BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067P07
Chromosome10 (Build37)
Map Location 92,273,755 - 92,454,581
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm872, 4930485B16Rik
Upstream geneLOC100041799, LOC667203, LOC216229, LOC100041814, Nedd1
Downstream geneEG667314, Pctk2, Elk3, LOC100041854, Lta4h, Hal, Amdhd1, Ccdc38, Snrpf, LOC100041873, Ntn4, LOC667338, LOC100041907, Usp44, Metap2, Vezt
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067P07.bB6Ng01-067P07.g
ACCDH886686DH886687
length9021,088
definitionDH886686|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067P07, 5' end.DH886687|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067P07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,273,755 - 92,274,656)(92,453,477 - 92,454,581)
sequence
gaattcagcctcagcgaggccatgttgctcagactgtaatggacaccacg
ttcacacactgtggaactggctgacttgaaaccggagccctgaacacctc
atgtgaccttgttgccacagacttggagaaagcgctcagctcagcattcc
tagccagatgtggtgtgaagcttgctgcatttggtaggtgtcacagagag
gtggggtgacccttagtcaggctttgcccttttcctttcagagaaacaca
catgagttcagagacggacctccgagcaactccgacatgctaaagctaat
tctcgtacttagtccgaatcctcgtcctctttgacctacagtgagatttg
aaatgcttcctaacttgttttctggccttgaaatccctgtttccacctct
cttgtcactgtcatggtcatcaaattgttgggtgaatgccattcatcttt
caattcctcccaaccccagactgatttccacacagcgcattcctatagag
caaagtccattcaccatttttttagtcaccatccgtggactgctccccac
aagtcgtggggttaagtgggagtcagagatgagcaagacaacttacggag
accgctacatatgtattactgtgccctaaatgtttataaataacagtttc
tcagaaatggagaatgctaaagccagagtatgtgcattttcttctccagg
cctccacaaccatggtgcttctatatttgggacctttaatatactaattt
ccattcatttatactgttcaggccttccataaatacctgctgaagtaacc
ttatgcattttggcaaatatatagtgagcttcttacatctacctattctt
ttttttttaaacattttatttatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgta
tg
gaattcaagaagaagaaaccgaggttgtgccaggttgtgccaggctggga
ggggactaattaaaccaaagtaagaagcaaggaagagtgagagcgttcct
ttttaaaggtgaagcattgaaataagtcttaaccatgttaccaagtggat
ggccttagaagacaggcttccaggagggcttgaaatgcaggttctaacac
agacagcactccaagagatacatcttcaagaggacagtggtgatgggcaa
atacctactgacaaaagtgacggagcgagatggtgatcctcacccgaggg
aaagcagtccacaaacattagccagagacaagacgggcactatgcactgt
cctgtggccgtcctgggttgacgtccccctgcagtcggaaggcttcagaa
ctgttacattccagtctcgggacaggctccatgccagtcgtgagagacca
tggcttccctcttggtgattctcagcaccacaaaaagggaaagagtctga
aatgaaagtaaagtctgaactttttttttataacagcaaattgaagaaaa
ataagattgtgtgaaaaatgccacaaagacatttgataacacttaagcaa
cctttcctaagaaaattgctggtgagttcggaatgagagggagctactga
ataatgataagggcatttacctaaattttaaagcaaatatcatactaaat
ggcaaacttctgaagccatttccttaaaaaccaggccaggaaggactttt
aacagggagtcattattttcaggggttccctcttgtgcgctagacatgga
tttgaaatgcctttagaataatagagaggaaaaaaatgtagcttatttgt
aattgtcggggactcaaagatcttgtaaggaacaattagaattataggaa
ggcgactatatcaagtggtatatatataaagcagatatgagtgatagctt
tagtttatgtaagaagcattaggataagggagcagactgtactatttaaa
ctctgcgagtgtcagtggacctgcataaagcactgaaatctggcaaggat
ccataaatctgaactatggcacccaccaagttctgtac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_92273755_92274656
seq2: B6Ng01-067P07.b_45_946

seq1  GAATTCAGCCTCAGCGAGGCCATGTTGCTCAGACTGTAATGGACACCACG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCCTCAGCGAGGCCATGTTGCTCAGACTGTAATGGACACCACG  50

seq1  TTCACACACTGTGGAACTGGCTGACTTGAAACCGGAGCCCTGAACACCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACACTGTGGAACTGGCTGACTTGAAACCGGAGCCCTGAACACCTC  100

seq1  ATGTGACCTTGTTGCCACAGACTTGGAGAAAGCGCTCAGCTCAGCATTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACCTTGTTGCCACAGACTTGGAGAAAGCGCTCAGCTCAGCATTCC  150

seq1  TAGCCAGATGTGGTGTGAAGCTTGCTGCATTTGGTAGGTGTCACAGAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAGATGTGGTGTGAAGCTTGCTGCATTTGGTAGGTGTCACAGAGAG  200

seq1  GTGGGGTGACCCTTAGTCAGGCTTTGCCCTTTTCCTTTCAGAGAAACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGTGACCCTTAGTCAGGCTTTGCCCTTTTCCTTTCAGAGAAACACA  250

seq1  CATGAGTTCAGAGACGGACCTCCGAGCAACTCCGACATGCTAAAGCTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTTCAGAGACGGACCTCCGAGCAACTCCGACATGCTAAAGCTAAT  300

seq1  TCTCGTACTTAGTCCGAATCCTCGTCCTCTTTGACCTACAGTGAGATTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGTACTTAGTCCGAATCCTCGTCCTCTTTGACCTACAGTGAGATTTG  350

seq1  AAATGCTTCCTAACTTGTTTTCTGGCCTTGAAATCCCTGTTTCCACCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTTCCTAACTTGTTTTCTGGCCTTGAAATCCCTGTTTCCACCTCT  400

seq1  CTTGTCACTGTCATGGTCATCAAATTGTTGGGTGAATGCCATTCATCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTCACTGTCATGGTCATCAAATTGTTGGGTGAATGCCATTCATCTTT  450

seq1  CAATTCCTCCCAACCCCAGACTGATTTCCACACAGCGCATTCCTATAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCCTCCCAACCCCAGACTGATTTCCACACAGCGCATTCCTATAGAG  500

seq1  CAAAGTCCATTCACCATTTTTTTAGTCACCATCCGTGGACTGCTCCCCAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTCCATTCACCATTTTTTTAGTCACCATCCGTGGACTGCTCCCCAC  550

seq1  AAGTCGTGGGGTTAAGTGGGAGTCAGAGATGAGCAAGACAACTTACGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCGTGGGGTTAAGTGGGAGTCAGAGATGAGCAAGACAACTTACGGAG  600

seq1  ACCGCTACATATGTATTACTGTGCCCTAAATGTTTATAAATAACAGTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCTACATATGTATTACTGTGCCCTAAATGTTTATAAATAACAGTTTC  650

seq1  TCAGAAATGGAGAATGCTAAAGCCAGAGTATGTGCATTTTCTTCTCCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAATGGAGAATGCTAAAGCCAGAGTATGTGCATTTTCTTCTCCAGG  700

seq1  CCTCCACAACCATGGTGCTTCTATATTTGGGACCTTTAATATACTAATTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCACAACCATGGTGCTTCTATATTTGGGACCTTTAATATACTAATTT  750

seq1  CCATTCATTTATACTGTTCAGGCCTTCCATAAATACCTGCTGAAGTAACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCATTTATACTGTTCAGGCCTTCCATAAATACCTGCTGAAGTAACC  800

seq1  TTATGCATTTTGGCAAATATATAGTGAGCTTCTTACATCTACCTATTCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCATTTTGGCAAATATATAGTGAGCTTCTTACATCTACCTATTCTT  850

seq1  TTTTTTTTAAACATTTTATTTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTAAACATTTTATTTATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTA  900

seq1  TG  902
      ||
seq2  TG  902

seq1: chr10_92453477_92454581
seq2: B6Ng01-067P07.g_69_1156 (reverse)

seq1  GTACAGGAACTTGGTGTGGTGTGCCATATGCTCAGATTTTAATGTGTATC  50
      ||||| |||||||||   | |||||||| | |||||||    | || |||
seq2  GTACA-GAACTTGGT---GGGTGCCATA-GTTCAGATT----TATGGATC  41

seq1  CTTGGCAAGATTTCAGTGCTTTTATGCAGGTTCACTGACACTTCGCAGAG  100
      ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||
seq2  CTT-GCCAGATTTCAGTGC-TTTATGCAGGTCCACTGACAC-TCGCAGAG  88

seq1  TTTTAAATAGTACAGTCTGCTCCCTTTATTCCTAATGCTTCCTTACATAA  150
       |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||
seq2  -TTTAAATAGTACAGTCTGCTCCCTT--ATCCTAATGCTT-CTTACATAA  134

seq1  ACTAAAGCTATCACTCATATCTGCTTAATATATATACCCACTTGATATAG  200
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2  ACTAAAGCTATCACTCATATCTGCTTTATATATATA-CCACTTGATATAG  183

seq1  TCGCCTTCCTATAATTCTAATTGTTCCTTACAAGATCTTTGAGTCCCCGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGCCTTCCTATAATTCTAATTGTTCCTTACAAGATCTTTGAGTCCCCGA  233

seq1  CAATTACAAATAAGCTACATTTTTTTCCTCTCTATTATTCTAAAGGCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTACAAATAAGCTACATTTTTTTCCTCTCTATTATTCTAAAGGCATT  283

seq1  TCAAATCCATGTCTAGCGCACAAGAGGGAACCCCTGAAAATAATGACTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCCATGTCTAGCGCACAAGAGGGAACCCCTGAAAATAATGACTCC  333

seq1  CTGTTAAAAGTCCTTCCTGGCCTGGTTTTTAAGGAAATGGCTTCAGAAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAAAAGTCCTTCCTGGCCTGGTTTTTAAGGAAATGGCTTCAGAAGT  383

seq1  TTGCCATTTAGTATGATATTTGCTTTAAAATTTAGGTAAATGCCCTTATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCATTTAGTATGATATTTGCTTTAAAATTTAGGTAAATGCCCTTATC  433

seq1  ATTATTCAGTAGCTCCCTCTCATTCCGAACTCACCAGCAATTTTCTTAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTCAGTAGCTCCCTCTCATTCCGAACTCACCAGCAATTTTCTTAGG  483

seq1  AAAGGTTGCTTAAGTGTTATCAAATGTCTTTGTGGCATTTTTCACACAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTTGCTTAAGTGTTATCAAATGTCTTTGTGGCATTTTTCACACAAT  533

seq1  CTTATTTTTCTTCAATTTGCTGTTATAAAAAAAAAGTTCAGACTTTACTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTTTCTTCAATTTGCTGTTATAAAAAAAAAGTTCAGACTTTACTT  583

seq1  TCATTTCAGACTCTTTCCCTTTTTGTGGTGCTGAGAATCACCAAGAGGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCAGACTCTTTCCCTTTTTGTGGTGCTGAGAATCACCAAGAGGGA  633

seq1  AGCCATGGTCTCTCACGACTGGCATGGAGCCTGTCCCGAGACTGGAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATGGTCTCTCACGACTGGCATGGAGCCTGTCCCGAGACTGGAATGT  683

seq1  AACAGTTCTGAAGCCTTCCGACTGCAGGGGGACGTCAACCCAGGACGGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGTTCTGAAGCCTTCCGACTGCAGGGGGACGTCAACCCAGGACGGCC  733

seq1  ACAGGACAGTGCATAGTGCCCGTCTTGTCTCTGGCTAATGTTTGTGGACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGACAGTGCATAGTGCCCGTCTTGTCTCTGGCTAATGTTTGTGGACT  783

seq1  GCTTTCCCTCGGGTGAGGATCACCATCTCGCTCCGTCACTTTTGTCAGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCCCTCGGGTGAGGATCACCATCTCGCTCCGTCACTTTTGTCAGTA  833

seq1  GGTATTTGCCCATCACCACTGTCCTCTTGAAGATGTATCTCTTGGAGTGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTGCCCATCACCACTGTCCTCTTGAAGATGTATCTCTTGGAGTGC  883

seq1  TGTCTGTGTTAGAACCTGCATTTCAAGCCCTCCTGGAAGCCTGTCTTCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTGTTAGAACCTGCATTTCAAGCCCTCCTGGAAGCCTGTCTTCTA  933

seq1  AGGCCATCCACTTGGTAACATGGTTAAGACTTATTTCAATGCTTCACCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCATCCACTTGGTAACATGGTTAAGACTTATTTCAATGCTTCACCTT  983

seq1  TAAAAAGGAACGCTCTCACTCTTCCTTGCTTCTTACTTTGGTTTAATTAG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAAGGAACGCTCTCACTCTTCCTTGCTTCTTACTTTGGTTTAATTAG  1033

seq1  TCCCCTCCCAGCCTGGCACAACCTGGCACAACCTCGGTTTCTTCTTCTTG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCCAGCCTGGCACAACCTGGCACAACCTCGGTTTCTTCTTCTTG  1083

seq1  AATTC  1105
      |||||
seq2  AATTC  1088