BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063P16
Chromosome10 (Build37)
Map Location 75,278,593 - 75,442,525
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGstt4, Gstt2, Mif, Derl3, Smarcb1, Mmp11, Ndg2, Gm867, Vpreb3, EG333669
Upstream geneEG630453, EG623346, Gnaz, LOC100040057, Rab36, Bcr, Specc1l, LOC100040670, Adora2a, EG544707, Upb1, 1110038D17Rik, Snrpd3, AI646023, Ggt1, Ggtla1, Susd2, Cabin1, Ddt, Gstt3, Gstt1
Downstream geneSuhw2, Slc5a4b, Slc5a4a, LOC100040150, Prmt2, S100b, Dip2a, Pcnt, 2610028H24Rik, A130042E20Rik, Mcm3ap, Lss, 1700027D21Rik, Ftcd, Col6a2, Col6a1, Pcbp3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063P16.bB6Ng01-063P16.g
ACCDH883907DH883908
length1,1301,040
definitionDH883907|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063P16, 5' end.DH883908|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063P16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,441,391 - 75,442,525)(75,278,593 - 75,279,646)
sequence
gaattctgggcctttctagcctagcgtcagggagttagagttgggaatcc
tagcaaaagtgctaaagcaaaacaacagactctcctcctgcttctcgcca
cacttctgcacatgcacactcctccatcttttcccagcaccaccacatgc
atgcatacaaacaacacagagactggctctcagcctgaaagaacatattt
gcttccagctcacaaccattctcatgcatacatcagtggccaaaaggaag
ttctgggaagaaatacagtaagcatcatgagccagtaataaaaaaggaaa
ctaaattaaccgaaaagtgctcaatcttaccatatctgggagttaaggag
taaaacaactctgagaaatgagacactttttcagcctgttaaaatgagca
aaaccggctggagagatggctcagcagttaagagcactggctgctcttcc
agaggtcctgagttcaaatcccagcaaccacatggtggctcacaaccatc
cataatgagatctgatgccctcttctgaggtgtctgaagacagctacagt
gtacttacatataataaagaaataaatcctcttaaaaaaaatgagcaaaa
cccttacaggctggatgaaaaccagaagaaggggggtacatgtgtgtgtg
catgcgtgcgtgtgtgtgcatgtgtcacttgttacagctcaaaagtcact
cttggtaaacagtctgagcaaagtgggaacaaaaggactctgcaaaaggc
tgcctatctccacccagcttacagctagtattaaatagagtgtttagtgt
cttctctctgaggctgcacatataccacaagtgcgcctgtcccttccact
ctgctgaaccctctgaattggctattattctcatttagtacagccttaac
tcttcccggctgtactttctgtaaagaacactttgtgtgagcgcagaact
tttggatgaagtgtgtgtgatttactcgtgaagcaatcgttgaagtctat
ggggacagcaaggtgtcctgtgtgcagcgatttgggtgaatagaatcaca
cagcaggggttgctcttctggacctgagcaagcaaacgaaaggctcaaac
tggagaacaaggacaaacatatgggctggg
gaattcaatggactgtggagagcatagaggtcaaagtgtaatatccaaaa
taaaagtcccttcaaaaggactttccaaactatactagcaggccaagtac
agagccagatttaaaaaaaaaaaaacaaaaacaaaaacaaaaaaaacaaa
ctggctcactaaataaatatagaaacatagttttaacggtcaaaaacaag
attagcaattcccctgccctgcctcacactaaaaaccacaagacagacaa
aatgagagtcacctatacaaaccaaccaatgtctaaaaaggttattggct
gcacaaattaaattatgccaaactaccctggtgcctatatccagccctta
caaaggtataaaaagtgtgttctttctttgttctgggtctctcccccagc
ctgcatgttgagagggggttccccaacatgttggataagtaaaatcctca
tgggttttgcaacaatggcggtctctgtggtctttgtgagtgagggtctt
ttgacaagctacaacaaaagcatagggtcctgtgcttggtgcaggccaga
atagttcttcttgtgtagttctacactacacattggccaaggactaaagt
tactactttgaatgctggccagaaactatgatagcctttcaagagactgg
ccaatgagctgaggctgtagctcagtaggtagagtgaaaacaaagcatgc
atacagcacaccacgaaacaggcattttgtatgtacctgtaatccccaca
ttagagaggcagcatcaagactgtcaaaagctgaaggccatccacagcta
aatagctagtctgaggccagcctgggacacaggagaccctatcttaagag
aaggacattcagctgccagacgtggtggcgcacactttaatcccagcact
tgggaagcagaggcaggaagatttctgagtttgaggccagctggtctcag
agtgagtcagactagccaaggctatacagagaaccctgtctcaaaaaaaa
aaaacaaaatgaagaagaagaaggagggagggaaggagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_75441391_75442525
seq2: B6Ng01-063P16.b_48_1177 (reverse)

seq1  CCCAGCCCATATG-TTGTCCTTGGTCTCCAGTTGGAAGCCCCTTCCGTTT  49
      ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    |||| |||||
seq2  CCCAGCCCATATGTTTGTCCTTGTTCTCCAGTTTGA---GCCTTTCGTTT  47

seq1  GCCTGCTCAGGTCCAGAAGAGCCACCCCCTGCTGTGTGATTCTACTCACC  99
      || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||
seq2  GCTTGCTCAGGTCCAGAAGAG-CAACCCCTGCTGTGTGATTCTATTCACC  96

seq1  CAAATCGCTGCCACACAGGACACCCTGCTGTCCCCATAGACCTCAACGAT  149
      |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAAATCGCTG-CACACAGGACACCTTGCTGTCCCCATAGACTTCAACGAT  145

seq1  TGCTTCACGAGTAAATCACACACACTTCATCCAAAAGTTCTGGCGCTCAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TGCTTCACGAGTAAATCACACACACTTCATCCAAAAGTTCT-GCGCTCAC  194

seq1  ACAAAGTGTTCTTTACAGAAAGTACAGCC-GGAAGAGTTAAGGCTGTACT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGTGTTCTTTACAGAAAGTACAGCCGGGAAGAGTTAAGGCTGTACT  244

seq1  AAATGAGAATAAATAGCCAATTCAGAGGGTTCAGCAGAGTGGAAGGGACA  298
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAGAAT-AATAGCCAATTCAGAGGGTTCAGCAGAGTGGAAGGGACA  293

seq1  GGCGCACTTGTGGTATATGTGCAGCCTCAGAGAGAAGACACTAAACACTC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGCACTTGTGGTATATGTGCAGCCTCAGAGAGAAGACACTAAACACTC  343

seq1  TATTTAATACTAGCTGTAAGCTGGGTGGAGATAGGCAGCCTTTTGCAGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTAATACTAGCTGTAAGCTGGGTGGAGATAGGCAGCCTTTTGCAGAG  393

seq1  TCCTTTTGTTCCCACTTTGCTCAGACTGTTTACCAAGAGTGACTTTTGAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTGTTCCCACTTTGCTCAGACTGTTTACCAAGAGTGACTTTTGAG  443

seq1  CTGTAACAAGTGACACATGCACACACACGCACGCATGCACACACACATGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAACAAGTGACACATGCACACACACGCACGCATGCACACACACATGT  493

seq1  ACCCCCCTTCTTCTGGTTTTCATCCAGCCTGTAAGGGTTTTGCTCATTTT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCCCTTCTTCTGGTTTTCATCCAGCCTGTAAGGGTTTTGCTCATTTT  543

seq1  TTTTAAGAGGATTTATTTCTTTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGAGGATTTATTTCTTTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCT  593

seq1  TCAGACACCTCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTATGGATGGTTGTGAGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGACACCTCAGAAGAGGGCATCAGATCTCATTATGGATGGTTGTGAGC  643

seq1  CACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGCCA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTCTGGAAGAGCAGCCA  693

seq1  GTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCGGTTTTGCTCATTTTAAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTTAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCGGTTTTGCTCATTTTAAC  743

seq1  AGGCTGAAAAAGTGTCTCATTTCTCAGAGTTGTTTTACTCCTTAACTCCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAAAAAGTGTCTCATTTCTCAGAGTTGTTTTACTCCTTAACTCCC  793

seq1  AGATATGGTAAGATTGAGCACTTTTCGGTTAATTTAGTTTCCTTTTTTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGGTAAGATTGAGCACTTTTCGGTTAATTTAGTTTCCTTTTTTAT  843

seq1  TACTGGCTCATGATGCTTACTGTATTTCTTCCCAGAACTTCCTTTTGGCC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGCTCATGATGCTTACTGTATTTCTTCCCAGAACTTCCTTTTGGCC  893

seq1  ACTGATGTATGCATGAGAATGGTTGTGAGCTGGAAGCAAATATGTTCTTT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATGTATGCATGAGAATGGTTGTGAGCTGGAAGCAAATATGTTCTTT  943

seq1  CAGGCTGAGAGCCAGTCTCTGTGTTGTTTGTATGCATGCATGTGGTGGTG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTGAGAGCCAGTCTCTGTGTTGTTTGTATGCATGCATGTGGTGGTG  993

seq1  CTGGGAAAAGATGGAGGAGTGTGCATGTGCAGAAGTGTGGCGAGAAGCAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAAAAGATGGAGGAGTGTGCATGTGCAGAAGTGTGGCGAGAAGCAG  1043

seq1  GAGGAGAGTCTGTTGTTTTGCTTTAGCACTTTTGCTAGGATTCCCAACTC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGAGTCTGTTGTTTTGCTTTAGCACTTTTGCTAGGATTCCCAACTC  1093

seq1  TAACTCCCTGACGCTAGGCTAGAAAGGCCCAGAATTC  1135
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCCCTGACGCTAGGCTAGAAAGGCCCAGAATTC  1130

seq1: chr10_75278593_75279646
seq2: B6Ng01-063P16.g_69_1108

seq1  GAATTCAATGGACTGTGGAGAGCATAGAGGTCAAAGTGTAATATCCAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGGACTGTGGAGAGCATAGAGGTCAAAGTGTAATATCCAAAA  50

seq1  TAAAAGTCCCTTCAAAAGGACTTTCCAAACTATACTAGCAGGCCAAGTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTCCCTTCAAAAGGACTTTCCAAACTATACTAGCAGGCCAAGTAC  100

seq1  AGAGCCAGATTTAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGATTTAAAAAAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAAAACAAA  150

seq1  CTGGCTCACTAAATAAATATAGAAACATAGTTTTAACGGTCAAAAACAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTCACTAAATAAATATAGAAACATAGTTTTAACGGTCAAAAACAAG  200

seq1  ATTAGCAATTCCCCTGCCCTGCCTCACACTAAAAACCACAAGACAGACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCAATTCCCCTGCCCTGCCTCACACTAAAAACCACAAGACAGACAA  250

seq1  AATGAGAGTCACCTATACAAACCAACCAATGTCTAAAAAGGTTATTGGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGAGTCACCTATACAAACCAACCAATGTCTAAAAAGGTTATTGGCT  300

seq1  GCACAAATTAAATTATGCCAAACTACCCTGGTGCCTATATCCAGCCCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAATTAAATTATGCCAAACTACCCTGGTGCCTATATCCAGCCCTTA  350

seq1  CAAAGGTATAAAAAGTGTGTTCTTTCTTTGTTCTGGGTCTCTCCCCCAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTATAAAAAGTGTGTTCTTTCTTTGTTCTGGGTCTCTCCCCCAGC  400

seq1  CTGCATGTTGAGAGGGGGTTCCCCAACATGTTGGATAAGTAAAATCCTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATGTTGAGAGGGGGTTCCCCAACATGTTGGATAAGTAAAATCCTCA  450

seq1  TGGGTTTTGCAACAATGGCGGTCTCTGTGGTCTTTGTGAGTGAGGGTCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTTTGCAACAATGGCGGTCTCTGTGGTCTTTGTGAGTGAGGGTCTT  500

seq1  TTGACAAGCTACAACAAAAGCATAGGGTCCTGTGCTTGGTGCAGGCCAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACAAGCTACAACAAAAGCATAGGGTCCTGTGCTTGGTGCAGGCCAGA  550

seq1  ATAGTTCTTCTTGTGTAGTTCTACACTACACATTGGCCAAGGACTAAAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTTCTTCTTGTGTAGTTCTACACTACACATTGGCCAAGGACTAAAGT  600

seq1  TACTACTTTGAATGCTGGCCAGAAACTATGATAGCCTTTCAAGAGACTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACTTTGAATGCTGGCCAGAAACTATGATAGCCTTTCAAGAGACTGG  650

seq1  CCAATGAGCTGAGGCTGTAGCTCAGTAGGTAGAGTGAAAACAAAGCATGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGAGCTGAGGCTGTAGCTCAGTAGGTAGAGTGAAAACAAAGCATGC  700

seq1  ATACAGCACACCACGAAACAGGCATTTTGTATGTACCTGTAATCCCCACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGCACACCACGAAACAGGCATTTTGTATGTACCTGTAATCCCCACA  750

seq1  TTAGAGAGGCAGCATCAAGACTGTCAAAAGCTGAAGGCCATCCACAGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGAGGCAGCATCAAGACTGTCAAAAGCTGAAGGCCATCCACAGCTA  800

seq1  AATAGCTAGTCTGAGGCCAGCCTGGGACACAGGAGACCCTATCTTAAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGCTAGTCTGAGGCCAGCCTGGGACACAGGAGACCCTATCTTAAGAG  850

seq1  AAGGACATTCAGCTGCCAGACGTGGTGGCGCACACCTTTAATCCCAGCAC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AAGGACATTCAGCTGCCAGACGTGGTGGCGCACA-CTTTAATCCCAGCAC  899

seq1  TTGGGAAGCAGAGGCAAGAAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTA  950
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| 
seq2  TTGGGAAGCAGAGGCAGGAAGATTTCTGAGTTTGAGGCCAG-CTGGTCT-  947

seq1  CAGAGTGAGTTCCAGGACTAGCCAAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTC  1000
      ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  CAGAGTGAGT--CA-GACTAGCCAA-GGCTATACAGAG-AACCCTGTCTC  992

seq1  AAAAAAAAAAAAAACAAAAAGGAAGAAAGAAAGAAGGGAGGGAGGGAGGG  1050
      ||||||||||||    |||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||
seq2  AAAAAAAAAAAA---CAAAATGAAGAA--GAAGAA-GGAGGGAGGGAAGG  1036

seq1  AGGG  1054
      || |
seq2  AGAG  1040