BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-066N07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 103,775,242 - 103,928,938
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100043277, 6430590A10Rik, Slc6a15, EG667697, LOC667701, EG627488, EG667692, EG667695, LOC100043292
Downstream geneLOC100042383, Tmtc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-066N07.bB6Ng01-066N07.g
ACCDH885897DH885898
length1,041526
definitionDH885897|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-066N07, 5' end.DH885898|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-066N07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(103,775,242 - 103,776,041)(103,928,405 - 103,928,938)
sequence
gaattctttacctaagtttgagatcctgtgaaatttttcccctccacatc
gacatgccaaatgaggcttcagatattatttatgcaatgatattgtagag
atatcctggatgtatcttccctatcctatctaatacacagaatcttagca
tattttcttgatctggaaagagctgaagtgatctttatatattacgttgt
atttatacattaagttgtatttagcatcaaaagtgaaggcatgtgctata
aactcggaaacattatgagaacaatatttagaacaaagtgggtatgtgct
atatcactttttcttccctatgttccaaatgatccctaaaacttagatga
agtgattgtgttgtgaatgtatcaattgcaatgtatgaactgaccagagt
cagttgtttttttgtttggcaagttgtgcctttaatgatctttgctattt
tacaagaatcttccttggtgaaggatgatagctctctttatctgtgcata
ggtgggtagatatttagaatgcagttacaaattatactggcttagaagga
tgtaagtactagaatttctatgatccatgacttatttagcctacaataat
aggctatgttctccacaacaagcgtgatttctctcctggtaagatggtct
tatgtcaaattacgcagttgttgtttaccaaggtgtgagtgtatctgtta
cagcattagggggatcttgtcattctggtcaatattgtggctcataggaa
tcacaacagggtagaataattgagttctttcaacattgccagctcagatc
acaccttcccacacaaagaaagctagccttcagggagagttatttcagca
cagacatagttcaaattcactgaatcttgtatccaaagtgtgtcttgtct
tctcaaaaggattttacattccatgtttgcaaataaccaatggcaacagt
gagagtcttcactatccgtggagtctctggactctgcagaccaccactca
actagaatttcccatgccttgtactgaatttctaacggatt
atagttaggttgataacttatgactttgtacagaaaaaaaaaaataaagg
aaaagagagaggagagagatactgggaaacagagaggaagagagagagag
agagagagagagagagagagagagagagagagagagagaatttctaggag
ttagcatagagcttttgcctagcatacataagctcccaagtttcaacttc
ctgcactgaaaacccaagtgttaaataagtcttaaaagtatctaactgac
actcactaaataattttttttattttgttgacactgctgtacataaattt
aatttaaatgcacataactatcacttttttgtttgtttcggcttttaaaa
ggatttttctgtatacccttgactagcttgggcttcagtacaaaagtctg
cctgcttctctgtcccatgtgttggattgtaggcaggagtcactctgcct
atacatcattctctatttagcttttgctgtgtgcagacaccttaattgcc
ttaaatctaagcctgtgtcaatggat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_103775242_103776041
seq2: B6Ng01-066N07.b_46_845

seq1  GAATTCTTTACCTAAGTTTGAGATCCTGTGAAATTTTTCCCCTCCACATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTACCTAAGTTTGAGATCCTGTGAAATTTTTCCCCTCCACATC  50

seq1  GACATGCCAAATGAGGCTTCAGATATTATTTATGCAATGATATTGTAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATGCCAAATGAGGCTTCAGATATTATTTATGCAATGATATTGTAGAG  100

seq1  ATATCCTGGATGTATCTTCCCTATCCTATCTAATACACAGAATCTTAGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCTGGATGTATCTTCCCTATCCTATCTAATACACAGAATCTTAGCA  150

seq1  TATTTTCTTGATCTGGAAAGAGCTGAAGTGATCTTTATATATTACGTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTCTTGATCTGGAAAGAGCTGAAGTGATCTTTATATATTACGTTGT  200

seq1  ATTTATACATTAAGTTGTATTTAGCATCAAAAGTGAAGGCATGTGCTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATACATTAAGTTGTATTTAGCATCAAAAGTGAAGGCATGTGCTATA  250

seq1  AACTCGGAAACATTATGAGAACAATATTTAGAACAAAGTGGGTATGTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCGGAAACATTATGAGAACAATATTTAGAACAAAGTGGGTATGTGCT  300

seq1  ATATCACTTTTTCTTCCCTATGTTCCAAATGATCCCTAAAACTTAGATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCACTTTTTCTTCCCTATGTTCCAAATGATCCCTAAAACTTAGATGA  350

seq1  AGTGATTGTGTTGTGAATGTATCAATTGCAATGTATGAACTGACCAGAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATTGTGTTGTGAATGTATCAATTGCAATGTATGAACTGACCAGAGT  400

seq1  CAGTTGTTTTTTTGTTTGGCAAGTTGTGCCTTTAATGATCTTTGCTATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTGTTTTTTTGTTTGGCAAGTTGTGCCTTTAATGATCTTTGCTATTT  450

seq1  TACAAGAATCTTCCTTGGTGAAGGATGATAGCTCTCTTTATCTGTGCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAGAATCTTCCTTGGTGAAGGATGATAGCTCTCTTTATCTGTGCATA  500

seq1  GGTGGGTAGATATTTAGAATGCAGTTACAAATTATACTGGCTTAGAAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGTAGATATTTAGAATGCAGTTACAAATTATACTGGCTTAGAAGGA  550

seq1  TGTAAGTACTAGAATTTCTATGATCCATGACTTATTTAGCCTACAATAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGTACTAGAATTTCTATGATCCATGACTTATTTAGCCTACAATAAT  600

seq1  AGGCTATGTTCTCCACAACAAGCGTGATTTCTCTCCTGGTAAGATGGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTATGTTCTCCACAACAAGCGTGATTTCTCTCCTGGTAAGATGGTCT  650

seq1  TATGTCAAATTACGCAGTTGTTGTTTACCAAGGTGTGAGTGTATCTGTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCAAATTACGCAGTTGTTGTTTACCAAGGTGTGAGTGTATCTGTTA  700

seq1  CAGCATTAGGGGGATCTTGTCATTCTGGTCAATATTGTGGCTCATAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATTAGGGGGATCTTGTCATTCTGGTCAATATTGTGGCTCATAGGAA  750

seq1  TCACAACAGGGTAGAATAATTGAGTTCTTTCAACATTGCCAGCTCAGATC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACAGGGTAGAATAATTGAGTTCTTTCAACATTGCCAGCTCAGATC  800

seq1: chr10_103928405_103928938
seq2: B6Ng01-066N07.g_68_599 (reverse)

seq1  ATCCATTGACACAGGCTTAGATTTAAGGCAATTAAGGTGTCTGCACACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCATTGACACAGGCTTAGATTTAAGGCAATTAAGGTGTCTGCACACAG  50

seq1  CAAAAGCTAAATAGAGAATGATGTATAGGCAGAGTGACTCCTGCCTACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGCTAAATAGAGAATGATGTATAGGCAGAGTGACTCCTGCCTACAA  100

seq1  TCCAACACATGGGACAGAGAAGCAGGCAGACTTTTGTACTGAAGCCCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACACATGGGACAGAGAAGCAGGCAGACTTTTGTACTGAAGCCCAAG  150

seq1  CTAGTCAAGGGTATACAGAAAAATCCTTTTAAAAGCCGAAACAAACAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTCAAGGGTATACAGAAAAATCCTTTTAAAAGCCGAAACAAACAAAA  200

seq1  AAGTGATAGTTATGTGCATTTAAATTAAATTTATGTACAGCAGTGTCAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGATAGTTATGTGCATTTAAATTAAATTTATGTACAGCAGTGTCAAC  250

seq1  AAAATAAAAAAAATTATTTAGTGAGTGTCAGTTAGATACTTTTAAGACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAAAAAAATTATTTAGTGAGTGTCAGTTAGATACTTTTAAGACTT  300

seq1  ATTTAACACTTGGGTTTTCAGTGCAGGAAGTTGAAACTTGGGAGCTTATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACACTTGGGTTTTCAGTGCAGGAAGTTGAAACTTGGGAGCTTATG  350

seq1  TATGCTAGGCAAAAGCTCTATGCTAACTCCTAGAAATTCTCTCTCTCTCT  400
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  TATGCTAGGCAAAAGCTCTATGCTAACTCCTAGAAAT--TCTCTCTCTCT  398

seq1  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCTGT  448

seq1  TTCCCAGTATCTCTCTCCTCTCTCTTTTCCTTTATTTTTTTTTTTCTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAGTATCTCTCTCCTCTCTCTTTTCCTTTATTTTTTTTTTTCTGTA  498

seq1  CAAAGTCATAAGTTATCAACCTAACTATGAATTC  534
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTCATAAGTTATCAACCTAACTATGAATTC  532