BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-065L14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 64,555,047 - 64,681,055
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCtnna3
Downstream geneLOC665206, LOC216036, 1700023F02Rik, 4930407I19Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-065L14.bB6Ng01-065L14.g
ACCDH885115DH885116
length1,066960
definitionDH885115|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065L14, 5' end.DH885116|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-065L14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,679,979 - 64,681,055)(64,555,047 - 64,555,999)
sequence
gattcttactaaacttgatattatggggttttttgtttgtttgtttgttt
ttgttttttcttttagacggtgtgtcctgtagtttagactggtcttcaac
tcactatacagtagccttaaactctttatctttctctattacacaagtac
tggtattccagacttgtaccaccatatctagctacctttaacatttattc
agcctaaattcatttcctgtcaatcataattatgacactaaaaaaaaaaa
taaatgctgatggggaaatcctgatttctgtctctagtcttaataacttt
ttttattttatgctacttaaaatttaaatataaatgtgttacatacaaaa
tggtatatttttcaatagtaaaacaaatgaagtcatgaaatttgcagaaa
tgtggttggaattagaagataaaatattaaggtgagccaaattaacaacc
tggatattctccctcatgtgtgaatccaaacctatatggtacaagtgttt
acatgcaaacagctgtaagtgtaagagcactataatattttataaagaac
acaaagaaagtgtagtgataagtgattggtagggacagagcaatcaaagg
atacatgaactatgaaaaagtaaataaatgtaatgtaaaacaacttatta
attgcttttctagtttcaaatttatcataataattttatataataggtat
atggacatataattgatagtgagaatggagaaccaaaagaaactttgatc
atttatataacttttgatcaatgtatatttttattaaatattttcttaat
gatcaatgtatattttaattgtgtagtttactattatttataagagttca
gaatgggcaagtatttgaatggcgatcttaatctagctgtgtgatatgtt
tattgtttgtaagctaaattatgacaaattgatagatcaatgaaaagatt
taaaataatttgcaccataatatcttatttgaataccctagtccaattaa
cctgaaggtgtttaggtcattaagaagtaagtgactgaaatcatgtgtga
atacagactcaatctc
gaattccaaaattagtgagcacaaattttatttatatatatatatgaaaa
tttaaatacaaattatatatgtatatataatacattatatattacataat
cattacacatataaatatattttatatatgtatgtacatatatacacata
tatgcacacatatacacacatatacatatatatgaagattggttattata
acctgatattttaggttgactgttcacacaaaggggaggtatttcatgta
caaatgaaaagtctcatatgacagtgaaatttacctctctttaggactgt
gatccttaagcacatcctagaaaatatgattctccagcttatccagcctt
ggtgttcaacattttaaaggtattaagttaaagatgtatgtagagtatag
actctagtttaaaagagtagaaactgaacttcatgccatatggattgtaa
ttatatgtaaatgtcacttgtatttactcagatgaaggaaagagatgaaa
gtcataccctaaccttaccaatatatggcttgggctgagcccagagtgtt
tccatcttactatccctaggcctaggcctagaggcttctagcccctgtac
aatctaatcttcaacaagtatataccttgaaggcttcagctcctagcctc
catctgctaacctaggtctagaatgttttagctctgagacttactgctga
ataaactcactctttctagaacattctgaactctggctgactggttaatc
cgctgttctggctcaaactcctctccaagataactgattcaaattgcctt
ctcttggcttaagactgaatggctgtgcttggaaaaactgcctctgaact
ccacattcgaactctctcttcctatgatgctctcaactgtttctctctcc
tgtgctattctaatgaaagtgggtatatctatcgtactctgactcatctg
tcaaatcttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_64679979_64681055
seq2: B6Ng01-065L14.b_49_1113 (reverse)

seq1  GAGATTTGAGGTCTGTATTCACACAGATGATTCATGTCACTTACTTCTTA  50
      |||| |||| ||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||
seq2  GAGA-TTGA-GTCTGTATTCACAC--ATGATTTCAGTCACTTACTTCTTA  46

seq1  ATGAACCTAAAACACCTTCAGGTTAATTTGGACTAGGGTATTCAAATAAG  100
      ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATG-ACCT-AAACACCTTCAGGTTAA-TTGGACTAGGGTATTCAAATAAG  93

seq1  ATATTATGGTGCAAATTATTTTAAATTCTATTTCATTTGATTCTTATCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||   ||||||
seq2  ATATTATGGTGCAAATTATTTTAAA-TCT-TTTCA-TTGAT--CTATCAA  138

seq1  TTTGTCATAATTTAGCTTACAAACAATAAACATATCACACAGCTAGATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCATAATTTAGCTTACAAACAATAAACATATCACACAGCTAGATTA  188

seq1  AGATCGCCATTCAAATACTTGCCCATTCTGAACTCTTATAAATATTAGTA  250
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGATCGCCATTCAAATACTTGCCCATTCTGAACTCTTATAAATAATAGTA  238

seq1  AACTACACAATTAAAATATACATTGATCATTAAGAAAATATTTAATAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACACAATTAAAATATACATTGATCATTAAGAAAATATTTAATAAAA  288

seq1  ATATACATTGATCAAAAGTTATATAAATGATCAAAGTTTCTTTTGGTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACATTGATCAAAAGTTATATAAATGATCAAAGTTTCTTTTGGTTCT  338

seq1  CCATTCTCACTATCAATTATATGTCCATATACCTATTATATAAAATTATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCTCACTATCAATTATATGTCCATATACCTATTATATAAAATTATT  388

seq1  ATGATAAATTTGAAACTAGAAAAGCAATTAATAAGTTGTTTTACATTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATAAATTTGAAACTAGAAAAGCAATTAATAAGTTGTTTTACATTACA  438

seq1  TTTATTTACTTTTTCATAGTTCATGTATCCTTTGATTGCTCTGTCCCTAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTACTTTTTCATAGTTCATGTATCCTTTGATTGCTCTGTCCCTAC  488

seq1  CAATCACTTATCACTACACTTTCTTTGTGTTCTTTATAAAATATTATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCACTTATCACTACACTTTCTTTGTGTTCTTTATAAAATATTATAGT  538

seq1  GCTCTTACACTTACAGCTGTTTGCATGTAAACACTTGTACCATATAGGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTACACTTACAGCTGTTTGCATGTAAACACTTGTACCATATAGGTT  588

seq1  TGGATTCACACATGAGGGAGAATATCCAGGTTGTTAATTTGGCTCACCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTCACACATGAGGGAGAATATCCAGGTTGTTAATTTGGCTCACCTT  638

seq1  AATATTTTATCTTCTAATTCCAACCACATTTCTGCAAATTTCATGACTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTTATCTTCTAATTCCAACCACATTTCTGCAAATTTCATGACTTC  688

seq1  ATTTGTTTTACTATTGAAAAATATACCATTTTGTATGTAACACATTTATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTTACTATTGAAAAATATACCATTTTGTATGTAACACATTTATA  738

seq1  TTTAAATTTTAAGTAGCATAAAATAAAAAAAGTTATTAAGACTAGAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATTTTAAGTAGCATAAAATAAAAAAAGTTATTAAGACTAGAGACA  788

seq1  GAAATCAGGATTTCCCCATCAGCATTTATTTTTTTTTTTAGTGTCATAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCAGGATTTCCCCATCAGCATTTATTTTTTTTTTTAGTGTCATAAT  838

seq1  TATGATTGACAGGAAATGAATTTAGGCTGAATAAATGTTAAAGGTAGCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATTGACAGGAAATGAATTTAGGCTGAATAAATGTTAAAGGTAGCTA  888

seq1  GATATGGTGGTACAAGTCTGGAATACCAGTACTTGTGTAATAGAGAAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGGTGGTACAAGTCTGGAATACCAGTACTTGTGTAATAGAGAAAGA  938

seq1  TAAAGAGTTTAAGGCTACTGTATAGTGAGTTGAAGACCAGTCTAAACTAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAGTTTAAGGCTACTGTATAGTGAGTTGAAGACCAGTCTAAACTAC  988

seq1  AGGACACACCGTCTAAAAGAAAAAACAAAAACAAACAAACAAACAAAAAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACACACCGTCTAAAAGAAAAAACAAAAACAAACAAACAAACAAAAAA  1038

seq1  CCCCATAATATCAAGTTTAGTAAGAAT  1077
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATAATATCAAGTTTAGTAAGAAT  1065

seq1: chr10_64555047_64555999
seq2: B6Ng01-065L14.g_69_1015

seq1  GAATTCCAAAATTAGTGAGCACAAATTTTATTTATATATATATATGAAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAATTAGTGAGCACAAATTTTATTTATATATATATATGAAAA  50

seq1  TTTAAATACAAATTATATATGTATATATAATACATTATATATTACATAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATACAAATTATATATGTATATATAATACATTATATATTACATAAT  100

seq1  CATTACACATATAAATATATTTTATATATGTATGTACATATATACACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACACATATAAATATATTTTATATATGTATGTACATATATACACATA  150

seq1  TATGCACACATATACACACATATACATATATATGAAGATTGGTTATTATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCACACATATACACACATATACATATATATGAAGATTGGTTATTATA  200

seq1  ACCTGATATTTTAGGTTGACTGTTCACACAAAGGGGAGGTATTTCATGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGATATTTTAGGTTGACTGTTCACACAAAGGGGAGGTATTTCATGTA  250

seq1  CAAATGAAAAGTCTCATATGACAGTGAAATTTACCTCTCTTTAGGACTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGAAAAGTCTCATATGACAGTGAAATTTACCTCTCTTTAGGACTGT  300

seq1  GATCCTTAAGCACATCCTAGAAAATATGATTCTCCAGCTTATCCAGCCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCTTAAGCACATCCTAGAAAATATGATTCTCCAGCTTATCCAGCCTT  350

seq1  GGTGTTCAACATTTTAAAGGTATTAAGTTAAAGATGTATGTAGAGTATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTCAACATTTTAAAGGTATTAAGTTAAAGATGTATGTAGAGTATAG  400

seq1  ACTCTAGTTTAAAAGAGTAGAAACTGAACTTCATGCCATATGGATTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAGTTTAAAAGAGTAGAAACTGAACTTCATGCCATATGGATTGTAA  450

seq1  TTATATGTAAATGTCACTTGTATTTACTCAGATGAAGGAAAGAGATGAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTAAATGTCACTTGTATTTACTCAGATGAAGGAAAGAGATGAAA  500

seq1  GTCATACCCTAACCTTACCAATATATGGCTTGGGCTGAGCCCAGAGTGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATACCCTAACCTTACCAATATATGGCTTGGGCTGAGCCCAGAGTGTT  550

seq1  TCCATCTTACTATCCCTAGGCCTAGGCCTAGAGGCTTCTAGCCCCTGTAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCTTACTATCCCTAGGCCTAGGCCTAGAGGCTTCTAGCCCCTGTAC  600

seq1  AATCTAATCTTCAACAAGTATATACCTTGAAGGCTTCAGCTCCTAGCCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTAATCTTCAACAAGTATATACCTTGAAGGCTTCAGCTCCTAGCCTC  650

seq1  CATCTGCTAACCTAGGTCTAGAATGTTTTAGGCTCTGAGACTTACTGCTG  700
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCTAACCTAGGTCTAGAATGTTTTA-GCTCTGAGACTTACTGCTG  699

seq1  AATAAACTCACTCTTTCTAGAACATTCTGAACTCTGGCTGACTGGTTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AATAAACTCACTCTTTCTAGAACATTCTGAACTCTGGCTGACTGGTT-AA  748

seq1  TCCGCTGTTCTGGCTCAAACTCCTCTCCAAGATAACTGATTCAAATTGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGCTGTTCTGGCTCAAACTCCTCTCCAAGATAACTGATTCAAATTGCC  798

seq1  TTCTCTTGGCTTAAGACTGAATGGCTGTGCTTGGAAAAACTGCCTCTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTTGGCTTAAGACTGAATGGCTGTGCTTGGAAAAACTGCCTCTGAA  848

seq1  CTCCACAATTCGAACTCTCTCTTCCTATGATGCTCTCAACTTGTTTCTCT  900
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTCCAC-ATTCGAACTCTCTCTTCCTATGATGCTCTCAAC-TGTTTCTCT  896

seq1  CTCCTGTGCTATTCTAATGAAAGTTGGGTATATCTATCGTACCTCTGACT  950
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CTCCTGTGCTATTCTAATGAAAG-TGGGTATATCTATCGTA-CTCTGACT  944

seq1  CAT  953
      |||
seq2  CAT  947