BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-083P24
Chromosome10 (Build37)
Map Location 40,013,311 - 40,165,609
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAmd1, Amd2, LOC668051, Cdc2l6, LOC666374
Upstream geneFyn, LOC629337, Traf3ip2, LOC667964, EG667970, E130307A14Rik, Rev3l, EG666304, LOC213332, 4930547M16Rik, LOC667982, 2010001E11Rik, LOC667994, LOC100041085, BC021785, AI317395, EG666342, Slc16a10, Bxdc1, 2410016F19Rik
Downstream geneSlc22a16, Ddo, 9030224M15Rik, Cdc40, Wasf1, Gpr6, A530089I17Rik, LOC633979
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-083P24.bB6Ng01-083P24.g
ACCDH898094DH898095
length1,1591,058
definitionDH898094|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083P24, 5' end.DH898095|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-083P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(40,013,311 - 40,014,476)(40,164,563 - 40,165,609)
sequence
gaattccaagtgtgcagccaccagatccagcctggagcagtggcttcttt
ctatacattaagcaaaaactatgggacagcacaaataagtattgtgtatg
catgtgtgccatgagtgtatgtggaggtcaaagaggacaaatttggagtc
acttctccccacctttggtaggttccgggaggtcaagtttgcacggcaag
caagtgcttttcaatagtcaacaatacaattaaaactctcccaaggagac
agtgaattatcaaattacactagtgtgggctcacagctctagtctcagca
caaaggacactaaagcaagagtgagaatttgagagcagctggggcttcaa
agccagaccccctcttcttcccacccacaaagcaggctgggtatggtaac
atgcacctgtaactccagagctcttaaagaaaaaaggcagaagggttgag
tttgaggcaagcctggtgtatatgataatatcacatattacaaaacaaaa
aaacccaaaagcccccaaacagtattaccatggcaggcagcactttaggt
tcaaccccaaccacaggtgtaaaagaaccaaattctgagattttagtgac
aatccattctttgaggtaaaacattaaaatccaaccagagcagaaactac
tcaagtttcacacaatgcgtacttacttgaattgagtcaaacccactgta
atccctagcaagcttcaacaggggaaccagtgctttcagtaagagggtgg
taccacatgtcttcaaaatgaaacgtctcttggagacaaacatgctactc
tcactgcaacagaaagtcacaaaccatcaccactgcgtcaggtattatga
gaacacaagtcatctatcagtgtatcagtattgtacatcactggtgaatg
tatgttatgtacttatccaccaaaaccagctacacccaagttagaaaaca
actggctctgtatccttgtatagctcgtgactgtaacagtcttcctttcc
ttcatcacctaatagtagcttttcccactcctctttctacacacacatcc
atacacagctattcgactaattctgaatgtgttgcagctgctgtattcac
tttcaagattgtatacttggctaaatagaataattctatggccaatcaat
ttctgcaag
gaattcccagatagctaaggctacctaaaaacaaagcaaaacaagcaaac
aagccagcaaacaaaaagccaaagggaaaggagtggggaagagggatggg
aaaggcagaggtgcgaaatgcaagaatgcgacttcacgcttctagacatt
agagaacagagccctgccatacactagtcggctatggaacaaaatatgaa
gtacgttcccaatggtgaacactcacaatctacctagttatggggttagg
tacaagtgtcctttgatgggtaacatcccaattttaatagaagtatcaag
agatgaatgaacaccctaaaatatactaagattatttctgatatgtttta
aaattttggattttattccggggttccaaaaaccacatgtacactaatga
tccccaaattaagactactaggtctctaatctcccatgttatcttagaaa
tagatcatattcacaagtaccataaactccttccatctaagattaatttt
tccttctccctaacaaaactgtcttttcctagtattcctgggtcaacaaa
agcagaagtctgaccttggccctgtccttgaatctagtcattgctcctct
gcttcttaagaactaagtattcacaatggcctttcctcctctttttactc
atcagcttgctcagagcttcatgttttctcaccagctgactacagctact
tgatagagctgctgcctatgagtccataccagctccataaccctgagcca
tctcgcttaaaaacttgactggcctaggaaaacccatattttaaagacaa
caattaggatccaccataactggtcttccttgcttttttgccttttctct
tttgcagtgataccaacctgtcggtagtttcttagtctacatcttttatt
ggtgccattttcttctgcctgcaatgctccgagacccactgcttttcacc
atatgagcttatgtgcagtgttccaaggccctcacccagctgcttaagcc
tccaccttccgtgtttcttcagtacttgtacggctgagcttagtcctttg
aatgatgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_40013311_40014476
seq2: B6Ng01-083P24.b_47_1205

seq1  GAATTCCAAGTGTGCAGCCACCAGATCCAGCCTGGAGCAGTGGCTTCTTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGTGTGCAGCCACCAGATCCAGCCTGGAGCAGTGGCTTCTTT  50

seq1  CTATACATTAAGCAAAAACTATGGGACAGCACAAATAAGTATTGTGTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATACATTAAGCAAAAACTATGGGACAGCACAAATAAGTATTGTGTATG  100

seq1  CATGTGTGCCATGAGTGTATGTGGAGGTCAAAGAGGACAAATTTGGAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGCCATGAGTGTATGTGGAGGTCAAAGAGGACAAATTTGGAGTC  150

seq1  ACTTCTCCCCACCTTTGGTAGGTTCCGGGAGGTCAAGTTTGCACGGCAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTCCCCACCTTTGGTAGGTTCCGGGAGGTCAAGTTTGCACGGCAAG  200

seq1  CAAGTGCTTTTCAATAGTCAACAATACAATTAAAACTCTCCCAAGGAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGCTTTTCAATAGTCAACAATACAATTAAAACTCTCCCAAGGAGAC  250

seq1  AGTGAATTATCAAATTACACTAGTGTGGGCTCACAGCTCTAGTCTCAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAATTATCAAATTACACTAGTGTGGGCTCACAGCTCTAGTCTCAGCA  300

seq1  CAAAGGACACTAAAGCAAGAGTGAGAATTTGAGAGCAGCTGGGGCTTCAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGACACTAAAGCAAGAGTGAGAATTTGAGAGCAGCTGGGGCTTCAA  350

seq1  AGCCAGACCCCCTCTTCTTCCCACCCACAAAGCAGGCTGGGTATGGTAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGACCCCCTCTTCTTCCCACCCACAAAGCAGGCTGGGTATGGTAAC  400

seq1  ATGCACCTGTAACTCCAGAGCTCTTAAAGAAAAAAGGCAGAAGGGTTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACCTGTAACTCCAGAGCTCTTAAAGAAAAAAGGCAGAAGGGTTGAG  450

seq1  TTTGAGGCAAGCCTGGTGTATATGATAATATCACATATTACAAAACAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGCAAGCCTGGTGTATATGATAATATCACATATTACAAAACAAAA  500

seq1  AAACCCAAAAGCCCCCAAACAGTATTACCATGGCAGGCAGCACTTTAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCAAAAGCCCCCAAACAGTATTACCATGGCAGGCAGCACTTTAGGT  550

seq1  TCAACCCCAACCACAGGTGTAAAAGAACCAAATTCTGAGATTTTAGTGAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCCCAACCACAGGTGTAAAAGAACCAAATTCTGAGATTTTAGTGAC  600

seq1  AATCCATTCTTTGAGGTAAAACATTAAAATCCAACCAGAGCAGAAACTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATTCTTTGAGGTAAAACATTAAAATCCAACCAGAGCAGAAACTAC  650

seq1  TCAAGTTTCACACAATGCGTACTTACTTGAATTGAGTCAAACCCACTGTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGTTTCACACAATGCGTACTTACTTGAATTGAGTCAAACCCACTGTA  700

seq1  ATCCCTAGCAAGCTTCAACAGGGGAACCAGTGCTTTCAGTAAGAGGGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCTAGCAAGCTTCAACAGGGGAACCAGTGCTTTCAGTAAGAGGGTGG  750

seq1  TACCACATGTCTTCAAAATGAAACGTCTCTTGGAGACAAACATGCTACTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCACATGTCTTCAAAATGAAACGTCTCTTGGAGACAAACATGCTACTC  800

seq1  TCACTGCAACAGAAAGTCACAAACCATCACCACTGCGTCAGGTATTATGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGCAACAGAAAGTCACAAACCATCACCACTGCGTCAGGTATTATGA  850

seq1  GAACACAAGTCATCTATCAGTGTATCAGTATTGTACATCACTGGTGAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACACAAGTCATCTATCAGTGTATCAGTATTGTACATCACTGGTGAATG  900

seq1  TATGTTATGTACTTATCCACCAAAACCAGCTACAACCAAAGTTAGAAAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||
seq2  TATGTTATGTACTTATCCACCAAAACCAGCTAC-ACCCAAGTTAG-AAAA  948

seq1  CAACTGGCTCTGTATCCTTGTATAGCTCGTGACTGTAACAGGTCTTCCTT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CAACTGGCTCTGTATCCTTGTATAGCTCGTGACTGTAACA-GTCTTCCTT  997

seq1  CCTTCCATCACCTAATAGTTAGCTTTTCCCACT-CTC-TTCTACACACAC  1048
       | | ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  TCCTTCATCACCTAATAG-TAGCTTTTCCCACTCCTCTTTCTACACACAC  1046

seq1  ATCCATACACAGCTA-TCGACTAAATTCTGAATGTG-TGCAGCTGCGTGT  1096
      ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  ATCCATACACAGCTATTCGACT-AATTCTGAATGTGTTGCAGCTGC-TGT  1094

seq1  ATTTCAC-TTCAAGATTGTATAACTTTTGCTTAAATAGTATATATTCTAT  1145
      | ||||| ||||||||||||||    |||  ||||||| ||| |||||||
seq2  A-TTCACTTTCAAGATTGTATA---CTTGGCTAAATAGAATA-ATTCTAT  1139

seq1  -GCCAATCCATTTTCCTGCAAG  1166
       ||||||| ||||  |||||||
seq2  GGCCAATCAATTT--CTGCAAG  1159

seq1: chr10_40164563_40165609
seq2: B6Ng01-083P24.g_67_1124 (reverse)

seq1  ACACCATTC-AAGGACT-AGCTCAG-CGTAC-AGTACTGA--GAACACGG  44
      ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||   |||||||
seq2  ACATCATTCAAAGGACTAAGCTCAGCCGTACAAGTACTGAAGAAACACGG  50

seq1  AA-GTGGA-GCCTAAGCAGCTGGGTGAGGGCCTTGGAACACTGCACATAA  92
      || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGAGGCTTAAGCAGCTGGGTGAGGGCCTTGGAACACTGCACATAA  100

seq1  GCTCATATGGTG-AAAGCAGTGGGTCTCGGAGCATTGCAGGCAGAAG-AA  140
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  GCTCATATGGTGAAAAGCAGTGGGTCTCGGAGCATTGCAGGCAGAAGAAA  150

seq1  ATGGCACCAAT-AAAGATGTAGACTAAGAAACTACCGACAGGTTGGTATC  189
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCACCAATAAAAGATGTAGACTAAGAAACTACCGACAGGTTGGTATC  200

seq1  ACTGCAAAAGAGAAAAGGCAAAAAAGCAAGGAAGACCAGTTATGGTGGAT  239
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCAAAAGAGAAAAGGCAAAAAAGCAAGGAAGACCAGTTATGGTGGAT  250

seq1  CCTAATTGTTGTCTTTAAAATATGGGTTTTCCTAGGCCAGTCAAGTTTTT  289
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAATTGTTGTCTTTAAAATATGGGTTTTCCTAGGCCAGTCAAGTTTTT  300

seq1  AAGCGAGATGGCTCAGGGTTATGGAGCTGGTATGGACTCATAGGCAGCAG  339
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCGAGATGGCTCAGGGTTATGGAGCTGGTATGGACTCATAGGCAGCAG  350

seq1  CTCTATCAAGTAGCTGTAGTCAGCTGGTGAGAAAACATGAAGCTCTGAGC  389
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATCAAGTAGCTGTAGTCAGCTGGTGAGAAAACATGAAGCTCTGAGC  400

seq1  AAGCTGATGAGTAAAAAGAGGAGGAAAGGCCATTGTGAATACTTAGTTCT  439
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGATGAGTAAAAAGAGGAGGAAAGGCCATTGTGAATACTTAGTTCT  450

seq1  TAAGAAGCAGAGGAGCAATGACTAGATTCAAGGACAGGGCCAAGGTCAGA  489
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAGCAGAGGAGCAATGACTAGATTCAAGGACAGGGCCAAGGTCAGA  500

seq1  CTTCTGCTTTTGTTGACCCAGGAATACTAGGAAAAGACAGTTTTGTTAGG  539
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGCTTTTGTTGACCCAGGAATACTAGGAAAAGACAGTTTTGTTAGG  550

seq1  GAGAAGGAAAAATTAATCTTAGATGGAAGGAGTTTATGGTACTTGTGAAT  589
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGGAAAAATTAATCTTAGATGGAAGGAGTTTATGGTACTTGTGAAT  600

seq1  ATGATCTATTTCTAAGATAACATGGGAGATTAGAGACCTAGTAGTCTTAA  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCTATTTCTAAGATAACATGGGAGATTAGAGACCTAGTAGTCTTAA  650

seq1  TTTGGGGATCATTAGTGTACATGTGGTTTTTGGAACCCCGGAATAAAATC  689
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGGATCATTAGTGTACATGTGGTTTTTGGAACCCCGGAATAAAATC  700

seq1  CAAAATTTTAAAACATATCAGAAATAATCTTAGTATATTTTAGGGTGTTC  739
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTTTAAAACATATCAGAAATAATCTTAGTATATTTTAGGGTGTTC  750

seq1  ATTCATCTCTTGATACTTCTATTAAAATTGGGATGTTACCCATCAAAGGA  789
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCTCTTGATACTTCTATTAAAATTGGGATGTTACCCATCAAAGGA  800

seq1  CACTTGTACCTAACCCCATAACTAGGTAGATTGTGAGTGTTCACCATTGG  839
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGTACCTAACCCCATAACTAGGTAGATTGTGAGTGTTCACCATTGG  850

seq1  GAACGTACTTCATATTTTGTTCCATAGCCGACTAGTGTATGGCAGGGCTC  889
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACGTACTTCATATTTTGTTCCATAGCCGACTAGTGTATGGCAGGGCTC  900

seq1  TGTTCTCTAATGTCTAGAAGCGTGAAGTCGCATTCTTGCATTTCGCACCT  939
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTCTAATGTCTAGAAGCGTGAAGTCGCATTCTTGCATTTCGCACCT  950

seq1  CTGCCTTTCCCATCCCTCTTCCCCACTCCTTTCCCTTTGGCTTTTTGTTT  989
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTTTCCCATCCCTCTTCCCCACTCCTTTCCCTTTGGCTTTTTGTTT  1000

seq1  GCTGGCTTGTTTGCTTGTTTTGCTTTGTTTTTAGGTAGCCTTAGCTATCT  1039
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCTTGTTTGCTTGTTTTGCTTTGTTTTTAGGTAGCCTTAGCTATCT  1050

seq1  GGGAATTC  1047
      ||||||||
seq2  GGGAATTC  1058