BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-094B05
Chromosome10 (Build37)
Map Location 67,871,277 - 68,072,268
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700040L02Rik
Upstream geneEgr2, Gm237, LOC100040081, LOC100039618, Zfp365, Plekhk1, Arid5b, LOC100040136
Downstream geneEG665342, Tmem26, A930033H14Rik, Rhobtb1, LOC100040182, Cdc2a, LOC100039696, EG382371, Ank3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094B05.bB6Ng01-094B05.g
ACCDH905389DH905390
length232864
definitionDH905389|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094B05, 5' end.DH905390|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094B05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,871,277 - 67,871,507)(68,071,411 - 68,072,268)
sequence
cacaccaggtagccattattattcattttggatggttgatctcgaggcct
ccgtatctccttgtttaacaactcttctctgcatcctgcaggatggtggt
agtagttggggtggggcatttgaattcaatctccagcaaaggaagaaagg
gcaggcccttcctgttccattctgggactctcctgtaatgtcaggctgct
gtctgtttggtttagccattgcctcagaatac
gaattcatataaaaagctgagatagtaaatgaaataaattttggcaggta
gctagggatggaaggtggcctgtgttatgtgttaagtgggggacgaaatc
tagcaagagggagggcacaatagaaggatggccaatggttatgagagatc
ttcagtgaactctgaaccctgtgtctataccaacaatgttcttcataaag
taaggcattgtcagttgctttcctgaggaatgttccagactcagttctga
atatacaatttcaaatcctttatatacttcatttttgtgtcattgttcct
ttgaaggctaaagggcctaaatgagatctagtattaagaataagagaaat
acacacacacacacacacattataatatatatacacatatacacacatgt
atatacatgtatatataatagatataaaatacatatatatttgaattata
atgtatatttgcatatacaaaatgtatataatttgtatgtatatattgta
catatatcatatacatgttctgtgttattgtatgtattatgaataatata
tattatataacatatatgctgtataatatatatttaatatagtatgcgta
atatatgtatgtatatatgggcaatcatgtatgtgtaatatattaaaata
acataggcacatctattatatgtatatacattaagtatttatgtatgcat
ataacatatgtgtatatacatatatgatatacaaatatttatacatatat
gtgtataatataatatatatacattattaggcatgtatacattttatatg
tatttattgtgttagtatataatatgtatatattacatataatgtatata
tgtttatgttaaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_67871277_67871507
seq2: B6Ng01-094B05.b_53_283

seq1  CACACCAGGTAGCCATTATTATTCCTTTTGGATGGTTGATCTCGAGGCCT  50
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCAGGTAGCCATTATTATTCATTTTGGATGGTTGATCTCGAGGCCT  50

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTATCTCCTTGTTTAACAACTCTTCTCTGCATCCTGCAGGATGGTGGT  100

seq1  AGTAGTTGGGGTGGGGCATTTGAATTCAATCTCCAGCAAAGGAAGAAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGTTGGGGTGGGGCATTTGAATTCAATCTCCAGCAAAGGAAGAAAGG  150

seq1  GCAGGCCCTTCCTGTTCCATTCTGGGACTCACCTGCAATGTCAGGCTGCT  200
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  GCAGGCCCTTCCTGTTCCATTCTGGGACTCTCCTGTAATGTCAGGCTGCT  200

seq1  GTCTGTTTGGTTCAGCCAAGGCCTCAGAATA  231
      |||||||||||| |||||  |||||||||||
seq2  GTCTGTTTGGTTTAGCCATTGCCTCAGAATA  231

seq1: chr10_68071411_68072268
seq2: B6Ng01-094B05.g_70_933 (reverse)

seq1  ATTTAACAT-AACATATATACA-TATATGTAATATATACATATTATATAC  48
      ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACATAAACATATATACATTATATGTAATATATACATATTATATAC  50

seq1  TAACACAATAAATACATAT-AAATGTATACATGCCTAAT-ATGTATATAT  96
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TAACACAATAAATACATATAAAATGTATACATGCCTAATAATGTATATAT  100

seq1  ATTATATTATACACATATATGTATAAATATTTGTATATCATATATGTATA  146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTATACACATATATGTATAAATATTTGTATATCATATATGTATA  150

seq1  TACACATATGTTATATGCATACAT-AATACTTAATGTATATACATATAAT  195
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATATGTTATATGCATACATAAATACTTAATGTATATACATATAAT  200

seq1  AGATGTGCCTATGTTA-TTTAATATATTACACATACATGATTGCCCATAT  244
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTGCCTATGTTATTTTAATATATTACACATACATGATTGCCCATAT  250

seq1  ATACATACATATATTACGCATACTATATTAAATATATATTATACAGCATA  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATACATATATTACGCATACTATATTAAATATATATTATACAGCATA  300

seq1  TATGTTATATAATATATATTATTCATAATACATACAATAACACAGAACAT  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTATATAATATATATTATTCATAATACATACAATAACACAGAACAT  350

seq1  GTATATGATATATGTACAATATATACATACAAATTATATACATTTTGTAT  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATGATATATGTACAATATATACATACAAATTATATACATTTTGTAT  400

seq1  ATGCAAATATACATTATAATTCAAATATATATGTATTTTATATCTATTAT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAAATATACATTATAATTCAAATATATATGTATTTTATATCTATTAT  450

seq1  ATATACATGTATATACATGTGTGTATATGTGTATATATATTATAATGTGT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACATGTATATACATGTGTGTATATGTGTATATATATTATAATGTGT  500

seq1  GTGTGTGTGTGTGTATTTCTCTTATTCTTAATACTAGATCTCATTTAGGC  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTATTTCTCTTATTCTTAATACTAGATCTCATTTAGGC  550

seq1  CCTTTAGCCTTCAAAGGAACAATGACACAAAAATGAAGTATATAAAGGAT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTAGCCTTCAAAGGAACAATGACACAAAAATGAAGTATATAAAGGAT  600

seq1  TTGAAATTGTATATTCAGAACTGAGTCTGGAACATTCCTCAGGAAAGCAA  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAATTGTATATTCAGAACTGAGTCTGGAACATTCCTCAGGAAAGCAA  650

seq1  CTGACAATGCCTTACTTTATGAAGAACATTGTTGGTATAGACACAGGGTT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACAATGCCTTACTTTATGAAGAACATTGTTGGTATAGACACAGGGTT  700

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGTTCACTGAAGATCTCTCATAACCATTGGCCATCCTTCTATTGTGC  750

seq1  CCTCCCTCTTGCTAGATTTCGTCCCCCACTTAACACATAACACAGGCCAC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTCTTGCTAGATTTCGTCCCCCACTTAACACATAACACAGGCCAC  800

seq1  CTTCCATCCCTAGCTACCTGCCAAAATTTATTTCATTTACTATCTCAGCT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATCCCTAGCTACCTGCCAAAATTTATTTCATTTACTATCTCAGCT  850

seq1  TATTATATGAATTC  858
      | ||||||||||||
seq2  TTTTATATGAATTC  864