BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068K19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,135,126 - 90,274,479
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneScyl2, Actr6, E030041M21Rik, E530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068K19.bB6Ng01-068K19.g
ACCDH887193DH887194
length1,1761,026
definitionDH887193|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068K19, 5' end.DH887194|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068K19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,135,126 - 90,136,311)(90,273,445 - 90,274,479)
sequence
gaattcttccccaaatttcaggtgctggtctacagtatgtatgtttcttg
tgccacagaattatccatatcattctgctgtatggtggttttttcccgtg
gctattaaagctaccacaaagccaaatgtctaaattagaaacttgagaca
ttctcctacagattcccattctcatctctatataactatggcaactggat
gatggtgggtttgacagaaagatgcccacagatgcagttaagggaaagag
aaaatttttttgatgtcaataaatgtgaacacttatgaatacacagagca
aaaggcagtgcagcatgctgccaaatgcaggtactaattccgtatgaatg
ttcctatgactaccttatttccacttatacttatatgcaaataaaagcta
tgctaccaaaaacaaagagcttcaaaatacaacagtttggagaacacaac
attggtctctagcacataacagttctgaaatgaacagtctgggtttataa
attggctctttattctgcaattctagaaggaatcaagaccttcgctctgt
ccctctgccatcctctaaatcatgtctactctaggtgacccagggactgg
cagtgttagcatcaccatagtgcttgtgggaagttcagtacctcagagag
tccctccaacccaactcaaggagactcacaagtcagcaggctgccatgag
attccaacacagtgaggactccgatgcactgtttttcccatgtggtcagc
actatcctgtgggcattgacattccagaacatggaaagattttaaaaagg
actaaaacctccagagcaaagagggttacgtgacaaattttcattaggct
cctgtaggtataaacctatctcataaatatcagcccccaaaagctgatgt
gtcttgtggtctattgagcaatcgtaagcccaccctttagatagaggaac
atctgtctctaattgtgtgacacttcctgacagcagcatctacctgatcc
attattggtggttagatgttccttatcccttgatctattttccatgctag
tataataatccattttagtactggtgcaacctccttttaatatccttaac
cccaaaaatgataatacatccttcattcccttgtctgtaatattggtaag
tgatttttctgggggtgtgtttgttg
gaattcaggtcctctgtaagagcagcaggcactcttaacagctgagccat
ctctggagtcccgtggcctctccagcttctacaagtaaattaagaggtcc
gccggaaatccctgggggaaatcccaacagacacttagctctggttcaga
gagaaggcaggctctttccagctcagggggtcaacacaaaatgacatgaa
attcactggtcttcatggctcagagaaaagtttccttggagatcacttag
ttcaggcattgctaactgctggccttagtacttctttatttcacatatca
ttattcgttcctactttttttttttaattaggactcctttggctggggca
tgttttcatttctccacattccgtatcatgtcctatcctaagtacatttc
attcactcggataatcaaggcattcagtataatttagtacaacccacact
ttaccttctacacagcaaagctccatatagagaggtctccaccttcctcg
ttaacttattcctcttagatcctgtgatggtttgtatatgtttggctcag
ggagtggccccattagaaggcatggccctgttggagtaggtgtgtcactg
ggtgtaggctttaggaccctcatcctagcttcctggaagtcagtcttctc
ctagcaatcttcagatgaagatgtagaactctcaactcctcctgcaccat
gcctgcctggatgctgccatgttcccaccttgatgataatggactgaccc
tctgaccctgccagccccaattaaatgttatctttataagagttgccttg
gtcatggtgtctgttcatagcagtaaaaccctcagtaataaagatcctta
tctcactctctgcagtggcaagatggccagtccttctggctaaatctagt
ttctcatttctcccagaccctcaaggctcagactatattctgtaggtcta
taggtgatactggagtagacatgggctcctatccattaaccggagtttag
aagaaaatatgcatggtgtaagggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90135126_90136311
seq2: B6Ng01-068K19.b_44_1219

seq1  GAATTCTTCCCCAAATTTCAGGTGCTGGTCTACAGTATGTATGTTTCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCCCAAATTTCAGGTGCTGGTCTACAGTATGTATGTTTCTTG  50

seq1  TGCCACAGAATTATCCATATCATTCTGCTGTATGGTGGTTTTTTCCCGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCACAGAATTATCCATATCATTCTGCTGTATGGTGGTTTTTTCCCGTG  100

seq1  GCTATTAAAGCTACCACAAAGCCAAATGTCTAAATTAGAAACTTGAGACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTAAAGCTACCACAAAGCCAAATGTCTAAATTAGAAACTTGAGACA  150

seq1  TTCTCCTACAGATTCCCATTCTCATCTCTATATAACTATGGCAACTGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTACAGATTCCCATTCTCATCTCTATATAACTATGGCAACTGGAT  200

seq1  GATGGTGGGTTTGACAGAAAGATGCCCACAGATGCAGTTAAGGGAAAGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTGGGTTTGACAGAAAGATGCCCACAGATGCAGTTAAGGGAAAGAG  250

seq1  AAAATTTTTTTGATGTCAATAAATGTGAACACTTATGAATACACAGAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTTTTTTGATGTCAATAAATGTGAACACTTATGAATACACAGAGCA  300

seq1  AAAGGCAGTGCAGCATGCTGCCAAATGCAGGTACTAATTCCGTATGAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCAGTGCAGCATGCTGCCAAATGCAGGTACTAATTCCGTATGAATG  350

seq1  TTCCTATGACTACCTTATTTCCACTTATACTTATATGCAAATAAAAGCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTATGACTACCTTATTTCCACTTATACTTATATGCAAATAAAAGCTA  400

seq1  TGCTACCAAAAACAAAGAGCTTCAAAATACAACAGTTTGGAGAACACAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCAAAAACAAAGAGCTTCAAAATACAACAGTTTGGAGAACACAAC  450

seq1  ATTGGTCTCTAGCACATAACAGTTCTGAAATGAACAGTCTGGGTTTATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTCTCTAGCACATAACAGTTCTGAAATGAACAGTCTGGGTTTATAA  500

seq1  ATTGGCTCTTTATTCTGCAATTCTAGAAGGAATCAAGACCTTCGCTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTCTTTATTCTGCAATTCTAGAAGGAATCAAGACCTTCGCTCTGT  550

seq1  CCCTCTGCCATCCTCTAAATCATGTCTACTCTAGGTGACCCAGGGACTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTGCCATCCTCTAAATCATGTCTACTCTAGGTGACCCAGGGACTGG  600

seq1  CAGTGTTAGCATCACCATAGTGCTTGTGGGAAGTTCAGTACCTCAGAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTAGCATCACCATAGTGCTTGTGGGAAGTTCAGTACCTCAGAGAG  650

seq1  TCCCTCCAACCCAACTCAAGGAGACTCACAAGTCAGCAGGCTGCCATGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCAACCCAACTCAAGGAGACTCACAAGTCAGCAGGCTGCCATGAG  700

seq1  ATTCCAACACAGTGAGGACTCCGATGCACTGTTTTTCCCATGTGGTCAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAACACAGTGAGGACTCCGATGCACTGTTTTTCCCATGTGGTCAGC  750

seq1  ACTATCCTGTGGGCATTGACATTCCAGAACATGGAAAGATTTTAAAAAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATCCTGTGGGCATTGACATTCCAGAACATGGAAAGATTTTAAAAAGG  800

seq1  ACTAAAACCTCCAGAGCAAAGAGGGTTACGTGACAAATTTTCATTAGGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAACCTCCAGAGCAAAGAGGGTTACGTGACAAATTTTCATTAGGCT  850

seq1  CCTGTTAGGTATAAACCTATCTCAT-AATATCAGCCCCCAAAAGCTGATG  899
      |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTG-TAGGTATAAACCTATCTCATAAATATCAGCCCCCAAAAGCTGATG  899

seq1  TGTCTTGTGGTCTAATTGAGCAATCGTAAGCCCACCCTTTAGATAGAGGA  949
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTGTGGTCT-ATTGAGCAATCGTAAGCCCACCCTTTAGATAGAGGA  948

seq1  ACATCTGTCTCTAATTGTGTGACACTTCCTGACAGCAGCATCTACCTGAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGTCTCTAATTGTGTGACACTTCCTGACAGCAGCATCTACCTGAT  998

seq1  CCATTATTGGTGTTAGGATGTTCCTTATCCCTTGATCTATTTTCCATGCT  1049
      |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTATTGGTGGTTAGATGTTCCTTATCCCTTGATCTATTTTCCATGCT  1048

seq1  AGTATCATAGTTCCATTTTAGTAACTTGCTGCAAACTGCTTTTATATTCC  1099
      ||||| |||  ||||||||||||   || ||||| || |||||| ||  |
seq2  AGTATAATA-ATCCATTTTAGTA--CTGGTGCAACCTCCTTTTA-ATATC  1094

seq1  TTTAACCACAAATATGATATATACCATCCTTCATTTCCCTTTGTCTGTTA  1149
       |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |
seq2  CTTAACCCCAAAAATGATA-ATA-CATCCTTCATT--CCCTTGTCTGTAA  1140

seq1  TTAGTTGGTTAGTTGATTTTTCTGGGGGT-TG-TTGTTG  1186
      |   ||||| || |||||||||||||||| || ||||||
seq2  T--ATTGGTAAG-TGATTTTTCTGGGGGTGTGTTTGTTG  1176

seq1: chr10_90273445_90274479
seq2: B6Ng01-068K19.g_70_1095 (reverse)

seq1  TCCCCTCTACA-CATGCATCTTTCTCTTTCTAAATACTCCGGTTTTATTG  49
      |||||| |||| ||||||| ||| || ||||||  |||||||  ||| ||
seq2  TCCCCT-TACACCATGCATATTT-TC-TTCTAA--ACTCCGG--TTAATG  43

seq1  GATTAGGGGCCCATGTCTACTTCAGTATCACCTATGAGACCTACAGAATA  99
      || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GA-TAGGAGCCCATGTCTACTCCAGTATCACCTAT-AGACCTACAGAATA  91

seq1  TAGTCTTGAGCCTTGAGGGTCTTGGGTGAAATGAGAAACTAGATTTAGCA  149
      ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| 
seq2  TAGTC-TGAGCCTTGAGGGTC-TGGGAGAAATGAGAAACTAGATTTAGCC  139

seq1  AG-AGGACTGGCCATCTTGCCACTGCAGAGAGTGAGATAAGGATCTTTAT  198
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGACTGGCCATCTTGCCACTGCAGAGAGTGAGATAAGGATCTTTAT  189

seq1  TACTGAGGGTTTTACTGCTATGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGAGGGTTTTACTGCTATGAACAGACACCATGACCAAGGCAACTCTT  239

seq1  ATAAAGATAACATTTAATTGGGGCTGGCAGGGTCAGAGGGTCAGTCCATT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGATAACATTTAATTGGGGCTGGCAGGGTCAGAGGGTCAGTCCATT  289

seq1  ATCATCAAGGTGGGAACATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGTGCAGGAGG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCAAGGTGGGAACATGGCAGCATCCAGGCAGGCATGGTGCAGGAGG  339

seq1  AGTTGAGAGTTCTACATCTTCATCTGAAGATTGCTAGGAGAAGACTGACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGAGAGTTCTACATCTTCATCTGAAGATTGCTAGGAGAAGACTGACT  389

seq1  TCCAGGAAGCTAGGATGAGGGTCCTAAAGCCTACACCCAGTGACACACCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGAAGCTAGGATGAGGGTCCTAAAGCCTACACCCAGTGACACACCT  439

seq1  ACTCCAACAGGGCCATGCCTTCTAATGGGGCCACTCCCTGAGCCAAACAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAACAGGGCCATGCCTTCTAATGGGGCCACTCCCTGAGCCAAACAT  489

seq1  ATACAAACCATCACAGGATCTAAGAGGAATAAGTTAACGAGGAAGGTGGA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAACCATCACAGGATCTAAGAGGAATAAGTTAACGAGGAAGGTGGA  539

seq1  GACCTCTCTATATGGAGCTTTGCTGTGTAGAAGGTAAAGTGTGGGTTGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCTCTATATGGAGCTTTGCTGTGTAGAAGGTAAAGTGTGGGTTGTA  589

seq1  CTAAATTATACTGAATGCCTTGATTATCCGAGTGAATGAAATGTACTTAG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATTATACTGAATGCCTTGATTATCCGAGTGAATGAAATGTACTTAG  639

seq1  GATAGGACATGATACGGAATGTGGAGAAATGAAAACATGCCCCAGCCAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGACATGATACGGAATGTGGAGAAATGAAAACATGCCCCAGCCAAA  689

seq1  GGAGTCCTAATTAAAAAAAAAAAGTAGGAACGAATAATGATATGTGAAAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCCTAATTAAAAAAAAAAAGTAGGAACGAATAATGATATGTGAAAT  739

seq1  AAAGAAGTACTAAGGCCAGCAGTTAGCAATGCCTGAACTAAGTGATCTCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGTACTAAGGCCAGCAGTTAGCAATGCCTGAACTAAGTGATCTCC  789

seq1  AAGGAAACTTTTCTCTGAGCCATGAAGACCAGTGAATTTCATGTCATTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAACTTTTCTCTGAGCCATGAAGACCAGTGAATTTCATGTCATTTT  839

seq1  GTGTTGACCCCCTGAGCTGGAAAGAGCCTGCCTTCTCTCTGAACCAGAGC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGACCCCCTGAGCTGGAAAGAGCCTGCCTTCTCTCTGAACCAGAGC  889

seq1  TAAGTGTCTGTTGGGATTTCCCCCAGGGATTTCCGGCGGACCTCTTAATT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTCTGTTGGGATTTCCCCCAGGGATTTCCGGCGGACCTCTTAATT  939

seq1  TACTTGTAGAAGCTGGAGAGGCCACGGGACTCCAGAGATGGCTCAGCTGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGTAGAAGCTGGAGAGGCCACGGGACTCCAGAGATGGCTCAGCTGT  989

seq1  TAAGAGTGCCTGCTGCTCTTACAGAGGACCTGAATTC  1035
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGTGCCTGCTGCTCTTACAGAGGACCTGAATTC  1026