BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091C11
Chromosome10 (Build37)
Map Location 10,598,799 - 10,719,629
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrm1
Upstream geneStxbp5, LOC100039238, LOC665110, 9130014G24Rik, Rab32, EG382450
Downstream geneShprh, Fbxo30, Epm2a, EG666732, LOC100039343
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091C11.bB6Ng01-091C11.g
ACCDH903261DH903262
length1,1301,141
definitionDH903261|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C11, 5' end.DH903262|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,718,496 - 10,719,629)(10,598,799 - 10,599,939)
sequence
gaattcctcttgattcgagccttccaagactttgcttgttatttcttctc
tccaatttttatcctcattattttccacagctgagatagtcccatcattg
aataacataattggtgttatttaaaagaaatctaatagctccccacctac
actccttttctttcattttatgctagataactggatgccatagcccactc
tttagcttcttcctctctatccaaagtcaaccctttctcagtctgttgtg
gttttatttcttcacaactatgccaaatctactctgacagtggaacttct
aaagccatgagatatttgtcaaagttcttgtgctgaattctctgaattat
aaaacatttaataatagcattagtaggataaatagtaattataacaagta
acaatatcagtggtacatgaacagaacctaagagtttactcacaggatag
cacttgggatctcttggttctcaaactacatatgaggtggctcaatttac
catccaagatcacagtgagaaagttctacagatgattactactacagccc
aaacctggaaaatattaaattctggacttgtattcacccatggctctctt
ttcttagtaatcttgtttggtttctcgtccatgatcatgtcttcaatctg
gcaccctctaaggtcctctcatcgattttcctactgtccctgtctctgtg
tgattgccattaccaagatttaatcacaaaaaggaatgagcctagtttgt
ctacataccacacaccaacttatttctatctgggacttagcatgggcctg
gtttagagttactgaatgacaatcgaatgtatcactgaatccgtatttac
tgtctgctgggttatgttcttaactcagtcctcagtcgattagcatattt
aaactactttaagtcttcatcgaatgtaatctgcatagctcagctaaaca
tttaaaaacactgctccagctctctttttaacagctctattcctcccttt
gcatatttaatcctggataaagcatgaatgtttatctgttgtatcattcc
agaaacctagcaactgcagaacttctatcatgacagtttgcatgttatgt
gtgtgttgtcgtctgtatgcctaaggcaca
gaattccatctctaactcatttaaaaaatccagacatggtggcaaaccca
gccctcctattttgagatggaaggcagagtcaggaaagcacagggccagt
tagtctggagtatgcagtgcagcaaaaacaagagagacccttgcctcaac
aaatagaaagagaagaacctattctcaatacctgtcatttgatttccaca
tatacaccatagtaaacatgcacccatactcacttacacatctacacaca
cacacacacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagaga
gagagagagagagagagagagagagagagagagagatttccagtagaacc
atacatagcaatttcaacttttatttggaaagtttgtaaagttttaagca
cccattccttgcagtaacatctccctatgggtgctgtatcattattcttt
gttttatttcccatttggaaagaaaccaggcttccttacttggctctaaa
tctgcatatctccttttgctaggctatcctcaaattcaaggcccccaaac
tgagcctgtcattggcaaaaccagagatccagatacttctgcctctgaga
tgtctacctcaaaaatgacattactgtgatgcccttacccagcttccaca
gtcccttaatccagttaaagccccagtcctaggggacatttacaactgca
aatccatcacttctttccagatcatttccattgctctagcttagacacta
acaatatcctacccagagcattgcactgggtctcaactggtcccactagt
tagagtttatgtaaaatatttattttccaattcatttaagtagggatatc
tctggaaattctacttagataagtacttctggatattctttatctaaaac
aatcctttgtgtgctttcatagctcttagcccaacatctatttgtttcat
ttataaacatatcattggtatcctttgtcttactagaccccaaatagctt
aggatatgtccatctaatttaataacatctctttgtatattttaagatta
tcatacatagcagatatgagcagtgggccatgattagtaaagaataatga
tagcttaagaatctattctattctgtttccaagcactaact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_10718496_10719629
seq2: B6Ng01-091C11.b_44_1173 (reverse)

seq1  TGTGCCTTTAGCATACAGACTGACAACACACACATACACATGCAAACCTG  50
      ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  TGTGCCTTAGGCATACAGAC-GACAACACACACATA-ACATGCAAA-CTG  47

seq1  TCATGATAG-AGTTCTGCAGTTGCTAGGTTTCTGGAATGATACAACAGAT  99
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGATAGAAGTTCTGCAGTTGCTAGGTTTCTGGAATGATACAACAGAT  97

seq1  AAACATTCATGCTTTTATCCAGGATTAAATATGCAAAGGGAGGAATAGAG  149
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATTCATGC-TTTATCCAGGATTAAATATGCAAAGGGAGGAATAGAG  146

seq1  CTG-TAAAGAGAGGAGCTGGAGCAGTGTTTTTAAATGTTTAGCTGAGCTA  198
      ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTAAAAAGA-GAGCTGGAGCAGTGTTTTTAAATGTTTAGCTGAGCTA  195

seq1  TGCAGATTACATTCGATGAAGACTTAAAGTAGTTTTAAATATGCTAATCG  248
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGCAGATTACATTCGATGAAGACTTAAAGTAG-TTTAAATATGCTAATCG  244

seq1  ACTGAGGACTGAGTTAAGAACATAACCCAGCAGACAGTAAATACGGATTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAGGACTGAGTTAAGAACATAACCCAGCAGACAGTAAATACGGATTC  294

seq1  AGTGATACATTCGATTGTCATTCAGTAACTCTAAACCAGGCCCATGCTAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATACATTCGATTGTCATTCAGTAACTCTAAACCAGGCCCATGCTAA  344

seq1  GTCCCAGATAGAAATAAGTTGGTGTGTGGTATGTAGACAAACTAGGCTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGATAGAAATAAGTTGGTGTGTGGTATGTAGACAAACTAGGCTCA  394

seq1  TTCCTTTTTGTGATTAAATCTTGGTAATGGCAATCACACAGAGACAGGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTTTGTGATTAAATCTTGGTAATGGCAATCACACAGAGACAGGGA  444

seq1  CAGTAGGAAAATCGATGAGAGGACCTTAGAGGGTGCCAGATTGAAGACAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGGAAAATCGATGAGAGGACCTTAGAGGGTGCCAGATTGAAGACAT  494

seq1  GATCATGGACGAGAAACCAAACAAGATTACTAAGAAAAGAGAGCCATGGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGGACGAGAAACCAAACAAGATTACTAAGAAAAGAGAGCCATGGG  544

seq1  TGAATACAAGTCCAGAATTTAATATTTTCCAGGTTTGGGCTGTAGTAGTA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATACAAGTCCAGAATTTAATATTTTCCAGGTTTGGGCTGTAGTAGTA  594

seq1  ATCATCTGTAGAACTTTCTCACTGTGATCTTGGATGGTAAATTGAGCCAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTGTAGAACTTTCTCACTGTGATCTTGGATGGTAAATTGAGCCAC  644

seq1  CTCATATGTAGTTTGAGAACCAAGAGATCCCAAGTGCTATCCTGTGAGTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATATGTAGTTTGAGAACCAAGAGATCCCAAGTGCTATCCTGTGAGTA  694

seq1  AACTCTTAGGTTCTGTTCATGTACCACTGATATTGTTACTTGTTATAATT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTAGGTTCTGTTCATGTACCACTGATATTGTTACTTGTTATAATT  744

seq1  ACTATTTATCCTACTAATGCTATTATTAAATGTTTTATAATTCAGAGAAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTATCCTACTAATGCTATTATTAAATGTTTTATAATTCAGAGAAT  794

seq1  TCAGCACAAGAACTTTGACAAATATCTCATGGCTTTAGAAGTTCCACTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCACAAGAACTTTGACAAATATCTCATGGCTTTAGAAGTTCCACTGT  844

seq1  CAGAGTAGATTTGGCATAGTTGTGAAGAAATAAAACCACAACAGACTGAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTAGATTTGGCATAGTTGTGAAGAAATAAAACCACAACAGACTGAG  894

seq1  AAAGGGTTGACTTTGGATAGAGAGGAAGAAGCTAAAGAGTGGGCTATGGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGTTGACTTTGGATAGAGAGGAAGAAGCTAAAGAGTGGGCTATGGC  944

seq1  ATCCAGTTATCTAGCATAAAATGAAAGAAAAGGAGTGTAGGTGGGGAGCT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAGTTATCTAGCATAAAATGAAAGAAAAGGAGTGTAGGTGGGGAGCT  994

seq1  ATTAGATTTCTTTTAAATAACACCAATTATGTTATTCAATGATGGGACTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGATTTCTTTTAAATAACACCAATTATGTTATTCAATGATGGGACTA  1044

seq1  TCTCAGCTGTGGAAAATAATGAGGATAAAAATTGGAGAGAAGAAATAACA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGCTGTGGAAAATAATGAGGATAAAAATTGGAGAGAAGAAATAACA  1094

seq1  AGCAAAGTCTTGGAAGGCTCGAATCAAGAGGAATTC  1134
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAGTCTTGGAAGGCTCGAATCAAGAGGAATTC  1130

seq1: chr10_10598799_10599939
seq2: B6Ng01-091C11.g_68_1208

seq1  GAATTCCATCTCTAACTCATTTAAAAAATCCAGACATGGTGGCAAACCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCTCTAACTCATTTAAAAAATCCAGACATGGTGGCAAACCCA  50

seq1  GCCCTCCTATTTTGAGATGGAAGGCAGAGTCAGGAAAGCACAGGGCCAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCTATTTTGAGATGGAAGGCAGAGTCAGGAAAGCACAGGGCCAGT  100

seq1  TAGTCTGGAGTATGCAGTGCAGCAAAAACAAGAGAGACCCTTGCCTCAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTGGAGTATGCAGTGCAGCAAAAACAAGAGAGACCCTTGCCTCAAC  150

seq1  AAATAGAAAGAGAAGAACCTATTCTCAATACCTGTCATTTGATTTCCACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGAAAGAGAAGAACCTATTCTCAATACCTGTCATTTGATTTCCACA  200

seq1  TATACACCATAGTAAACATGCACCCATACTCACTTACACATCTACACACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACACCATAGTAAACATGCACCCATACTCACTTACACATCTACACACA  250

seq1  CACACACACACACACACACACACACAC----AGAGAGAGAGAGAGAGAGA  296
      |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  300

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTCCAGTAGAACC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTTCCAGTAGAACC  350

seq1  ATACATAGCAATTTCAACTTTTATTTGGAAAGTTTGTAAAGTTTTAAGCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAGCAATTTCAACTTTTATTTGGAAAGTTTGTAAAGTTTTAAGCA  400

seq1  CCCATTCCTTGCAGTAACATCTCCCTATGGGTGCTGTATCATTATTCTTT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTCCTTGCAGTAACATCTCCCTATGGGTGCTGTATCATTATTCTTT  450

seq1  GTTTTATTTCCCATTTGGAAAGAAACCAGGCTTCCTTACTTGGCTCTAAA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATTTCCCATTTGGAAAGAAACCAGGCTTCCTTACTTGGCTCTAAA  500

seq1  TCTGCATATCTCCTTTTGCTAGGCTATCCTCAAATTCAAGGCCCCCAAAC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCATATCTCCTTTTGCTAGGCTATCCTCAAATTCAAGGCCCCCAAAC  550

seq1  TGAGCCTGTCATTGGCAAAACCAGAGATCCAGATACTTCTGCCTCTGAGA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCCTGTCATTGGCAAAACCAGAGATCCAGATACTTCTGCCTCTGAGA  600

seq1  TGTCTACCTCAAAAATGACATTACTGTGATGCCCTTACCCAGCTTCCACA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTACCTCAAAAATGACATTACTGTGATGCCCTTACCCAGCTTCCACA  650

seq1  GTCCCTTAATCCAGTTAAAGCCCCAGTCCTAGGGGACATTTACAACTGCA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTTAATCCAGTTAAAGCCCCAGTCCTAGGGGACATTTACAACTGCA  700

seq1  AATCCATCACTTCTTTCCAGATCATTTCCATTGCTCTAGCTTAGACACTA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCATCACTTCTTTCCAGATCATTTCCATTGCTCTAGCTTAGACACTA  750

seq1  ACAATATCCTACCCAGAGCATTGCACTGGGTCTCAACTGGTCCCACTAGT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATATCCTACCCAGAGCATTGCACTGGGTCTCAACTGGTCCCACTAGT  800

seq1  TAGAGTTTATGTAAAATATTTATTTTCCAATTCATTTAAGTA-GGATATC  845
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TAGAGTTTATGTAAAATATTTATTTTCCAATTCATTTAAGTAGGGATATC  850

seq1  TCTGGAAATTCTACTTAGATAAGTACTTCTGGATATTCTTTATCT-AAAC  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCTGGAAATTCTACTTAGATAAGTACTTCTGGATATTCTTTATCTAAAAC  900

seq1  AATCCTTTGTGTGCTTTCATAGCTCTTAGCCCAACATCTATTTGTTTCAT  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTTGTGTGCTTTCATAGCTCTTAGCCCAACATCTATTTGTTTCAT  950

seq1  TTATAAACATATCATTTGTTATCCTTTGTCTTACTAGACCCCCAAATAGC  994
      |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTATAAACATATCA-TTGGTATCCTTTGTCTTACTAGA-CCCCAAATAGC  998

seq1  TTAGGATATGTCCATCTAATTTAATAACATCTCTTTGTATATTGTAAAGA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||
seq2  TTAGGATATGTCCATCTAATTTAATAACATCTCTTTGTATATT-TTAAGA  1047

seq1  TTATCATACATAGCAGATAATGAGCAGTGGGCAATGAATAAGTAAAAGAA  1094
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||
seq2  TTATCATACATAGCAGAT-ATGAGCAGTGGGCCATG-ATTAGT-AAAGAA  1094

seq1  TAAATGATAGCTAAAG-ATCTATCCTATTCTG-TTCCAAGCACTTAACT  1141
      | |||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||
seq2  T-AATGATAGCTTAAGAATCTATTCTATTCTGTTTCCAAGCAC-TAACT  1141