BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-073M14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 25,909,610 - 26,058,932
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSamd3, L3mbtl3
Upstream geneAkap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352
Downstream geneLOC435208, LOC667572, LOC100040349, Arhgap18, Lama2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-073M14.bB6Ng01-073M14.g
ACCDH890812DH890813
length1,009613
definitionDH890812|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073M14, 5' end.DH890813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-073M14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,057,926 - 26,058,932)(25,909,610 - 25,910,224)
sequence
gaattctttgagtttctccttggtgtggtttttctccataaaaacgaagg
cttgacgtaaccgtttaggaaagttcactaattttcaagttgttaccatg
tatgtatggaatacctccttttatttacaagtatatccatcaagggggta
gttcctgcttctgcccctttacccatttcccaagatgttacatgttcaat
tgtgctctctcaagcacatgcttccagagtggccctgtctcttcctgctt
cccttaaagccagagcttataaacccagtcgatctcaggtcctcttcctt
gctggttggttggataaaccctcctccttcttgggattggctctcaggtc
atttccacataagctcctctctgctttacttcacatggccggatgcttgt
gccctgccgggtctttgctcgaggtcagtagagatctgtgcagcccagct
accaaccttcaggccttcactcttccctggaggggctgtgaacccagtga
ccctgcatccaggcgctttaagatacctttctgtctggttggtccttttg
ggtgactaagggaagtatatgaaatctctagtcacgtagcgtggtgttgc
ctcgcccttcagattctgtctcctgtcctccgaaagccctcagtgtgaga
ttccaaagcggtggctcgtgtacgccttgctttcagtcagtatttctttt
tcgtaaccgttcacgttcccttctgttaatgtgctccaaacggggcttga
cacatccctggggactcacaagcgcttcccggtgctgctacgagcgatcc
tgtcacatgcccgaccccccttccccgttcgagcaccttctgatccagag
ccatttaatccagaggcttctgatcttttatcacatatgcattgttttgt
acctaatgatctgccttgtcaccacatcaatgtttatttcatctccaaga
tgagcagatattggataccactcagtggtttcctatccccagctgtccat
ggcgtgaga
gaattcagtgccatgagatctctcctaacaaggccataaaagggagatct
tgtttggtgcacataattgactctacaagccagtgtatgccttctccgct
ctgcgctctttcatgatatgtgatgtcctctcaggttagagttcatggga
cttctagtctgcgaactgtgagaagccaataacatatctcatcaggtgat
catgcttaaataggataactcttctgatttctgttccctgtagctttacg
tactaaaaatgggggctggagatttggcttagtgattaaacacactggtc
ttacagagtacctgggttcaattgtctgaagacacatggggctcacaacc
atctgtaactccagttctaggagacctggcaaatgcttcagcctccatag
atacatacacacacatggtacacagatatatatagaggcaaaacacttgg
gcacataaaataataataaaaaaatcaaatctcaaaacttattgatatat
gtgtttatatactatatatattatatatataacatatatatacacatagt
atatatatatatatacatatatatatatatatatatatatgtatatatat
atatatgtttaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_26057926_26058932
seq2: B6Ng01-073M14.b_43_1051 (reverse)

seq1  TCTCACGCCATGGACAGCTGGGGATAGGAAACCACTGAGTGGTTATCCAA  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TCTCACGCCATGGACAGCTGGGGATAGGAAACCACTGAGTGG-TATCCAA  49

seq1  TATCTGCTCATCTTGGAGATGAAATAAACATTGATGTGGTGAC-AGGCAG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TATCTGCTCATCTTGGAGATGAAATAAACATTGATGTGGTGACAAGGCAG  99

seq1  ATTCATTAGGTACAAAACAATGCATATGTGAT-AAAGATCAGAAGCCTCT  148
      | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  A-TCATTAGGTACAAAACAATGCATATGTGATAAAAGATCAGAAGCCTCT  148

seq1  GGATTAAATGGCTCTGGATCAGAAGGTGCTCGAACGGGGAAGGGGGGTCG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTAAATGGCTCTGGATCAGAAGGTGCTCGAACGGGGAAGGGGGGTCG  198

seq1  GGCATGTGACAGGATCGCTCGTAGCAGCACC-GGAAGCGCTTGTGAGTCC  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GGCATGTGACAGGATCGCTCGTAGCAGCACCGGGAAGCGCTTGTGAGTCC  248

seq1  CCAGGGATGTGTCAAG-CCCGTTTGGAGCACATTAACAGAAGGGAACGTG  296
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGATGTGTCAAGCCCCGTTTGGAGCACATTAACAGAAGGGAACGTG  298

seq1  AACGGTTACGAAAAAGAAATACTGACTGAAAGCAAGGCGTACACGAGCCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGTTACGAAAAAGAAATACTGACTGAAAGCAAGGCGTACACGAGCCA  348

seq1  CCGCTTTGGAATCTCACACTGAGGGCTTTCGGAGGACAGGAGACAGAATC  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTTTGGAATCTCACACTGAGGGCTTTCGGAGGACAGGAGACAGAATC  398

seq1  TGAAGGGCGAGGCAACACCACGCTACGTGACTAGAGATTTCATATACTTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGGCGAGGCAACACCACGCTACGTGACTAGAGATTTCATATACTTC  448

seq1  CCTTAGTCACCCAAAAGGACCAACCAGACAGAAAGGTATCTTAAAGCGCC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAGTCACCCAAAAGGACCAACCAGACAGAAAGGTATCTTAAAGCGCC  498

seq1  TGGATGCAGGGTCACTGGGTTCACAGCCCCTCCAGGGAAGAGTGAAGGCC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGCAGGGTCACTGGGTTCACAGCCCCTCCAGGGAAGAGTGAAGGCC  548

seq1  TGAAGGTTGGTAGCTGGGCTGCACAGATCTCTACTGACCTCGAGCAAAGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGTTGGTAGCTGGGCTGCACAGATCTCTACTGACCTCGAGCAAAGA  598

seq1  CCCGGCAGGGCACAAGCATCCGGCCATGTGAAGTAAAGCAGAGAGGAGCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGGCAGGGCACAAGCATCCGGCCATGTGAAGTAAAGCAGAGAGGAGCT  648

seq1  TATGTGGAAATGACCTGAGAGCCAATCCCAAGAAGGAGGAGGGTTTATCC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGAAATGACCTGAGAGCCAATCCCAAGAAGGAGGAGGGTTTATCC  698

seq1  AACCAACCAGCAAGGAAGAGGACCTGAGATCGACTGGGTTTATAAGCTCT  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAACCAGCAAGGAAGAGGACCTGAGATCGACTGGGTTTATAAGCTCT  748

seq1  GGCTTTAAGGGAAGCAGGAAGAGACAGGGCCACTCTGGAAGCATGTGCTT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTAAGGGAAGCAGGAAGAGACAGGGCCACTCTGGAAGCATGTGCTT  798

seq1  GAGAGAGCACAATTGAACATGTAACATCTTGGGAAATGGGTAAAGGGGCA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGCACAATTGAACATGTAACATCTTGGGAAATGGGTAAAGGGGCA  848

seq1  GAAGCAGGAACTACCCCCTTGATGGATATACTTGTAAATAAAAGGAGGTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCAGGAACTACCCCCTTGATGGATATACTTGTAAATAAAAGGAGGTA  898

seq1  TTCCATACATACATGGTAACAACTTGAAAATTAGTGAACTTTCCTAAACG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATACATACATGGTAACAACTTGAAAATTAGTGAACTTTCCTAAACG  948

seq1  GTTACGTCAAGCCTTCGTTTTTATGGAGAAAAACCACACCAAGGAGAAAC  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACGTCAAGCCTTCGTTTTTATGGAGAAAAACCACACCAAGGAGAAAC  998

seq1  TCAAAGAATTC  1007
      |||||||||||
seq2  TCAAAGAATTC  1009

seq1: chr10_25909610_25910224
seq2: B6Ng01-073M14.g_68_680

seq1  GAATTCAGTGCCATGAGATCTCTCCTAACAAGGCCATAAAAGGGAGATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTGCCATGAGATCTCTCCTAACAAGGCCATAAAAGGGAGATCT  50

seq1  TGTTTGGTGCACATAATTGACTCTACAAGCCAGTGTATGCCTTCTCCGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGTGCACATAATTGACTCTACAAGCCAGTGTATGCCTTCTCCGCT  100

seq1  CTGCGCTCTTTCATGATATGTGATGTCCTCTCAGGTTAGAGTTCATGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGCTCTTTCATGATATGTGATGTCCTCTCAGGTTAGAGTTCATGGGA  150

seq1  CTTCTAGTCTGCGAACTGTGAGAAGCCAATAACATATCTCATCAGGTGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGTCTGCGAACTGTGAGAAGCCAATAACATATCTCATCAGGTGAT  200

seq1  CATGCTTAAATAGGATAACTCTTCTGATTTCTGTTCCCTGTAGCTTTACG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTTAAATAGGATAACTCTTCTGATTTCTGTTCCCTGTAGCTTTACG  250

seq1  TACTAAAAATGGGGGCTGGAGATTTGGCTTAGTGATTAAACACACTGGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAAAAATGGGGGCTGGAGATTTGGCTTAGTGATTAAACACACTGGTC  300

seq1  TTACAGAGTACCTGGGTTCAATTGTCTGAAGACACATGGGGCTCACAACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAGTACCTGGGTTCAATTGTCTGAAGACACATGGGGCTCACAACC  350

seq1  ATCTGTAACTCCAGTTCTAGGAGACCTGGCAAATGCTTCAGCCTCCATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAACTCCAGTTCTAGGAGACCTGGCAAATGCTTCAGCCTCCATAG  400

seq1  ATACATACACACACATGGTACACAGATATATATAGAGGCAAAACACTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACACACACATGGTACACAGATATATATAGAGGCAAAACACTTGG  450

seq1  GCACATAAAATAATAATAAAAAAATCAAATCTCAAAACTTATTGATATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACATAAAATAATAATAAAAAAATCAAATCTCAAAACTTATTGATATAT  500

seq1  GTGTTTATATACTATATATATTATATATATAACATATATATACACATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GTGTTTATATACTATATATATTATATATATAACATATATATACACATAG-  549

seq1  ATATATATATATATATACATATATATATATATATATATATATGTATATAT  600
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TATATATATATATATACATATATATATATATATATATATATGTATATAT  598

seq1  ATATATATGTTTACA  615
      |||||||||||||||
seq2  ATATATATGTTTACA  613