BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074D17
Chromosome10 (Build37)
Map Location 89,463,713 - 89,583,461
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneTmem16d, Gas2l3, Nr1h4, EG627532, Slc17a8, Scyl2, Actr6, E030041M21Rik, E530015N03Rik, LOC100043039
Downstream geneLOC544719, Apaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074D17.bB6Ng01-074D17.g
ACCDH891139DH891140
length1,1051,144
definitionDH891139|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074D17, 5' end.DH891140|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074D17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(89,582,356 - 89,583,461)(89,463,713 - 89,464,841)
sequence
gaattcaccttctgtgattgccattgagtggcttggttcactggcttgaa
gcagaaagctgactttaaaaatttcagagttcccctccatcttagacagt
gcttaactcttacttgcaatatcttgagaagaaggcaagatactcacaga
tgctattattataatggtttcctacaattgggacctctgatggtcacatg
gcctaagccccaagaaatgacatattatggtgtaattttgtcaccacatt
acctggaatagagaacctgactgggttcctgacccacttgtctattccat
gctcccgaatgccctggtcatgcctccacttctacaaaccagtgaaaaca
ctttgaggtggcaaaaactgtgactgaaaaagaggaaacctaactcaagc
aagtttaatcataacttgtgattcttattgcacatttgttgctccacagg
tcacagaacatagccaacccaacacatttagctattaaaactactgcctt
ctctaggttcccattttgaaattgtagtagctattcctggttgtcaactt
gactgtatatggaataaactacaatccagaattggaaggctcaccagtga
ccctaatctggaggctgggagatagaagtttctgatctggatcttggtat
ggagatcttgaggcatagtggctatggattccagattaatacagagagat
ctccaagttcaaggtcatctgggattaaaggtgtggtagcacacaccttt
aatctgggctacaccttctgctggagaccatttaaggacattggaagaaa
gggagtctcgatctcattccttcgcctgcttgccatgtgggactgagata
cttggacttccattcacagctactactgaaccattgttgggagttggact
gcagactgtaaattatcaataaatccctttactatatagagactataagt
tctgtgactctagagaaccctgactaatacagaaatatttctgactgatt
tgacttgtaaatagcctactacagagaggtatgtgacttttctagctttt
aaagaattttcttggggcacaaggaccctcctcatgctgacgtgggtcag
acatg
gaattcaaatgtggaaaccctgggagcttccattggtttgtattagtttt
ggttaaaagtgctaatgaccttgactgcattagtgtcatggaaggacaag
agacaaaatctcaacttatatgacctttgctcttagaattttgatagttt
aagtgtatcttggtctgatgaaagagaagaaaagaaaacttattatcatg
ttgaaaattagagattacatatttgggagaagggaattctagctacagtg
aaacatgacaagtggtggattctttaaggcttaggagtaaatttggcttt
gagaatgctgagttaaaagtatagaaaaatctccagtaaaacgtccagag
gagtgattggtctttgcggaacagtcaaagttgggtagaaattcgaggag
cacacatgtagaagaacagcaagacaaaatcagaccccaaacagttagca
agaacaaaaaaaaaagcacttgaaggttagtatatatctaaatgaatgga
catctatcatgtgaagcacattatgagttaattctttaatagggttgccc
ctctccccctttaaatggcagttgggtactgctggactgtttctgaccca
ccagctgcccatgttaacggcacagagaacttctattaagtttggcctta
gttaggcttgttcccacctatctcttatacttaaattggcccgtttatac
tgttctatgttctacaatgtggctcattacctcctaagtaccagcacttg
cttcttcctctgagtctggctgcaaatctcttgcctttgactccttccca
gagtttctatctctgcccagatagtctgccttttcctcgtctacttagtt
tataggtcattcagttctttattaacttaagcagaagggtgagagaggag
atgttttacaaacactgagataggtgatacttaataacaaagacatttat
tcagtgcaaaagagattatcccaatagtgggtctgtactttgccatttat
cctcattgagtttaatataattctgagtggaaatccaatttggcagtttc
tcagataatttggggaatatttttaacttcaggacagtattaccacttcc
taggatatatccctgaaatattgtaccactataccccaaaggac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_89582356_89583461
seq2: B6Ng01-074D17.b_46_1150 (reverse)

seq1  CATGTCTGACCCACGTTCCAGCATTGAGAGGGT-CTTGTGCCCCAAGAAA  49
      ||||||||||||||||  ||||||   |||||| ||||||||||||||||
seq2  CATGTCTGACCCACGT--CAGCATGAGGAGGGTCCTTGTGCCCCAAGAAA  48

seq1  TTCCTTTAAAAGCTAAGATAGTCACATATCTTCTCTGTAGTAGGCTATTT  99
       | ||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTTAAAAGCTAGAAAAGTCACATA-CCTCTCTGTAGTAGGCTATTT  97

seq1  ACAAGTCAAATCAGTCAGAAATATTTCTGTATTAGTCAGGGTTCTCTAGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTCAAATCAGTCAGAAATATTTCTGTATTAGTCAGGGTTCTCTAGA  147

seq1  GTCACAGAACTTATAGTCTCTATATAGTAAAGGGATTTATTGATAATTTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACAGAACTTATAGTCTCTATATAGTAAAGGGATTTATTGATAATTTA  197

seq1  CAGTCTGCAGTCCAACTCCCAACAATGGTTCAGTAGTAGCTGTGAATGGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTGCAGTCCAACTCCCAACAATGGTTCAGTAGTAGCTGTGAATGGA  247

seq1  AGTCCAAGTATCTCAGTCCCACATGGCAAGCAGGCGAAGGAATGAGATCG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAAGTATCTCAGTCCCACATGGCAAGCAGGCGAAGGAATGAGATCG  297

seq1  AGACTCCC-TTCTTCCAATGTCCTTAAATGGTCTCCAGCAGAAGGTGTAG  348
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCCCTTTCTTCCAATGTCCTTAAATGGTCTCCAGCAGAAGGTGTAG  347

seq1  CCCAGATTAAAGGTGTGTGCTACCACACCTTTAATCCCAGATGACCTTGA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGATTAAAGGTGTGTGCTACCACACCTTTAATCCCAGATGACCTTGA  397

seq1  ACTTGGAGATCTCTCTGTATTAATCTGGAATCCATAGCCACTATGCCTCA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGAGATCTCTCTGTATTAATCTGGAATCCATAGCCACTATGCCTCA  447

seq1  AGATCTCCATACCAAGATCCAGATCAGAAACTTCTATCTCCCAGCCTCCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTCCATACCAAGATCCAGATCAGAAACTTCTATCTCCCAGCCTCCA  497

seq1  GATTAGGGTCACTGGTGAGCCTTCCAATTCTGGATTGTAGTTTATTCCAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAGGGTCACTGGTGAGCCTTCCAATTCTGGATTGTAGTTTATTCCAT  547

seq1  ATACAGTCAAGTTGACAACCAGGAATAGCTACTACAATTTCAAAATGGGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGTCAAGTTGACAACCAGGAATAGCTACTACAATTTCAAAATGGGA  597

seq1  ACCTAGAGAAGGCAGTAGTTTTAATAGCTAAATGTGTTGGGTTGGCTATG  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAGAGAAGGCAGTAGTTTTAATAGCTAAATGTGTTGGGTTGGCTATG  647

seq1  TTCTGTGACCTGTGGAGCAACAAATGTGCAATAAGAATCACAAGTTATGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTGACCTGTGGAGCAACAAATGTGCAATAAGAATCACAAGTTATGA  697

seq1  TTAAACTTGCTTGAGTTAGGTTTCCTCTTTTTCAGTCACAGTTTTTGCCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAACTTGCTTGAGTTAGGTTTCCTCTTTTTCAGTCACAGTTTTTGCCA  747

seq1  CCTCAAAGTGTTTTCACTGGTTTGTAGAAGTGGAGGCATGACCAGGGCAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAAAGTGTTTTCACTGGTTTGTAGAAGTGGAGGCATGACCAGGGCAT  797

seq1  TCGGGAGCATGGAATAGACAAGTGGGTCAGGAACCCAGTCAGGTTCTCTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGAGCATGGAATAGACAAGTGGGTCAGGAACCCAGTCAGGTTCTCTA  847

seq1  TTCCAGGTAATGTGGTGACAAAATTACACCATAATATGTCATTTCTTGGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGGTAATGTGGTGACAAAATTACACCATAATATGTCATTTCTTGGG  897

seq1  GCTTAGGCCATGTGACCATCAGAGGTCCCAATTGTAGGAAACCATTATAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGGCCATGTGACCATCAGAGGTCCCAATTGTAGGAAACCATTATAA  947

seq1  TAATAGCATCTGTGAGTATCTTGCCTTCTTCTCAAGATATTGCAAGTAAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAGCATCTGTGAGTATCTTGCCTTCTTCTCAAGATATTGCAAGTAAG  997

seq1  AGTTAAGCACTGTCTAAGATGGAGGGGAACTCTGAAATTTTTAAAGTCAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAAGCACTGTCTAAGATGGAGGGGAACTCTGAAATTTTTAAAGTCAG  1047

seq1  CTTTCTGCTTCAAGCCAGTGAACCAAGCCACTCAATGGCAATCACAGAAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGCTTCAAGCCAGTGAACCAAGCCACTCAATGGCAATCACAGAAG  1097

seq1  GTGAATTC  1106
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1105

seq1: chr10_89463713_89464841
seq2: B6Ng01-074D17.g_69_1212

seq1  GAATTCAAATGTGGAAACCCTGGGAGCTTCCATTGGTTTGTATTAGTTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATGTGGAAACCCTGGGAGCTTCCATTGGTTTGTATTAGTTTT  50

seq1  GGTTAAAAGTGCTAATGACCTTGACTGCATTAGTGTCATGGAAGGACAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAAAAGTGCTAATGACCTTGACTGCATTAGTGTCATGGAAGGACAAG  100

seq1  AGACAAAATCTCAACTTATATGACCTTTGCTCTTAGAATTTTGATAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAAATCTCAACTTATATGACCTTTGCTCTTAGAATTTTGATAGTTT  150

seq1  AAGTGTATCTTGGTCTGATGAAAGAGAAGAAAAGAAAACTTATTATCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTATCTTGGTCTGATGAAAGAGAAGAAAAGAAAACTTATTATCATG  200

seq1  TTGAAAATTAGAGATTACATATTTGGGAGAAGGGAATTCTAGCTACAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAATTAGAGATTACATATTTGGGAGAAGGGAATTCTAGCTACAGTG  250

seq1  AAACATGACAAGTGGTGGATTCTTTAAGGCTTAGGAGTAAATTTGGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGACAAGTGGTGGATTCTTTAAGGCTTAGGAGTAAATTTGGCTTT  300

seq1  GAGAATGCTGAGTTAAAAGTATAGAAAAATCTCCAGTAAAACGTCCAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATGCTGAGTTAAAAGTATAGAAAAATCTCCAGTAAAACGTCCAGAG  350

seq1  GAGTGATTGGTCTTTGCGGAACAGTCAAAGTTGGGTAGAAATTCGAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGATTGGTCTTTGCGGAACAGTCAAAGTTGGGTAGAAATTCGAGGAG  400

seq1  CACACATGTAGAAGAACAGCAAGACAAAATCAGACCCCAAACAGTTAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACATGTAGAAGAACAGCAAGACAAAATCAGACCCCAAACAGTTAGCA  450

seq1  AGAACAAAAAAAAAAGCACTTGAAGGTTAGTATATATCTAAATGAATGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAAAAAAAAAGCACTTGAAGGTTAGTATATATCTAAATGAATGGA  500

seq1  CATCTATCATGTGAAGCACATTATGAGTTAATTCTTTAATAGGGTTGCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATCATGTGAAGCACATTATGAGTTAATTCTTTAATAGGGTTGCCC  550

seq1  CTCTCCCCCTTTAAATGGCAGTTGGGTACTGCTGGACTGTTTCTGACCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCCCCCTTTAAATGGCAGTTGGGTACTGCTGGACTGTTTCTGACCCA  600

seq1  CCAGCTGCCCATGTTAACGGCACAGAGAACTTCTATTAAGTTTGGCCTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTGCCCATGTTAACGGCACAGAGAACTTCTATTAAGTTTGGCCTTA  650

seq1  GTTAGGCTTGTTCCCACCTATCTCTTATACTTAAATTGGCCCGTTTATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGCTTGTTCCCACCTATCTCTTATACTTAAATTGGCCCGTTTATAC  700

seq1  TGTTCTATGTTCTACAATGTGGCTCATTACCTCCTAAGTACCAGCACTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTATGTTCTACAATGTGGCTCATTACCTCCTAAGTACCAGCACTTG  750

seq1  CTTCTTCCTCTGAGTCTGGCTGCAAATCTCTTGCCTTTGACTCCTTCCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCCTCTGAGTCTGGCTGCAAATCTCTTGCCTTTGACTCCTTCCCA  800

seq1  GAGTTTCTATCTCTGCCCAGATAGTCTGCC-TTTCCTCGTCTACTTAG-T  848
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
seq2  GAGTTTCTATCTCTGCCCAGATAGTCTGCCTTTTCCTCGTCTACTTAGTT  850

seq1  TATAGGTCATTCAGTTCTTTATTAAACTAAGCAGAA-GGTGAGAGAGAAG  897
      |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||
seq2  TATAGGTCATTCAGTTCTTTATTAACTTAAGCAGAAGGGTGAGAGAGGAG  900

seq1  ATGTTTACAAAACACTGAGATAGGTGATACTTAAT-ACAAAGACATTTAT  946
      ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGTTTTACAAACACTGAGATAGGTGATACTTAATAACAAAGACATTTAT  950

seq1  TCAGTGCAAAAGAGATTATCCAAATAGTTGGGTCTGTACTTTGCCATTTA  996
      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTGCAAAAGAGATTATCCCAATAG-TGGGTCTGTACTTTGCCATTTA  999

seq1  T-CTCATTGAGTTTAATATA--TCTGAGT-GAAAT-CAATTTGGCAGTTT  1041
      | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  TCCTCATTGAGTTTAATATAATTCTGAGTGGAAATCCAATTTGGCAGTTT  1049

seq1  CTCAGAAAATT--GGGAATAATTTTAAC-TCAAGACAGGTATACCACTT-  1087
      |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||| |||||   |||||||| 
seq2  CTCAGATAATTTGGGGAATATTTTTAACTTCAGGACAGTATTACCACTTC  1099

seq1  CTAGGCATATA-CCCAG-AATA-TGTACCACCATACCAC-AAGGAC  1129
      ||||| ||||| ||| | |||| |||||||| ||||| | ||||||
seq2  CTAGG-ATATATCCCTGAAATATTGTACCACTATACCCCAAAGGAC  1144