BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-055F13
Chromosome10 (Build37)
Map Location 59,235,429 - 59,396,009
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCbara1, EG664907, LOC664936, Dnajb12
Upstream geneLOC100039099, Sh3md4, Sept10, Ankrd57, LOC664892, P4ha1, LOC100039174, Pla2g12b, Oit3, Ccdc109a, LOC100039225
Downstream geneDdit4, D10Ertd641e, Ascc1, Spock2, Chst3, LOC100039080, Psap, Cdh23, 4632428N05Rik, Slc29a3, Unc5b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-055F13.bB6Ng01-055F13.g
ACCDH877820DH877821
length9931,068
definitionDH877820|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055F13, 5' end.DH877821|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-055F13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(59,395,018 - 59,396,009)(59,235,429 - 59,236,498)
sequence
gaattcataaatgttagacaagcacactctaccaatggaactaccaagtt
gttaattacctaactaattaatcgtgctggggatgggatccagggtcacg
aatgtgctagacaagcattccaccaacaagctatacccctggccctcgga
gttaatcttcataatccttacttcccccctccgttttgtgagacagcctt
cctatgtgttcctaactgtccaggaacttgctatgtaggtgtggacagac
ttgaacttgtggcaatccttcccttcttgtgcctcccaagtgctgggatt
atagacatgagccactcatgtcccacaaaaaaaatcagccttagttacag
ctaaggcaagtgaagttcacagaaaggtcctgttcaatatcaagtccagg
gctcaccccaagcagcctctcccacagagcacacgtatgggctgaaggac
agcttcaactgtgcccagaagcctggtgtcccctttttgatctttcacaa
ggctgagctaccagttcctgtcggttaaccccccagagagagtctgacgc
agtttgactaaaggaaaccaccagtcttggcacgaactgcccttcctggc
aggccgactgaggtcagggtgggtggagctgggaatggcatttcttattc
ctttccccagatacccatggactactgcctgggtattgggctcaccttga
gcctcagtgtcttcgtctgtacaatggggtgaaggttccactcctctatt
gctgggtccagttgagagagttaaaaaaacaaaaattctttgagccaggc
agtggtggtacatgcctttaatctccagcattcaggaggcagaggcaggc
ggatctctatgagttcaaggtcagcctggtctatacagagagttcaggga
tacacaaggaaactctgtctcaaaaaacgaaaccaaccaccacaactctc
tcttctctctctctctctctctctctctcacactcctctctcc
gaattcttctggaaggatgtctgacttatgacagtctcatgtggactttg
gtgtcatgccctgtctctcttctgttaccctaggcagactgaaagttagc
cctctctgagtcatgaataacccttcaccctcagtgccacccctgtcctc
taaggttctgtgggagcttagttctcagcagttaccatgtttcagggcct
tctctcatggcctgtaagccctggactggaacccagtgtctatacctgcc
tgcacacctagctacacgtctgtcggtatgccttaaacatgtagcttaca
atgttgtggatgctcaggcttcatcgttggctccttccttgtttctgaaa
caagtttttaaggggccattgcaagctgggtatggaggcacatgcctata
accccagcatttgggagtctgaggcaggaggatggcggcaaggttgagat
cagccaggatatatagtgaattcaaggccagcttggaacacatagcaaaa
ccttgtctcaaaagggtcaggatgaagagtactgccgttgagtgtttttc
ccaattaccatctatcctagagaagctatcagcacaatttgcagcatata
caattactccacgcatatttattggctagataaatgaagttttatgagct
gttaccttacacatattaaaattttatattttctgaacataccttcagct
tcttgattaatattttaaaactattttatattaatattctctattacata
taaacaaagccagaaatttaattataatagccagaatgttttttctgttg
ggacacttaattgaaaaccaaatagcttttgggataccaaacagagtagc
atacaaagaggggtccttaagattgaatggttaagtaacatactcggatt
cttttaatacagcagctagatctagcaggggaggtggcaaattccatctc
agcacaagccgttgcctgggttatcgaactctatttttgaatgaagctac
acaaaaaggaaagaaggtcgaagtgccgagcatttgtctttaagctcctc
taatacgagaccagattc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_59395018_59396009
seq2: B6Ng01-055F13.b_45_1037 (reverse)

seq1  GGAGAGA-----GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG-AGAGAGAGTT  44
      |||||||     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GGAGAGAGGAGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAGAGAGTT  50

seq1  GGTTGGTTGGTTGGTTTCGTTTTTTTGAGACAGGGTTTCCCTTGTGTATC  94
      |  ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||
seq2  G--TGG-TGGTTGGTTTCG-TTTTTTGAGACAGAGTTT-CCTTGTGTATC  95

seq1  CCTGAACTCTCTGTATAGACCAGGCTGACCTTGAACTCATAGAGATCCGC  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAACTCTCTGTATAGACCAGGCTGACCTTGAACTCATAGAGATCCGC  145

seq1  CTGCCTCTGCCTCCTGAATGCTGGAGATTAAAGGCATGTACCACCACTGC  194
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCTGCCTCCTGAATGCTGGAGATTAAAGGCATGTACCACCACTGC  195

seq1  CTGGCTCAAAGAATTTTTGTTTTTTTAACTCTCTCAACTGGACCCAGCAA  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCAAAGAATTTTTGTTTTTTTAACTCTCTCAACTGGACCCAGCAA  245

seq1  TAGAGGAGTGGAACCTTCACCCCATTGTACAGACGAAGACACTGAGGCTC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGAGTGGAACCTTCACCCCATTGTACAGACGAAGACACTGAGGCTC  295

seq1  AAGGTGAGCCCAATACCCAGGCAGTAGTCCATGGGTATCTGGGGAAAGGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGAGCCCAATACCCAGGCAGTAGTCCATGGGTATCTGGGGAAAGGA  345

seq1  ATAAGAAATGCCATTCCCAGCTCCACCCACCCTGACCTCAGTCGGCCTGC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAAATGCCATTCCCAGCTCCACCCACCCTGACCTCAGTCGGCCTGC  395

seq1  CAGGAAGGGCAGTTCGTGCCAAGACTGGTGGTTTCCTTTAGTCAAACTGC  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAAGGGCAGTTCGTGCCAAGACTGGTGGTTTCCTTTAGTCAAACTGC  445

seq1  GTCAGACTCTCTCTGGGGGGTTAACCGACAGGAACTGGTAGCTCAGCCTT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGACTCTCTCTGGGGGGTTAACCGACAGGAACTGGTAGCTCAGCCTT  495

seq1  GTGAAAGATCAAAAAGGGGACACCAGGCTTCTGGGCACAGTTGAAGCTGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAAGATCAAAAAGGGGACACCAGGCTTCTGGGCACAGTTGAAGCTGT  545

seq1  CCTTCAGCCCATACGTGTGCTCTGTGGGAGAGGCTGCTTGGGGTGAGCCC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCAGCCCATACGTGTGCTCTGTGGGAGAGGCTGCTTGGGGTGAGCCC  595

seq1  TGGACTTGATATTGAACAGGACCTTTCTGTGAACTTCACTTGCCTTAGCT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTTGATATTGAACAGGACCTTTCTGTGAACTTCACTTGCCTTAGCT  645

seq1  GTAACTAAGGCTGATTTTTTTTGTGGGACATGAGTGGCTCATGTCTATAA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTAAGGCTGATTTTTTTTGTGGGACATGAGTGGCTCATGTCTATAA  695

seq1  TCCCAGCACTTGGGAGGCACAAGAAGGGAAGGATTGCCACAAGTTCAAGT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGCACTTGGGAGGCACAAGAAGGGAAGGATTGCCACAAGTTCAAGT  745

seq1  CTGTCCACACCTACATAGCAAGTTCCTGGACAGTTAGGAACACATAGGAA  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCACACCTACATAGCAAGTTCCTGGACAGTTAGGAACACATAGGAA  795

seq1  GGCTGTCTCACAAAACGGAGGGGGGAAGTAAGGATTATGAAGATTAACTC  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTCTCACAAAACGGAGGGGGGAAGTAAGGATTATGAAGATTAACTC  845

seq1  CGAGGGCCAGGGGTATAGCTTGTTGGTGGAATGCTTGTCTAGCACATTCG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGGCCAGGGGTATAGCTTGTTGGTGGAATGCTTGTCTAGCACATTCG  895

seq1  TGACCCTGGATCCCATCCCCAGCACGATTAATTAGTTAGGTAATTAACAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCTGGATCCCATCCCCAGCACGATTAATTAGTTAGGTAATTAACAA  945

seq1  CTTGGTAGTTCCATTGGTAGAGTGTGCTTGTCTAACATTTATGAATTC  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTAGTTCCATTGGTAGAGTGTGCTTGTCTAACATTTATGAATTC  993

seq1: chr10_59235429_59236498
seq2: B6Ng01-055F13.g_68_1135

seq1  GAATTCTTCTGGAAGGATGTCTGACTTATGACAGTCTCATGTGGACTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTGGAAGGATGTCTGACTTATGACAGTCTCATGTGGACTTTG  50

seq1  GTGTCATGCCCTGTCTCTCTTCTGTTACCCTAGGCAGACTGAAAGTTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCATGCCCTGTCTCTCTTCTGTTACCCTAGGCAGACTGAAAGTTAGC  100

seq1  CCTCTCTGAGTCATGAATAACCCTTCACCCTCAGTGCCACCCCTGTCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTGAGTCATGAATAACCCTTCACCCTCAGTGCCACCCCTGTCCTC  150

seq1  TAAGGTTCTGTGGGAGCTTAGTTCTCAGCAGTTACCATGTTTCAGGGCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTTCTGTGGGAGCTTAGTTCTCAGCAGTTACCATGTTTCAGGGCCT  200

seq1  TCTCTCATGGCCTGTAAGCCCTGGACTGGAACCCAGTGTCTATACCTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCATGGCCTGTAAGCCCTGGACTGGAACCCAGTGTCTATACCTGCC  250

seq1  TGCACACCTAGCTACACGTCTGTCGGTATGCCTTAAACATGTAGCTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACACCTAGCTACACGTCTGTCGGTATGCCTTAAACATGTAGCTTACA  300

seq1  ATGTTGTGGATGCTCAGGCTTCATCGTTGGCTCCTTCCTTGTTTCTGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTGTGGATGCTCAGGCTTCATCGTTGGCTCCTTCCTTGTTTCTGAAA  350

seq1  CAAGTTTTTAAGGGGCCATTGCAAGCTGGGTATGGAGGCACATGCCTATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTTTTAAGGGGCCATTGCAAGCTGGGTATGGAGGCACATGCCTATA  400

seq1  ACCCCAGCATTTGGGAGTCTGAGGCAGGAGGATGGCGGCAAGGTTGAGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAGCATTTGGGAGTCTGAGGCAGGAGGATGGCGGCAAGGTTGAGAT  450

seq1  CAGCCAGGATATATAGTGAATTCAAGGCCAGCTTGGAACACATAGCAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGGATATATAGTGAATTCAAGGCCAGCTTGGAACACATAGCAAAA  500

seq1  CCTTGTCTCAAAAGGGTCAGGATGAAGAGTACTGCCGTTGAGTGTTTTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTCTCAAAAGGGTCAGGATGAAGAGTACTGCCGTTGAGTGTTTTTC  550

seq1  CCAATTACCATCTATCCTAGAGAAGCTATCAGCACAATTTGCAGCATATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTACCATCTATCCTAGAGAAGCTATCAGCACAATTTGCAGCATATA  600

seq1  CAATTACTCCACGCATATTTATTGGCTAGATAAATGAAGTTTTATGAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTACTCCACGCATATTTATTGGCTAGATAAATGAAGTTTTATGAGCT  650

seq1  GTTACCTTACACATATTAAAATTTTATA-TTTCTGAACATACCTTCAGCT  699
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTTACACATATTAAAATTTTATATTTTCTGAACATACCTTCAGCT  700

seq1  TCTTGATTAATATTTTAAAACTATTTTATATTAATATTCTCTATTACATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGATTAATATTTTAAAACTATTTTATATTAATATTCTCTATTACATA  750

seq1  TAAACAAAGCCAGAAATTTAATTATAATAGCCAGAATGTTTTTTCTGTTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAAAGCCAGAAATTTAATTATAATAGCCAGAATGTTTTTTCTGTTG  800

seq1  GGACACTTAATTGAAAACCAAATAGCTTTT-GGATACCAAACAGAGTAGC  848
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GGACACTTAATTGAAAACCAAATAGCTTTTGGGATACCAAACAGAGTAGC  850

seq1  ATACAAAGAGGGGTCCTTAAGATTGAATGGGTTAAGTAACATACTCGGAT  898
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAAGAGGGGTCCTTAAGATTGAAT-GGTTAAGTAACATACTCGGAT  899

seq1  TCTTTTAATACAGCAGCTAGATCTAAGCA-GCGAGGTGGCAAATTCCATC  947
      |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAATACAGCAGCTAGATCT-AGCAGGGGAGGTGGCAAATTCCATC  948

seq1  TCAGCACAAGCCGTTGCCTTGGTTATCGAACTTCTATTTTTGAAATGAAG  997
      ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  TCAGCACAAGCCGTTGCCTGGGTTATCGAAC-TCTATTTTTG-AATGAAG  996

seq1  CCACACAAAATGAAAAGAAGGTCGAGTTGGCGAGCATTTGTCTTTAAGCT  1047
      | |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||
seq2  CTACACAAAAAGGAAAGAAGGTCGAAGTGCCGAGCATTTGTCTTTAAGCT  1046

seq1  CTCCCAATACGAGACCAGGATTC  1070
      |  | |||||||||||| |||||
seq2  CCTCTAATACGAGACCA-GATTC  1068