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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-054N18
Chromosome	10 (Build37)
Map Location	126,447,522 - 126,448,644
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Avil
Upstream gene	Lrig3, LOC100043547, LOC668336, Xrcc6bp1, LOC622567, Ctdsp2
Downstream gene	Tsfm, Mettl1, Cyp27b1, March9, Cdk4, Tspan31, Centg1, Os9, LOC100043028, B4galnt1, LOC100043035, C78409, D10Ertd610e, Dtx3, Pip5k2c, Kif5a, Dctn2, Mbd6, LOC100043045, Ddit3, Mars, LOC622075, Arhgap9, Gli1, Inhbe, Inhbc, R3hdm2, Stac3, Ndufa4l2, Shmt2, Nxph4, Lrp1, LOC100043054, Stat6, Nab2, BC030440, Myo1a, Tac2, Zbtb39, Admr, Rdh1, Rdh9, Rdh16, AY053573, Rdhs, BC089597, Rdh7, Sdro, LOC382468, Hsd17b6, LOC100043618
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-054N18.b	B6Ng01-054N18.g
ACC	DH877488	DH877489
length	1,262	1,113
definition	DH877488\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054N18, 5' end.	DH877489\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054N18, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctcatgtttacaaacttttattgtgcaatttaaaactattggtta aatatagtttgctatagccaattactggagggattagagttaggtgggtt ttgacttacctggttgggagtggagatgagagaagagaaaagagagagac cactaggaaagaggggaggagacgccctgagatgagatgccccatgagta catagccaggagaaacagcaaatatttggggaacaccactggggaagtag ccaggccagcagttagaaaagtagcttagctgttacctcccagtaattgt caaagccaaatagaataaccacaatctgagtctcatttatttgtaagcta aacggtgataaatttaaattggtttactgcgtgtgccacagtgcacatgt gggtcagaggacaacgtgtgggcgtctctctctcctttcactgtttgatt cctaggttgaactcaggttatcaggcatggtggttagggcctttactgat taagtgtgtctccagccctgatatcacggttttatattgtcctccacctt taggaaacaagtacttgttgaattacggtacaaagtcaaagtaggatgtc cacaattatttgaaaaggctgttaaatattacataatattaccacatagc tggaagccttcacccggctcactcaaagcggtagctcgcagcggtggcgc gggggaagcagggggcttaagagcgctctgttgttaagccacacgctaaa gagcaaagcaaagggaaatactgcgtctcttccccttgctttggaaatgc agatttaaaagaataataaaatgcgtgttgtatgcaaagagagaatgtta gttccctcttggcaaggacggagaggccatgggcctacaatgcacatgtg gttaaagtattgtgttagggctggagaggccactcagtagttaagacatg agttgtattttcagaggatcctggtttgattcctggtattcacatggtgg cttaacacccacctgtaactgcaaatttcaggacctccttatccctggtt ctgacttctgaagggagtcaggtttgtacatggcaatatgtcgggacaaa atctcttatcacattaaatggatgaatgaatgagtgaatctaaacatctc tcccttactttgaaactgaccataggattatcgcttaagaaaaacaactg gaaattacggtatgtgaagcaaagactttctgacttgaggacccgccaag agtcatagagag	gaattccctgaacaggatacccctctctgaggaattgtgtctcctcttgt gtccaggtctggagaattgagaacctggagctggtccccgtggaatacca gtggcatggcttcttctacgggggagactgctatctggttctctacacgt acgatgtgaacgggaaaccccattacatcttgtacatctggcaggtaggt caggcgcaagctctcagcgcggtattgaatccaggggcctccctgggaaa ccccattacatcttgtacatctggcaggtaggtcaggcgcaagctctcag cgcggtattgaatccaggggcctccctgggaaaccccattacatcttgta catctggcaggtaggacaggcaaaagctccgtgtggtgttggatccaggg gcctccctaggctcactcctttctcaccaccgcagggccgccacgcatcc cgggatgagctggcagcctcagcctatcgggcagtggaggtggatcagca gtttgatggagcccctgtgcaggtccgggttagcatggggaaggagccac gccacttcatggccatcttcaaaggaaagctggttatctacgaggtgagg acctacagacaacttcatcttgtgcaaggatgctcggagctgaggagcta ataaagagctaccagacaggctggtggcaggatgaggtggcctgtgtggc gggatgaacaaggcttagcttagacgttagggcaacggaggcgcttggtc tgcgacatccagggaaatctcaagccactatctagttagtgcactgtctt tcccattctgtgccacatgatctgcacagcagtagctattaccaagcctg cacccatccaacactgctctgctctcctcagtcactgccctgtgtgcccc tctcctagtctaacgctgcttcttccacagagccctgatggagcctgggc agcaattcagaacactcaagtattagggggtctctcaagtctgattgtca agtccttcctctgcccgtgtaagcattaccaacctcacttctcctcctgg tgcacagtgaataatacctgctccgcgaattactcaaggtcagtagggag gaaatctggtcct
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GCCTCCCTAGGCTCACTCCTTTCTCACCACCGCAGGGCCGCCACGCATCC 450 seq1 CGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGGAGGTGGATCAGCA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGGAGGTGGATCAGCA 500 seq1 GTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCAC 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCAC 550 seq1 GCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGTGAGG 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGTGAGG 600 seq1 ACCTACAGACAACTTCATCTTGTGCAAGGATGCTCGGAGCTGAGGAGCTA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCTACAGACAACTTCATCTTGTGCAAGGATGCTCGGAGCTGAGGAGCTA 650 seq1 ATAAAGAGCTACCAGACAGGCTGGTGGCAGGATGAGGTGGCCTGTGTGGC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAAAGAGCTACCAGACAGGCTGGTGGCAGGATGAGGTGGCCTGTGTGGC 700 seq1 GGGATGAACAAGGCTTAGCTTAGACGTTAGGGCAACGGAGGCGCTTGGTC 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGGATGAACAAGGCTTAGCTTAGACGTTAGGGCAACGGAGGCGCTTGGTC 750 seq1 TGCGACATCCAGGGAAATCTCAAGCCACTATCTAGTTAGTGCACTGTCTT 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCGACATCCAGGGAAATCTCAAGCCACTATCTAGTTAGTGCACTGTCTT 800 seq1 TCCCATTCTGTGCCACATGATCTGCACAGCAGTAGCTATTACCAAGCCTG 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCCATTCTGTGCCACATGATCTGCACAGCAGTAGCTATTACCAAGCCTG 850 seq1 CACCCATCCAACACTGCTCTGCTCTCCTCAGTCACTGCCCTGGTGTGCCC 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CACCCATCCAACACTGCTCTGCTCTCCTCAGTCACTGCCCT-GTGTGCCC 899 seq1 CTCTCCTAGTCTAAGGCCTGCTTCTTCCACAGAGCCCTGATGGAAGCCTG 950 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| seq2 CTCTCCTAGTCTAACG-CTGCTTCTTCCACAGAGCCCTGATGG-AGCCTG 947 seq1 GGCAGGCAATTCAG-ACACTCAGGTATAGGGGGGTCTCTCAAGTCTGA-T 998 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| seq2 GGCA-GCAATTCAGAACACTCAAGTATTAGGGGGTCTCTCAAGTCTGATT 996 seq1 GTCAGGTCCTTCTCTTGCCCCGTGTAAGCCAATTTCCCAACCTCAC-TCT 1047 \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\| seq2 GTCAAGTCCTTC-CTCTGCCCGTGTAAGC---ATTACCAACCTCACTTCT 1042 seq1 CCTCCT-GTGCACAGTGGAATAATACCTGCTCCGCAGAATTACTCGAGGT 1096 \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| seq2 CCTCCTGGTGCACAGT-GAATAATACCTGCTCCGC-GAATTACTCAAGGT 1090 seq1 CAGTTAGTGGAGGAAAATCGTGGTCCT 1123 \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 CAG-TAG-GGAGG-AAATC-TGGTCCT 1113

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr10_126447522_126448644
seq2: B6Ng01-054N18.g_68_1180

seq1  GAATTCCCTGAACAGGATACCCCTCTCTGAGGAATTGTGTCTCCTCTTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTGAACAGGATACCCCTCTCTGAGGAATTGTGTCTCCTCTTGT  50

seq1  GTCCAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCCGTGGAATACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAGGTCTGGAGAATTGAGAACCTGGAGCTGGTCCCCGTGGAATACCA  100

seq1  GTGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCATGGCTTCTTCTACGGGGGAGACTGCTATCTGGTTCTCTACACGT  150

seq1  ACGATGTGAACGGGAAACCCCATTACATCTTGTACATCTGGCAGGTAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATGTGAACGGGAAACCCCATTACATCTTGTACATCTGGCAGGTAGGT  200

seq1  CAGGCGCAAGCTCTCAGCGCGGTATTGAATCCAGGGGCCTCCCTGGGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCGCAAGCTCTCAGCGCGGTATTGAATCCAGGGGCCTCCCTGGGAAA  250

seq1  CCCCATTACATCTTGTACATCTGGCAGGTAGGTCAGGCGCAAGCTCTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATTACATCTTGTACATCTGGCAGGTAGGTCAGGCGCAAGCTCTCAG  300

seq1  CGCGGTATTGAATCCAGGGGCCTCCCTGGGAAACCCCATTACATCTTGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGGTATTGAATCCAGGGGCCTCCCTGGGAAACCCCATTACATCTTGTA  350

seq1  CATCTGGCAGGTAGGACAGGCAAAAGCTCCGTGTGGTGTTGGATCCAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGGCAGGTAGGACAGGCAAAAGCTCCGTGTGGTGTTGGATCCAGGG  400

seq1  GCCTCCCTAGGCTCACTCCTTTCTCACCACCGCAGGGCCGCCACGCATCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCCTAGGCTCACTCCTTTCTCACCACCGCAGGGCCGCCACGCATCC  450

seq1  CGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGGAGGTGGATCAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGATGAGCTGGCAGCCTCAGCCTATCGGGCAGTGGAGGTGGATCAGCA  500

seq1  GTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGATGGAGCCCCTGTGCAGGTCCGGGTTAGCATGGGGAAGGAGCCAC  550

seq1  GCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGTGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACTTCATGGCCATCTTCAAAGGAAAGCTGGTTATCTACGAGGTGAGG  600

seq1  ACCTACAGACAACTTCATCTTGTGCAAGGATGCTCGGAGCTGAGGAGCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTACAGACAACTTCATCTTGTGCAAGGATGCTCGGAGCTGAGGAGCTA  650

seq1  ATAAAGAGCTACCAGACAGGCTGGTGGCAGGATGAGGTGGCCTGTGTGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAGCTACCAGACAGGCTGGTGGCAGGATGAGGTGGCCTGTGTGGC  700

seq1  GGGATGAACAAGGCTTAGCTTAGACGTTAGGGCAACGGAGGCGCTTGGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGAACAAGGCTTAGCTTAGACGTTAGGGCAACGGAGGCGCTTGGTC  750

seq1  TGCGACATCCAGGGAAATCTCAAGCCACTATCTAGTTAGTGCACTGTCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGACATCCAGGGAAATCTCAAGCCACTATCTAGTTAGTGCACTGTCTT  800

seq1  TCCCATTCTGTGCCACATGATCTGCACAGCAGTAGCTATTACCAAGCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTCTGTGCCACATGATCTGCACAGCAGTAGCTATTACCAAGCCTG  850

seq1  CACCCATCCAACACTGCTCTGCTCTCCTCAGTCACTGCCCTGGTGTGCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CACCCATCCAACACTGCTCTGCTCTCCTCAGTCACTGCCCT-GTGTGCCC  899

seq1  CTCTCCTAGTCTAAGGCCTGCTTCTTCCACAGAGCCCTGATGGAAGCCTG  950
      |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CTCTCCTAGTCTAACG-CTGCTTCTTCCACAGAGCCCTGATGG-AGCCTG  947

seq1  GGCAGGCAATTCAG-ACACTCAGGTATAGGGGGGTCTCTCAAGTCTGA-T  998
      |||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |
seq2  GGCA-GCAATTCAGAACACTCAAGTATTAGGGGGTCTCTCAAGTCTGATT  996

seq1  GTCAGGTCCTTCTCTTGCCCCGTGTAAGCCAATTTCCCAACCTCAC-TCT  1047
      |||| ||||||| ||   |||||||||||    || |||||||||| |||
seq2  GTCAAGTCCTTC-CTCTGCCCGTGTAAGC---ATTACCAACCTCACTTCT  1042

seq1  CCTCCT-GTGCACAGTGGAATAATACCTGCTCCGCAGAATTACTCGAGGT  1096
      |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  CCTCCTGGTGCACAGT-GAATAATACCTGCTCCGC-GAATTACTCAAGGT  1090

seq1  CAGTTAGTGGAGGAAAATCGTGGTCCT  1123
      ||| ||| ||||| ||||| |||||||
seq2  CAG-TAG-GGAGG-AAATC-TGGTCCT  1113

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