BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073F19
Chromosome10 (Build37)
Map Location 87,210,234 - 87,234,475
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNt5dc3, C630002B14Rik, Stab2, 1700113H08Rik, Ascl1, Pah, LOC100041517
Downstream geneENSMUSG00000058934, Igf1, Tyms-ps, Pmch, 4930547N16Rik, EG626115, Nup37, Ccdc53, LOC667000, 1200002N14Rik, Gnptab, Sycp3, Chpt1, 8030451F13Rik, LOC667046, LOC627414, LOC100042998, EG435236, Spic, EG237433, Arl1, Utp20
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073F19.bB6Ng01-073F19.g
ACCDH890518DH890519
length1,1051,072
definitionDH890518|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073F19, 5' end.DH890519|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073F19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(87,210,234 - 87,211,355)(87,233,412 - 87,234,475)
sequence
gaattcatagcccacacctcttctttgtgtacactttgtttggcttcaat
tctactgccgacccacatgattgagaagggccattgaccttcttttccta
aaccccagatggtgtcctgtcaccaggacatcaggatagatgtggggcac
tctcttccagccctctgtccttgtccttgtcccatcttgcagggtgttaa
catatctccatatgtgaatgtccccctcataaaaatcctggatctcattt
cttcttggatctgcactatggtctgactccttaactgagttaggagcaca
acacccacaattcctcttcgttttcccatgtgctgaacttgagtttggat
aatatcttaactgagtgaaagatgatgggtgtgtattaattatttgactg
gtagacacacacacacacacacaaacacacacacacacacacacacaaat
ccctgaaaacagtccataaaattctgacgggacagcatcaagtactatag
atgctctcacatgggtggcaaacacatggttgcctctttgacactgatta
tctgggacaatgctaagctgcttagatttcagcagtctgagctttttcta
taggaccccttcctaatgatacatctccaaacaattgcacttccatgctt
cccaatcctcaaatatgaccatttctttatctctaccacatacagcattt
ggtttttccttttcttgtagcttttctttacaggtttggagtctcagtat
gcacacacacagcagtattaatatctcagactcagaattgctccctttat
cctcaaacatgtattcccacatcacagaagggcagagactgcatgcctca
gctccacctccaactctgtgttcaatacaggacaggcaatacctacccac
atggtaggtgtgtggaaatttttattaatgagtaattgggagatacatac
taatgaaaggtccaggactgatattttctggatccgtgtccagaaatcag
acatatatatctcctagtaaacacatcagttcaaaatataataactggag
attttctggattgaaatatcaattagctaaatgtgcatgcttcgaatatt
attaa
gaattctttggtttcacagtaaagagagtcctgagaacaatacctgcgat
tcagtaccatattgtaagcttgggcactcagaaggccagcctgaactatg
cccccacctctaatgaaagggaacgacacagagaagagctgcatgctttt
atatggctgcttatgatgagcaatttaacttttacagctttattaaatgt
tttatggaaaggtttatttcatgttttattgtagctttgtaggatggcta
catctggccaaacaacttgcagatgaacacaagtgttttataaatattgt
tagtaagcagttgcttggtgaattcatggcttatttggacacatgtacag
gtgggtgggggtggttctccttagtgagctgcaacagtgcagagtgacta
tgaagggggagggaagaaatcaggacaagagaaaagggagcaagtatgac
atgctaatgctgacatgcaagagtaaaggcaagacacattttatggatat
gagtgaatgaagacacttgaattaggaaatatatatcctcaaagcacaga
tagctgggttaaagtttgatttatgaagctaaaaataatatttataggat
ttttattttgtttgccataaaactatgaggtggataagaacataaatgta
acactactacagtattctaagcctgattccaagcaatttgcaagctacat
ctcatataattctttaaaaaatttattgatatttgagaatttcatatatt
gagtactgtgtatatttcctacttctactttcttcaactcctcccatgtt
tcctgattctcaaattcatggccttcttactttcaacttgtttgcatatg
tacacacacacactcacactcactcacacacacacacacacacactctca
cacttgtggatgaatcccaccttctgacttcactaggtgttgctcatatg
tgtatgtgtcactgggagtagactagccagtcggagctcatgttctagca
aagactcatttatctttttcacagttattaattggcctttagcctcttca
tcaaccaaggatgtgaaactgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_87210234_87211355
seq2: B6Ng01-073F19.b_47_1151

seq1  GAATTCATAGCCCACACCTCTTCTTTGTGTACACTTTGTTTGGCTTCAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGCCCACACCTCTTCTTTGTGTACACTTTGTTTGGCTTCAAT  50

seq1  TCTACTGCCGACCCACATGATTGAGAAGGGCCATTGACCTTCTTTTCCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTGCCGACCCACATGATTGAGAAGGGCCATTGACCTTCTTTTCCTA  100

seq1  AACCCCAGATGGTGTCCTGTCACCAGGACATCAGGATAGATGTGGGGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCCAGATGGTGTCCTGTCACCAGGACATCAGGATAGATGTGGGGCAC  150

seq1  TCTCTTCCAGCCCTCTGTCCTTGTCCTTGTCCCATCTTGCAGGGTGTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCCAGCCCTCTGTCCTTGTCCTTGTCCCATCTTGCAGGGTGTTAA  200

seq1  CATATCTCCATATGTGAATGTCCCCCTCATAAAAATCCTGGATCTCATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCTCCATATGTGAATGTCCCCCTCATAAAAATCCTGGATCTCATTT  250

seq1  CTTCTTGGATCTGCACTATGGTCTGACTCCTTAACTGAGTTAGGAGCACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTGGATCTGCACTATGGTCTGACTCCTTAACTGAGTTAGGAGCACA  300

seq1  ACACCCACAATTCCTCTTCGTTTTCCCATGTGCTGAACTTGAGTTTGGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCACAATTCCTCTTCGTTTTCCCATGTGCTGAACTTGAGTTTGGAT  350

seq1  AATATCTTAACTGAGTGAAAGATGATGGGTGTGTATTAATTATTTGACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTTAACTGAGTGAAAGATGATGGGTGTGTATTAATTATTTGACTG  400

seq1  GTAGACACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACACAAAT  450

seq1  CCCTGAAAACAGTCCATAAAATTCTGACGGGACAGCATCAAGTACTATAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAAAACAGTCCATAAAATTCTGACGGGACAGCATCAAGTACTATAG  500

seq1  ATGCTCTCACATGGGTGGCAAACACATGGTTGCCTCTTTGACACTGATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTCACATGGGTGGCAAACACATGGTTGCCTCTTTGACACTGATTA  550

seq1  TCTGGGACAATGCTAAGCTGCTTAGATTTCAGCAGTCTGAGCTTTTTCTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGACAATGCTAAGCTGCTTAGATTTCAGCAGTCTGAGCTTTTTCTA  600

seq1  TAGGACCCCTTCCTAATGATACATCTCCAAACAATTGCACTTCCATGCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACCCCTTCCTAATGATACATCTCCAAACAATTGCACTTCCATGCTT  650

seq1  CCCAATCCTCAAATATGACCATTTCTTTATCTCTACCACATACAGCATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATCCTCAAATATGACCATTTCTTTATCTCTACCACATACAGCATTT  700

seq1  GGTTTTTCCTTTTCTTGTAGCTTTTCTTTACAGGTTTGGAGTCTCAGTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTCCTTTTCTTGTAGCTTTTCTTTACAGGTTTGGAGTCTCAGTAT  750

seq1  GCACACACACAGCAGTATTAATATCTCAGACTCAGAATTGCTCCCTTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACACACAGCAGTATTAATATCTCAGACTCAGAATTGCTCCCTTTAT  800

seq1  CCTCAAACATGTATTCCCACATCACAGAAGGGCAGAGACTGCATGCCTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAACATGTATTCCCACATCACAGAAGGGCAGAGACTGCATGCCTCA  850

seq1  GCTCCACCTCCAACTCTGTGTTCAATACAGGACAGGCAATACCTACCCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCACCTCCAACTCTGTGTTCAATACAGGACAGGCAATACCTACCCAC  900

seq1  ATGGTAGGTGTGTGGAAATTTTTTATTAAATGAGTAATTGGGAGATACAT  950
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGGTGTGTGGAAA-TTTTTATT-AATGAGTAATTGGGAGATACAT  948

seq1  ACTAATGAAAAGGTCCAGGAACTGATATTTTCTGGATCCGTGTTCCAGAA  1000
      ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACTAATG-AAAGGTCCAGG-ACTGATATTTTCTGGATCCGTG-TCCAGAA  995

seq1  ATCAGACATATATATCTCCTAAGTAAACACAATCAGTTTCAAAATTATAA  1050
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||
seq2  ATCAGACATATATATCTCCT-AGTAAACAC-ATCAG-TTCAAAA-TATAA  1041

seq1  TAAACTGGAGGGATTTTCTGGATTTTGAAATATCAATATAGCTACATGTG  1100
      | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||
seq2  T-AACTGGA--GATTTTCTGGA--TTGAAATATCAAT-TAGCTAAATGTG  1085

seq1  CATGCTATTCAGATATTATTAA  1122
      |||||  |||  ||||||||||
seq2  CATGC--TTCGAATATTATTAA  1105

seq1: chr10_87233412_87234475
seq2: B6Ng01-073F19.g_66_1137 (reverse)

seq1  CCAG-TTCACATTCCTGTGTTGATGAAGA-GCTAAAGG-CAATTAATAAC  47
      |||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  CCAGTTTCACA-TCCTTGGTTGATGAAGAGGCTAAAGGCCAATTAATAAC  49

seq1  TGCTGAAAAGATAATTG-GTCTTTGCTAG-ACATGAGCTCCGACTGGCT-  94
      ||   ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| 
seq2  TGTGAAAAAGATAAATGAGTCTTTGCTAGAACATGAGCTCCGACTGGCTA  99

seq1  GTCTACTCCCAAGTGACACATAACACATATGAGCAACACCTAGTGAAGTC  144
      |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACTCCC-AGTGACACAT-ACACATATGAGCAACACCTAGTGAAGTC  147

seq1  AGAAGGTGGGATTCATCAACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  194
      ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTGGGATTCATCCACAAGTGTGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  197

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATATGC-AACAAG-TGAAAGTAAG  242
      | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  GAGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTACATATGCAAACAAGTTGAAAGTAAG  247

seq1  -AGGCCATGAATTTGAGAATCAGG-AACATGGGAGGAGTTGAAGAAAGTA  290
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCATGAATTTGAGAATCAGGAAACATGGGAGGAGTTGAAGAAAGTA  297

seq1  GAAGTAGGAAATATACACAGTACTC-ATATATGAAATTCTCAAATATCAA  339
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAGGAAATATACACAGTACTCAATATATGAAATTCTCAAATATCAA  347

seq1  TAAATTTTTTAAAGAATTATATGAGATGTAGCTTGCAAATTGCTTGGAAT  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTTTAAAGAATTATATGAGATGTAGCTTGCAAATTGCTTGGAAT  397

seq1  CAGGCTTAGAATACTGTAGTAGTGTTACATTTATGTTCTTATCCACCTCA  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCTTAGAATACTGTAGTAGTGTTACATTTATGTTCTTATCCACCTCA  447

seq1  TAGTTTTATGGCAAACAAAATAAAAATCCTATAAATATTATTTTTAGCTT  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTTATGGCAAACAAAATAAAAATCCTATAAATATTATTTTTAGCTT  497

seq1  CATAAATCAAACTTTAACCCAGCTATCTGTGCTTTGAGGATATATATTTC  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATCAAACTTTAACCCAGCTATCTGTGCTTTGAGGATATATATTTC  547

seq1  CTAATTCAAGTGTCTTCATTCACTCATATCCATAAAATGTGTCTTGCCTT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATTCAAGTGTCTTCATTCACTCATATCCATAAAATGTGTCTTGCCTT  597

seq1  TACTCTTGCATGTCAGCATTAGCATGTCATACTTGCTCCCTTTTCTCTTG  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTTGCATGTCAGCATTAGCATGTCATACTTGCTCCCTTTTCTCTTG  647

seq1  TCCTGATTTCTTCCCTCCCCCTTCATAGTCACTCTGCACTGTTGCAGCTC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGATTTCTTCCCTCCCCCTTCATAGTCACTCTGCACTGTTGCAGCTC  697

seq1  ACTAAGGAGAACCACCCCCACCCACCTGTACATGTGTCCAAATAAGCCAT  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGGAGAACCACCCCCACCCACCTGTACATGTGTCCAAATAAGCCAT  747

seq1  GAATTCACCAAGCAACTGCTTACTAACAATATTTATAAAACACTTGTGTT  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAAGCAACTGCTTACTAACAATATTTATAAAACACTTGTGTT  797

seq1  CATCTGCAAGTTGTTTGGCCAGATGTAGCCATCCTACAAAGCTACAATAA  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGCAAGTTGTTTGGCCAGATGTAGCCATCCTACAAAGCTACAATAA  847

seq1  AACATGAAATAAACCTTTCCATAAAACATTTAATAAAGCTGTAAAAGTTA  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGAAATAAACCTTTCCATAAAACATTTAATAAAGCTGTAAAAGTTA  897

seq1  AATTGCTCATCATAAGCAGCCATATAAAAGCATGCAGCTCTTCTCTGTGT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTCATCATAAGCAGCCATATAAAAGCATGCAGCTCTTCTCTGTGT  947

seq1  CGTTCCCTTTCATTAGAGGTGGGGGCATAGTTCAGGCTGGCCTTCTGAGT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCCCTTTCATTAGAGGTGGGGGCATAGTTCAGGCTGGCCTTCTGAGT  997

seq1  GCCCAAGCTTACAATATGGTACTGAATCGCAGGTATTGTTCTCAGGACTC  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAAGCTTACAATATGGTACTGAATCGCAGGTATTGTTCTCAGGACTC  1047

seq1  TCTTTACTGTGAAACCAAAGAATTC  1064
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACTGTGAAACCAAAGAATTC  1072