BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-057N01
Chromosome10 (Build37)
Map Location 96,586,252 - 96,737,890
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667407
Upstream geneEG432491, LOC667380, Btg1, LOC628256, 4930556N09Rik
Downstream geneDcn, Lum, Kera, Epyc, 4921510H08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-057N01.bB6Ng01-057N01.g
ACCDH879570DH879571
length1,0551,100
definitionDH879570|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057N01, 5' end.DH879571|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-057N01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(96,586,252 - 96,587,310)(96,736,780 - 96,737,890)
sequence
gaattcagctttaaaatcacctctttctaagctgccacagcaccctgcac
ttctccttcattcaatttatttgtttaaagtcactgtgctatgacggaat
tgcatgaagttgacattcattttgttggctatggatagcacttgtcccag
tatctagaagacagtaataactgatacactttattgataaaatcttttgt
ataagacttaaataccaactgacactatcagggggcacatataaatttca
tatttcaatacacactagaagactaagagctatgctgctaactgctcata
gaactgatttattcagtaatcctagacagaaaaaaaactcaccaacaaaa
acatgtggcaaacctctcctaatatcatgtccttgctcagaaatatacct
cttggtagtcatgcaaagccacatctagacatagaggtactacttacata
gtgagcatatttcagtgaattcaaaagtggtatactgatgttgccttcca
aacaatctgtagtctgataaagccaacccaacagacagacttttcatagt
gagcagtgattcttgtgcagcctcataactgatcaaatattgagacatag
catggaattctcagctctaaatgggacatccatatcactttcttcaagat
ttcaggaatgttgaaagagtaggcagtaagaatgaggtcagattaggggt
atggagtgttggagaatgctgtcttctaggcacaacacagcctatgcact
cttgaagtctaggagctgtaactgctgtcataaaacccacaaaatactgg
acctgtcagcattcaacacagagggaaggtgaggctcatgatgccctccc
tctttatccctgaagattctaggcagttataattgctgagagagggagac
acactttctttagtagtgtatccactagtgcataacacaaacatcagtgc
ataacacaaaaacgcacattgactcccacagaaacatttcccaaaagaca
gagaacaaagatggctacttaagattaaatggtgtgattgtaggaagtag
agaag
gaattcctttttatagggaaagcatttgatggcttcgattaggtccaccc
aacttattgagagtaactcctttacatacaaccaactgagtgcccatgtt
aatcatatttacaaaaatacctctgcagccataccaagattagcgtctca
tccaataactgttctgtggacaatctaggttaaaccaaaaaactgatcat
catgttccattaaacagtatattttttaaaccaataagtgtgtttattct
tttgaagatctagtcatagaaacctctttaccataaagttctcccaggac
ttttagatcatctttccaagcaaactaacagtagataagcatttataaag
gaagatattttattttcctgatatattgtaacattcaattctatgatagg
tgaacatactgaatacttccaggccatccattgcagtgaagtacacagaa
aatcgcaggaagaattttattgttctataatacccagcaagcagtataat
tatcgaacatcttaaatgattaataggaaaaactctatttccttcagttt
tgtaccgcatattttttattctagagaaatatgtttttaatattcattta
atattgattaaatacccaagccttccacattaaaactaaattgaaagcat
gctttttgcaagtgaatattaagcaatctgtcagtgaggaaaacccaagt
taaagaatcaatgcagaaagtttttaaaataaagcaaatgcagaatgaat
tcactaccccaactttatttatcaagaagaaatagtcttgtggtttcttt
tcttcacacaaaagggtaatcttaactggtgcctacttgctccccttctc
tttaacaaaatgtggagtctgacattccagtcttctgcattatccagaca
cagggtcatgaatgtggtctcctggtacctcttgctgatgtttccctgag
agacactaagaatcacttttgtaggtcgccatagagatgccaaatcagat
tccatattgatcatggaatgtaaatgtccctagacttgatgctgtttact
atgataagtgtctctgtcagtgaccgacaaggatgctctcctggaaatgg

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_96586252_96587310
seq2: B6Ng01-057N01.b_44_1098

seq1  GAATTCAGCTTTAAAATCACCTCTTTCTAAGCTGCCACAGCACCCTGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCTTTAAAATCACCTCTTTCTAAGCTGCCACAGCACCCTGCAC  50

seq1  TTCTCCTTCATTCAATTTATTTGTTTAAAGTCACTGTGCTATGACGGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTTCATTCAATTTATTTGTTTAAAGTCACTGTGCTATGACGGAAT  100

seq1  TGCATGAAGTTGACATTCATTTTGTTGGCTATGGATAGCACTTGTCCCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGAAGTTGACATTCATTTTGTTGGCTATGGATAGCACTTGTCCCAG  150

seq1  TATCTAGAAGACAGTAATAACTGATACACTTTATTGATAAAATCTTTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAGAAGACAGTAATAACTGATACACTTTATTGATAAAATCTTTTGT  200

seq1  ATAAGACTTAAATACCAACTGACACTATCAGGGGGCACATATAAATTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACTTAAATACCAACTGACACTATCAGGGGGCACATATAAATTTCA  250

seq1  TATTTCAATACACACTAGAAGACTAAGAGCTATGCTGCTAACTGCTCATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCAATACACACTAGAAGACTAAGAGCTATGCTGCTAACTGCTCATA  300

seq1  GAACTGATTTATTCAGTAATCCTAGACAGAAAAAAAACTCACCAACAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTGATTTATTCAGTAATCCTAGACAGAAAAAAAACTCACCAACAAAA  350

seq1  ACATGTGGCAAACCTCTCCTAATATCATGTCCTTGCTCAGAAATATACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGGCAAACCTCTCCTAATATCATGTCCTTGCTCAGAAATATACCT  400

seq1  CTTGGTAGTCATGCAAAGCCACATCTAGACATAGAGGTACTACTTACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTAGTCATGCAAAGCCACATCTAGACATAGAGGTACTACTTACATA  450

seq1  GTGAGCATATTTCAGTGAATTCAAAAGTGGTATACTGATGTTGCCTTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGCATATTTCAGTGAATTCAAAAGTGGTATACTGATGTTGCCTTCCA  500

seq1  AACAATCTGTAGTCTGATAAAGCCAACCCAACAGACAGACTTTTCATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATCTGTAGTCTGATAAAGCCAACCCAACAGACAGACTTTTCATAGT  550

seq1  GAGCAGTGATTCTTGTGCAGCCTCATAACTGATCAAATATTGAGACATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTGATTCTTGTGCAGCCTCATAACTGATCAAATATTGAGACATAG  600

seq1  CATGGAATTCTCAGCTCTAAATGGGACATCCATATCACTTTCTTCAAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAATTCTCAGCTCTAAATGGGACATCCATATCACTTTCTTCAAGAT  650

seq1  TTCAGGAATGTTGAAAGAGTAGGCAGTAAGAATGAGGTCAGATTAGGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGGAATGTTGAAAGAGTAGGCAGTAAGAATGAGGTCAGATTAGGGGT  700

seq1  ATGGAGTGTTGGAGAATGCTGTCTTCTAGGCACAACACAGCCTATGCACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAGTGTTGGAGAATGCTGTCTTCTAGGCACAACACAGCCTATGCACT  750

seq1  CTTGAAGTCTAGGAGCTGTAACTGCTGTCATAAAACCCACAAAATACTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAGTCTAGGAGCTGTAACTGCTGTCATAAAACCCACAAAATACTGG  800

seq1  ACCTGTCAGCATTCAACACAGAGGGAAGGTGAGGCTCATGATGCCCTCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCAGCATTCAACACAGAGGGAAGGTGAGGCTCATGATGCCCTCCC  850

seq1  TCTTTATCCCTGAAGATTCTAGGCAGTTAATAATTGCTGAGAGAGGGAGA  900
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATCCCTGAAGATTCTAGGCAGTT-ATAATTGCTGAGAGAGGGAGA  899

seq1  CACACTTTCTTTAGTAGTGTATCCACTAGTGCATAACACAAAACATCAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CACACTTTCTTTAGTAGTGTATCCACTAGTGCATAACAC-AAACATCAGT  948

seq1  GCATAACACAAAAACGCACATTGACTCACACAGAAACATATACACAAAAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||
seq2  GCATAACACAAAAACGCACATTGACTCCCACAGAAACAT-TTCCCAAAAG  997

seq1  ACAAGAAGACAAAAGATGGGCTACTTAGGA-TAAATGGTGTGATTGTAGG  1049
      |||   |||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||
seq2  ACA--GAGAACAAAGAT-GGCTACTTAAGATTAAATGGTGTGATTGTAGG  1044

seq1  AAGTAG-GAAG  1059
      |||||| ||||
seq2  AAGTAGAGAAG  1055

seq1: chr10_96736780_96737890
seq2: B6Ng01-057N01.g_65_1164 (reverse)

seq1  CCATTTCCAGGGAGAGCATCATCGTTCGGTCAACTTGACAGAGACACTTA  50
      ||||||||| |||||||||| | | |||||||   |||||||||||||| 
seq2  CCATTTCCA-GGAGAGCATCCTTG-TCGGTCA--CTGACAGAGACACTT-  45

seq1  ATCAATAGTAAACAGCATCAAGTCTAGGGGACATTTTACATTCCATGATC  100
      ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||
seq2  ATC-ATAGTAAACAGCATCAAGTCTA-GGGACA-TTTACATTCCATGATC  92

seq1  AATATGGAATCTGATTTTGGCATCTCTATGGCGACCTACAAAAAGTGATT  150
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATATGGAATCTGA-TTTGGCATCTCTATGGCGACCTAC-AAAAGTGATT  140

seq1  CTTAGTGTCTCTCAGGGGAAACATCAGCAAGAGGTACCAGGAGACCACAT  200
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGTGTCTCTCA-GGGAAACATCAGCAAGAGGTACCAGGAGACCACAT  189

seq1  TCATGACCCTGTGTCTGGATAATGCAGAAGACTGGAATGTCAGACTCCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGACCCTGTGTCTGGATAATGCAGAAGACTGGAATGTCAGACTCCAC  239

seq1  ATTTTGTTAAAGAGAAGGGGAGCAAGTAGGCACCAGTTAAGATTACCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTTAAAGAGAAGGGGAGCAAGTAGGCACCAGTTAAGATTACCCTT  289

seq1  TTGTGTGAAGAAAAGAAACCACAAGACTATTTCTTCTTGATAAATAAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTGAAGAAAAGAAACCACAAGACTATTTCTTCTTGATAAATAAAGT  339

seq1  TGGGGTAGTGAATTCATTCTGCATTTGCTTTATTTTAAAAACTTTCTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTAGTGAATTCATTCTGCATTTGCTTTATTTTAAAAACTTTCTGCA  389

seq1  TTGATTCTTTAACTTGGGTTTTCCTCACTGACAGATTGCTTAATATTCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATTCTTTAACTTGGGTTTTCCTCACTGACAGATTGCTTAATATTCAC  439

seq1  TTGCAAAAAGCATGCTTTCAATTTAGTTTTAATGTGGAAGGCTTGGGTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAAAAAGCATGCTTTCAATTTAGTTTTAATGTGGAAGGCTTGGGTAT  489

seq1  TTAATCAATATTAAATGAATATTAAAAACATATTTCTCTAGAATAAAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAATATTAAATGAATATTAAAAACATATTTCTCTAGAATAAAAAA  539

seq1  TATGCGGTACAAAACTGAAGGAAATAGAGTTTTTCCTATTAATCATTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCGGTACAAAACTGAAGGAAATAGAGTTTTTCCTATTAATCATTTAA  589

seq1  GATGTTCGATAATTATACTGCTTGCTGGGTATTATAGAACAATAAAATTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTCGATAATTATACTGCTTGCTGGGTATTATAGAACAATAAAATTC  639

seq1  TTCCTGCGATTTTCTGTGTACTTCACTGCAATGGATGGCCTGGAAGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCGATTTTCTGTGTACTTCACTGCAATGGATGGCCTGGAAGTATT  689

seq1  CAGTATGTTCACCTATCATAGAATTGAATGTTACAATATATCAGGAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATGTTCACCTATCATAGAATTGAATGTTACAATATATCAGGAAAAT  739

seq1  AAAATATCTTCCTTTATAAATGCTTATCTACTGTTAGTTTGCTTGGAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTTCCTTTATAAATGCTTATCTACTGTTAGTTTGCTTGGAAAG  789

seq1  ATGATCTAAAAGTCCTGGGAGAACTTTATGGTAAAGAGGTTTCTATGACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCTAAAAGTCCTGGGAGAACTTTATGGTAAAGAGGTTTCTATGACT  839

seq1  AGATCTTCAAAAGAATAAACACACTTATTGGTTTAAAAAATATACTGTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTTCAAAAGAATAAACACACTTATTGGTTTAAAAAATATACTGTTT  889

seq1  AATGGAACATGATGATCAGTTTTTTGGTTTAACCTAGATTGTCCACAGAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAACATGATGATCAGTTTTTTGGTTTAACCTAGATTGTCCACAGAA  939

seq1  CAGTTATTGGATGAGACGCTAATCTTGGTATGGCTGCAGAGGTATTTTTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTATTGGATGAGACGCTAATCTTGGTATGGCTGCAGAGGTATTTTTG  989

seq1  TAAATATGATTAACATGGGCACTCAGTTGGTTGTATGTAAAGGAGTTACT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATATGATTAACATGGGCACTCAGTTGGTTGTATGTAAAGGAGTTACT  1039

seq1  CTCAATAAGTTGGGTGGACCTAATCGAAGCCATCAAATGCTTTCCCTATA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAATAAGTTGGGTGGACCTAATCGAAGCCATCAAATGCTTTCCCTATA  1089

seq1  AAAAGGAATTC  1111
      |||||||||||
seq2  AAAAGGAATTC  1100