BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-044G22
Chromosome10 (Build37)
Map Location 14,945,679 - 15,063,709
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGpr126, LOC100039571, LOC100039409, Vta1, D230044M03Rik, EG666904, Nmbr, LOC666917
Downstream geneLOC637043, LOC100039492, LOC671439
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-044G22.bB6Ng01-044G22.g
ACCDH870187DH870188
length1,1401,168
definitionDH870187|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044G22, 5' end.DH870188|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-044G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,062,574 - 15,063,709)(14,945,679 - 14,946,866)
sequence
gaattcaaaattgtactcattgggtaatattttttcaatatcatccattt
tattttcaagtaaactttatccatgagttgaaaaaactaaattcatatgg
gtcatgctgttctttgtaagactttttctcttagtaatcctttataagat
ttactatttggttatctgtagtgctgttttaacagcttacagatgatgat
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ttagtttaaagatcaaactgatgttataacctgatttaggacataaatta
tgtgtttataataatatcttttgaaatcatctaaaatcaccatgtacaca
aaatttgacttataagattgattcatgatactatgatctttgcaattatt
atcttaagagcacgtgttctcttttgttctagattgcctctttaacattg
tgttatctggcgagaaggaatatttgcacagactcactcacaattcagaa
tgaagtgctttcttactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_15062574_15063709
seq2: B6Ng01-044G22.b_45_1184 (reverse)

seq1  TGGCAAG------------GTAGCCCGGGGCTCGAGTCTCGAGTCGAGCG  38
      |||||||            |||||||  |||||| |||||||||||||||
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      |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||
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      || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
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      || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGCGTTTGATCTGTCCTCTAACAAACGGGGTTTTCCATTTATTCTAC  291

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATAATACGTTTTGTTCAGAGGCAAACTACATATCAACTTTATGTTA  341

seq1  TAATTTTTAAGAAATTTATTCTTTCCATTAGATACTTGGTTAAATATTTT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTAAGAAATTTATTCTTTCCATTAGATACTTGGTTAAATATTTT  391

seq1  TATAATCTATAAAATTTATTCATGTTAATCCTAAACAGAAATAGTTCAAA  437
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAGGCTGGACCTAGGCCCCTGGCACATATATAACAGATGTGCAGCT  541

seq1  TGGTCTTCATATCAGTTCCACTAAACTGGAGCAGGAGTTGTCCCTAAACC  587
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTTCATATCAGTTCCACTAAACTGGAGCAGGAGTTGTCCCTAAACC  591

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTTGCCTACCTGCAGAACCTGTTCCCCTAACTGGGGAATCCTGTC  641

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTCAGTGGAAGAGGATTCACCTAGTACTGGAGTGATCCGATGTGCT  691

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGAGGTGGGGAGAGGAGTGTGGTGTGGGAACGGATTAGGAGAAAAGAA  741

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGAAAAATCTATGCCAGAGGGTATTGAGAGAAGAGGGGAACTGATA  791

seq1  TTGGGATGTAAAGTGAATAAATAAAAACATAAATTAAAAATGGGCATATT  837
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGATGTAAAGTGAATAAATAAAAACATAAATTAAAAATGGGCATATT  841

seq1  ATATGAAAAATCTATTTTCAAAAACAAAAAATAAAAATAATAAAAAATGT  887
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAAAATCTATTTTCAAAAACAAAAAATAAAAATAATAAAAAATGT  891

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTATGGAATATTGATATTAGGAATTTTATATTAACTCTTCATAAA  941

seq1  TCATCATCTGTAAGCTGTTAAAACAGCACTACAGATAACCAAATAGTAAA  987
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATCTGTAAGCTGTTAAAACAGCACTACAGATAACCAAATAGTAAA  991

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTATAAAGGATTACTAAGAGAAAAAGTCTTACAAAGAACAGCATGACC  1041

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATGATATTGAAAAAATATTACCCAATGAGTACAATTTTGAATTC  1140

seq1: chr10_14945679_14946866
seq2: B6Ng01-044G22.g_66_1233

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCAAATCATGAATGACTAAATTGCTGGTAAGTCACACTGATACACT  150

seq1  GTTTAATATGAAATGACAAGAGATGATGGAATTCTTCCTTATTGGAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTGTAAAGACATTTAAATATGTAATAATATTTACACATATATTTAA  350

seq1  ATATTATATATAAATAATAAACATATATGTATTTATATGATAGCGTTTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTATATATAAATAATAAACATATATGTATTTATATGATAGCGTTTCA  400

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTAAATATCCATACATTCAAACTGTATTATATATTATGCGTGTCA  450

seq1  TTCTAACATTTGTATGTTAGAATTTTAATAGGATATGGTATATCAGAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACATTTGTATGTTAGAATTTTAATAGGATATGGTATATCAGAAAG  500

seq1  CATAATAAGATACAATTATAGAAATTGTTTTAGTACGGTATTAATAGGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATAAGATACAATTATAGAAATTGTTTTAGTACGGTATTAATAGGCT  550

seq1  TCTTCCTAAACTTTGGTATATTAATCAACTCTGCCTAAAACGTGTGTTAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTAAACTTTGGTATATTAATCAACTCTGCCTAAAACGTGTGTTAT  600

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATTCTATTGATTCATACAGGATGGTTTCCTAGGTTATGGACCAATTCATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTATTGATTCATACAGGATGGTTTCCTAGGTTATGGACCAATTCATT  700

seq1  AGACCTAATTATTGTATTAAAATGACTGGGAGCAGTAGCTGTAAAGTAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||
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seq1  GTGGCTTAGTTTAAAAGATCAAACTGATGTTATAACCTGATTTTAGGACA  950
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
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seq1  ATTAAAATATGTGTTTATAATAATATTCTTTTGGAAAATCATCTAAAATC  1000
        |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||
seq2  --TAAATTATGTGTTTATAATAATA-TCTTTTG--AAATCATCTAAAATC  988

seq1  AACCATGTACACAAAATTTGACTTATAAGATTTGATTCATGATACTATGA  1050
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -ACCATGTACACAAAATTTGACTTATAAGA-TTGATTCATGATACTATGA  1036

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      ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||
seq2  TCTTTGCAA-TTATTATCTTAAGAGCACGTGTTCTCTTTTGTTCTAGATT  1085

seq1  GCTCTTTTAACAATTGTGTTATTCTGTCAAAAGAAGTAATA-TTGCACTA  1147
      ||   |||||| ||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| |
seq2  GCCTCTTTAAC-ATTGTGTTA-TCTGGC--GAGAAGGAATATTTGCAC-A  1130

seq1  GACTTCATCATCAATTCTAAAATATGAGTGCTTTCTTACTT  1188
      ||||   ||| ||||||  ||  |  |||||||||||||||
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