BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068K03
Chromosome10 (Build37)
Map Location 12,457,155 - 12,576,833
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUtrn, LOC665172
Upstream genenone
Downstream geneStx11, Sf3b5, Plagl1, 4930519B02Rik, Ltv1, LOC666829, Phactr2, LOC100039475, Fuca2, Pex3, Deadc1, Aig1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068K03.bB6Ng01-068K03.g
ACCDH887163DH887164
length1,0731,114
definitionDH887163|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068K03, 5' end.DH887164|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068K03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,575,747 - 12,576,833)(12,457,155 - 12,458,276)
sequence
gaattcactatgtagaccaagctagctttaaactcacagagatccacctg
cctctgcctcctgagctctggtgttaaagacatgtgccaccatatctaga
ctttacattttaaagtaggtctttggtaatttcatacaatatattatggt
catattctcccccttcttaaacatctctcagatctactcttccttcccta
ctcacacaaatttgcttccttttttttttttccccctgaatccagtttgt
atttccatatactcttgagtggctatccactgggtggcctggttgacctt
ccaggggttggtttgaaggacagcggctcccatgggctctgtgtttgaat
acagggtccctcactgatggacctgcttgggaaaaaccaggaacttttgc
ccttgttggaggagttggaccactgtgggtgaactttagggttttgaaag
tctcagcccaataccagtattcctctctctgtttcctgcttttggatcaa
gatatgagctcttagctcacaaaaccaaccaaccatccaactaaccaacc
acttattgccctcgttccatcttaagttgtgcatcagattcgtaattcag
tgtttaaaagccattttgccatctgaagagaaatacctagcaccagttac
ttgcatgtcgcccccaggattcggatgagggatgaaaacgacagaaaagc
gggggtcttgtgggatgcgctgactgatgtagcttagcgtgcttattata
tacagtttaacagggaggtgggcttattacatacacctggaaatagaggc
ctgtttccctaagcttgctaggagcagtctctataagagagcagcctcta
agactgtaaacattggaggaataggggagttatggaagacattttctgca
acactgtcagatccacaatctaattgaggaatgcctagccatcctttgag
tctcaccagggagggcgtgccacttccagaggctgaggcatggctgtgct
ccatcaacaccactcactctgggctcactctgccctacaactaagtgatc
aagtaggcactgggatagtttaa
gaattcctggcgtattaaattggtggaaacggcaccggaacgcgaatcac
aacgtggaaagtgaaacagaccatggtataagcctgctctttaaactgtt
acagaccactgaacagtaagtaggcccgtggcacactgtcctgtggtgac
agcctcaatgagggggctgtctaaatgaggttaacctgaggccttgtctg
tggggagctgcattgattattaacctaattgatataggaaggctagtctg
aaaccgagcagcaccactccctggttggggccctggactgtatgaaagta
aagaaagccagttgggcactagcatgggcacagtcattcttctctgctcc
tcactgtgcagtgacatgactactgaattcaagctcccactcctcggggg
tccccaaaatgagaccaaaacctggaattgttagctaaaataaatccttt
cctcccttaagttgcctttttggccagggtgttttatcactgtaacaaat
ataaaattacaatatcacccatgcaaaatataacttcccctcttactacc
ctctgcattccaactgtcctctatgatcttgacagagatgagactcacag
agcggtgtgaggacagtggaaggcttgccctgtactgattttagtcacag
ccccgcaggcctgtacttgagtgtcactgtgcactgtggtctggggagtc
aggctctcggtccttgagctccactcaccgggactgcctctccatgctct
ccacccggagcgccctcccaccttgcattcagcaaggtcatctgttcctg
gatctcaaactcctcctcctctgacagagtcccttgtgtcatcagctggt
tgccagcctgcaggacgctccccacgctgctctggtgtgctgtcagctcc
atctaaaagtctagcaaaggagattgtggtagttagtgagtcacttgctg
cgagacttgaaacacatactggtagtgcataagctcaccagcacgctcca
gaagaaaggacctggtgcaaagcaagacggaggaggcttcaccaaggtgg
aagctctgaatagaaggtttggtattaccctaacttcaagagaagcttag
atctaagatacaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_12575747_12576833
seq2: B6Ng01-068K03.b_49_1121 (reverse)

seq1  TTAAACTATCCCAGTGCCTACCTTTGATCACTTAGTTGTAGGGCAGGAGT  50
      |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTAAACTATCCCAGTGCCTAC--TTGATCACTTAGTTGTAGGGCA-GAGT  47

seq1  GAAGCCCAGAGTGAGTGTGTTGTTGATGTGAGCACAGCCATGCCTCAGCC  100
      | ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  G-AGCCCAGAGTGA--GTGGTGTTGATG-GAGCACAGCCATGCCTCAGCC  93

seq1  TCCTGGAAGTGGCCACGCCCTCCCTGGGTGAGACTCAAAGGGATGGCTAG  150
      | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
seq2  T-CTGGAAGTGG-CACGCCCTCCCT-GGTGAGACTCAAA-GGATGGCTAG  139

seq1  GCATTCCTCAAATTAGATTGTGGATCTTGACAGTGTTTGCAGAAAATGTC  200
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||
seq2  GCATTCCTC-AATTAGATTGTGGATC-TGACAGTG-TTGCAGAAAATGTC  186

seq1  TTCCATAACTCCCCTATTCCTCCAATGTTTACAGTCTTAGAGGCTGCTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATAACTCCCCTATTCCTCCAATGTTTACAGTCTTAGAGGCTGCTCT  236

seq1  CTTATAGAGACTGCTCCTAGCAAGCTTAGGGAAACAGGCCTCTATTTCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAGAGACTGCTCCTAGCAAGCTTAGGGAAACAGGCCTCTATTTCCA  286

seq1  GGTGTATGTAATAAGCCCACCTCCCTGTTAAACTGTATATAATAAGCACG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTATGTAATAAGCCCACCTCCCTGTTAAACTGTATATAATAAGCACG  336

seq1  CTAAGCTACATCAGTCAGCGCATCCCACAAGACCCCCGCTTTTCTGTCGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCTACATCAGTCAGCGCATCCCACAAGACCCCCGCTTTTCTGTCGT  386

seq1  TTTCATCCCTCATCCGAATCCTGGGGGCGACATGCAAGTAACTGGTGCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATCCCTCATCCGAATCCTGGGGGCGACATGCAAGTAACTGGTGCTA  436

seq1  GGTATTTCTCTTCAGATGGCAAAATGGCTTTTAAACACTGAATTACGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTTCTCTTCAGATGGCAAAATGGCTTTTAAACACTGAATTACGAAT  486

seq1  CTGATGCACAACTTAAGATGGAACGAGGGCAATAAGTGGTTGGTTAGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGCACAACTTAAGATGGAACGAGGGCAATAAGTGGTTGGTTAGTTG  536

seq1  GATGGTTGGTTGGTTTTGTGAGCTAAGAGCTCATATCTTGATCCAAAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTGGTTGGTTTTGTGAGCTAAGAGCTCATATCTTGATCCAAAAGC  586

seq1  AGGAAACAGAGAGAGGAATACTGGTATTGGGCTGAGACTTTCAAAACCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAACAGAGAGAGGAATACTGGTATTGGGCTGAGACTTTCAAAACCCT  636

seq1  AAAGTTCACCCACAGTGGTCCAACTCCTCCAACAAGGGCAAAAGTTCCTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTCACCCACAGTGGTCCAACTCCTCCAACAAGGGCAAAAGTTCCTG  686

seq1  GTTTTTCCCAAGCAGGTCCATCAGTGAGGGACCCTGTATTCAAACACAGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTCCCAAGCAGGTCCATCAGTGAGGGACCCTGTATTCAAACACAGA  736

seq1  GCCCATGGGAGCCGCTGTCCTTCAAACCAACCCCTGGAAGGTCAACCAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCATGGGAGCCGCTGTCCTTCAAACCAACCCCTGGAAGGTCAACCAGG  786

seq1  CCACCCAGTGGATAGCCACTCAAGAGTATATGGAAATACAAACTGGATTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCAGTGGATAGCCACTCAAGAGTATATGGAAATACAAACTGGATTC  836

seq1  AGGGGGAAAAAAAAAAAAGGAAGCAAATTTGTGTGAGTAGGGAAGGAAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGAAAAAAAAAAAAGGAAGCAAATTTGTGTGAGTAGGGAAGGAAGA  886

seq1  GTAGATCTGAGAGATGTTTAAGAAGGGGGAGAATATGACCATAATATATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATCTGAGAGATGTTTAAGAAGGGGGAGAATATGACCATAATATATT  936

seq1  GTATGAAATTACCAAAGACCTACTTTAAAATGTAAAGTCTAGATATGGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAAATTACCAAAGACCTACTTTAAAATGTAAAGTCTAGATATGGTG  986

seq1  GCACATGTCTTTAACACCAGAGCTCAGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATGTCTTTAACACCAGAGCTCAGGAGGCAGAGGCAGGTGGATCTCT  1036

seq1  GTGAGTTTAAAGCTAGCTTGGTCTACATAGTGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTTTAAAGCTAGCTTGGTCTACATAGTGAATTC  1073

seq1: chr10_12457155_12458276
seq2: B6Ng01-068K03.g_68_1181

seq1  GAATTCCTGGCGTATTAAATTGGTGGAAACGGCACCGGAACGCGAATCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGGCGTATTAAATTGGTGGAAACGGCACCGGAACGCGAATCAC  50

seq1  AACGTGGAAAGTGAAACAGACCATGGTATAAGCCTGCTCTTTAAACTGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGGAAAGTGAAACAGACCATGGTATAAGCCTGCTCTTTAAACTGTT  100

seq1  ACAGACCACTGAACAGTAAGTAGGCCCGTGGCACACTGTCCTGTGGTGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCACTGAACAGTAAGTAGGCCCGTGGCACACTGTCCTGTGGTGAC  150

seq1  AGCCTCAATGAGGGGGCTGTCTAAATGAGGTTAACCTGAGGCCTTGTCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCAATGAGGGGGCTGTCTAAATGAGGTTAACCTGAGGCCTTGTCTG  200

seq1  TGGGGAGCTGCATTGATTATTAACCTAATTGATATAGGAAGGCTAGTCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAGCTGCATTGATTATTAACCTAATTGATATAGGAAGGCTAGTCTG  250

seq1  AAACCGAGCAGCACCACTCCCTGGTTGGGGCCCTGGACTGTATGAAAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCGAGCAGCACCACTCCCTGGTTGGGGCCCTGGACTGTATGAAAGTA  300

seq1  AAGAAAGCCAGTTGGGCACTAGCATGGGCACAGTCATTCTTCTCTGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAGCCAGTTGGGCACTAGCATGGGCACAGTCATTCTTCTCTGCTCC  350

seq1  TCACTGTGCAGTGACATGACTACTGAATTCAAGCTCCCACTCCTCGGGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGTGCAGTGACATGACTACTGAATTCAAGCTCCCACTCCTCGGGGG  400

seq1  TCCCCAAAATGAGACCAAAACCTGGAATTGTTAGCTAAAATAAATCCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCAAAATGAGACCAAAACCTGGAATTGTTAGCTAAAATAAATCCTTT  450

seq1  CCTCCCTTAAGTTGCCTTTTTGGCCAGGGTGTTTTATCACTGTAACAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTTAAGTTGCCTTTTTGGCCAGGGTGTTTTATCACTGTAACAAAT  500

seq1  ATAAAATTACAATATCACCCATGCAAAATATAACTTCCCCTCTTACTACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATTACAATATCACCCATGCAAAATATAACTTCCCCTCTTACTACC  550

seq1  CTCTGCATTCCAACTGTCCTCTATGATCTTGACAGAGATGAGACTCACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCATTCCAACTGTCCTCTATGATCTTGACAGAGATGAGACTCACAG  600

seq1  AGCGGTGTGAGGACAGTGGAAGGCTTGCCCTGTACTGATTTTAGTCACAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGGTGTGAGGACAGTGGAAGGCTTGCCCTGTACTGATTTTAGTCACAG  650

seq1  CCCCGCAGGCCTGTACTTGAGTGTCACTGTGCACTGTGGTCTGGGGAGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCGCAGGCCTGTACTTGAGTGTCACTGTGCACTGTGGTCTGGGGAGTC  700

seq1  AGGCTCTCGGTCCTTGAGCTCCACTCACCGGGACTGCCTCTCCATGCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTCTCGGTCCTTGAGCTCCACTCACCGGGACTGCCTCTCCATGCTCT  750

seq1  CCACCCGGAGCG-CCTCCCACCTTGCATTCAGCAAGGTCATCTGTTCCTG  799
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCGGAGCGCCCTCCCACCTTGCATTCAGCAAGGTCATCTGTTCCTG  800

seq1  GATCTCAAACTCCTCCTCCTCTGACAGAGTCCCTTGTGTCATCAGCTGGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCAAACTCCTCCTCCTCTGACAGAGTCCCTTGTGTCATCAGCTGGT  850

seq1  TGCCAGCCTGCAGGACGCTCCCCACGCTGCTCTGGTGTGCTGTCAGCTCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGCCTGCAGGACGCTCCCCACGCTGCTCTGGTGTGCTGTCAGCTCC  900

seq1  ATCATAAAAGTCTAGCAAAGGAGATTGTGGTAGTTAGTGAGTCACTTGCT  949
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATC-TAAAAGTCTAGCAAAGGAGATTGTGGTAGTTAGTGAGTCACTTGCT  949

seq1  GCGAAGACATGAAACAACAAACTGGTAGTGCATAAGCCCAACAGCAACGC  999
      ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||
seq2  GCG-AGACTTGAAAC-ACATACTGGTAGTGCATAAGCTCACCAGC-ACGC  996

seq1  CCCAG-AGAAAGGAACCTGTGCAAAGCAAAGACGGAGGAGGCTTTCACCA  1048
       |||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||| 
seq2  TCCAGAAGAAAGGACCTGGTGCAAAGC-AAGACGGAGGAGGC-TTCACC-  1043

seq1  AAGGTGGAAAGCTCTGAAATGAGAGATTTGGTATTAACCATAAC-TCAAG  1097
      ||||||| ||||||||||  || || ||||||||| ||| |||| |||||
seq2  AAGGTGG-AAGCTCTGAATAGA-AGGTTTGGTATT-ACCCTAACTTCAAG  1090

seq1  AGAAAGCTAGATCAAAGAAAACAAT  1122
      ||||   |||||| ||| | |||||
seq2  AGAAGCTTAGATCTAAG-ATACAAT  1114