BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-038E17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,264,928 - 90,382,715
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneE030041M21Rik, E530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-038E17.bB6Ng01-038E17.g
ACCDH865895DH865896
length678938
definitionDH865895|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038E17, 5' end.DH865896|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038E17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,264,928 - 90,265,605)(90,381,767 - 90,382,715)
sequence
gaattccagacagataaggatgacagaagagagggacaatcatggaaggc
acagaagacatctgagagatgagtcctttgaaccagatacggtagatagt
ttacagtggttggttttgatactttcctcactgttgaagcaaagtattgg
aaaaaaaaattccagcccgtggaaagacggctttattttggctcacagtt
attttggaagcctgtcttagtggggaaggtaagttaacaaagagaatgtg
gtggctgatggattgcatctgccttccccaagcagttgctctatctgcta
ttgctcatccactttcctttttagttaaatcctggagggtgggtcttccc
accttaatttacttaatctagataatccttagattggcccagagaccaac
ctaatctagataaccctcccaggtatgcctaaaggcttatcccctatagg
tgatcctagaacctgacaagatgataataacattaaccttcccaaagata
aaattaacatttgcaattcccttagatcaggagttgaggggacttctcat
ttattgtcccagctttcatggtgtgtgtttgttctaagctatgtgtgtga
catgtgacaaatgttctctagatgactgttgaatatgtgaaaaataggaa
gagagagagagaagggaggggggaggta
gaattctgttagatgggacagagggaactaccaaagatagaaagcacgag
aaaagggccttgccttttggatgtttctaactggctttgagaaaaaagaa
aaaaaaaaaaaacaagtagaaaaattgtgagccctgtagaaatgcatggg
ccttgtcacagctgtgcacctggagcatgtcttctgtatgtgggtcacct
agcatcacaggtgagccttgctagcatcgtgcccagccttcagctcctcc
tgggaacatgtgtctaatgagaacaccacatgcctttgctctgttctcag
ccattgtctgcatttgttctagttggtggcttgcttgtattgactgctcc
acctagtctcagatgtcttgacacatatcacttaaaacatagcataacat
ttaagaactataacattaacattaacacttttccccttgactttatggcc
cattcctgattcattataaaattttatctttatatgaattatttgtaaaa
gtaataatggactgcaattaacttcaagattaagcttttctctgatttta
tatttttgacctttgcttctctttctttctctctctctctctctctctct
ctctctctctctctctctcaaatgtctgacttattatttctctagtttta
taaagctggttatgcattgcccttaaaaactcatgcagatgtcaacctga
atgctctgaggaattctttattatttttaagctgagcataataacctttt
tatgactctggaagcgctgcagctatgagttttcaaagctctccccaaat
ctagcaaacatccctcagtttccccattcgacttctctccctcccgtgtt
ccctgagaaagcacatgactagaaacagtgttgtacacttattcacaggt
gtgccgtaacagacacaggagtttgcacgcaactctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90264928_90265605
seq2: B6Ng01-038E17.b_46_723

seq1  GAATTCCAGACAGATAAGGATGACAGAAGAGAGGGACAATCATGGAAGGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGACAGATAAGGATGACAGAAGAGAGGGACAATCATGGAAGGC  50

seq1  ACAGAAGACATCTGAGAGATGAGTCCTTTGAACCAGATACGGTAGATAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAGACATCTGAGAGATGAGTCCTTTGAACCAGATACGGTAGATAGT  100

seq1  TTACAGTGGTTGGTTTTGATACTTTCCTCACTGTTGAAGCAAAGTATTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGTGGTTGGTTTTGATACTTTCCTCACTGTTGAAGCAAAGTATTGG  150

seq1  AAAAAAAAATTCCAGCCCGTGGAAAGACGGCTTTATTTTGGCTCACAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAATTCCAGCCCGTGGAAAGACGGCTTTATTTTGGCTCACAGTT  200

seq1  ATTTTGGAAGCCTGTCTTAGTGGGGAAGGTAAGTTAACAAAGAGAATGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGGAAGCCTGTCTTAGTGGGGAAGGTAAGTTAACAAAGAGAATGTG  250

seq1  GTGGCTGATGGATTGCATCTGCCTTCCCCAAGCAGTTGCTCTATCTGCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTGATGGATTGCATCTGCCTTCCCCAAGCAGTTGCTCTATCTGCTA  300

seq1  TTGCTCATCCACTTTCCTTTTTAGTTAAATCCTGGAGGGTGGGTCTTCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCATCCACTTTCCTTTTTAGTTAAATCCTGGAGGGTGGGTCTTCCC  350

seq1  ACCTTAATTTACTTAATCTAGATAATCCTTAGATTGGCCCAGAGACCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTAATTTACTTAATCTAGATAATCCTTAGATTGGCCCAGAGACCAAC  400

seq1  CTAATCTAGATAACCCTCCCAGGTATGCCTAAAGGCTTATCCCCTATAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATCTAGATAACCCTCCCAGGTATGCCTAAAGGCTTATCCCCTATAGG  450

seq1  TGATCCTAGAACCTGACAAGATGATAATAACATTAACCTTCCCAAAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCCTAGAACCTGACAAGATGATAATAACATTAACCTTCCCAAAGATA  500

seq1  AAATTAACATTTGCAATTCCCTTAGATCAGGAGTTGAGGGGACTTCTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAACATTTGCAATTCCCTTAGATCAGGAGTTGAGGGGACTTCTCAT  550

seq1  TTATTGTCCCAGCTTTCATGGTGTGTGTTTGTTCTAAGCTATGTGTGTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTGTCCCAGCTTTCATGGTGTGTGTTTGTTCTAAGCTATGTGTGTGA  600

seq1  CATGTGACAAATGTTCTCTAGATGACTGTTGAATATGTGAAAAATAGGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGACAAATGTTCTCTAGATGACTGTTGAATATGTGAAAAATAGGAA  650

seq1  GAGAGAGAGAGAAGGGAGGGGGGAGGTA  678
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAAGGGAGGGGGGAGGTA  678

seq1: chr10_90381767_90382715
seq2: B6Ng01-038E17.g_66_1003 (reverse)

seq1  ACAGAGTTGCGTGCAAACTCCTGTTGTTCTGTTAACGGCATCACCTGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||
seq2  ACAGAGTTGCGTGCAAACTCCTGT--GTCTGTT-ACGGCA-CACCTGTGA  46

seq1  CTTAAGTGTACAACACCTGTTTGCTATGTCATTGTTGCTTTCTCAAGGGA  100
        ||||||||||||| |||||| ||| |||||   ||||||||| |||||
seq2  -ATAAGTGTACAACA-CTGTTT-CTA-GTCAT--GTGCTTTCTC-AGGGA  89

seq1  ACACGGGAGGGAGAGAAGTCGAATGGGGAAACTGAGGGATGTTTGCTAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGGGAGGGAGAGAAGTCGAATGGGGAAACTGAGGGATGTTTGCTAGA  139

seq1  TTTGGGGAGAGCTTTGAAGAACTCATAGCTGCAGCGCTTCCAGAGTCAT-  199
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TTTGGGGAGAGCTTTGAA-AACTCATAGCTGCAGCGCTTCCAGAGTCATA  188

seq1  AAAAGGTTATTATGCTCAGCTTAAAAATAATAATGAATTCCTCAGAGCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTTATTATGCTCAGCTTAAAAATAATAAAGAATTCCTCAGAGCAT  238

seq1  TCAGGTTGACATCTGCATGAGTTTTTAAGGGCAATGCATAACCAGCTTTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGTTGACATCTGCATGAGTTTTTAAGGGCAATGCATAACCAGCTTTA  288

seq1  TAAAACTAGAGAAATAATAAGTCAGACATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAACTAGAGAAATAATAAGTCAGACATTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  338

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAAGCAAAGGTCAAAAATA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAGAAGCAAAGGTCAAAAATA  388

seq1  TAAAATCAGAGAAAAGCTTAATCTTGAAGTTAATTGCAGTCCATTATTAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCAGAGAAAAGCTTAATCTTGAAGTTAATTGCAGTCCATTATTAC  438

seq1  TTTTACAAATAATTCATATAAAGATAAAATTTTATAATGAATCAGGAATG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTACAAATAATTCATATAAAGATAAAATTTTATAATGAATCAGGAATG  488

seq1  GGCCATAAAGTCAAGGGGAAAAGTGTTAATGTTAATGTTATAGTTCTTAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATAAAGTCAAGGGGAAAAGTGTTAATGTTAATGTTATAGTTCTTAA  538

seq1  ATGTTATGCTATGTTTTAAGTGATATGTGTCAAGACATCTGAGACTAGGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTATGCTATGTTTTAAGTGATATGTGTCAAGACATCTGAGACTAGGT  588

seq1  GGAGCAGTCAATACAAGCAAGCCACCAACTAGAACAAATGCAGACAATGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCAGTCAATACAAGCAAGCCACCAACTAGAACAAATGCAGACAATGG  638

seq1  CTGAGAACAGAGCAAAGGCATGTGGTGTTCTCATTAGACACATGTTCCCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAACAGAGCAAAGGCATGTGGTGTTCTCATTAGACACATGTTCCCA  688

seq1  GGAGGAGCTGAAGGCTGGGCACGATGCTAGCAAGGCTCACCTGTGATGCT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGCTGAAGGCTGGGCACGATGCTAGCAAGGCTCACCTGTGATGCT  738

seq1  AGGTGACCCACATACAGAAGACATGCTCCAGGTGCACAGCTGTGACAAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGACCCACATACAGAAGACATGCTCCAGGTGCACAGCTGTGACAAGG  788

seq1  CCCATGCATTTCTACAGGGCTCACAATTTTTCTACTTGTTTTTTTTTTTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGCATTTCTACAGGGCTCACAATTTTTCTACTTGTTTTTTTTTTTT  838

seq1  TTCTTTTTTCTCAAAGCCAGTTAGAAACATCCAAAAGGCAAGGCCCTTTT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTTTCTCAAAGCCAGTTAGAAACATCCAAAAGGCAAGGCCCTTTT  888

seq1  CTCGTGCTTTCTATCTTTGGTAGTTCCCTCTGTCCCATCTAACAGAATTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGTGCTTTCTATCTTTGGTAGTTCCCTCTGTCCCATCTAACAGAATTC  938