BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-049K08
Chromosome10 (Build37)
Map Location 123,468,533 - 123,509,886
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMon2, Usp15, LOC100042958, AI851790
Downstream gene4930503E24Rik, LOC671416
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-049K08.bB6Ng01-049K08.g
ACCDH873849DH873850
length670939
definitionDH873849|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049K08, 5' end.DH873850|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049K08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,468,533 - 123,469,199)(123,508,930 - 123,509,886)
sequence
gaattctgtaataatctcaaaactttaaagaatgaaaataacattacttt
cctgaaggtatatttagggatgggtatgctttgtagttttaatcccataa
agtgaatgctgtaaaaggctcattcggtttatgtttgagttgtgtggtgg
ttgatcttgacttttgaaagatatccagtcaattagcaaaacatatgttt
ggtttgaatgtgaggcctttccagagttgattaatgatgaggatgttgac
ctaaccaacattaatctatggttggcttcaaaatttgaatttactactga
gaagtaatgggaacagacatttatagggaagaaagataattggcgcttga
ccataaaggcatgtcttaccctggtccctttcctactatactctgttttt
tgtttatcatggattgaacaaatctgcttgctcacctatgctctcccaga
catgaggggcaaaatcctccaatactgtgaactaaatgtatctttttcca
tgaacttttcccctggtattgtgtaacagtcacaagaaaggcccaactaa
gccaggtggtggtggcacatgcctttaatcccaacaccttggggggtcag
aggcagacagatttctgagtttgaggccagtctggtctacaaagtgagtt
ccaggacagccagggctaca
gaattcattccaggaaacttctatctttagatcagaggtagtaaggcata
ttgctttaaaccacaagaatatttttcacatttgctccttggaatgtatc
ctattcctctgcttttgtttttgtttttgtttttatttgttttgtttttg
cagtaggagggatataacccaatgctcatttcttttgaccaaaagtccta
aagtgcaccccattctggcttagaacatctatgatccttaaagccttcag
agccatcacttgaaacacatgattgtcaaacagcacttaacaccaggtac
agcccatgtcatggctcactactttaccaccattaacatcttttcacaga
ttgaaaatccaggtatacgagtacataatgaccaaaagtgtatagtgacc
agaggtgtacaatggtcacaggtatacagagatcacaagtatataataac
catgggtatataatggccacaggtatatattatagattggctgtcagcat
ctttatttgacaattagaaataacttaagggcaaactcacatattactcc
ttgggtctacttgcagactcttctcatctcaggtctctggggcaaccagg
gtcctgggagcctgtacttagcatttataatacataggatcagaccaaac
ctcagcagggtgtataatggtcagagttatatagtgaccacatgcatgtg
atgatcatgggtatacaatgatcacaggtttataatgaccttagatatat
aatgattacaggtataaaatgatgacaggtatataatgaccacaggtaac
acaggtatataatggccataaacaagatctacatacagatatatatatat
atatatcatagatcactcagcttagtaatatagctaaaatttcatatcat
tagaagctattactcatgattactgtagcatacgtgtta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_123468533_123469199
seq2: B6Ng01-049K08.b_43_712

seq1  GAATTCTGTAATAATCTCAAAACTTTAAAGAATGAAAATAACATTACTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTAATAATCTCAAAACTTTAAAGAATGAAAATAACATTACTTT  50

seq1  CCTGAAGGTATATTTAGGGATGGGTATGCTTTGTAGTTTTAATCCCATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAGGTATATTTAGGGATGGGTATGCTTTGTAGTTTTAATCCCATAA  100

seq1  AGTGAATGCTGTAAAAGGCTCATTCGGTTTATGTTTGAGTTGTGTGGTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATGCTGTAAAAGGCTCATTCGGTTTATGTTTGAGTTGTGTGGTGG  150

seq1  TTGATCTTGACTTTTGAAAGATATCCAGTCAATTAGCAAAACATATGTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCTTGACTTTTGAAAGATATCCAGTCAATTAGCAAAACATATGTTT  200

seq1  GGTTTGAATGTGAGGCCTTTCCAGAGTTGATTAATGATGAGGATGTTGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGAATGTGAGGCCTTTCCAGAGTTGATTAATGATGAGGATGTTGAC  250

seq1  CTAACCAACATTAATCTATGGTTGGCTTCAAAATTTGAATTTACTACTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCAACATTAATCTATGGTTGGCTTCAAAATTTGAATTTACTACTGA  300

seq1  GAAGTAATGGGAACAGACATTTATAGGGAAGAAAGATAATTGGCGCTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAATGGGAACAGACATTTATAGGGAAGAAAGATAATTGGCGCTTGA  350

seq1  CCATAAAGGCATGTCTTACCCTGGTCCCTTTCCTACTATACTCTGTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAAGGCATGTCTTACCCTGGTCCCTTTCCTACTATACTCTGTTTTT  400

seq1  TGTTTATCATGGATTGAACAAATCTGCTTGCTCACCTATGCTCTCCCAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTATCATGGATTGAACAAATCTGCTTGCTCACCTATGCTCTCCCAGA  450

seq1  CATGAGGGGCAAAATCCTCCAATACTGTGAACTAAATGTATCTTTTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGGGGCAAAATCCTCCAATACTGTGAACTAAATGTATCTTTTTCCA  500

seq1  TGAACTTTTCCCCTGGTATTGTGTAACAGTCACAAG-AAGGCCCAACTAA  549
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGAACTTTTCCCCTGGTATTGTGTAACAGTCACAAGAAAGGCCCAACTAA  550

seq1  GCCAGGTGGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAACAC--TTGGGGGTCAG  597
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||
seq2  GCCAGGTGGTGGTGGCACATGCCTTTAATCCCAACACCTTGGGGGGTCAG  600

seq1  AGGCAGACAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGACAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTT  650

seq1  CCAGGACAGCCAGGGCTACA  667
      ||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGACAGCCAGGGCTACA  670

seq1: chr10_123508930_123509886
seq2: B6Ng01-049K08.g_68_1006 (reverse)

seq1  TAACACGTATGGCTTACAGTTAAATCATGAGTTAAATTAGCTTTCTAAAT  50
      |||||||||||   ||||||  ||||||||||   | |||| |||| |||
seq2  TAACACGTATG--CTACAGT--AATCATGAGT---AATAGC-TTCT-AAT  41

seq1  GATAATTGAAATTTTTAGGCTAATATTAACTAAAGCTGAAGTGATCTATG  100
      ||||  |||||||||   ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||
seq2  GATA--TGAAATTTT--AGCT-ATATT-ACT-AAGCTG-AGTGATCTATG  83

seq1  ATATATATATATATATATCTTGTATGTAAGATCTTGTTTATTGCCATTAT  150
      ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  ATATATATATATATATATC-TGTATGT-AGATCTTGTTTATGGCCATTAT  131

seq1  ATACCTGTGGTTACCTGTGGTCATTATATACCTGTCATCATTTTATACCT  200
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCTGT-GTTACCTGTGGTCATTATATACCTGTCATCATTTTATACCT  180

seq1  GTAATCATTATATATCTAAGGTCATTATAAACCTGTGATCATTGTATACC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCATTATATATCTAAGGTCATTATAAACCTGTGATCATTGTATACC  230

seq1  CATGATCATCACATGCATGTGGTCACTATATAACTCTGACCATTATACA-  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CATGATCATCACATGCATGTGGTCACTATATAACTCTGACCATTATACAC  280

seq1  CCTGCTGAGGTTTGGTCTGATCCTATGTATTATAAATGCTAAGTACAGGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCTGAGGTTTGGTCTGATCCTATGTATTATAAATGCTAAGTACAGGC  330

seq1  TCCCAGGA-CCTGGTTGCCCCAGAGACCTGAGATGAGAAGAGTCTGCAAG  398
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGACCCTGGTTGCCCCAGAGACCTGAGATGAGAAGAGTCTGCAAG  380

seq1  TAGACCCAAGGAGTAATATGTGAGTTTGCCCTTAAGTTATTTCTAATTGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCCAAGGAGTAATATGTGAGTTTGCCCTTAAGTTATTTCTAATTGT  430

seq1  CAAATAAAGATGCTGACAGCCAATCTATAATATATACCTGTGGCCATTAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAAAGATGCTGACAGCCAATCTATAATATATACCTGTGGCCATTAT  480

seq1  ATACCCATGGTTATTATATACTTGTGATCTCTGTATACCTGTGACCATTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCATGGTTATTATATACTTGTGATCTCTGTATACCTGTGACCATTG  530

seq1  TACACCTCTGGTCACTATACACTTTTGGTCATTATGTACTCGTATACCTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACCTCTGGTCACTATACACTTTTGGTCATTATGTACTCGTATACCTG  580

seq1  GATTTTCAATCTGTGAAAAGATGTTAATGGTGGTAAAGTAGTGAGCCATG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTCAATCTGTGAAAAGATGTTAATGGTGGTAAAGTAGTGAGCCATG  630

seq1  ACATGGGCTGTACCTGGTGTTAAGTGCTGTTTGACAATCATGTGTTTCAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGCTGTACCTGGTGTTAAGTGCTGTTTGACAATCATGTGTTTCAA  680

seq1  GTGATGGCTCTGAAGGCTTTAAGGATCATAGATGTTCTAAGCCAGAATGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGGCTCTGAAGGCTTTAAGGATCATAGATGTTCTAAGCCAGAATGG  730

seq1  GGTGCACTTTAGGACTTTTGGTCAAAAGAAATGAGCATTGGGTTATATCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCACTTTAGGACTTTTGGTCAAAAGAAATGAGCATTGGGTTATATCC  780

seq1  CTCCTACTGCAAAAACAAAACAAATAAAAACAAAAACAAAAACAAAAGCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTACTGCAAAAACAAAACAAATAAAAACAAAAACAAAAACAAAAGCA  830

seq1  GAGGAATAGGATACATTCCAAGGAGCAAATGTGAAAAATATTCTTGTGGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAATAGGATACATTCCAAGGAGCAAATGTGAAAAATATTCTTGTGGT  880

seq1  TTAAAGCAATATGCCTTACTACCTCTGATCTAAAGATAGAAGTTTCCTGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGCAATATGCCTTACTACCTCTGATCTAAAGATAGAAGTTTCCTGG  930

seq1  AATGAATTC  957
      |||||||||
seq2  AATGAATTC  939