BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-052G04
Chromosome10 (Build37)
Map Location 75,705,959 - 75,863,147
singlet/doubletdoublet
Overlap geneS100b, Dip2a, Pcnt
Upstream geneSpecc1l, LOC100040670, Adora2a, EG544707, Upb1, 1110038D17Rik, Snrpd3, AI646023, Ggt1, Ggtla1, Susd2, Cabin1, Ddt, Gstt3, Gstt1, Gstt4, Gstt2, Mif, Derl3, Smarcb1, Mmp11, Ndg2, Gm867, Vpreb3, EG333669, Suhw2, Slc5a4b, Slc5a4a, LOC100040150, Prmt2
Downstream gene2610028H24Rik, A130042E20Rik, Mcm3ap, Lss, 1700027D21Rik, Ftcd, Col6a2, Col6a1, Pcbp3, LOC100041099, Slc19a1, Col18a1, LOC665762, Pofut2, Adarb1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-052G04.bB6Ng01-052G04.g
ACCDH875755DH875756
length1,064926
definitionDH875755|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052G04, 5' end.DH875756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-052G04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,862,073 - 75,863,147)(75,705,959 - 75,706,476)
sequence
gaattcatgttcagcacatggagatatcatccaacctgtcctggtgttgt
ctgtgtccctgtgtttttataattgccactagcccagtggacacttacag
atgctgttcagctattactaggagtttctcatactagagtcctaggcacg
cctctttggctctccttaccaggtggatctagtatgatctcagttaggtt
ctgtccagagtgtatagtctggaggtccagtgagtgtaagcatgctcagg
taagctcagatatgtgcaaacatacccacttctgcaggagacctcatgct
ggcttataacagttgattccttaaatccctgattccttgtatttgcctaa
catactcattcccccttcccccataggaaaaagagatactaaagcaagag
aacatgggtgacttactgctaacaactgtatcacggtccgggctggatga
agctgggtgtcctatgcttccccaaggcagctcttctaggggtccggaag
cccaaccagatgtaacagagagggcactcttacagcacgagaatgaggta
agcaacatgagctgggtggcactgcccaactgcagccccatgaccctggc
tgccccatgaccccgagcccttctgcataaaggctcaccatccaaaacca
ggcagcagcactgtggccagagtttataccctgtaactttgtaggtttct
gtcactaggggataataatacctagactttgaaaccttccaaagctactt
tatttaataagtattaaatatgttaaaatattagaaaaaaatgtcaacac
ttcttcatgtagatgaaaggttttggacttaaaagaacagctagagaaga
tcaaagatgacttagtagctgggtgtggcagcacatgcctttaatcccaa
gcactcgagaggcattcggatctctgagtcaagggcactctggtcaccga
gcaatttcagacagcaggctacaagaaaacaacaacaacaaaaaaccaaa
cagctatggcttctccctaccctaaggattgtccgctgatactactgatt
ccggggtggggggg
gaattctataccgagaaatgatctgtagtgtttgattgattagctggagc
taaagaatcagctaggattattaacaagagaccagaaccactccagcgaa
gccttggctttatggggacaaaaactgatgctggttagctggggtgagaa
gttagcagtgattaagagaacagcatcattaaagtgaaatctgagggtat
ttccttagggtcagcacacagaagctgtggtccagagtgggtagtgctac
atcctatgctgtggctgaacttggtattgtgtaagactcactcaggcggt
gctggtgaaggcatgaagggatcacggaaagcgtggcactgtgtggtggg
ccttgaggtcctgaagagaaaccaggagaggccaatggtaaaggtgaacc
tcaacagccatggacctcagcatattggagatagcagtacgatgggatga
cttccatggacagtggcagccgtagagtggaactagcctgagcctttgag
gtatgtgagctgtggagggaggacagggttgaggaagcagagctgcccca
ggccctttggagcacagaggatatgaatggctcccaaacaccaagcacag
agctttttatactgtaggactgtaggactctgattttgctttggcctaat
tgtgactgtgcccttgtcttagttagggctttactgctgtgagcagacac
catgaccaaagcaactcttataaggacaacatttagttggggctggctta
caggttcagaggttcagttcattatcatggcgggagcatggcagtgtcca
ggcaggcatggtgcaggagatactgagagttctacatcttcatctgaagg
ctgctagcataagactggcttccagacagctaggatgagggtcttgaagc
ccacacccacagtgacacatctactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_75862073_75863147
seq2: B6Ng01-052G04.b_44_1107 (reverse)

seq1  CCCCCCCACCCCGGGATCAGTAGTATCAGCGGACAATCCCTTAGGGTAGG  50
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCCCCCCACCCCGGAATCAGTAGTATCAGCGGACAAT-CCTTAGGGTAGG  49

seq1  GAG-AGCCATAGCTGTTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCTTTG  99
      ||| |||||||||||||||||||||||||       ||||| |||  |||
seq2  GAGAAGCCATAGCTGTTTGGTTTTTTGTT------GTTGTTGTTTTCTTG  93

seq1  TAGCCCTGGCTGTCCTGAAATTGCTCGGTGGACCAGAGTGCCCTTGAACT  149
      |||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
seq2  TAGCC--TGCTGT-CTGAAATTGCTCGGT-GACCAGAGTGCCCTTG-ACT  138

seq1  CAGAGATCCGAATGCCTCTCGAGTGCTTGGGATTAAAGGCATGTGCTGCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATCCGAATGCCTCTCGAGTGCTTGGGATTAAAGGCATGTGCTGCC  188

seq1  ACACCCAGCTACTAAGTCATCTTTGATCTTCTCTAGCTGTTCTTTTAAGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCAGCTACTAAGTCATCTTTGATCTTCTCTAGCTGTTCTTTTAAGT  238

seq1  CCAAAACCTTTCATCTACATGAAGAAGTGTTGACATTTTTTTCTAATATT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAACCTTTCATCTACATGAAGAAGTGTTGACATTTTTTTCTAATATT  288

seq1  TTAACATATTTAATACTTATTAAATAAAGTAGCTTTGGAAGGTTTCAAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACATATTTAATACTTATTAAATAAAGTAGCTTTGGAAGGTTTCAAAG  338

seq1  TCTAGGTATTATTATCCCCTAGTGACAGAAACCTACAAAGTTACAGGGTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGGTATTATTATCCCCTAGTGACAGAAACCTACAAAGTTACAGGGTA  388

seq1  TAAACTCTGGCCACAGTGCTGCTGCCTGGTTTTGGATGGTGAGCCTTTAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACTCTGGCCACAGTGCTGCTGCCTGGTTTTGGATGGTGAGCCTTTAT  438

seq1  GCAGAAGGGCTCGGGGTCATGGGGCAGCCAGGGTCATGGGGCTGCAGTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAGGGCTCGGGGTCATGGGGCAGCCAGGGTCATGGGGCTGCAGTTG  488

seq1  GGCAGTGCCACCCAGCTCATGTTGCTTACCTCATTCTCGTGCTGTAAGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGCCACCCAGCTCATGTTGCTTACCTCATTCTCGTGCTGTAAGAG  538

seq1  TGCCCTCTCTGTTACATCTGGTTGGGCTTCCGGACCCCTAGAAGAGCTGC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTCTGTTACATCTGGTTGGGCTTCCGGACCCCTAGAAGAGCTGC  588

seq1  CTTGGGGAAGCATAGGACACCCAGCTTCATCCAGCCCGGACCGTGATACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGGGAAGCATAGGACACCCAGCTTCATCCAGCCCGGACCGTGATACA  638

seq1  GTTGTTAGCAGTAAGTCACCCATGTTCTCTTGCTTTAGTATCTCTTTTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTTAGCAGTAAGTCACCCATGTTCTCTTGCTTTAGTATCTCTTTTTC  688

seq1  CTATGGGGGAAGGGGGAATGAGTATGTTAGGCAAATACAAGGAATCAGGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGGGGAAGGGGGAATGAGTATGTTAGGCAAATACAAGGAATCAGGG  738

seq1  ATTTAAGGAATCAACTGTTATAAGCCAGCATGAGGTCTCCTGCAGAAGTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGGAATCAACTGTTATAAGCCAGCATGAGGTCTCCTGCAGAAGTG  788

seq1  GGTATGTTTGCACATATCTGAGCTTACCTGAGCATGCTTACACTCACTGG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATGTTTGCACATATCTGAGCTTACCTGAGCATGCTTACACTCACTGG  838

seq1  ACCTCCAGACTATACACTCTGGACAGAACCTAACTGAGATCATACTAGAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCAGACTATACACTCTGGACAGAACCTAACTGAGATCATACTAGAT  888

seq1  CCACCTGGTAAGGAGAGCCAAAGAGGCGTGCCTAGGACTCTAGTATGAGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTGGTAAGGAGAGCCAAAGAGGCGTGCCTAGGACTCTAGTATGAGA  938

seq1  AACTCCTAGTAATAGCTGAACAGCATCTGTAAGTGTCCACTGGGCTAGTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCTAGTAATAGCTGAACAGCATCTGTAAGTGTCCACTGGGCTAGTG  988

seq1  GCAATTATAAAAACACAGGGACACAGACAACACCAGGACAGGTTGGATGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTATAAAAACACAGGGACACAGACAACACCAGGACAGGTTGGATGA  1038

seq1  TATCTCCATGTGCTGAACATGAATTC  1075
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTCCATGTGCTGAACATGAATTC  1064

seq1: chr10_75705959_75706476
seq2: B6Ng01-052G04.g_67_584

seq1  GAATTCTATACCGAGAAATGATCTGTAGTGTTTGATTGATTAGCTGGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATACCGAGAAATGATCTGTAGTGTTTGATTGATTAGCTGGAGC  50

seq1  TAAAGAATCAGCTAGGATTATTAACAAGAGACCAGAACCACTCCAGCGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAATCAGCTAGGATTATTAACAAGAGACCAGAACCACTCCAGCGAA  100

seq1  GCCTTGGCTTTATGGGGACAAAAACTGATGCTGGTTAGCTGGGGTGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGCTTTATGGGGACAAAAACTGATGCTGGTTAGCTGGGGTGAGAA  150

seq1  GTTAGCAGTGATTAAGAGAACAGCATCATTAAAGTGAAATCTGAGGGTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGCAGTGATTAAGAGAACAGCATCATTAAAGTGAAATCTGAGGGTAT  200

seq1  TTCCTTAGGGTCAGCACACAGAAGCTGTGGTCCAGAGTGGGTAGTGCTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTAGGGTCAGCACACAGAAGCTGTGGTCCAGAGTGGGTAGTGCTAC  250

seq1  ATCCTATGCTGTGGCTGAACTTGGTATTGTGTAAGACTCACTCAGGCGGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTATGCTGTGGCTGAACTTGGTATTGTGTAAGACTCACTCAGGCGGT  300

seq1  GCTGGTGAAGGCATGAAGGGATCACGGAAAGCGTGGCACTGTGTGGTGGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGAAGGCATGAAGGGATCACGGAAAGCGTGGCACTGTGTGGTGGG  350

seq1  CCTTGAGGTCCTGAAGAGAAACCAGGAGAGGCCAATGGTAAAGGTGAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGGTCCTGAAGAGAAACCAGGAGAGGCCAATGGTAAAGGTGAACC  400

seq1  TCAACAGCCATGGACCTCAGCATATTGGAGATAGCAGTACGATGGGATGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACAGCCATGGACCTCAGCATATTGGAGATAGCAGTACGATGGGATGA  450

seq1  CTTCCATGGACAGTGGCAGCCGTAGAGTGGAACTAGCCTGAGCCTTTGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATGGACAGTGGCAGCCGTAGAGTGGAACTAGCCTGAGCCTTTGAG  500

seq1  GTATGTGAGCTGTGGAGG  518
      ||||||||||||||||||
seq2  GTATGTGAGCTGTGGAGG  518