BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-098O09
Chromosome10 (Build37)
Map Location 108,838,062 - 109,037,045
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePawr, EG667814, Syt1, EG368203
Downstream geneNav3, LOC100042497, LOC100042502, LOC100042506, LOC100042510, LOC667855
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-098O09.bB6Ng01-098O09.g
ACCDH908847DH908848
length1,227974
definitionDH908847|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O09, 5' end.DH908848|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-098O09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,838,062 - 108,839,287)(109,036,066 - 109,037,045)
sequence
gaattcatttacagaaagaggcaaaaataacagagagttaaatgataagt
gacagagattaagaaatacatttacaacataactaatgtagtgtcaaagt
gaagacgtgggatgagggaacattgatggcaaagtcaaaacacaagacaa
ggtaagtttaaatggattcagttcaaaatgaaaaacaacatatgaaatca
atcacttagccaggcagtggtggcacaagcctttaactccaccacttggg
agacagaggcaggtggatttctgagtttgaggccagcctggtctacagaa
tgagttccaggacagccagggctatacacagagaaaatctgtctcaaaaa
aacaacaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaacaaaaaaccaacaacaac
gacaacaaaaatcacttatttgatagactattttgaagatcagaataaca
ggttggagaacaagggaaatgggtcgaagctaactacatgctcaactggc
tgatgtgtgaaatatttcagggtgtaacacagcctccacccccccacacc
ccggccagcccccgtagtgtctatgcttagaacgtccaaatgagtagatg
acaaatctctgaaattgtaaagccactaaaccactatgaaacctgtacta
atatatactctcactgatacatagggatacaattctttggattctaatca
atgtgctgctaagtaatgcattgctaattaattaatgagagtttgtgatg
ctgctgttgcaattaaagctgaattttttttcactgaaactcttaacaaa
ggtgaactttgtgaaggaaaacagttccctaaatataaaatgtttctgtt
acttgattttagttgttaataaaaatgtcattaattatagaataaaggct
agtttcaatgaaacaattctagccagcatgtaactgttggagtaaatata
cttgaacaattctacttatatacaaatccttaatataaaatgtaagcatt
caataacactgattattcaccagggctaatcagagatatgcttccttccc
tccaagcttctcccattagacccttttccttcgtgtctttcaaatcatag
gcccttctttcactaatttattggttgcttaacattccattaaccaagct
cagataattggacccaaccgtcaaccgaattcatcgaatggcttaacctt
ctacttcctgtcctagacttccacttc
gaattccatgattaaataccatgctacacaaaatgaattacataatgtat
attgctatagagtattctaaaagaattagatataataaaacatgtttcag
attcatttataaaatttggaagcacccatgtacttatgaataattaactt
cctaattataagatccttctctattcttataagtacttcccattgcctgt
aatagagaaaattttttctttgtctttgacgtgtttgaaagatagttttt
tgacatatgctacaatgttaatgtttcctttctttagattaatttttatc
attgaatatttcatcagaaagtggatttaaaaccacttgttttgaagctt
tgtcaggataggaatagtcagatgaaaaccctaaactaaagatgtcagtg
tagtcttgatttcccttgtgggaacttctctctgtggctgtgatggttgt
attgtctgctctttgccctcacattctcattaggtgccagggagtctgca
gtcccagggggccaatgcttcatagttctgatctatatatgagaacgaac
gtccttgtttattattagatatctttgtcatttacatttcaaatgctatc
cccaaagtcccctatatctacccaccccctgccctgatccccaacccacc
cactcctgcttcctggccctggcattcccctggactggggaatatgatct
tcacaagaccaaggtcctctcctcccattgatggccaactaggccatcct
ctgctacatatgtaactagagacacagctctggaggtactggttagttca
tattgttcctcctatagcgttgcagaccccttcagctccttgggtacttt
ctctagctccttcattagagtttctggagctattctctcatgctattcca
gacgaaggaaggagggacagaaggaacactgatttcaatattcaaacttt
ccagtgtatgagattgttaaagaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_108838062_108839287
seq2: B6Ng01-098O09.b_47_1273

seq1  GAATTCATTTACAGAAAGAGGCAAAAATAACAGAGAGTTAAATGATAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTTACAGAAAGAGGCAAAAATAACAGAGAGTTAAATGATAAGT  50

seq1  GACAGAGATTAAGAAATACATTTACAACATAACTAATGTAGTGTCAAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGATTAAGAAATACATTTACAACATAACTAATGTAGTGTCAAAGT  100

seq1  GAAGACGTGGGATGAGGGAACATTGATGGCAAAGTCAAAACACAAGACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACGTGGGATGAGGGAACATTGATGGCAAAGTCAAAACACAAGACAA  150

seq1  GGTAAGTTTAAATGGATTCAGTTCAAAATGAAAAACAACATATGAAATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAAGTTTAAATGGATTCAGTTCAAAATGAAAAACAACATATGAAATCA  200

seq1  ATCACTTAGCCAGGCAGTGGTGGCACAAGCCTTTAACTCCACCACTTGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTTAGCCAGGCAGTGGTGGCACAAGCCTTTAACTCCACCACTTGGG  250

seq1  AGACAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAA  300

seq1  TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACACAGAGAAAATCTGTCTCAAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCTATACACAGAGAAAATCTGTCTCAAAAA  350

seq1  AACAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAACAAAAAACCAACAACAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAAACAAAAAACCAACAACAAC  400

seq1  GACAACAAAAATCACTTATTTGATAGACTATTTTGAAGATCAGAATAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAACAAAAATCACTTATTTGATAGACTATTTTGAAGATCAGAATAACA  450

seq1  GGTTGGAGAACAAGGGAAATGGGTCGAAGCTAACTACATGCTCAACTGGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGGAGAACAAGGGAAATGGGTCGAAGCTAACTACATGCTCAACTGGC  500

seq1  TGATGTGTGAAATATTTCAGGGTGTAACACAGCCTCCACCCCCCCACACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGTGAAATATTTCAGGGTGTAACACAGCCTCCACCCCCCCACACC  550

seq1  CCGGCCAGCCCCCGTAGTGTCTATGCTTAGAACGTCCAAATGAGTAGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCCAGCCCCCGTAGTGTCTATGCTTAGAACGTCCAAATGAGTAGATG  600

seq1  ACAAATCTCTGAAATTGTAAAGCCACTAAACCACTATGAAACCTGTACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATCTCTGAAATTGTAAAGCCACTAAACCACTATGAAACCTGTACTA  650

seq1  ATATATACTCTCACTGATACATAGGGATACAATTCTTTGGATTCTAATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATACTCTCACTGATACATAGGGATACAATTCTTTGGATTCTAATCA  700

seq1  ATGTGCTGCTAAGTAATGCATTGCTAATTAATTAATGAGAGTTTGTGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTGCTAAGTAATGCATTGCTAATTAATTAATGAGAGTTTGTGATG  750

seq1  CTGCTGTTGCAATTAAAGCTGAA-TTTTTTTCACTGAAACTCTTAACAAA  799
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGTTGCAATTAAAGCTGAATTTTTTTTCACTGAAACTCTTAACAAA  800

seq1  GGTGAACTTTGTGAAGGAAAACAGTTCCCTAAATATAAAATGTTTCTGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAACTTTGTGAAGGAAAACAGTTCCCTAAATATAAAATGTTTCTGTT  850

seq1  ACTTGATTTTAGTTGTTAATAAAAATGTCATTAATTATAGAAT-AAGGCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  ACTTGATTTTAGTTGTTAATAAAAATGTCATTAATTATAGAATAAAGGCT  900

seq1  AGTTTCAATGAAACAAATTCTAGCCAGCATGTAACTGTTGGAGTAAATAT  948
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCAATGAAAC-AATTCTAGCCAGCATGTAACTGTTGGAGTAAATAT  949

seq1  ACTTGAACAATTCTACTTATATACAAATCCTTAATATAAAATGTAAGCAT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGAACAATTCTACTTATATACAAATCCTTAATATAAAATGTAAGCAT  999

seq1  TCAATAACCACTGATTATTCACCAGGGCTAATCAGAGATAATGCTTTCCT  1048
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
seq2  TCAATAA-CACTGATTATTCACCAGGGCTAATCAGAGAT-ATGCTTCCTT  1047

seq1  CCCTCCAAGC-TCTCCCA-TAGACCCTTTT-CTTCGTGTCTTTCAAAATC  1095
      |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||
seq2  CCCTCCAAGCTTCTCCCATTAGACCCTTTTCCTTCGTGTCTTTC-AAATC  1096

seq1  ATAGCCCCTTCCTTCACTAA-TTATT-GTTACAT-ACATATCATTTACCA  1142
      |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | | ||||  |||| ||||
seq2  ATAGGCCCTTCTTTCACTAATTTATTGGTTGCTTAACATTCCATTAACCA  1146

seq1  AGCTCAG-TAAATAGCACCAACCGTCAACACCAATTTCATCAGATATGCT  1191
      ||||||| ||| | |  ||||||||||  ||| | |||||| ||   |||
seq2  AGCTCAGATAATTGGACCCAACCGTCA--ACCGAATTCATC-GAATGGCT  1193

seq1  TAATCTTTTCTACTTCCTGT-CTAGTACTCCACTTC  1226
      ||| |  ||||||||||||| ||||   ||||||||
seq2  TAACC--TTCTACTTCCTGTCCTAGACTTCCACTTC  1227

seq1: chr10_109036066_109037045
seq2: B6Ng01-098O09.g_69_1042 (reverse)

seq1  TTCTTTAACAATCTCACTATAC-CTGGGAAGTTTTGAATATTGAAATCAG  49
      |||||||||||||||   |||| |||| ||| ||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTAACAATCTC---ATACACTGGAAAG-TTTGAATATTGAAATCAG  46

seq1  TGGTTCCCTTCTGTCCCTCCTTCCTTCCTTCTGGAATAGCATGAGAGAAT  99
      ||  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||
seq2  TG--TTCCTTCTGTCCCTCCTTCCTT-CGTCTGGAATAGCATGAGAGAAT  93

seq1  AGCTCCAGAAACTCTAATGAAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCAGAAACTCTAATGAAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTGA  143

seq1  AGGGGTCTGCAACGCTATAGGAGGAACAATATGAACTAACCAGTACCTCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTCTGCAACGCTATAGGAGGAACAATATGAACTAACCAGTACCTCC  193

seq1  AGAGCTGTGTCTCTAGTTACATATGTAGCAGAGGATGGCCTAGTTGGCCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTGTGTCTCTAGTTACATATGTAGCAGAGGATGGCCTAGTTGGCCA  243

seq1  TCAATGGGAGGAGAGGACCTTGGTCTTGTGAAGATCATATTCCCCAGTCC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGGAGGAGAGGACCTTGGTCTTGTGAAGATCATATTCCCCAGTCC  293

seq1  AGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGGGATCAGGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAATGCCAGGGCCAGGAAGCAGGAGTGGGTGGGTTGGGGATCAGGG  343

seq1  CAGGGGGTGGGTAGATATAGGGGACTTTGGGGATAGCATTTGAAATGTAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGGTGGGTAGATATAGGGGACTTTGGGGATAGCATTTGAAATGTAA  393

seq1  ATGACAAAGATATCTAATAATAAACAAGGACGTTCGTTCTCATATATAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACAAAGATATCTAATAATAAACAAGGACGTTCGTTCTCATATATAGA  443

seq1  TCAGAACTATGAAGCATTGGCCCCCTGGGACTGCAGACTCCCTGGCACCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAACTATGAAGCATTGGCCCCCTGGGACTGCAGACTCCCTGGCACCT  493

seq1  AATGAGAATGTGAGGGCAAAGAGCAGACAATACAACCATCACAGCCACAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGAATGTGAGGGCAAAGAGCAGACAATACAACCATCACAGCCACAG  543

seq1  AGAGAAGTTCCCACAAGGGAAATCAAGACTACACTGACATCTTTAGTTTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGTTCCCACAAGGGAAATCAAGACTACACTGACATCTTTAGTTTA  593

seq1  GGGTTTTCATCTGACTATTCCTATCCTGACAAAGCTTCAAAACAAGTGGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTTCATCTGACTATTCCTATCCTGACAAAGCTTCAAAACAAGTGGT  643

seq1  TTTAAATCCACTTTCTGATGAAATATTCAATGATAAAAATTAATCTAAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAATCCACTTTCTGATGAAATATTCAATGATAAAAATTAATCTAAAG  693

seq1  AAAGGAAACATTAACATTGTAGCATATGTCAAAAAACTATCTTTCAAACA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAAACATTAACATTGTAGCATATGTCAAAAAACTATCTTTCAAACA  743

seq1  CGTCAAAGACAAAGAAAAAATTTTCTCTATTACAGGCAATGGGAAGTACT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCAAAGACAAAGAAAAAATTTTCTCTATTACAGGCAATGGGAAGTACT  793

seq1  TATAAGAATAGAGAAGGATCTTATAATTAGGAAGTTAATTATTCATAAGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGAATAGAGAAGGATCTTATAATTAGGAAGTTAATTATTCATAAGT  843

seq1  ACATGGGTGCTTCCAAATTTTATAAATGAATCTGAAACATGTTTTATTAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGGTGCTTCCAAATTTTATAAATGAATCTGAAACATGTTTTATTAT  893

seq1  ATCTAATTCTTTTAGAATACTCTATAGCAATATACATTATGTAATTCATT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATTCTTTTAGAATACTCTATAGCAATATACATTATGTAATTCATT  943

seq1  TTGTGTAGCATGGTATTTAATCATGGAATTC  980
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTAGCATGGTATTTAATCATGGAATTC  974