BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-040O08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,225,686 - 67,414,705
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039618, Zfp365
Upstream geneReep3, Jmjd1c, Nrbf2, Egr2, Gm237, LOC100040081
Downstream genePlekhk1, Arid5b, LOC100040136, 1700040L02Rik, EG665342, Tmem26
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-040O08.bB6Ng01-040O08.g
ACCDH867723DH867724
length971937
definitionDH867723|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-040O08, 5' end.DH867724|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-040O08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,413,734 - 67,414,705)(67,225,686 - 67,226,627)
sequence
gaattcttgtgtctacaaaactcagaacttgaacttgagaggaaagttaa
tatttgttaggtaaacactgggagttttttcttcggaggcttagtgtttt
ttagttcatttttcatcagagtcaagaaattacactgtggagagaaacca
cttagcacatttcagcttattcttctaggagttaaattggaagagaataa
aatgaacttaaaaaaacatttgaaaccactttgatgtagtcttctgcgaa
gggtctgctcatttcaaagcttgacatggagcatataagaaagcatcaat
tcagaaatattagctgggacacactaatttgaaaatatttgttgtgatgg
aaatgagagaaatggtatgccctgtttgtttgagtgattggaaaactcac
ctggaggaataaatgagctttttctgggatctgacatagaagactaggag
cggccacacacagctcatttaaagtggggttgttgcgataccttttacta
tgaaaatttgaaccctttgtagatgaacccaagccgtagttttggaaaat
acagcattcttcattccattaaactaactgggtattccgtagcgctgtcc
gtacaataggaaactcagaagggcaaggaaagaaaacatggcagcttact
gcataatgcaaggagcagagctccttggtttactactctgcacaaaaagg
ggcctccctctgctctgaattccataacagtgagggaattaagagctgac
attgcactgaggcggtggctcagtggataaaatactttgccttgtaagca
tagatctccaagttcaatcctcagcaacattttgtaatccttagcagtgg
ggagactgagacagggaagatctttaggctcactggctggccagcttaac
ctattagtgagttctgagccagtgagaggcctggacagtcttatggatag
agtttgactctgcttccacgt
gaattccaggtgtgaacaccaggtgtgaatccctgaaagcagagatgatc
atcttacaatctgcccattgaacttgtaggcagcattccagcagaaatgc
tctagaggggctttggctcaatggccactggaacagagagagtctcttca
gtagctcagagagattaagtgagttccaggacagccagagctacacagag
aaaccctgtcttgaaaaaccaaaaataaaaaaaattgtacttggaagatg
ggtaaagcttgcttttggttctgaggaagagagtgggtacagagtgtcat
agagcatgtaggtctgctccataggacatgctggcataaccttcattttg
acgatagttatggtgcatcttgctagctaatgaaagacttgaaggtactc
tgaggggcccaaagcaagtcattgagtccttaaaacacatgcatgggttt
gtctaacgcattgagctcatcctatccctctcctttgctccaagttcctc
ttctaccacatgcctaccattctagccaaaaggaagctttactcacagca
ttctaaagccagtacatttctatagctccttctgtctggggacaccctcc
aaccaaccttcggatatttccttttcccgattcctttctatctttaggag
ttccacctatgtgcaaagctgcagagcctttctctgcccttctgcggtga
ataaaagggccttctctcaatgatcatctggctctatgaatcattttata
aagttggctgtttgcttgtctatgtcaacttcttcaacctttgtggtggt
ttgacaaaactgccctcactgcccataggctcatatgttgatcctcaggt
ggtgaaactgtttgggaggattaagagtgtggcccttgtagaagaatgtg
gtcctgttgaaacaggtgtggcctgttgggggaagtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67413734_67414705
seq2: B6Ng01-040O08.b_44_1014 (reverse)

seq1  ACGTGGAAGCCAGATGTCAAACTCTATTCCATAAGAACTGTCCAGACCTC  50
      ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||
seq2  ACGTGGAAG-CAGA-GTCAAACTCTA-TCCATAAG-ACTGTCCAGGCCTC  46

seq1  TCACTGGCTCAGAACTCACTAAGTAGGCTAAGCTGGCCAGCCAGTGAGCC  100
      |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
seq2  TCACTGGCTCAGAACTCACTAA-TAGGTTAAGCTGGCCAGCCAGTGAG-C  94

seq1  CTAAAGATCTT-CCTGTCTCAGTCTCCCCACTGCT-AGGATTAC-AAATG  147
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||
seq2  CTAAAGATCTTCCCTGTCTCAGTCTCCCCACTGCTAAGGATTACAAAATG  144

seq1  TTGCTGAGGATTGAACTTGGAGATCTATGCTTACAAGGC-AAGTATTTTA  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTGCTGAGGATTGAACTTGGAGATCTATGCTTACAAGGCAAAGTATTTTA  194

seq1  TCCACTGAGCCACCGCCTCAGTGCAATGTCAGCTCTTAATTCCCTCACTG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTGAGCCACCGCCTCAGTGCAATGTCAGCTCTTAATTCCCTCACTG  244

seq1  TTATGGAATTCAGAGCAGAGGGAGGCCCC-TTTTGTGCAGAGTAGTAAAC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGAATTCAGAGCAGAGGGAGGCCCCTTTTTGTGCAGAGTAGTAAAC  294

seq1  CAAGGAGCTCTGCTCCTTGCATTATGCAGTAAGCTGCCATGTTTTCTTTC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGGAGCTCTGCTCCTTGCATTATGCAGTAAGCTGCCATGTTTTCTTTC  344

seq1  CTTGCCCTTCTGAGTTTCCTATTGTACGGACAGCGCTACGGAATACCCAG  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCCCTTCTGAGTTTCCTATTGTACGGACAGCGCTACGGAATACCCAG  394

seq1  TTAGTTTAATGGAATGAAGAATGCTGTATTTTCCAAAACTACGGCTTGGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTAATGGAATGAAGAATGCTGTATTTTCCAAAACTACGGCTTGGG  444

seq1  TTCATCTACAAAGGGTTCAAATTTTCATAGTAAAAGGTATCGCAACAACC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTACAAAGGGTTCAAATTTTCATAGTAAAAGGTATCGCAACAACC  494

seq1  CCACTTTAAATGAGCTGTGTGTGGCCGCTCCTAGTCTTCTATGTCAGATC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTAAATGAGCTGTGTGTGGCCGCTCCTAGTCTTCTATGTCAGATC  544

seq1  CCAGAAAAAGCTCATTTATTCCTCCAGGTGAGTTTTCCAATCACTCAAAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAAAGCTCATTTATTCCTCCAGGTGAGTTTTCCAATCACTCAAAC  594

seq1  AAACAGGGCATACCATTTCTCTCATTTCCATCACAACAAATATTTTCAAA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGGCATACCATTTCTCTCATTTCCATCACAACAAATATTTTCAAA  644

seq1  TTAGTGTGTCCCAGCTAATATTTCTGAATTGATGCTTTCTTATATGCTCC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGTGTCCCAGCTAATATTTCTGAATTGATGCTTTCTTATATGCTCC  694

seq1  ATGTCAAGCTTTGAAATGAGCAGACCCTTCGCAGAAGACTACATCAAAGT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCAAGCTTTGAAATGAGCAGACCCTTCGCAGAAGACTACATCAAAGT  744

seq1  GGTTTCAAATGTTTTTTTAAGTTCATTTTATTCTCTTCCAATTTAACTCC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTCAAATGTTTTTTTAAGTTCATTTTATTCTCTTCCAATTTAACTCC  794

seq1  TAGAAGAATAAGCTGAAATGTGCTAAGTGGTTTCTCTCCACAGTGTAATT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGAATAAGCTGAAATGTGCTAAGTGGTTTCTCTCCACAGTGTAATT  844

seq1  TCTTGACTCTGATGAAAAATGAACTAAAAAACACTAAGCCTCCGAAGAAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACTCTGATGAAAAATGAACTAAAAAACACTAAGCCTCCGAAGAAA  894

seq1  AATCTCCCAGTGTTTACCTAACAAATATTAACTTTCCTCTCAAGTTCAAG  945
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCCCAGTGTTTACCTAACAAATATTAACTTTCCTCTCAAGTTCAAG  944

seq1  TTCTGAGTTTTGTAGACACAAGAATTC  972
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGTTTTGTAGACACAAGAATTC  971

seq1: chr10_67225686_67226627
seq2: B6Ng01-040O08.g_70_1006

seq1  GAATTCCAGGTGTGAACACCAGGTGTGAATCCCTGAAAGCAGAGATGATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGTGTGAACACCAGGTGTGAATCCCTGAAAGCAGAGATGATC  50

seq1  ATCTTACAATCTGCCCATTGAACTTGTAGGCAGCATTCCAGCAGAAATGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTTACAATCTGCCCATTGAACTTGTAGGCAGCATTCCAGCAGAAATGC  100

seq1  TCTAGAGGGGCTTTGGCTCAATGGCCACTGGAACAGAGAGAGTCTCTTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGGGGCTTTGGCTCAATGGCCACTGGAACAGAGAGAGTCTCTTCA  150

seq1  GTAGCTCAGAGAGATTAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTCAGAGAGATTAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGAGCTACACAGAG  200

seq1  AAACCCTGTCTTGAAAAACCAAAAATAAAAAAAATTGTACTTGGAAGATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTGTCTTGAAAAACCAAAAATAAAAAAAATTGTACTTGGAAGATG  250

seq1  GGTAAAGCTTGCTTTTGGTTCTGAGGAAGAGAGTGGGTACAGAGTGTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAAGCTTGCTTTTGGTTCTGAGGAAGAGAGTGGGTACAGAGTGTCAT  300

seq1  AGAGCATGTAGGTCTGCTCCATAGGACATGCTGGCATAACCTTCATTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCATGTAGGTCTGCTCCATAGGACATGCTGGCATAACCTTCATTTTG  350

seq1  ACGATAGTTATGGTGCATCTTGCTAGCTAATGAAAGACTTGAAGGTACTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATAGTTATGGTGCATCTTGCTAGCTAATGAAAGACTTGAAGGTACTC  400

seq1  TGAGGGGCCCAAAGCAAGTCATTGAGTCCTTAAAACACATGCATGGGTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGGCCCAAAGCAAGTCATTGAGTCCTTAAAACACATGCATGGGTTT  450

seq1  GTCTAACGCATTGAGCTCATCCTATCCCTCTCCTTTGCTCCAAGTTCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAACGCATTGAGCTCATCCTATCCCTCTCCTTTGCTCCAAGTTCCTC  500

seq1  TTCTACCACATGCCTACCATTCTAGCCAAAAGGAAGCTTTACTCACAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACCACATGCCTACCATTCTAGCCAAAAGGAAGCTTTACTCACAGCA  550

seq1  TTCTAAAGCCAGTACATTTCTATAGCTCCTTCTGTCTGGGGACACCCTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAAGCCAGTACATTTCTATAGCTCCTTCTGTCTGGGGACACCCTCC  600

seq1  AACCAACCTTCGGATATTTCCTTTTCCCGATTCCTTTCTATCTTTAGGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACCTTCGGATATTTCCTTTTCCCGATTCCTTTCTATCTTTAGGAG  650

seq1  TTCCACCTATGTGCAAAGCTGCAGAGCCTTTCTCTGCCCTTCTGCGGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCACCTATGTGCAAAGCTGCAGAGCCTTTCTCTGCCCTTCTGCGGTGA  700

seq1  ATAAAAGGGCCTTCTCTCAATGATCATCTGGCTCTATGAATCATTTTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGGGCCTTCTCTCAATGATCATCTGGCTCTATGAATCATTTTATA  750

seq1  AAGTTGGCTGTTTGCTTGTCTATGTCAACTTCTTCAACCTTTGTGGTGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGGCTGTTTGCTTGTCTATGTCAACTTCTTCAACCTTTGTGGTGGT  800

seq1  TTGAACAAAACTGCCCTCACTGCCCATAGGCTCATATGTTGATCCTCAGG  850
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTG-ACAAAACTGCCCTCACTGCCCATAGGCTCATATGTTGATCCTCAGG  849

seq1  TGGTGAAACTGTTTGGGAAGGATTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGAAGAAG  900
      ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |  | |||||| 
seq2  TGGTGAAACTGTTTGGG-AGGATTAAGA-GTGTGGCCCTTGTAGAAGAA-  896

seq1  TGTGGTCCTGTTGAAACAGGTGTGGCCCTGTTGGGGGAGGTG  942
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  TGTGGTCCTGTTGAAACAGGTGTGG-CCTGTTGGGGGAAGTG  937