCTTCTCAACATGACTTCTCTTCCCTGTGTGACCAGGATCCCAC  484

seq1  TAATCCTTTTGTAGGGGGCAGTGGGGAGCCATAGAAGGCTTTAGAGCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCCTTTTGTAGGGGGCAGTGGGGAGCCATAGAAGGCTTTAGAGCAGG  534

seq1  AGTATGTCCTTGCTGGAGTTGATTTCTGATAGGGCAGGATTTCTATGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGTCCTTGCTGGAGTTGATTTCTGATAGGGCAGGATTTCTATGAGC  584

seq1  ATGTGCTCAAGGGAGAATTCCATTGAATGACTGAGAGGATGCTAAGGCCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTCAAGGGAGAATTCCATTGAATGACTGAGAGGATGCTAAGGCCC  634

seq1  TCATTGGAACGGCTTCTGGTGTCTACCTTGAGAATTCCATAGGCTCCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGGAACGGCTTCTGGTGTCTACCTTGAGAATTCCATAGGCTCCAAA  684

seq1  GGAGGCATCTGTAGTGGACGATGTTTGTATCTGGTTCCTGGTGAATGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCATCTGTAGTGGACGATGTTTGTATCTGGTTCCTGGTGAATGATG  734

seq1  GGGGCATCTTCTACCCATTGACACACCAGTGTATCCACCAGGCATCCAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCATCTTCTACCCATTGACACACCAGTGTATCCACCAGGCATCCAGA  784

seq1  CAGGGTCCATGAGCCTTCTTCTACTGTGACCCTGGATTGACAGAGCCAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGTCCATGAGCCTTCTTCTACTGTGACCCTGGATTGACAGAGCCAGC  834

seq1  AGAGGGCTGATGCCCAGAGCCTCTTCCTAGCTTCCCAGAGAGGGGCAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGCTGATGCCCAGAGCCTCTTCCTAGCTTCCCAGAGAGGGGCAGAG  884

seq1  CCTGGCTCCTAGAGGTACTAAATACCAATCAGTCCACAGCTGCCCCTTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGCTCCTAGAGGTACTAAATACCAATCAGTCCACAGCTGCCCCTTTA  934

seq1  GTTCATATAGAGCCAAGCAGGAAAGAAAAGGAGCCACGGACACATCCCCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATATAGAGCCAAGCAGGAAAGAAAAGGAGCCACGGACACATCCCCT  984

seq1  GCTTCCTAGTCAGAGTCTTAGCACTGAACTGGGGTGGGGTACATGGGTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTAGTCAGAGTCTTAGCACTGAACTGGGGTGGGGTACATGGGTCT  1034

seq1  CTAGCCCAGCCTTGAGTGTGTGACATCCTGACATCAGTGGGCCATTGAAT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCCCAGCCTTGAGTGTGTGACATCCTGACATCAGTGGGCCATTGAAT  1084

seq1  TC  1102
      ||
seq2  TC  1086

seq1: chr10_60311136_60312244
seq2: B6Ng01-026B08.g_66_1164

seq1  GAATTCCTCGCCTTGGACTAACATGTTATTTGAAGACAGGTCTGTGCAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCGCCTTGGACTAACATGTTATTTGAAGACAGGTCTGTGCAGA  50

seq1  TGTATTCATGTTTAGATGAGGTCACAGAATGGCTCCAATCCAACAGGACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCATGTTTAGATGAGGTCACAGAATGGCTCCAATCCAACAGGACT  100

seq1  GTGTCCCTACAGACAGGGCAAACCTGGACACAGCTGCATGCTGGGAAGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCTACAGACAGGGCAAACCTGGACACAGCTGCATGCTGGGAAGGC  150

seq1  GGTGTGAAGGCAGTGGGGGAAGGTAGACAGTCAGGATGCTCCAGTAAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGAAGGCAGTGGGGGAAGGTAGACAGTCAGGATGCTCCAGTAAAGG  200

seq1  CCATGAAACCACCATCACCGGTGATGCTGGCTGCTAGAAGTGGCTGGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAAACCACCATCACCGGTGATGCTGGCTGCTAGAAGTGGCTGGGAA  250

seq1  AGAGGCCAGCATGGTCTGCAGACTTGTAGGGAGCATAGCCCGTTCCCTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCCAGCATGGTCTGCAGACTTGTAGGGAGCATAGCCCGTTCCCTGA  300

seq1  GCTTAGACTTTTTGCCTCCTCAACTGTGAGATACTGTGGCTGTCTAAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGACTTTTTGCCTCCTCAACTGTGAGATACTGTGGCTGTCTAAGCC  350

seq1  ACTGGGTGTGCTTGCTTTTTTGAGGCCCGAGTCCTCACACTTGCATGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGTGTGCTTGCTTTTTTGAGGCCCGAGTCCTCACACTTGCATGGGA  400

seq1  AGCAGCGCCGTACTGACTGAATCATCAGCCCTGTTTCTGGAAATGTGACT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCGCCGTACTGACTGAATCATCAGCCCTGTTTCTGGAAATGTGACT  450

seq1  TCTTTATTTATTAGTTTATTTTATTGATCAGTTGAATTTTATAAATATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTTATTAGTTTATTTTATTGATCAGTTGAATTTTATAAATATAA  500

seq1  TGCTGTTTTGTGGGAGAGCGTGCGAGCACTTGTGCCACTGTGCACATATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTTTGTGGGAGAGCGTGCGAGCACTTGTGCCACTGTGCACATATG  550

seq1  GAGGTCAGAGGACAACTTCCAAGAGTCAGTTTTCTCCTATTGTGTAGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCAGAGGACAACTTCCAAGAGTCAGTTTTCTCCTATTGTGTAGGTG  600

seq1  CTGGGGATTGAACTCAAGCCATCAGACTTGGCAACAAGTGCCTTTACCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGATTGAACTCAAGCCATCAGACTTGGCAACAAGTGCCTTTACCTG  650

seq1  CTTAGCCCTCTTGCCAGTCCTGGAAAAGTTACTCATATTGGCACTGATAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGCCCTCTTGCCAGTCCTGGAAAAGTTACTCATATTGGCACTGATAT  700

seq1  GTTACCACATATTCCTATTGTCCTTCTGCCCTACTGCCC-TTCTGCCCTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTTACCACATATTCCTATTGTCCTTCTGCCCTACTGCCCTTTCTGCCCTT  750

seq1  CTGCCCTTCTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCTTCTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACTGCCCTACT  800

seq1  GCCTTCTCTGGGACTCCTCATCTAAGAGCCCCAACCCTGGGTTGCCCCAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTCTCTGGGACTCCTCATCTAAGAGCCCCAACCCTGGGTTGCCCCAG  850

seq1  TCTCTTTCAGAAAAGCAGCTCCCATGATCTCTCTCTTCCTCTTTGGCTCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCAGAAAAGCAGCTCCCATGATCTCTCTCTTCCTCTTTGGCTCC  900

seq1  ATTCTCCAACCCTGTCCTTCTCACACTCTGATTGATCACCTCCCTCAGAA  949
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  ATTCTCCAACCCTGT-CTTCTCACACTCTGATTGATCACCT-CCTCAGAA  948

seq1  GCATCTGTACCCACAGGGAAGCATCCAACTGAGTGTCTTCCGCGGAACCT  999
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GCATCTGTACCCACAGGGAAGCATCCAACTGAGTTTCTTCCGCGGAACCT  998

seq1  AGCTGGTGGACCTGGTTCTATGGTATTTTCATAATCCCTCTGCGCTGTTT  1049
      |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||
seq2  AGCTGGTGGAC--TGTTCTATGG-ATTTTCATAATCCCCCTGCGCTG-TT  1044

seq1  TGAATAAAAATGACCCTTATAGCCCATAGGGAGTGGCACAATTAGGAGAT  1099
      ||||| ||||||| |||||  |||   ||||||| || ||||   |||||
seq2  TGAAT-AAAATGA-CCTTAATGCCATAAGGGAGT-GCCCAAT--AGAGAT  1089

seq1  GTGGCCTTGT  1109
      ||||||||||
seq2  GTGGCCTTGT  1099