BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-077N14
Chromosome10 (Build37)
Map Location 7,330,377 - 7,554,584
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLrp11, Pcmt1, Nup43, Lats1, Katna1, BC013529, Ppil4, LOC665035, Zc3h12d
Upstream geneMthfd1l, Plekhg1, Iyd, Ppp1r14c, EG666520, LOC100039303, LOC670558, LOC626333, LOC666541, 9230019H11Rik, LOC100041405, LOC672213
Downstream geneMap3k7ip2, LOC100039046, Ust, Sash1, LOC100039173
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-077N14.bB6Ng01-077N14.g
ACCDH893717DH893718
length1,1401,066
definitionDH893717|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077N14, 5' end.DH893718|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-077N14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(7,553,441 - 7,554,584)(7,330,377 - 7,331,460)
sequence
gaattcacctacttcagaaaataattctccctggggacccgaacagtaac
tttagttccttttaagacacatgatttctaaataagggaggaagcaggag
tgggtaggggcctgctctcaagcctcttcactttgacgagctcgtctttg
agctgttagttctcagctgcttaagtgtgaccttgttatttttaaaaatc
ttagagtctgaacagcttcgtctaagttttcttcctcagtcttgactgga
agtcccagatagcccagaagatcagtgacgaaatcttacagatttcatca
tgagacctcagaagggtcagcatcccaaccctctcttctttaggactgat
ggcagacacaactgtcccgtgtcccttgatggcagacacaactgtcccgt
gtcccttctaaaagcagcaaacccaggtttgacgactccccaagctgaaa
gcctgccctctttgcctggaagagcctctggagaaattgaggagagactg
aaacaggagaaaaagtgaaggataaaggtggagaaacagcagccccctgt
gcacagcactgcctatcatgaggggctgcctcctacactgtggaaaactt
agcctccttttgaaggggaaagtgcgagcctgctcctcgcaccgaggttt
atgtgaggaaaccgagggaaagagcctttggtgacttggccagggtgcta
ctagatagtgatatttgtcatccagaccagagagccccctccagtggcca
cctgtagtgcaaacccacagcactaagcccccagactactcattaggcac
ccagtcctggtccacaggccacttgaagtcaatcacagcagtgaggagac
ggtcagcctggtcttagcttctcaacaacgccacgaagtttggtggtcag
cacagacttccagtcccaagtggggctagctaccagtcagatttgttttg
gtttggttttgtcagagtttgaggaagtcacagagactctagatttcatc
ccacagggctgatttttttttttttaagcctgctcacttctgccttttta
aagagaacttgtaaatttaaaaccttatttgcagagggctaggcctgtat
cttagtggcagggtgcttgctgcttgcacaagccatttta
gaattcactttagctggttactaacaactctatcactgtatttcagaaga
agttgggaggaaaataatttcagattacccaaactgaaagtccagaagaa
gctatgtcaactaagggttaagcagtaaggaataaatgaggcagggagcg
aaatccctgtagcccttagcatcgtagccttgggagacaggtaggatgga
ggctcgtaagtgtgtgaccagcatggacaatacagtaaaatcctgtttca
aaaaaacaaggggctgggaatatggctcagtcagcaaagcccctgccgtg
taagaacatggacctacatatgttctgtgcaagcagggaagacctaggca
tggtcatatgggtatgtagccctggccctagggagctggagatgggtggg
tccctggggcacactgagcggccactctagccaatagatgagctctgggt
ttaatgagagaccttgtctcaaaagataagatggaatgagataataaaag
atactcagtgtcgacctctgacctgcacacatgtacatgtacctgcaaac
acatgtgcactacataaatctaagaaaaaaagcaaagaagctgggtgagg
tggctatgtaactgcaacactcaggatgctgaaacatgatgattgccaca
aagtcaatgctagcctgggctgcacagtgttttcccagggctatgaggac
aaacaaaacagaaagagagagacagagatgacagagagagacagatgaca
gagagagacatacagacagacagagagagagagatgtggtggcatatgtc
tgtgataccagcactttgaggtagatagaggaggatcccacagctcacta
ggcagccagtgtagctaggtgagctgcaggttcactgagagaccctgtct
caaaagtagatagagacaatcacacgacatacatacatacacacacacac
acacacacacacactcacatacacacactacaacacccacacaacacaca
aaatgttgttgttgggccgcggcctacatgaacgggtactctgggagcag
gctgggctgaagagac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_7553441_7554584
seq2: B6Ng01-077N14.b_47_1186 (reverse)

seq1  TAAAATGGGGCCTTGTGCAAGCCAGGCAAGCACCCTGCTACTAAGATACA  50
      ||||||||   |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||
seq2  TAAAATGG---CTTGTGCAAGC--AGCAAGCACCCTGCCACTAAGATACA  45

seq1  GGCCTAGCCCTCTGC-AATAAGTTTTTAAA-TTACAAATTCTCTTTTAAA  98
      ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||
seq2  GGCCTAGCCCTCTGCAAATAAGGTTTTAAATTTACAAGTTCTC-TTTAAA  94

seq1  AAGGCAGAAGTGAGCAGGCTT-AAAAAAAAAAAATCAGCCCTGTGGGATG  147
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGAAGTGAGCAGGCTTAAAAAAAAAAAAATCAGCCCTGTGGGATG  144

seq1  AAATCTTAGAGTCTCTGTGACTTCCTCAAACTCTGACAAAACCAAACCAA  197
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATC-TAGAGTCTCTGTGACTTCCTCAAACTCTGACAAAACCAAACCAA  193

seq1  AACAAATCTGACTGGTAGCTAGCCCCACTTGGGACTGGAAGTCTGTGCTG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATCTGACTGGTAGCTAGCCCCACTTGGGACTGGAAGTCTGTGCTG  243

seq1  ACCACCAAACTTCGTGGCGTTGTTGAGAAGCTAAGACCAGGCTGACCGTC  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCAAACTTCGTGGCGTTGTTGAGAAGCTAAGACCAGGCTGACCGTC  293

seq1  TCCTCACTGCTGTGATTGACTTCAAGTGGCCTGTGGACCAGGACTGGGTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACTGCTGTGATTGACTTCAAGTGGCCTGTGGACCAGGACTGGGTG  343

seq1  CCTAATGAGTAGTCTGGGGGCTTAGTGCTGTGGGTTTGCACTACAGGTGG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATGAGTAGTCTGGGGGCTTAGTGCTGTGGGTTTGCACTACAGGTGG  393

seq1  CCACTGGAGGGGGCTCTCTGGTCTGGATGACAAATATCACTATCTAGTAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGGAGGGGGCTCTCTGGTCTGGATGACAAATATCACTATCTAGTAG  443

seq1  CACCCTGGCCAAGTCACCAAAGGCTCTTTCCCTCGGTTTCCTCACATAAA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGGCCAAGTCACCAAAGGCTCTTTCCCTCGGTTTCCTCACATAAA  493

seq1  CCTCGGTGCGAGGAGCAGGCTCGCACTTTCCCCTTCAAAAGGAGGCTAAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCGGTGCGAGGAGCAGGCTCGCACTTTCCCCTTCAAAAGGAGGCTAAG  543

seq1  TTTTCCACAGTGTAGGAGGCAGCCCCTCATGATAGGCAGTGCTGTGCACA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCACAGTGTAGGAGGCAGCCCCTCATGATAGGCAGTGCTGTGCACA  593

seq1  GGGGGCTGCTGTTTCTCCACCTTTATCCTTCACTTTTTCTCCTGTTTCAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGCTGCTGTTTCTCCACCTTTATCCTTCACTTTTTCTCCTGTTTCAG  643

seq1  TCTCTCCTCAATTTCTCCAGAGGCTCTTCCAGGCAAAGAGGGCAGGCTTT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCTCAATTTCTCCAGAGGCTCTTCCAGGCAAAGAGGGCAGGCTTT  693

seq1  CAGCTTGGGGAGTCGTCAAACCTGGGTTTGCTGCTTTTAGAAGGGACACG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTGGGGAGTCGTCAAACCTGGGTTTGCTGCTTTTAGAAGGGACACG  743

seq1  GGACAGTTGTGTCTGCCATCAAGGGACACGGGACAGTTGTGTCTGCCATC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAGTTGTGTCTGCCATCAAGGGACACGGGACAGTTGTGTCTGCCATC  793

seq1  AGTCCTAAAGAAGAGAGGGTTGGGATGCTGACCCTTCTGAGGTCTCATGA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTAAAGAAGAGAGGGTTGGGATGCTGACCCTTCTGAGGTCTCATGA  843

seq1  TGAAATCTGTAAGATTTCGTCACTGATCTTCTGGGCTATCTGGGACTTCC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATCTGTAAGATTTCGTCACTGATCTTCTGGGCTATCTGGGACTTCC  893

seq1  AGTCAAGACTGAGGAAGAAAACTTAGACGAAGCTGTTCAGACTCTAAGAT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAAGACTGAGGAAGAAAACTTAGACGAAGCTGTTCAGACTCTAAGAT  943

seq1  TTTTAAAAATAACAAGGTCACACTTAAGCAGCTGAGAACTAACAGCTCAA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAATAACAAGGTCACACTTAAGCAGCTGAGAACTAACAGCTCAA  993

seq1  AGACGAGCTCGTCAAAGTGAAGAGGCTTGAGAGCAGGCCCCTACCCACTC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACGAGCTCGTCAAAGTGAAGAGGCTTGAGAGCAGGCCCCTACCCACTC  1043

seq1  CTGCTTCCTCCCTTATTTAGAAATCATGTGTCTTAAAAGGAACTAAAGTT  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCTCCCTTATTTAGAAATCATGTGTCTTAAAAGGAACTAAAGTT  1093

seq1  ACTGTTCGGGTCCCCAGGGAGAATTATTTTCTGAAGTAGGTGAATTC  1144
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTCGGGTCCCCAGGGAGAATTATTTTCTGAAGTAGGTGAATTC  1140

seq1: chr10_7330377_7331460
seq2: B6Ng01-077N14.g_68_1133

seq1  GAATTCACTTTAGCTGGTTACTAACAACTCTATCACTGTATTTCAGAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTAGCTGGTTACTAACAACTCTATCACTGTATTTCAGAAGA  50

seq1  AGTTGGGAGGAAAATAATTTCAGATTACCCAAACTGAAAGTCCAGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGGAGGAAAATAATTTCAGATTACCCAAACTGAAAGTCCAGAAGAA  100

seq1  GCTATGTCAACTAAGGGTTAAGCAGTAAGGAATAAATGAGGCAGGGAGCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATGTCAACTAAGGGTTAAGCAGTAAGGAATAAATGAGGCAGGGAGCG  150

seq1  AAATCCCTGTAGCCCTTAGCATCGTAGCCTTGGGAGACAGGTAGGATGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCCCTGTAGCCCTTAGCATCGTAGCCTTGGGAGACAGGTAGGATGGA  200

seq1  GGCTCGTAAGTGTGTGACCAGCATGGACAATACAGTAAAATCCTGTTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCGTAAGTGTGTGACCAGCATGGACAATACAGTAAAATCCTGTTTCA  250

seq1  AAAAAACAAGGGGCTGGGAATATGGCTCAGTCAGCAAAGCCCCTGCCGTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAACAAGGGGCTGGGAATATGGCTCAGTCAGCAAAGCCCCTGCCGTG  300

seq1  TAAGAACATGGACCTACATATGTTCTGTGCAAGCAGGGAAGACCTAGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAACATGGACCTACATATGTTCTGTGCAAGCAGGGAAGACCTAGGCA  350

seq1  TGGTCATATGGGTATGTAGCCCTGGCCCTAGGGAGCTGGAGATGGGTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATATGGGTATGTAGCCCTGGCCCTAGGGAGCTGGAGATGGGTGGG  400

seq1  TCCCTGGGGCACACTGAGCGGCCACTCTAGCCAATAGATGAGCTCTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGGGCACACTGAGCGGCCACTCTAGCCAATAGATGAGCTCTGGGT  450

seq1  TTAATGAGAGACCTTGTCTCAAAAGATAAGATGGAATGAGATAATAAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAGAGACCTTGTCTCAAAAGATAAGATGGAATGAGATAATAAAAG  500

seq1  ATACTCAGTGTCGACCTCTGACCTGCACACATGTACATGTACCTGCAAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCAGTGTCGACCTCTGACCTGCACACATGTACATGTACCTGCAAAC  550

seq1  ACATGTGCACTACATAAATCTAAGAAAAAAAGCAAAGAAGCTGGGTGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGCACTACATAAATCTAAGAAAAAAAGCAAAGAAGCTGGGTGAGG  600

seq1  TGGCTATGTAACTGCAACACTCAGGATGCTGAAACATGATGATTGCCACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTATGTAACTGCAACACTCAGGATGCTGAAACATGATGATTGCCACA  650

seq1  AAGTCAATGCTAGCCTGGGCTGCACAGTGTTTTCCCAGGGCTATGAGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAATGCTAGCCTGGGCTGCACAGTGTTTTCCCAGGGCTATGAGGAC  700

seq1  AAACAAAACAGAAAGAGAGAGACAGAGATGACAGAGAGAGACAGATGACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAAAACAGAAAGAGAGAGACAGAGATGACAGAGAGAGACAGATGACA  750

seq1  GAGAGAGACATACAGACAGACAGAGAGAGAGAGATGTGGTGGCATATGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGACATACAGACAGACAGAGAGAGAGAGATGTGGTGGCATATGTC  800

seq1  TGTGATACCAGCACTTTGAGGTAGATAGAGGAGGATCCCACAGCTCACTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATACCAGCACTTTGAGGTAGATAGAGGAGGATCCCACAGCTCACTA  850

seq1  GGCAGCCAGTGTAGCTAGGTGAGCTGCAGGTTCACTGAGAGACCCTGTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCCAGTGTAGCTAGGTGAGCTGCAGGTTCACTGAGAGACCCTGTCT  900

seq1  CAAAAAGTAAGATAGAGAACAATCACACGAACATACATACATACACACAC  950
      | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  C-AAAAGT-AGATAGAG-ACAATCACACG-ACATACATACATACACACAC  946

seq1  ACACACACACACACACACACACACACACACACCACACACACCCCACCACC  1000
      |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||       
seq2  ACACACACACACACACACTCACATACACACACTACA-ACACCC-------  988

seq1  ACCACACCACAC-ACATGTTGTATGTTGGCCCGCGGCCTACATGAACCGG  1049
        |||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||
seq2  -ACACAACACACAAAATGTTGT-TGTTGGGCCGCGGCCTACATGAA-CGG  1035

seq1  GTACACCTGGGAGGCAGGCTGGGGCTGAAAGAGAC  1084
      ||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||
seq2  GTAC-TCTGGGA-GCAGGCT-GGGCTG-AAGAGAC  1066