BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-082L18
Chromosome10 (Build37)
Map Location 24,737,556 - 24,882,852
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG667479, LOC212399
Upstream geneTaar7d, Taar7e, LOC628480, Taar7f, Taar8a, Taar8b, Taar8c, Taar9, Stx7, Moxd1, LOC628537, Ctgf, Enpp1, Enpp3, Crsp3, Arg1
Downstream geneAkap7, LOC665800, Epb4.1l2, 2010003K15Rik, EG667513, LOC667519, LOC628697, C030003D03Rik, LOC100040851, LOC15352
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-082L18.bB6Ng01-082L18.g
ACCDH897202DH897203
length1,167862
definitionDH897202|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082L18, 5' end.DH897203|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082L18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,881,651 - 24,882,852)(24,737,556 - 24,738,417)
sequence
gaattcaggtgatggttttaaaatggaaactgcgctgtctggtcgtctat
aaatcccattattagtcacacattggaacaccacgagattctcttgtagc
agtaaagctaagggcaaataaacaagagactgaagagtagaatggagaaa
gtgatccctgggaaccgactctggcttctctctaatggtccaaattactt
cctaaacgctgctatcttgtggaagcacccccataccttatgtgttactt
tctttgacttgtgttaggaaagtggcagagtcctgcgtgtgcccctacta
gcctaagtaattctatggcttctacatctcttgttctttagtaactatat
tgtaagttgttatagcattgcaaatatctccctacagttcctaccccaac
ccacctgggcacaatgtctctgtggtgtctttgtactaaaggaatctgta
aattcttcactgattttccccctagcctatgtttcatctcacctataact
tcagaaaatatttttatatttacatatgtgagatataaaaagtcatagga
ggcaagaggacaaagaaacaggaatctttgcagctcgacagaaatgatgg
tgcttcgagcaacagaaaaggcaccaaatgcaaatatctgatatggtaat
cgagtggagaaaatgcatgaatatgcagcagtggggagagactaagtata
tccttgagatccgggaggacaaacttggaagctgttctcaccagcctgtg
tttggggggtaccctcagggaaaggcttgtactgagatcttttgctgact
tggttggacatttgtcacagctagggacagcttagtatctttagaacacc
tttcctatgtttattaagctcctgccttttaagctccgcttgcccagggg
agataccccaggagaattttggagttgagcatctcattggtgcactgaga
ttcagatttaggatctgggatctcagaagagggagggaccctgattgagc
agccattttgatgagatatgctcagaaagcagcgttggggtaggagtatg
ctcactgataagttctgcaccgagactgaactgagaatagtctctggtgc
attcctgtgaccagttggggcaggcacagggatagtagctggtgttcact
tgacaggcagctgatta
gaattccttcagcaggagattaccattcctaatgttgaaaggatgttaaa
agttcggggcaggggtatgatagctgttttctactgaagggaggtctttg
tcagagggaggtagttctgggtgcattgaagagggcttctctggtcatgt
agctagggaagagttccaatttggtcagctgtgatagctcaggctgttgc
caccctgtgtttctaaagagacatcatgagggatatgtataagagggctg
taagcagatgaattatttattgagtaaaactggactgtacattcattaga
cacaatgacagacacaccaagggtccctaacatttatgaggctcctacat
acttagtatatatggcactacccataaaagatgcacatctgagcccttac
tattaattaaaacaattaaatattaatgtagtctcccactggtgacactc
atgtatccttttctcaagaaacataaatgaagctcgtggctggcttctct
tcccttgtgtctcactgtgagctcaaatccttcccataagctgcatgggt
tgagtccttcccctgaatggtctctggtagtggtggagacttccagacaa
ggtaacatctctcaggacttatgagaagagatgaaggaacaaccctcacc
acagagccggcagctgagtcagttccagccatctcaggactggttctcct
gaacgtatttccttcttctgacctcctacctttctctacctccctctttg
ttcctggaactgcctgtccctctagctatagaaagagcagcaggaaggag
tttggctcccttaaatcactctttggatctacaagaacacaggcaggggt
gggttgggttgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_24881651_24882852
seq2: B6Ng01-082L18.b_49_1215 (reverse)

seq1  TAATCAGACTGGCTTGTC-AGTGAACTACAAAGACCTACTTATCTCTGTG  49
      ||||||| || || |||| |||||||    |  | |||| |||| |||||
seq2  TAATCAG-CT-GCCTGTCAAGTGAAC----ACCAGCTAC-TATCCCTGTG  43

seq1  CCCTGCCCCAACACTGGGGTCACAGGGAAATGCACCCAGAGACCTAATCT  99
       |||||||||||     |||||||||  |||||| ||||||| ||| |||
seq2  -CCTGCCCCAAC----TGGTCACAGG--AATGCA-CCAGAGA-CTATTCT  84

seq1  CAAGTTTTCAAGTCTTCGTGGCAGGAACTTTATCAGTTGAGCCATACTCC  149
      | ||||    |||| |||  ||| |||| ||||||| |||| |||||| |
seq2  C-AGTT---CAGTC-TCGGTGCA-GAAC-TTATCAG-TGAG-CATACT-C  124

seq1  CTACCCCACCGCTGCTTTTCTGAGCCATATCCTCATCAAAATGGCCTGGC  199
      |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||   ||
seq2  CTACCCCAACGCTGC-TTTCTGAG-CATAT-CTCATCAAAATGGC--TGC  169

seq1  TCAATTCAGGGTCCCTCCCTCTTTCTTGGAGATCCCAGATCCTAAATCTG  249
      |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||
seq2  TCAA-TCAGGGTCCCTCCCTC-TTCT--GAGATCCCAGATCCTAAATCTG  215

seq1  AATCTCAGTGCACCAATGAGATGCTCAACTCCAAAATTCTTCCTGGGGTA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  AATCTCAGTGCACCAATGAGATGCTCAACTCCAAAATTC-TCCTGGGGTA  264

seq1  TCTCCCCTGGGCAAGCGGAGCTTAAAAGGCAGGAGCTTAATAAACATAGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCTGGGCAAGCGGAGCTTAAAAGGCAGGAGCTTAATAAACATAGG  314

seq1  AAAGGTGTTCTAAAGATACTAAGCTGTCCCTAGCTGTGACAAATGTCCAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTGTTCTAAAGATACTAAGCTGTCCCTAGCTGTGACAAATGTCCAA  364

seq1  CCAAGTCAGCAAAAGATCTCAGTACAAGCCTTTCCCTGAGGGTACCCCCC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTCAGCAAAAGATCTCAGTACAAGCCTTTCCCTGAGGGTACCCCCC  414

seq1  AAACACAGGCTGGTGAGAACAGCTTCCAAGTTTGTCCTCCCGGATCTCAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACAGGCTGGTGAGAACAGCTTCCAAGTTTGTCCTCCCGGATCTCAA  464

seq1  GGATATACTTAGTCTCTCCCCACTGCTGCATATTCATGCATTTTCTCCAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATACTTAGTCTCTCCCCACTGCTGCATATTCATGCATTTTCTCCAC  514

seq1  TCGATTACCATATCAGATATTTGCATTTGGTGCCTTTTCTGTTGCTCGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATTACCATATCAGATATTTGCATTTGGTGCCTTTTCTGTTGCTCGAA  564

seq1  GCACCATCATTTCTGTCGAGCTGCAAAGATTCCTGTTTCTTTGTCCTCTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATCATTTCTGTCGAGCTGCAAAGATTCCTGTTTCTTTGTCCTCTT  614

seq1  GCCTCCTATGACTTTTTATATCTCACATATGTAAATATAAAAATATTTTC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCTATGACTTTTTATATCTCACATATGTAAATATAAAAATATTTTC  664

seq1  TGAAGTTATAGGTGAGATGAAACATAGGCTAGGGGGAAAATCAGTGAAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTTATAGGTGAGATGAAACATAGGCTAGGGGGAAAATCAGTGAAGA  714

seq1  ATTTACAGATTCCTTTAGTACAAAGACACCACAGAGACATTGTGCCCAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACAGATTCCTTTAGTACAAAGACACCACAGAGACATTGTGCCCAGG  764

seq1  TGGGTTGGGGTAGGAACTGTAGGGAGATATTTGCAATGCTATAACAACTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTTGGGGTAGGAACTGTAGGGAGATATTTGCAATGCTATAACAACTT  814

seq1  ACAATATAGTTACTAAAGAACAAGAGATGTAGAAGCCATAGAATTACTTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATAGTTACTAAAGAACAAGAGATGTAGAAGCCATAGAATTACTTA  864

seq1  GGCTAGTAGGGGCACACGCAGGACTCTGCCACTTTCCTAACACAAGTCAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGTAGGGGCACACGCAGGACTCTGCCACTTTCCTAACACAAGTCAA  914

seq1  AGAAAGTAACACATAAGGTATGGGGGTGCTTCCACAAGATAGCAGCGTTT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGTAACACATAAGGTATGGGGGTGCTTCCACAAGATAGCAGCGTTT  964

seq1  AGGAAGTAATTTGGACCATTAGAGAGAAGCCAGAGTCGGTTCCCAGGGAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTAATTTGGACCATTAGAGAGAAGCCAGAGTCGGTTCCCAGGGAT  1014

seq1  CACTTTCTCCATTCTACTCTTCAGTCTCTTGTTTATTTGCCCTTAGCTTT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCTCCATTCTACTCTTCAGTCTCTTGTTTATTTGCCCTTAGCTTT  1064

seq1  ACTGCTACAAGAGAATCTCGTGGTGTTCCAATGTGTGACTAATAATGGGA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTACAAGAGAATCTCGTGGTGTTCCAATGTGTGACTAATAATGGGA  1114

seq1  TTTATAGACGACCAGACAGCGCAGTTTCCATTTTAAAACCATCACCTGAA  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAGACGACCAGACAGCGCAGTTTCCATTTTAAAACCATCACCTGAA  1164

seq1  TTC  1202
      |||
seq2  TTC  1167

seq1: chr10_24737556_24738417
seq2: B6Ng01-082L18.g_69_930

seq1  GAATTCCTTCAGCAGGAGATTACCATTCCTAATGTTGAAAGGATGTTAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCAGCAGGAGATTACCATTCCTAATGTTGAAAGGATGTTAAA  50

seq1  AGTTCGGGGCAGGGGTATGATAGCTGTTTTCTACTGAAGGGAGGTCTTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCGGGGCAGGGGTATGATAGCTGTTTTCTACTGAAGGGAGGTCTTTG  100

seq1  TCAGAGGGAGGTAGTTCTGGGTGCATTGAAGAGGGCTTCTCTGGTCATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGGGAGGTAGTTCTGGGTGCATTGAAGAGGGCTTCTCTGGTCATGT  150

seq1  AGCTAGGGAAGAGTTCCAATTTGGTCAGCTGTGATAGCTCAGGCTGTTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGGGAAGAGTTCCAATTTGGTCAGCTGTGATAGCTCAGGCTGTTGC  200

seq1  CACCCTGTGTTTCTAAAGAGACATCATGAGGGATATGTATAAGAGGGCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTGTGTTTCTAAAGAGACATCATGAGGGATATGTATAAGAGGGCTG  250

seq1  TAAGCAGATGAATTATTTATTGAGTAAAACTGGACTGTACATTCATTAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAGATGAATTATTTATTGAGTAAAACTGGACTGTACATTCATTAGA  300

seq1  CACAATGACAGACACACCAAGGGTCCCTAACATTTATGAGGCTCCTACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAATGACAGACACACCAAGGGTCCCTAACATTTATGAGGCTCCTACAT  350

seq1  ACTTAGTATATATGGCACTACCCATAAAAGATGCACATCTGAGCCCTTAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAGTATATATGGCACTACCCATAAAAGATGCACATCTGAGCCCTTAC  400

seq1  TATTAATTAAAACAATTAAATATTAATGTAGTCTCCCACTGGTGACACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAATTAAAACAATTAAATATTAATGTAGTCTCCCACTGGTGACACTC  450

seq1  ATGTATCCTTTTCTCAAGAAACATAAATGAAGCTCGTGGCTGGCTTCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATCCTTTTCTCAAGAAACATAAATGAAGCTCGTGGCTGGCTTCTCT  500

seq1  TCCCTTGTGTCTCACTGTGAGCTCAAATCCTTCCCATAAGCTGCATGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGTGTCTCACTGTGAGCTCAAATCCTTCCCATAAGCTGCATGGGT  550

seq1  TGAGTCCTTCCCCTGAATGGTCTCTGGTAGTGGTGGAGACTTCCAGACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTCCTTCCCCTGAATGGTCTCTGGTAGTGGTGGAGACTTCCAGACAA  600

seq1  GGTAACATCTCTCAGGACTTATGAGAAGAGATGAAGGAACAACCCTCACC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAACATCTCTCAGGACTTATGAGAAGAGATGAAGGAACAACCCTCACC  650

seq1  ACAGAGCCGGCAGCTGAGTCAGTTCCAGCCATCTCAGGACTGGTTCTCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGCCGGCAGCTGAGTCAGTTCCAGCCATCTCAGGACTGGTTCTCCT  700

seq1  GAACGTATTTCCTTCTTCTGACCTCCTACCTTTCTCTACCTCCCTCTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTATTTCCTTCTTCTGACCTCCTACCTTTCTCTACCTCCCTCTTTG  750

seq1  TTCCTGGAACTGCCTGTCCCTCTAGCTATAGAAAGAGCAGCAGGAAGGAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGGAACTGCCTGTCCCTCTAGCTATAGAAAGAGCAGCAGGAAGGAG  800

seq1  TTTGGCTCCCTTAAATCACTCTTTGGATCTACAAGAACACAGGCAGGGGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGCTCCCTTAAATCACTCTTTGGATCTACAAGAACACAGGCAGGGGT  850

seq1  GGGGTGGGGTGG  862
      ||| |||| |||
seq2  GGGTTGGGTTGG  862