BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-035C13
Chromosome10 (Build37)
Map Location 96,726,906 - 96,897,741
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC667380, Btg1, LOC628256, 4930556N09Rik, EG667407
Downstream geneDcn, Lum, Kera, Epyc, 4921510H08Rik, EG667438
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-035C13.bB6Ng01-035C13.g
ACCDH863707DH863708
length946884
definitionDH863707|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035C13, 5' end.DH863708|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035C13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,726,906 - 96,727,871)(96,896,843 - 96,897,741)
sequence
gaattcagtgtcctaatgttactctaggattatgagtttcagttttcgaa
tgaagaaattttgagtcttgtttgttaccaaagtaacaaactagtaagag
aggaagcaatttcccaaaccctacacctgagcacttgtcagttaatgtta
gcatgaccataagtgcaacttctaaaataagttctttttaaacaatagca
atgcacgcacacaaaacaatcaaatccatgaaatagtgtagtgcagacaa
ataggagggtattacagtgtctgtgtgcaagcatgcatggatatgagata
taaaacaacaaaaaccagggccagcactgagctaaaaaccattttcatta
ttgacacatgctcttaaattcaaatatcgtttcagagatggtaagaacga
ttttatgttaaatttgtgcacaaaaataaattagcctggcagcaaaagtc
aatgtgctagtggtctagaatgtattaagatttagtaggcagaatatttg
aatatgttttaatagctattactgttaaaatattgagctgaaatcaaatg
tcagtggacctccccaaaccattaagaattaagccttcataaaaactggt
cttcaaaattacctctgagaatgtgatatctacaatttaaattcctgttt
tcaagtatgtaattctttaagaatctatgaaagctacatatgctcacatc
tgtaaggcatcttttttcctccagggctagaaaagtcagaacacacacac
acacacacacacggcatatcactcaaatgcagagagagacacaagagata
agagcagagacaaaatacaatgcaacaggactacatagcatatctcattc
agtatatacgtactctaaatgtattgatctgtgtgatatttaaacccaaa
atgcagagatatatagaatttctcagaagacacttgatgacttcaa
gaattcctgcatagaaaacatttagaggcgaaaggccagtatgactctaa
actgtgccatgctgtaacctgttttgagaatgcagcatctggactctgtt
gctctctctcatgaaaattcccacttccttttaaaccttgatacctctaa
ttgctctgactaggactttgagtactatattgaatatgtagggagagact
gagcataattttctaacaacaatgcctcctaactatgtattttggacaat
taaataatccccgaagcactctaccatttcttttaagttctgatcctgcc
accatgattcaactttaacaattttcatgaccagattttgcgcattacct
tcagtgtcttcctagcaaagcctttgctttgttgctttaatttttctgat
attgacttccttccagctctgacaatctctcccagatattttactatatc
cttgcatgagctttaagttctggtgaaattgttacttattagctagatat
cccttgtattttgtatgattattcaaatctgcttaccttaatattttact
gaacttatgcagcttggcccagttaggtgtagatgcatctaacattagaa
tcatttgtatcattttcctatgccactatgaactgtttgatataggtaaa
cagcatatcatttgccctaatttataaaatagtgataaggtgcttatcta
ttttgtatgaaacatacggcagagtgttttcacatcttgttatctaagct
tttgtaaaaatttagcctctttaacatgatatggaatacttcatgaatgg
agtaaatacatacttcaaagaatttattatgggaggattatagaagggta
ccttggaggatacaggagataaggaggggggaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_96726906_96727871
seq2: B6Ng01-035C13.b_48_993

seq1  GAATTCAGTGTCCTAATGTTACTCTAGGATTATGAGTTTCAGTTTTCGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGTCCTAATGTTACTCTAGGATTATGAGTTTCAGTTTTCGAA  50

seq1  TGAAGAAATTTTGAGTCTTGTTTGTTACCAAAGTAACAAACTAGTAAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGAAATTTTGAGTCTTGTTTGTTACCAAAGTAACAAACTAGTAAGAG  100

seq1  AGGAAGCAATTTCCCAAACCCTACACCTGAGCACTTGTCAGTTAATGTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGCAATTTCCCAAACCCTACACCTGAGCACTTGTCAGTTAATGTTA  150

seq1  GCATGACCATAAGTGCAACTTCTAAAATAAGTTCTTTTTAAACAATAGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGACCATAAGTGCAACTTCTAAAATAAGTTCTTTTTAAACAATAGCA  200

seq1  ATGCACGCACACAAAACAATCAAATCCATGAAATAGTGTAGTGCAGACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACGCACACAAAACAATCAAATCCATGAAATAGTGTAGTGCAGACAA  250

seq1  ATAGGAGGGTATTACAGTGTCTGTGTGCAAGCATGCATGGATATGAGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGAGGGTATTACAGTGTCTGTGTGCAAGCATGCATGGATATGAGATA  300

seq1  TAAAACAACAAAAACCAGGGCCAGCACTGAGCTAAAAACCATTTTCATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACAACAAAAACCAGGGCCAGCACTGAGCTAAAAACCATTTTCATTA  350

seq1  TTGACACATGCTCTTAAATTCAAATATCGTTTCAGAGATGGTAAGAACGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACACATGCTCTTAAATTCAAATATCGTTTCAGAGATGGTAAGAACGA  400

seq1  TTTTATGTTAAATTTGTGCACAAAAATAAATTAGCCTGGCAGCAAAAGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGTTAAATTTGTGCACAAAAATAAATTAGCCTGGCAGCAAAAGTC  450

seq1  AATGTGCTAGTGGTCTAGAATGTATTAAGATTTAGTAGGCAGAATATTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGCTAGTGGTCTAGAATGTATTAAGATTTAGTAGGCAGAATATTTG  500

seq1  AATATGTTTTAATAGCTATTACTGTTAAAATATTGAGCTGAAATCAAATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGTTTTAATAGCTATTACTGTTAAAATATTGAGCTGAAATCAAATG  550

seq1  TCAGTGGACCTCCCCAAACCATTAAGAATTAAGCCTTCATAAAAACTGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGGACCTCCCCAAACCATTAAGAATTAAGCCTTCATAAAAACTGGT  600

seq1  CTTCAAAATTACCTCTGAGAATGTGATATCTACAATTTAAATTCCTGTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAAAATTACCTCTGAGAATGTGATATCTACAATTTAAATTCCTGTTT  650

seq1  TCAAGTATGTAATTCTTTAAGAATCTATGAAAGCTACATATGCTCACATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTATGTAATTCTTTAAGAATCTATGAAAGCTACATATGCTCACATC  700

seq1  TGTAAGGGCATCTTTTTTCCTCCAAGGGCTAGAAAAGTCAGAACACACAC  750
      ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAA-GGCATCTTTTTTCCTCC-AGGGCTAGAAAAGTCAGAACACACAC  748

seq1  ACACACACACACACGGCATATCACTCAAATGCAGAGAGAGACACAAAGAG  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACACACACACACACGGCATATCACTCAAATGCAGAGAGAGACAC-AAGAG  797

seq1  ATAAAGAAGCAGAGACAAAAATAACAAATGCAAACAGGGACTACATAGCA  850
      ||||   ||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||
seq2  ATAA--GAGCAGAGAC-AAAATA--CAATGC-AACA-GGACTACATAGCA  840

seq1  TATCTCATTTCCAGTATATACGTACTCTAAATGTATTTGATCTGTGTGTA  900
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
seq2  TATCTCATT--CAGTATATACGTACTCTAAATGTA-TTGATCTGTGTG-A  886

seq1  TATTTTAAACCCCAAAATGGCAGAGATATATAGAAAATTTCTCAGAAGAC  950
      |||||  || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| 
seq2  TATTT--AAACCCAAAAT-GCAGAGATATATAG--AATTTCTCAGAAGA-  930

seq1  CACTTGATGACTTCAA  966
      ||||||||||||||||
seq2  CACTTGATGACTTCAA  946

seq1: chr10_96896843_96897741
seq2: B6Ng01-035C13.g_67_950 (reverse)

seq1  CTTCCCCCCTCCTTTATCCTCCCTGTAGTCCTTCCAAGGTACCCTTCCTA  50
      |||||||||||| |||||   |||||| ||| |||||||||||||| |||
seq2  CTTCCCCCCTCC-TTATC--TCCTGTA-TCC-TCCAAGGTACCCTT-CTA  44

seq1  TAATTCCTCCCATAAATAAATCTTTTGAGTATGTAATTTTACTCCATTCA  100
      ||| |||||||||||  || |||||  ||||||||  |||||||||||||
seq2  TAA-TCCTCCCATAATAAATTCTTTGAAGTATGTA--TTTACTCCATTCA  91

seq1  TGAAGTATTCCATATTCATGTTTATAAGAGGCTAAAATTTTTACAAAAGC  150
      |||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||
seq2  TGAAGTATTCCATA-TCATGTT--AAAGAGGCT-AAATTTTTACAAAAGC  137

seq1  TTAGATAACAAGATGTGAAAACACCTCTGCCGTATGTTTCATACAAAATA  200
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATAACAAGATGTGAAAACA-CTCTGCCGTATGTTTCATACAAAATA  186

seq1  GATAAGCACCTATTCACTATTTTATTAAATTAGGGCAAATGATATGCTGT  250
      |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGCACCTTATCACTATTTTA-TAAATTAGGGCAAATGATATGCTGT  235

seq1  TTACCTATATCAAACAGTTCATAGTGGCATAGGAAAATGATACAAATGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTATATCAAACAGTTCATAGTGGCATAGGAAAATGATACAAATGAT  285

seq1  TCTAATGTTAGATGCATCTACACCTAACTGGGCCAAGCTGCATAAGTTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATGTTAGATGCATCTACACCTAACTGGGCCAAGCTGCATAAGTTCA  335

seq1  GTAAAATATTAAGGTAAGCAGATTTGAATAATCATACAAAATACAAGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATATTAAGGTAAGCAGATTTGAATAATCATACAAAATACAAGGGA  385

seq1  TATCTAGCTAATAAGTAACAATTTCACCAGAACTTAAAGCTCATGCAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAGCTAATAAGTAACAATTTCACCAGAACTTAAAGCTCATGCAAGG  435

seq1  ATATAGTAAAATATCTGGGAGAGATTGTCAGAGCTGGAAGGAAGTCAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGTAAAATATCTGGGAGAGATTGTCAGAGCTGGAAGGAAGTCAATA  485

seq1  TCAGAAAAATTAAAGCAACAAAGCAAAGGCTTTGCTAGGAAGACACTGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAAAATTAAAGCAACAAAGCAAAGGCTTTGCTAGGAAGACACTGAA  535

seq1  GGTAATGCGCAAAATCTGGTCATGAAAATTGTTAAAGTTGAATCATGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATGCGCAAAATCTGGTCATGAAAATTGTTAAAGTTGAATCATGGTG  585

seq1  GCAGGATCAGAACTTAAAAGAAATGGTAGAGTGCTTCGGGGATTATTTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGATCAGAACTTAAAAGAAATGGTAGAGTGCTTCGGGGATTATTTAA  635

seq1  TTGTCCAAAATACATAGTTAGGAGGCATTGTTGTTAGAAAATTATGCTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCAAAATACATAGTTAGGAGGCATTGTTGTTAGAAAATTATGCTCA  685

seq1  GTCTCTCCCTACATATTCAATATAGTACTCAAAGTCCTAGTCAGAGCAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTCCCTACATATTCAATATAGTACTCAAAGTCCTAGTCAGAGCAAT  735

seq1  TAGAGGTATCAAGGTTTAAAAGGAAGTGGGAATTTTCATGAGAGAGAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGTATCAAGGTTTAAAAGGAAGTGGGAATTTTCATGAGAGAGAGCA  785

seq1  ACAGAGTCCAGATGCTGCATTCTCAAAACAGGTTACAGCATGGCACAGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGTCCAGATGCTGCATTCTCAAAACAGGTTACAGCATGGCACAGTT  835

seq1  TAGAGTCATACTGGCCTTTCGCCTCTAAATGTTTTCTATGCAGGAATTC  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCATACTGGCCTTTCGCCTCTAAATGTTTTCTATGCAGGAATTC  884