BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104F23
Chromosome10 (Build37)
Map Location 90,222,371 - 90,425,470
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnks1b
Upstream geneE030041M21Rik, E530015N03Rik, LOC100043039, LOC544719
Downstream geneApaf1, 1200009F10Rik, Slc25a3, Tmpo, LOC100041769
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104F23.bB6Ng01-104F23.g
ACCDH912693DH912694
length1,1701,171
definitionDH912693|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104F23, 5' end.DH912694|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104F23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(90,424,285 - 90,425,470)(90,222,371 - 90,223,532)
sequence
gaattcaccatatcaggggctaccatgaagttgaggtctggggtccaact
ctgtcaaaggtcacagttattcctttctatgtcttgaaccttggaagtca
gcatggccaggctcatcttgtgtaattgccacctgtgggcataaactgga
attcttttaggtttgtattagttacctctgaaccctaaaaatgctatgta
gtcatgacctaggctcctcctgcatctttgtggcttaatagaagacagtc
tcctgggactaaggacgtagctcaatgatagaatgcttagccagcacttt
caaggctttaggtttaacctccaggttaccggtccaccataaatctctag
ggacacatgacaagtggctttgaatgttttctacattacacagtccagcg
aaggacagtaacatgcatgtgcgttgtgtatttggtgtggccatgggggt
aattattggaaggtgcttactctgaccctcagttttcttatcatgcatag
ctatctatcttaatggatcattctgagactcactaacaatattgagctca
atggcagtaagatccaacatgtattctttactgtgtgccacgcggcatga
aaagtgcgttatcatttaggataaaggcagggagtcccaattccgtgggg
gataaaaatggggtgcatataaaaaaatcacactttcactttctttttct
ctttcgtaagggcacccatatgtagataagaaacttaaggagccatcata
tctcaagtatgaagtctaacagtacccagaaaatgcacatttttatttct
cttttgcaaactgggggtgtggaggtaactggtatccactgtgggttctt
ccaggcagcttagcatcattggatgcttactgggcttgtggtggccatgc
ccctgctccctggcctgggtctaacctgtagtgcccataaagtgctcatc
caatgacggagggccaaaggttccaccgagcttcaaaggagatcgagaga
acaaagaatgtttctcctgctgtcctgcatcccagtcctgaggctgatct
ggcacaatcctttcttttgatgtagaaactgtagcatagacctgtaggca
gtctcctcaccccacttcccccggacaagtcttgtacccaaggtatgaca
gtagatttctccacttagtt
gaattctagatgtggtggcaagtagggcttgcctggtaaccagtagctat
gcggggcggggaatgggggaatgagaccatggaagaatgctgcaattctt
gtttacctgtctgctgcagcattcattcactgccctcacaaagattcaga
agacagaggcaagttccaggggcatggcccacaggcttgtcagagctcca
ggcctggagttcaagtcttggtcacaaaggtctgtcctccagggtcacat
ttgtaggtgctttgcatcgtggaaaagtagatgaaaagtgctgaattcta
ttcagaggctcaagtccaggatatgatcctgcgtattccttcattccata
ttcagctcctatattccacagtcacctacatcctcatccttgccacccat
ctaaaagatgtgacagttcagattgccagaactaagttccttatcgttcc
taaaagcctcaccctgcagctttctctcatctagacgcatggcacagctc
cagcttcctgattgctcaagacaaatcttgaatgcctggattctgatgcc
tctctgtcttctatattcccaatctagcctgtcagcaaatcctgttggct
ttgcccctaggatgcgtttagaatctaccacctctgaacccttccattac
tgcttcggtagctcaagccaccatcaacacacacaccacacacacacaca
tacacacatgcacagacaagtgcctgcacacaaaatacacacgtgttcat
acatgcatgcacatgcatgcatgcacctgcataatcatgcacacacatgc
acacatacacatgcacacatacatgcatgagctcttgagtacatgcaccc
tccacacatgctcgtacacacacacacacacacacctcttttttttattt
tagcaggcagaaatacctatggtataatatctgacctcatctttgctctc
atttcctcaaagcttcctactgcagctctagaaagcttctcctttctaat
cccctgttattccagcacacactgggccccaatggcttctggaattccac
tcccttggggttctctttttcctaagcagaaaaaaagccttacttcaatc
ggtcagggtctatctgtaaatttcacctctcaaagggagaacaattgaat
ccttaaaatacctttctctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr10_90424285_90425470
seq2: B6Ng01-104F23.b_43_1212 (reverse)

seq1  AACTAAGTGGAGAATTCTTACATGTTCCATTCCCTGGGTACCAGGACTTG  50
      |||||||||||||| || ||| |||  ||| || |||||| || ||||||
seq2  AACTAAGTGGAGAAATC-TAC-TGT--CATACCTTGGGTA-CAAGACTTG  45

seq1  TTCTGGGGGGAGTTGGGGTGGAGGGAGATTGCCTACA-GTCTATGCTACA  99
      | |  ||||||  |||||||   ||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  TCC--GGGGGAAGTGGGGTG--AGGAGACTGCCTACAGGTCTATGCTACA  91

seq1  GTTTTCCTACAATCAAAAGGAAGGA-TGTGCCAGATCAGCCTCAGGACTG  148
      ||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTT--CTAC-ATCAAAAGAAAGGATTGTGCCAGATCAGCCTCAGGACTG  138

seq1  GGATGCAGGACAGCAGGGAGAAACATTTCTTTGTTTCTCTGCGATCCTCC  198
      ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||
seq2  GGATGCAGGACAGCA-GGAGAAACA-TTCTTTG-TTCTCT-CGAT-CTCC  183

seq1  TTTGAAGCTCGGTGGAACCTTTGGCCCCTCCGTCATTGGATGAGCACTTT  248
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAAGCTCGGTGGAACCTTTGG-CCCTCCGTCATTGGATGAGCACTTT  232

seq1  ATGGGCACTACAGGTTAGACCCAGGCCAGGGAGCAGGGGCATGGCCACCA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCACTACAGGTTAGACCCAGGCCAGGGAGCAGGGGCATGGCCACCA  282

seq1  CAAGCCCAGTAAGCATCCAATGATGCTAAGCTGCCTGGAAGAACCCACAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCCCAGTAAGCATCCAATGATGCTAAGCTGCCTGGAAGAACCCACAG  332

seq1  TGGATACCAGTTACCTCCACACCCCCAGTTTGCAAAAGAGAAATAAAAAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATACCAGTTACCTCCACACCCCCAGTTTGCAAAAGAGAAATAAAAAT  382

seq1  GTGCATTTTCTGGGTACTGTTAGACTTCATACTTGAGATATGATGGCTCC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCATTTTCTGGGTACTGTTAGACTTCATACTTGAGATATGATGGCTCC  432

seq1  TTAAGTTTCTTATCTACATATGGGTGCCCTTACGAAAGAGAAAAAGAAAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTTCTTATCTACATATGGGTGCCCTTACGAAAGAGAAAAAGAAAG  482

seq1  TGAAAGTGTGATTTTTTTATATGCACCCCATTTTTATCCCCCACGGAATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGTGTGATTTTTTTATATGCACCCCATTTTTATCCCCCACGGAATT  532

seq1  GGGACTCCCTGCCTTTATCCTAAATGATAACGCACTTTTCATGCCGCGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTCCCTGCCTTTATCCTAAATGATAACGCACTTTTCATGCCGCGTG  582

seq1  GCACACAGTAAAGAATACATGTTGGATCTTACTGCCATTGAGCTCAATAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACAGTAAAGAATACATGTTGGATCTTACTGCCATTGAGCTCAATAT  632

seq1  TGTTAGTGAGTCTCAGAATGATCCATTAAGATAGATAGCTATGCATGATA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGTGAGTCTCAGAATGATCCATTAAGATAGATAGCTATGCATGATA  682

seq1  AGAAAACTGAGGGTCAGAGTAAGCACCTTCCAATAATTACCCCCATGGCC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAACTGAGGGTCAGAGTAAGCACCTTCCAATAATTACCCCCATGGCC  732

seq1  ACACCAAATACACAACGCACATGCATGTTACTGTCCTTCGCTGGACTGTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAAATACACAACGCACATGCATGTTACTGTCCTTCGCTGGACTGTG  782

seq1  TAATGTAGAAAACATTCAAAGCCACTTGTCATGTGTCCCTAGAGATTTAT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGTAGAAAACATTCAAAGCCACTTGTCATGTGTCCCTAGAGATTTAT  832

seq1  GGTGGACCGGTAACCTGGAGGTTAAACCTAAAGCCTTGAAAGTGCTGGCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGACCGGTAACCTGGAGGTTAAACCTAAAGCCTTGAAAGTGCTGGCT  882

seq1  AAGCATTCTATCATTGAGCTACGTCCTTAGTCCCAGGAGACTGTCTTCTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCATTCTATCATTGAGCTACGTCCTTAGTCCCAGGAGACTGTCTTCTA  932

seq1  TTAAGCCACAAAGATGCAGGAGGAGCCTAGGTCATGACTACATAGCATTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCCACAAAGATGCAGGAGGAGCCTAGGTCATGACTACATAGCATTT  982

seq1  TTAGGGTTCAGAGGTAACTAATACAAACCTAAAAGAATTCCAGTTTATGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGTTCAGAGGTAACTAATACAAACCTAAAAGAATTCCAGTTTATGC  1032

seq1  CCACAGGTGGCAATTACACAAGATGAGCCTGGCCATGCTGACTTCCAAGG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGGTGGCAATTACACAAGATGAGCCTGGCCATGCTGACTTCCAAGG  1082

seq1  TTCAAGACATAGAAAGGAATAACTGTGACCTTTGACAGAGTTGGACCCCA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGACATAGAAAGGAATAACTGTGACCTTTGACAGAGTTGGACCCCA  1132

seq1  GACCTCAACTTCATGGTAGCCCCTGATATGGTGAATTC  1186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCAACTTCATGGTAGCCCCTGATATGGTGAATTC  1170

seq1: chr10_90222371_90223532
seq2: B6Ng01-104F23.g_66_1236

seq1  GAATTCTAGATGTGGTGGCAAGTAGGGCTTGCCTGGTAACCAGTAGCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGATGTGGTGGCAAGTAGGGCTTGCCTGGTAACCAGTAGCTAT  50

seq1  GCGGGGCGGGGAATGGGGGAATGAGACCATGGAAGAATGCTGCAATTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGGGCGGGGAATGGGGGAATGAGACCATGGAAGAATGCTGCAATTCTT  100

seq1  GTTTACCTGTCTGCTGCAGCATTCATTCACTGCCCTCACAAAGATTCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACCTGTCTGCTGCAGCATTCATTCACTGCCCTCACAAAGATTCAGA  150

seq1  AGACAGAGGCAAGTTCCAGGGGCATGGCCCACAGGCTTGTCAGAGCTCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGGCAAGTTCCAGGGGCATGGCCCACAGGCTTGTCAGAGCTCCA  200

seq1  GGCCTGGAGTTCAAGTCTTGGTCACAAAGGTCTGTCCTCCAGGGTCACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTGGAGTTCAAGTCTTGGTCACAAAGGTCTGTCCTCCAGGGTCACAT  250

seq1  TTGTAGGTGCTTTGCATCGTGGAAAAGTAGATGAAAAGTGCTGAATTCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAGGTGCTTTGCATCGTGGAAAAGTAGATGAAAAGTGCTGAATTCTA  300

seq1  TTCAGAGGCTCAAGTCCAGGATATGATCCTGCGTATTCCTTCATTCCATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGGCTCAAGTCCAGGATATGATCCTGCGTATTCCTTCATTCCATA  350

seq1  TTCAGCTCCTATATTCCACAGTCACCTACATCCTCATCCTTGCCACCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCTCCTATATTCCACAGTCACCTACATCCTCATCCTTGCCACCCAT  400

seq1  CTAAAAGATGTGACAGTTCAGATTGCCAGAACTAAGTTCCTTATCGTTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAGATGTGACAGTTCAGATTGCCAGAACTAAGTTCCTTATCGTTCC  450

seq1  TAAAAGCCTCACCCTGCAGCTTTCTCTCATCTAGACGCATGGCACAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGCCTCACCCTGCAGCTTTCTCTCATCTAGACGCATGGCACAGCTC  500

seq1  CAGCTTCCTGATTGCTCAAGACAAATCTTGAATGCCTGGATTCTGATGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCCTGATTGCTCAAGACAAATCTTGAATGCCTGGATTCTGATGCC  550

seq1  TCTCTGTCTTCTATATTCCCAATCTAGCCTGTCAGCAAATCCTGTTGGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTCTTCTATATTCCCAATCTAGCCTGTCAGCAAATCCTGTTGGCT  600

seq1  TTGCCCCTAGGATGCGTTTAGAATCTACCACCTCTGAACCCTTCCATTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCCCTAGGATGCGTTTAGAATCTACCACCTCTGAACCCTTCCATTAC  650

seq1  TGCTTCGGTAGCTCAAGCCACCATCAACACACACACCACACACACACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCGGTAGCTCAAGCCACCATCAACACACACACCACACACACACACA  700

seq1  TACACACATGCACAGACAAGTGCCTGCACAC-AAATACACACGTGTTCAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TACACACATGCACAGACAAGTGCCTGCACACAAAATACACACGTGTTCAT  750

seq1  ACATGCATGCACATGCATGCATGCACCTGCATAATCATGCACACACATGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATGCACATGCATGCATGCACCTGCATAATCATGCACACACATGC  800

seq1  ACACATACACATGCACACATACATGCATGAGCTCTTGAGTACATGCACCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATACACATGCACACATACATGCATGAGCTCTTGAGTACATGCACCC  850

seq1  TCCACACATGCTCGTACACACACACACACACACACCTC-TTTTTTTATTT  898
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TCCACACATGCTCGTACACACACACACACACACACCTCTTTTTTTTATTT  900

seq1  TAGCAGGCAGAAATACCTATGGTATAATATCTGACCTCATCTTTGCTCTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGGCAGAAATACCTATGGTATAATATCTGACCTCATCTTTGCTCTC  950

seq1  ATTTCC-CAAAGC-TCCTACTGCAGCTCTAGAAAGC-TCT-CTTTCT-AT  993
      |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||
seq2  ATTTCCTCAAAGCTTCCTACTGCAGCTCTAGAAAGCTTCTCCTTTCTAAT  1000

seq1  TCCCTGTTATTCCAGCACACACT-GGCCCCCATGGCTCTTG--ATTCCAC  1040
       |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||  |||||||
seq2  CCCCTGTTATTCCAGCACACACTGGGCCCCAATGGCTTCTGGAATTCCAC  1050

seq1  TCCC-TGGGGTTCTCTTTCT-CTAGCCAG--TAAAAGCTCTATCTTTCAT  1086
      |||| ||||||||||||| | |||  |||   |||||| ||  |||  ||
seq2  TCCCTTGGGGTTCTCTTTTTCCTAAGCAGAAAAAAAGC-CTTACTTCAAT  1099

seq1  CCCTGTCAGGTTTCTA-CT-TAAATTTCACCTTCTCAAAGGGGGAACATT  1134
        | ||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |
seq2  --CGGTCAGG-GTCTATCTGTAAATTTCACC-TCTCAAAGGGAGAACAAT  1145

seq1  TTAAACTCCTTACAATACCTTTCTCTGA  1162
      | ||  |||||| |||||||||||||||
seq2  TGAA--TCCTTAAAATACCTTTCTCTGA  1171