BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054K15
Chromosome10 (Build37)
Map Location 32,039,197 - 32,146,666
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTcba1
Upstream geneHddc2, Tpd52l1, LOC100041294, Ibrdc1, LOC666055, LOC667752, LOC100040638
Downstream geneEG667761, Trdn
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054K15.bB6Ng01-054K15.g
ACCDH877347DH877348
length1,1281,123
definitionDH877347|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054K15, 5' end.DH877348|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054K15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,145,521 - 32,146,666)(32,039,197 - 32,040,342)
sequence
gaattccatgaaagtattttgtacagagagatctacatctaaaatatatg
atgtacatatatgtacaggggaactcactctgtagaccaggctggactcg
aactcagaaatccgcctgcctctgcctccctagtgctgggattaaaggcg
tgtgccaccaccgcccggctgattatatgttttataattatataaatgtg
tatatatacataatttatacaagttaaaacatgcatagatataaatgtgc
caatatagagaaaattatttcttaatttatgaatgtctacagttccttta
gaaccaatgtttggttcattttttttataatttcattcaaattttttgca
attaatgtggacagctcatattttattatatttgttgttatttatcacca
ctgtgaattacattcatacttatactttagaatttttaaattgtcatgac
cttagttattcgagaatataaagatctcctcttgtgctttccaatactac
tttgtagcaaacttgcttaaagaacctcaatctgaacttctaacatatat
catcttataaaatatattaaatttcaaagtagattgaactttgacctctt
aaagttgatacagtgaaacagcctaaaattcagaagctattttattaaga
taatggaaagaattcaggcaattttctttgccttttatcaaaagactcgt
gatgattttcttagagaaaaatcatcagggcaaataattagtagattgta
gtattttatgccaaggctgcattttaattcactgatattgtgtgagttct
gaatgcttttgcaggactgtgattgcacagagaattaaatttaaatggac
cagtaactcatcagctccctctaaacaaatgggagtggagaactgacagg
agataacacctttatgacccctaacttgcttgcacagttgtttgacttgg
cagagtttgactctaggtggaatctggggcttaaatttcctttgaagtga
atgtgaagagttagtgaggaaaggaacaaatccagacactggaaatcagc
caacaataccacaccattccttctgagataaatgtttaactcttgtagac
ctgccagggataggggagggggaagaaa
gaattccagtacagccaggactacacagagaaaccatgtctcaaacaaac
aaacaaacaaacaacaacaacaacaacaaaaagaaaagtctatgagacta
aggatgcagaaacattgctattagatttcactcaacattagaactttagc
tgatgatgcctgggcaacaatatgtaattacatctaatgttttctgtgtg
tttcagaagtagctggaagctacttctgtaaagctgtcatgttttaagat
attttgtagttgtttctaggatacatatgtaatttgttattaaatgttgc
catatgaaaaagccaggtaatagtacacccaattcaatctttggggaata
aaactgttctattttttaacaggcagaaagaagttaaaacctgccacaca
ctgggtaaaatcagaaatgagtggaataccaaaaaatggaatattagaac
aattgcatatttcttttcctataatgaatgaattattcatttaaagagat
ttcaatgtttgtacatatttatgctcaataaaatcagtgcttatatcaaa
ttttttttctataaccttatggcatacttttctcctttcctttttacctg
tattacggaaattttacttagattagtgtttcttcaataactaatactca
tctttaagcaagacatgactatacacacctctaatcccagacacaagaga
gacattcagaacaagggcaatatcacggcttgcctacatttgcaatgagt
tcaagactatcctgggtaataagaacacatgctccactatgttcatagca
gccttatttataatagccagaagctggaaagaactctgatgtccctcaac
agaagaatggatacagaaaatgtggaacattacataataaggtactactc
agctattaaaacatgaatttataaaattcctaggcaaatggatagatctg
gagggtatcatcctgagtgagtacccaatcaaagaagactcacatgatat
gcactcactgatagtggatatagccagaaagttagagtacccagatacat
cgcaaacacatgaactcagaggagaagaccaagtgtgatactttgcccct
tcttagaatcgaacaaaaccatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_32145521_32146666
seq2: B6Ng01-054K15.b_48_1175 (reverse)

seq1  TTTCTCTCCCCCTCCTCTATCCCTTGCAGGTCCCTACAAGAGCTCTTAAA  50
      ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    | ||
seq2  TTTCT-TCCCCCTCCCCTATCCCTGGCAGGT--CTACAAGAG----TTAA  43

seq1  ACATTTTAATCTCAGAAGGAATTGCTGTTGTTATTGTTGTGCTGATTTTC  100
      ||||||  ||||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||
seq2  ACATTT--ATCTCAGAAGGAA-TGGTG-TGGTATTGTTG-GCTGA-TTTC  87

seq1  CAGTTGTCTGGATTTTGTTCCTTTCCTCACTAACTCTTCACATTTCACTT  150
      ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAG-TGTCTGGA-TTTGTTCCTTTCCTCACTAACTCTTCACA-TTCACTT  134

seq1  CAAAGGAAAATCTAAGCCCCAGATTCCACCCTAGAGTCAAACTCTGCCAA  200
      |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGG-AAATTTAAGCCCCAGATTCCA-CCTAGAGTCAAACTCTGCCAA  182

seq1  GTCAAACAACTGTGCAAGCAAGTTAGGGGTCATAAAGGTGTTATCTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAACAACTGTGCAAGCAAGTTAGGGGTCATAAAGGTGTTATCTCCTG  232

seq1  TCAGTTCTCCACTCCCATTTGTTTAGAGGGAGCTGATGAGTTACTGGTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTTCTCCACTCCCATTTGTTTAGAGGGAGCTGATGAGTTACTGGTCC  282

seq1  ATTTAAATTTAATTCTCTGTGCAATCACAGTCCTGCAAAAGCATTCAGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAATTTAATTCTCTGTGCAATCACAGTCCTGCAAAAGCATTCAGAA  332

seq1  CTCACACAATATCAGTGAATTAAAATGCAGCCTTGGCATAAAATACTACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACACAATATCAGTGAATTAAAATGCAGCCTTGGCATAAAATACTACA  382

seq1  ATCTACTAATTATTTGCCCTGATGATTTTTCTCTAAGAAAATCATCACGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACTAATTATTTGCCCTGATGATTTTTCTCTAAGAAAATCATCACGA  432

seq1  GTCTTTTGATAAAAGGCAAAGAAAATTGCCTGAATTCTTTCCATTATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTTGATAAAAGGCAAAGAAAATTGCCTGAATTCTTTCCATTATCTT  482

seq1  AATAAAATAGCTTCTGAATTTTAGGCTGTTTCACTGTATCAACTTTAAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATAGCTTCTGAATTTTAGGCTGTTTCACTGTATCAACTTTAAGA  532

seq1  GGTCAAAGTTCAATCTACTTTGAAATTTAATATATTTTATAAGATGATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAAAGTTCAATCTACTTTGAAATTTAATATATTTTATAAGATGATAT  582

seq1  ATGTTAGAAGTTCAGATTGAGGTTCTTTAAGCAAGTTTGCTACAAAGTAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAGAAGTTCAGATTGAGGTTCTTTAAGCAAGTTTGCTACAAAGTAG  632

seq1  TATTGGAAAGCACAAGAGGAGATCTTTATATTCTCGAATAACTAAGGTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGGAAAGCACAAGAGGAGATCTTTATATTCTCGAATAACTAAGGTCA  682

seq1  TGACAATTTAAAAATTCTAAAGTATAAGTATGAATGTAATTCACAGTGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATTTAAAAATTCTAAAGTATAAGTATGAATGTAATTCACAGTGGT  732

seq1  GATAAATAACAACAAATATAATAAAATATGAGCTGTCCACATTAATTGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATAACAACAAATATAATAAAATATGAGCTGTCCACATTAATTGCA  782

seq1  AAAAATTTGAATGAAATTATAAAAAAAATGAACCAAACATTGGTTCTAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTTGAATGAAATTATAAAAAAAATGAACCAAACATTGGTTCTAAA  832

seq1  GGAACTGTAGACATTCATAAATTAAGAAATAATTTTCTCTATATTGGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACTGTAGACATTCATAAATTAAGAAATAATTTTCTCTATATTGGCAC  882

seq1  ATTTATATCTATGCATGTTTTAACTTGTATAAATTATGTATATATACACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATATCTATGCATGTTTTAACTTGTATAAATTATGTATATATACACA  932

seq1  TTTATATAATTATAAAACATATAATCAGCCGGGCGGTGGTGGCACACGCC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATAATTATAAAACATATAATCAGCCGGGCGGTGGTGGCACACGCC  982

seq1  TTTAATCCCAGCACTAGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCCCAGCACTAGGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAG  1032

seq1  TCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCCCTGTACATATATGTACATCATA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCCTGGTCTACAGAGTGAGTTCCCCTGTACATATATGTACATCATA  1082

seq1  TATTTTAGATGTAGATCTCTCTGTACAAAATACTTTCATGGAATTC  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAGATGTAGATCTCTCTGTACAAAATACTTTCATGGAATTC  1128

seq1: chr10_32039197_32040342
seq2: B6Ng01-054K15.g_69_1191

seq1  GAATTCCAGTACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCATGTCTCAAACAAAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTACAGCCAGGACTACACAGAGAAACCATGTCTCAAACAAAC  50

seq1  AAACAAACAAACAACAACAACAACAACAAAAAGAAAAGTCTATGAGACTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAACAAACAACAACAACAACAACAAAAAGAAAAGTCTATGAGACTA  100

seq1  AGGATGCAGAAACATTGCTATTAGATTTCACTCAACATTAGAACTTTAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCAGAAACATTGCTATTAGATTTCACTCAACATTAGAACTTTAGC  150

seq1  TGATGATGCCTGGGCAACAATATGTAATTACATCTAATGTTTTCTGTGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATGCCTGGGCAACAATATGTAATTACATCTAATGTTTTCTGTGTG  200

seq1  TTTCAGAAGTAGCTGGAAGCTACTTCTGTAAAGCTGTCATGTTTTAAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAAGTAGCTGGAAGCTACTTCTGTAAAGCTGTCATGTTTTAAGAT  250

seq1  ATTTTGTAGTTGTTTCTAGGATACATATGTAATTTGTTATTAAATGTTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTAGTTGTTTCTAGGATACATATGTAATTTGTTATTAAATGTTGC  300

seq1  CATATGAAAAAGCCAGGTAATAGTACACCCAATTCAATCTTTGGGGAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGAAAAAGCCAGGTAATAGTACACCCAATTCAATCTTTGGGGAATA  350

seq1  AAACTGTTCTATTTTTTAACAGGCAGAAAGAAGTTAAAACCTGCCACACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGTTCTATTTTTTAACAGGCAGAAAGAAGTTAAAACCTGCCACACA  400

seq1  CTGGGTAAAATCAGAAATGAGTGGAATACCAAAAAATGGAATATTAGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTAAAATCAGAAATGAGTGGAATACCAAAAAATGGAATATTAGAAC  450

seq1  AATTGCATATTTCTTTTCCTATAATGAATGAATTATTCATTTAAAGAGAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCATATTTCTTTTCCTATAATGAATGAATTATTCATTTAAAGAGAT  500

seq1  TTCAATGTTTGTACATATTTATGCTCAATAAAATCAGTGCTTATATCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATGTTTGTACATATTTATGCTCAATAAAATCAGTGCTTATATCAAA  550

seq1  TTTTTTTTCTATAACCTTATGGCATACTTTTCTCCTTTCCTTTTTACCTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTCTATAACCTTATGGCATACTTTTCTCCTTTCCTTTTTACCTG  600

seq1  TATTACGGAAATTTTACTTAGATTAGTGTTTCTTCAATAACTAATACTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACGGAAATTTTACTTAGATTAGTGTTTCTTCAATAACTAATACTCA  650

seq1  TCTTTAAGCAAGACATGACTATACACACCTCTAATCCCAGACACAAGAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGCAAGACATGACTATACACACCTCTAATCCCAGACACAAGAGA  700

seq1  GACATTCAGAACAAGGGCAATATCACGGCTTGCCTACATTTGCAATGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATTCAGAACAAGGGCAATATCACGGCTTGCCTACATTTGCAATGAGT  750

seq1  TCAAGACTATCCTGGGTAATAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGACTATCCTGGGTAATAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCA  800

seq1  GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACTCTGATGTCCCTCAAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACTCTGATGTCCCTCAAC  850

seq1  AGAAGAATGGATACAGAAAATGTGGAACATTACATAATAAGGTACTACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATGGATACAGAAAATGTGGAACATTACATAATAAGGTACTACTC  900

seq1  AGCTATTAAAAACAATGAATTTATAAAATTCCTAGGCAAATGGATAGATC  950
      |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATTAAAA--CATGAATTTATAAAATTCCTAGGCAAATGGATAGATC  948

seq1  TGGAGGGTATCATCCTGAGTGAGGTAACCCAATCAAAGAAGAACTCACAT  1000
      |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGGAGGGTATCATCCTGAGTGAG--TACCCAATCAAAGAAG-ACTCACAT  995

seq1  GATATGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAAAGTTAGAGTACCC  1050
      ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  GATATGCACTCACTGAT-AGTGGATA-TAG-CCAGAAAGTTAGAGTACCC  1042

seq1  AAGATACAATTCGCAAAACACATGAAACTCAAGAAGAAGGAAGACCAAAG  1100
       |||||||  |||| ||||||||| ||||| ||| ||  ||||||| |||
seq2  -AGATACA--TCGC-AAACACATG-AACTC-AGAGGA--GAAGACC-AAG  1083

seq1  TGTGAATACTTTGCCCCTTCTTAGAATTGGGAACAAAATACCCATG  1146
      |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||   |||||
seq2  TGTG-ATACTTTGCCCCTTCTTAGAAT--CGAACAAAA---CCATG  1123